Comparative studies on IR, Raman, and surface enhanced Raman scattering spectroscopy of dipeptides containing Δala and Δphe

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 4, 2012, Pages 1414-1425

  Malek, Kamilla ^a   Makowski, MacIej ^b   Królikowska, Agata ^c   Bukowska, Jolanta ^c  

^a JAGIELLONIAN UNIVERSITY   (Poland)

^b UNIVERSITY OF OPOLE   (Poland)

^c UNIVERSITY OF WARSAW   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADSORPTION; ALKALINITY; CARBOXYLATION; RAMAN SCATTERING; STRETCHING;

ADSORPTION MECHANISM; ALKALINE PH; CARBOXYLATE IONS; CARBOXYLIC GROUP; COMPARATIVE STUDIES; CONFORMATIONAL STRUCTURES; DEHYDROPEPTIDES; DI-PEPTIDES; METAL SURFACES; RAMAN BANDS; SERS SPECTRUM; SURFACE-ENHANCED RAMAN; SURFACE-ENHANCED RAMAN SCATTERING SPECTROSCOPY; SYMMETRIC STRETCHING; VISIBLE LIGHT EXCITATION;

PEPTIDES;

EID: 84856515292     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp208586j     Document Type: Article

References (56)

1. Rink, R.; Wierenga, J.; Kuipers, A.; Kluskens, L. D.; Driessen, A. J. M.; Kuipers, O. P. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73, 1792-1796
2. Bagley, M. C.; Dale, J. W.; Merritt, E. A.; Xiong, X. Chem. Rev. 2005, 105, 685-714
3. Brotz, H.; Sahl, H. G. J. Antimicrob. Chemother. 2000, 46, 1-6
4. Grigoryan, H. A.; Hambardzumyana, A. A.; Mkrtchyan, M. V.; Topuzyan, V. O.; Halebyan, G. P.; Asatryan, R. S. Chem.-Biol. Interact. 2008, 171, 108-116
5. Latajka, R.; Lewginski, M.; Makowski, M.; Pawelczak, M.; Huber, T.; Sewald, N.; Kafarski, P. J. Pept. Sci. 2008, 14, 1084-1094
6. Langer, M.; Pauling, A.; Retey, J. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1995, 34, 1464-1465
7. Gupta, A.; Chauhan, V. S. Biopolymers 1990, 30, 395-403
8. Brasun, J.; Makowski, M.; Oldziej, S.; Swiatek-Kozlowska, J. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 1391-1398
9. Sigh, T. P.; Kaur, P. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1996, 66, 141-165
10. Broda, M. A.; Siodlak, D.; Rzeszotarska, B. J. Pept. Sci. 2005, 11, 546-555
11. Gupta, A.; Mehrotra, R.; Klimov, E.; Siesler, H. W.; Joshi, R. M.; Chauhan, V. S. Chem. Biodiversity 2006, 3, 284-295
12. Makowski, M.; Brzuszkiewicz, A.; Lisowski, M.; Lis, T. Acta Crystallogr., Sect. C: Cryst. Struct. Commun. 2005, 61, o424-o426
13. Makowski, M.; Lisowski, M.; Maciag, A.; Lis, T. Acta Crystallogr., Sect. E: Struct. Rep. Online 2006, 62, o807-o810
14. Makowski, M.; Lisowski, M.; Mikolajczyk, I.; Lis, T. Acta Crystallogr., Sect. E: Struct. Rep. Online 2007, 63, o19-o21
15. Jain, R. M.; Rajashankar, K. R.; Ramakumar, S.; Chauhan, V. S. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3205-3211
16. Aleman, C. Biopolymers 1994, 34, 841-847
17. Inai, Y.; Sakakura, Y.; Hirabayashi, T. Polym. J. 1998, 30, 828-832
18. Gupta, A.; Mehrotra, R.; Tewari, J.; Jain, R. M.; Chauhan, V. S. Biopolymers 1999, 50, 595-601
19. Broda, M. A.; Rzeszotarska, B.; Smelka, L.; Rospenk, M. J. Pept. Res. 1997, 50, 342-351
20. Stevenson, R.; Stokes, R. J.; MacMillan, D.; Armstrong, D.; Faulds, K.; Wadsworth, R.; Kunuthur, S.; Suckling, C. J.; Graham, D. Analyst 2009, 134, 1561-1564
21. Pan, Z.; Morgan, S. H.; Ueda, A.; Mu, R.; Cui, Y.; Guo, M.; Burger, A.; Yeh, Y. J. Raman Spectrosc. 2005, 36, 1082-1087
22. Kneipp, J.; Kneipp, H.; Wittig, B.; Kneipp, K. Nanomedicine 2010, 6, 214-226
23. Qian, X.-M.; Nie, S. M. Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 912-920
24. Hering, K.; Cialla, D.; Ackermann, K.; Dorfer, T.; Moller, R.; Schneidewind, H.; Mattheis, R.; Fritzsche, W.; Rosch, P.; Popp, J. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 390, 113-124
25. Makowski, M.; Rzeszotarska, B.; Kubica, Z.; Wieczorek, P. Liebigs Ann. Chem. 1984, No. 5, 920-928
26. Makowski, M.; Rzeszotarska, B.; Pietrzynski, G.; Kubica, Z. Liebigs Ann. Chem. 1985, No. 5, 893-900
27. Makowski, M.; Rzeszotarska, B.; Smelka, L.; Kubica, Z. Liebigs Ann. Chem. 1985, No. 7, 1457-1464
28. Creighton, J. A.; Blatchford, C. G.; Albrecht, M. G. J. Chem. Soc. 1979, 75, 790-798
29. Chowdhury, J.; Ghosh, M.; Misra, T. N. J. Colloid Interface Sci. 2000, 228, 372-378
30. Yaffe, N. R.; Blanch, E. W. Vib. Spectrosc. 2008, 48, 196-201
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Gaussian 09, revision A. 1; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
32. Lee, C.; Yang, W.; Parr., R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785-789
33. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652
34. Michalska, D.; Wysokinski, R. Chem. Phys. Lett. 2005, 403, 211-217
35. Fogarasi, G.; Zhou, X.; Taylor, P. W.; Pulay, P. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 8191-8201
36. Pulay, P.; Fogarasi, G.; Pang, F.; Boggs, J. E. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 2550-2560
37. Martin, J. M. L.; Van Alsenoy, C. Gar2ped; University of Antwerp, 1995.
38. Zanuy, D.; Rodriguez-Ropero, F.; Nussinov, R.; Aleman, C. J. Struct. Biol. 2007, 160, 177-189
39. Makowski, M.; Lisowski, M.; Mikolajczyk, I.; Lis, T. Acta Crystallogr., Sect. E: Struct. Rep. Online 2007, E63, o989-o991
40. Broda, M. A.; Buczek, A.; Siodlak, D.; Rzeszotarska, B. J. Pept. Sci. 2009, 15, 465-473
41. Broda, M. A.; Rospenk, M.; Siodlak, D.; Rzeszotarska, B. J. Mol. Struct. 2005, 740, 17-24
42. Varsanyi, G. Assignments for vibrational spectra of 700 benzene derivatives; Akademiai Kiado: Budapest, Hungary, 1973; pp 46-87.
43. Cioslowski, J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8333-8336
44. Kumar, K.; Phelps, D. J.; Carey, P. R. Can. J. Chem. 1978, 56, 232-239
45. Furuya, K.; Kawato, K.; Yokoyama, H.; Sakamoto, A.; Tasumi, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8251-8256
46. Jezowska-Bojczuk, M.; Varnagy, K.; Sovago, I.; Pietrzynski, G.; Dyba, M.; Kubica, Z.; Rzeszotarska, B.; Smelka, L.; Kozlowski, H. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1996, No. 15, 3265-3268
47. Swiatek-Kozlowska, J.; Brasun, J.; Chruscinski, L.; Chruscinka, E.; Makowski, M.; Kozlowski, H. New J. Chem. 2000, 24, 893-896
48. Bell, S. E. J.; Sirimuthu, N. M. S. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 3787-3792
49. Sekine, R.; Vongsvivut, J.; Robertson, E. G.; Spiccia, L.; McNaughton, D. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7104-7111
50. Castro, J. L.; Lopez-Raminez, M. R.; Lopez Tocon, I.; Otero, J. C. J. Colloid Interface Sci. 2003, 263, 357-363
51. Lopez-Ramirez, M. R.; Garcia-Ramos, J. V.; Otero, J. C.; Castro, J. L.; Sanchez-Cortes, S. Chem. Phys. Lett. 2007, 446, 380-384
52. Seballos, L.; Richards, N.; Stevens, D. J.; Patel, M.; Kapitzky, L.; Lokey, S.; Millhauser, G.; Zhang, J. Z. Chem. Phys. Lett. 2007, 447, 335-339
53. Fleger, Y.; Mastai, Y.; Rosenbluh, M.; Dressler, D. H. J. Raman Spectrosc. 2009, 40, 1572-1577
54. Kwon, Y. J.; Son, D. H.; Ahn, S. J.; Kim, M. S.; Kim, K. J. Phys. Chem. 1994, 98, 8481-8487
55. Suh, J. S.; Kim, J. J. Raman Spectrosc. 1998, 29, 143-148
56. Suh, J. S.; Moskovits, M. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4711-4718