Probing the specific interactions and structures of gas-phase vancomycin antibiotics with cell-wall precursor through IRMPD spectroscopy

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 14, 2010, Pages 3606-3615

  Poully, Jean Christophe ^a   Lecomte, Frédéric ^a   Nieuwjaer, Nicolas ^a   Manil, Bruno ^a   Schermann, Jean Pierre ^a   Desfrançois, Charles ^a   Calvo, Florent ^b   Grégoire, Gilles ^a  

^a UNIVERSITÉ PARIS 13   (France)

^b UNIVERSITÉ LYON 1   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 77950232969     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b923787a     Document Type: Article

References (55)

1. M. Nieto, H. R. Perkins Biochem. J., 1971, 123, 773-787
2. D. H. Williams, M. S. Westwell Chem. Soc. Rev., 1998, 27, 57.
3. A. N. Chatterjee, H. R. Perkins Biochem. Biophys. Res. Commun., 1966, 24, 489.
4. D. H. Williams Nat. Prod. Rep., 1996, 13, 469.
5. C. T. Walsh Science, 1993, 261, 308.
6. D. Kahne, C. Leimkuhler, W. Lu, C. Walsh Chem. Rev., 2005, 105, 425.
7. J. S. Anderson, M. Matsuhashi, M. A. Haskin, J. L. Strominger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1965, 53, 881.
8. J. Liu, K. J. Volk, M. S. Lee, M. Pucci, S. Handwerger Anal. Chem., 1994, 66, 2412-2416
9. H. R. Perkins Biochem. J., 1969, 111, 195.
10. M. Nieto, H. R. Perkins Biochem. J., 1971, 123, 789-803
11. M. P. Williamson, D. H. Williams J. Am. Chem. Soc., 1981, 103, 6580.
12. M. Schafer, T. R. Schneider, G. M. Sheldrick Structure, 1996, 4, 1509.
13. G. J. Sharman, A. C. Try, R. J. Dancer, Y. R. Cho, T. Staroske, B. Bardsley, A. J. Maguire, M. A. Cooper, D. P. O’Brien, D. H. Williams J. Am. Chem. Soc., 1997, 119, 12041.
14. C. M. Pearce, U. Gerhad, D. H. Williams J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1995, 159.
15. D. H. Williams, J. P. Waltho Biochem. Pharmacol., 1988, 37, 133-141
16. J. P. Mackay, U. Gerhard, D. A. Beauregard, R. A. Maplestone, D. H. Williams J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 4573-4580
17. R. Kannan, C. M. Harris, T. M. Harris, J. P. Waltho, N. J. Skelton, D. H. Williams J. Am. Chem. Soc., 1988, 110, 2946-2953
18. D. H. Williams Acc. Chem. Res., 1984, 17, 364.
19. M. F. Bush, J. S. Prell, R. J. Saykally, E. R. Williams J. Am. Chem. Soc., 2007, 129, 13544-13553
20. P. E. Barran, N. C. Polfer, D. J. Campopiano, D. J. Clarke, P. R. R. Langridge-Smith, R. J. Langley, J. R. W. Govan, A. Maxwell, J. R. Dorin, R. P. Millar, M. T. Bowers Int. J. Mass Spectrom., 2005, 240, 273-284
21. A. J. R. Heck, T. J. D. Jørgensen, M. O’Sullivan, M. von Raumer, P. J. Derrick J. Am. Soc. Mass Spectrom., 1998, 9, 1255-1266
22. T. J. D. Jørgensen, P. Roepstorff, A. J. R. Heck Anal. Chem., 1998, 70, 4427-4432
23. T. J. D. Jørgensen, T. Staroske, P. Roepstorff, D. H. Williams, A. J. R. Heck J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1999, 1859-1863
24. T. J. D. Jørgensen, P. Hvelplund, J. U. Andersen, P. Roepstorff Int. J. Mass Spectrom., 2002, 219, 659-670
25. P. J. Vollmerhaus, E. Breukink, A. J. R. Heck Chem.-Eur. J., 2003, 9, 1556-1565
26. A. J. R. Heck, T. J. D. Jørgensen Int. J. Mass Spectrom., 2004, 236, 11-23
27. J. Diana, D. Visky, J. Hoogmartens, A. Van Schepdael, E. Adams Rapid Commun. Mass Spectrom., 2006, 20, 685-693
28. T. J. D. Jørgensen, D. Delforge, J. Remacle, G. Bojesen, P. Roepstorff Int. J. Mass Spectrom., 1999, 188, 63-85
29. Z. Yang, E. R. Vorpagel, J. Laskin J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 13013.
30. Z. Yang, E. R. Vorpagel, J. Laskin Chem.-Eur. J., 2009, 15, 2081-2090
31. T. Wyttenbach, M. Witt, M. T. Bowers J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 3458-3464
32. C. Kapota, J. Lemaire, P. Maitre, G. Ohanessian J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 1836-1842
33. J. T. O’Brien, J. S. Prell, J. D. Steill, J. Oomens, E. R. Williams J. Phys. Chem. A, 2008, 112, 10823-10830
34. J. S. Prell, J. T. O’Brien, J. D. Steill, J. Oomens, E. R. Williams J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 11442-11449
35. J. Oomens, B. G. Sartakov, G. Meijer, G. Von Helden Int. J. Mass Spectrom., 2006, 254, 1-19
36. G. Grégoire, M. P. Gaigeot, D. C. Marinica, J. Lemaire, J. P. Schermann, C. Desfrançois Phys. Chem. Chem. Phys., 2007, 9, 3082-3097
37. J. Oomens, N. Polfer, D. T. Moore, L. van der Meer, A. G. Marshall, J. R. Eyler, G. Meijer, G. von Helden Phys. Chem. Chem. Phys., 2005, 7, 1345-1348
38. K. Pagel, P. Kupser, F. Bierau, N. C. Polfer, J. D. Steill, J. Oomens, G. Meijer, B. Koksch, G. von Helden Int. J. Mass Spectrom., 2009, 283, 161-168
39. V. Gabelica, F. Rosu, E. De Pauw, J. Lemaire, J. C. Gillet, J. C. Poully, F. Lecomte, G. Gregoire, J. P. Schermann, C. Desfrancois J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 1810.
40. J. C. Poully, G. Gregoire, J. P. Schermann J. Phys. Chem. A, 2009, 113, 8020-8026
41. C. S. Goh, D. Milburn, M. Gerstein Curr. Opin. Struct. Biol., 2004, 14, 104-109
42. B. Lucas, G. Gregoire, J. Lemaire, P. Maitre, F. Glotin, J. P. Schermann, C. Desfrancois Int. J. Mass Spectrom., 2005, 243, 105-113
43. Y. Bouteiller, J. C. Gillet, G. Gregoire, J. P. Schermann J. Phys. Chem. A, 2008, 112, 11656-11660
44. NIST, and Precomputed vibrational scaling factors at http://cccbdb.nist.gov/vibscalejust.asp
45. Y. Sugita, Y. Okamoto Chem. Phys. Lett., 1999, 314, 141-151
46. D. A. Case, J. W. Caldwell, T. E. Cheatham III, J. Wang, W. S. Ross, C. L. Simmerling, T. A. Darden, K. M. Merz, R. V. Stanton, A. L. Cheng, J. J. Vincent, M. Crowley, V. Tsui, H. Gohlke, R. J. Radmer, Y. Duan, J. Pitera, I. Massova, G. L. Seibel, U. C. Singh, P. K. Weiner, and P. A. Kollman, AMBER 7, University of California, San Francisco CA, 2002
47. P. S. Shenkin, D. Q. McDonald J. Comput. Chem., 1994, 15, 899-916
48. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, GAUSSIAN 09 (Revision A.2), Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2009
49. J. Oomens, J. D. Steill J. Phys. Chem. A, 2008, 112, 3281-3283
50. C. C. Liou, H. F. Wu, J. S. Brodbelt J. Am. Soc. Mass Spectrom., 1994, 5, 260-273
51. J. Oomens, J. D. Steill, B. Redlich J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 4310-4319
52. J. D. Steill, J. Oomens J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 13570.
53. E. Fischer Ber. Dtsch. Chem. Ges., 1894, 27, 2985.
54. V. H. Wysocki, G. Tsaprailis, L. L. Smith, L. A. Breci J. Mass Spectrom., 2000, 35, 1399-1406
55. R. S. Roy, P. Yang, S. Kodali, Y. S. Xiong, R. M. Kim, P. R. Griffin, H. R. Onishi, J. Kohler, L. L. Silver, K. Chapman Chem. Biol., 2001, 8, 1095-1106