EndoV/DNA ligase mutation scanning assay using microchip capillary electrophoresis and dual-color laser-induced fluorescence detection

Analytical Methods

Volumn 4, Issue 1, 2012, Pages 58-64

  Kotani, Akira ^a,b   Witek, Małgorzata A ^b   Osiri, John K ^b   Wang, Hong ^b   Sinville, Rondedrick ^b   Pincas, Hanna ^c   Barany, Francis ^c   Soper, Steven A ^b,d  

^a TOKYO UNIVERSITY OF PHARMACY AND LIFE SCIENCES   (Japan)

^b LOUISIANA STATE UNIVERSITY   (United States)

^c WEILL CORNELL MEDICAL COLLEGE   (United States)

^d Ulsan National Institute of Science and Technology   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CAPILLARY GEL ELECTROPHORESIS; CLEAVAGE PRODUCTS; DNA FRAGMENT; DNA LIGASES; DNA SAMPLES; ELECTROPHEROGRAMS; ENDONUCLEASES; GENOMIC DNA; HIGH SENSITIVITY; HIGHLY SENSITIVE; HYDROXYETHYL CELLULOSE; LASER INDUCED FLUORESCENCE; LASER INDUCED FLUORESCENCE DETECTION; LOW LEVEL; MICROCHIP CAPILLARY ELECTROPHORESIS; MICROCHIP SEPARATIONS; PCR PRODUCTS; POLYACRYLAMIDE GELS; WILD TYPES;

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; COLOR; DETECTORS; DNA; FLUORESCENCE; GELS; LASER PRODUCED PLASMAS; MICROPROCESSOR CHIPS; SCANNING; SEPARATION; UREA;

POLYMERASE CHAIN REACTION;

EID: 84862935445     PISSN: 17599660     EISSN: 17599679     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1ay05366c     Document Type: Article

References (47)

1. P. A. Futreal L. Coin M. Marshall T. Down T. Hubbard R. Wooster N. Rahman M. R. Stratton Nat. Rev. Cancer 2004 4 177
2. R. Sachidanandam D. Weissman S. C. Schmidt J. M. Kakoi L. D. Stein G. Marth S. Sherry et al. Nature 2001 409 928
3. L. C. Cantley K. R. Auger C. Carpenter B. Duckworth A. Graziani R. Kapeller S. Soltoff Cell 1991 64 281
4. S. Hietanen S. Lain E. Krausz C. Blattner D. P. Lane Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 8501
5. R. A. Weinberg Science 1991 254 1138
6. K. Motojima T. Urano Y. Nagata H. Shiku T. Tsunoda T. Kanematsu Am. J. Gastroenterol. 1991 86 1784
7. C. P. Dieterle M. Conzelmann U. Linnemann M. R. Berger Clin. Cancer Res. 2004 10 641
8. P. Anker F. Lefort V. Vasioukhin J. Lyautey C. Lederrey X. Q. Chen M. Stroun H. E. Mulcahy M. J. G. Farthing Gastroenterology 1997 112 1114
9. J. P. Struewing P. Hartge S. Wacholder S. M. Baker M. Berlin M. McAdams M. M. Timmerman L. C. Brody M. A. Tucker N. Engl. J. Med. 1997 336 1401
10. R. J. Hung J. D. McKay V. Gaborieau P. Boffetta M. Hashibe D. Zaridze A. Mukeria et al. Nature 2008 452 633
11. D. Y. Wu L. Ugozzoli B. K. Pal R. B. Wallace Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989 86 2757
12. A. Russom A. Ahmadian H. Andersson P. Nilsson G. Stemme Electrophoresis 2003 24 158
13. B. J. Conner A. A. Reyes C. Morin K. Itakura R. L. Teplitz R. B. Wallace Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1983 80 278
14. K. A. Phillips K. Nichol H. Ozcelik J. Knight S. J. Done P. J. Goodwin I. L. Andrulis J. Natl. Cancer Inst. 1999 91 469
15. T. Soussi K. Dehouche C. Beroud Hum. Mutat. 2000 15 105
16. P. O. Ekstrom A. L. Borresen-Dale H. Qvist K. E. Giercksky W. G. Thilly BioTechniques 1999 27 128
17. D. Hamroun S. Kato C. Ishioka M. Claustres C. Beroud T. Soussi Hum. Mutat. 2006 27 14
18. J. G. Hacia J. B. Fan O. Ryder L. Jin K. Edgemon G. Ghandour R. A. Mayer B. Sun L. Hsie C. M. Robbins L. C. Brody D. Wang E. S. Lander R. Lipshutz S. P. Fodor F. S. Collins Nat. Genet. 1999 22 164
19. E. Schaeffeler T. Lang U. M. Zanger M. Eichelbaum M. Schwab Clin. Chem. 2001 47 548
20. W. G. Liu D. I. Smith K. J. Rechtzigel S. N. Thibodeau C. D. James Nucleic Acids Res. 1998 26 1396
21. D. Glavac M. Dean Hum. Mutat. 1993 2 404
22. R. Fodde M. Losekoot Hum. Mutat. 1994 3 83
23. A. J. Nataraj I. Olivos-Glander N. Kusukawa W. E. Highsmith Electrophoresis 1999 20 1177
24. F. Sanger S. Nicklen A. R. Coulson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1977 74 5463
25. I. I. Haris P. M. Green D. R. Bentley F. Giannelli PCR Methods Appl. 1994 3 268
26. R. Youil B. W. Kemper R. G. H. Cotton Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 87
27. H. Pincas M. R. Pingle J. Huang K. Q. Lao P. B. Paty A. M. Friedman F. Barany Nucleic Acids Res. 2004 32 e148
28. J. Tong W. G. Cao F. Barany Nucleic Acids Res. 1999 27 788
29. J. Huang B. Kirk R. Favis T. Soussi P. Paty W. Cao F. Barany Oncogene 2002 21 1909
30. J. M. Huang J. Lu F. Barany W. G. Cao Biochemistry 2002 41 8342
31. M. Khanna W. G. Cao M. Zirvi P. Paty F. Barany Clin. Biochem. 1999 32 287
32. F. Barany Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 189
33. M. L. Hupert W. J. Guy S. D. Llopis H. Shadpour S. Rani D. E. Nikitopoulos S. A. Soper Microfluid. Nanofluid. 2007 3 1
34. J. H. Aborn S. A. El-Difrawy M. Novotny E. A. Gismondi R. Lam P. Matsudaira B. K. Mckenna T. O'Neil P. Streechon D. J. Ehrlich Lab Chip 2005 5 669
35. R. G. Blazej P. Kumaresan R. A. Mathies Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 7240
36. R. Sinville S. A. Soper J. Sep. Sci. 2007 30 1714
37. H. J. Tian A. Jaquins-Gerstl N. Munro M. Trucco L. C. Brody J. P. Landers Genomics 2000 63 25
38. H. J. Tian L. C. Brody J. P. Landers Genome Res. 2000 10 1403
39. D. Schmalzing A. Adourian L. Koutny L. Ziaugra P. Matsudaira D. Ehrlich Anal. Chem. 1998 70 2303
40. C. N. Hestekin J. P. Jakupciak T. N. Chiesl C. W. Kan C. D. O'Connell A. E. Barron Electrophoresis 2006 27 3823
41. G. Vahedi C. Kaler C. J. Backhouse Electrophoresis 2004 25 2346
42. Y. Endo L. Zhang R. Katashima M. Itakura E. A. S. Doherty A. E. Barron Y. Baba Electrophoresis 2005 26 3380
43. S. Stenirri M. Cretich I. Rech A. Restelli M. Ghioni S. Cova M. Ferrari L. Cremonesi M. Chiari Electrophoresis 2008 29 4972
44. I. Rech S. Cova A. Restelli M. Ghioni M. Chiari M. Cretich Electrophoresis 2006 27 3797
45. H. Shadpour H. Musyimi J. Chen S. A. Soper J. Chromatogr., A 2006 1111 238 251
46. M. Zuborova Z. Demianova D. Kaniansky M. Masar B. Stanislawski J. Chromatogr., A 2003 990 179 188
47. M. E. Cavalier M. M. Davis J. M. Croop J. Pediatr. Hematol. Oncol. 2005 27 441