Microsolvation of lysine by water: Computational study of stabilized zwitterion

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 33, 2011, Pages 10147-10153

  Hwang, Tae Kyu ^a   Eom, Ga Young ^a   Choi, Min Seo ^a   Jang, Sung Woo ^a   Kim, Ju Young ^a   Lee, Sungyul ^b   Lee, Yonghoon ^c   Kim, Bongsoo ^a  

^a Kyung Hee University   (South Korea)

^b Mokpo National University   (South Korea)

^c Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; GIBBS FREE ENERGY; MOLECULES; TEMPERATURE;

B3LYP/6-311++G; CANONICAL FORM; COMPUTATIONAL STUDIES; GASPHASE; LOW TEMPERATURES; MICROSOLVATION; RELATIVE STABILITIES; WATER MOLECULE;

COMPUTATION THEORY;

EID: 84860411201     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp202850s     Document Type: Article

References (46)

1. Xu, S.; Niles, J. M.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 10696
2. Desfrançois, C.; Carles, S.; Schermann, J. P. Chem. Rev. 2000, 100, 3943
3. Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 8827
4. Diken, E. G.; Hammer, N. I.; Johnson, M. A. J. Chem. Phys. 2004, 120, 9902
5. Snoek, L. C.; Robertson, E. G.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Chem. Phys. Lett. 2001, 321, 49
6. Snoek, L. C.; Kroemer, R. T.; Hockridge, M. R.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1819
7. Mayer, I.; Valiron, P. J. Chem. Phys. 1998, 109, 3360
8. Balabin, R. M. J. Phys. Chem. Lett. 2010, 1, 20
9. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 15075.
10. Mol. Phys. 2011, 109, 943.
11. Balabin, R. M,. Enthalpy difference between conformations of normal alkanes: Intramolecular basis set superposition error (BSSE) in the case of n-butane and n-hexane; Journal of Chemical Physics, (2008).
12. J. Chem. Phys. 2010, 132, 231101.
13. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 5980.
14. Ahn, D.-S.; Park, S.-W.; Jeon, I.-S.; Lee, M.-K.; Kim, N.-H.; Han, Y.-H.; Lee, S. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 14019
15. Park, S.-W.; Ahn, D.-S.; Lee, S. Chem. Phys. Lett. 2003, 371, 74
16. Jeon, I.-S.; Ahn, D.-S.; Park, S.-W.; Lee, S.; Kim, B. Int. J. Quantum Chem. 2005, 101, 55
17. Lee, K.-M.; Park, S.-W.; Jeon, I.-S.; Lee, B.-R.; Ahn, D.-S.; Lee, S. Bull. Korean Chem. Soc. 2005, 26, 909
18. Ahn, D.-S.; Kang, A.-R.; Lee, S.; Kim, B.; Kim, K.; Neuhauser, D. J. Chem. Phys. 2003, 122, 084310
19. Park, S.-W.; Im, S.; Lee, S.; Desfrançois, C. Int. J. Quantum Chem. 2007, 107, 1316
20. Kim, J.-Y.; Im, S.; Kim, B.; Desfrançois, C.; Lee, S. Chem. Phys. Lett. 2008, 451, 198
21. Im, S.; Jang, S.-W.; Lee, S.; Lee, Y.; Kim, B. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 9767
22. Kim, J.-Y.; Schermann, J. P.; Lee, S. Bull. Korean Chem. Soc. 2010, 31, 59
23. Csaszar, A. G.; Perczel, A. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999, 71, 243
24. Rogalewicz, F.; Ohanessian, G.; Gresh, N. J. Comput. Chem. 2000, 21, 963
25. Godfrey, P. D.; Firth, S.; Heatherley, L. D.; Brown, R. D.; Pierlot, A. P. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9687
26. Spinor, J.; Sulkes, M. J. Chem. Phys. 1993, 98, 9389
27. Gao, X.; Fischer, G. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 4404
28. Gao, X.; Fischer, G. Spectrochim. Acta 1999, 55, 2329
29. Fernandez-Ramos, A.; Smedarchina, Z.; Siebrand, W.; Zgierski, M. Z. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9714
30. Lemoff, A. S.; Bush, M. F.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1903
31. Hu, C. H.; Shen, M.; Schafer, H. F., III. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2923
32. Bandyopadhyay, P.; Gordon, M. S; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 2002, 116, 5023
33. Julian, R. R.; Jarrold, M. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10861
34. Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8159
35. Ding, Y.; Krogh-Jespersen, K. Chem. Phys. Lett. 1992, 199, 261
36. Rodziewicz, P.; Doltsinis, N. L. ChemPhysChem 2007, 8, 1959
37. Blom, M. N.; Compagnon, I.; Polfer, N. C.; von Helden, G.; Meijer, G.; Suhai, S.; Paizs, B.; Oomens, J. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 7309
38. Aikens, C. M.; Gordon, M. S. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12835
39. Jockusch, R. A.; Price, W. D.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9266
40. Bush, M. F.; O'Brien, J. T.; Prell, J. S.; Saykally, R. J.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1612
41. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785
42. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
43. Chai, J. D.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 6615
44. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. GAUSSIAN 03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
45. Tomasi, B.; Mennuci, J.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999
46. Leng, Y.; Zhang, M.; Song, C.; Chen, M.; Lin, Z. THEOCHEM 2008, 858, 52