Laser spectroscopy of jet-cooled biomolecules and their water-containing clusters: Water bridges and molecular conformation

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 105, Issue 39, 2001, Pages 8827-8839

  Zwier, Timothy S ^a  

^a PURDUE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMOLECULES; LASER SPECTROSCOPY;

BIOLOGICAL MATERIALS; CONFORMATIONS; FLUORESCENCE; HYDROGEN BONDS; INFRARED SPECTROSCOPY; IONIZATION; LASER APPLICATIONS; ULTRAVIOLET SPECTROSCOPY;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0035807680     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp011659+     Document Type: Article

References (95)

1. Marchi, M.; Borgis, D.; Levy, N.; Ballone, P. J. Chem. Phys. 2001, 114, 4377-4385.
2. Kollman, P. A.; Massova, I.; Reyes, C.; Kühn, B.; Huo, S. H.; Chong, L.; Lee, M.; Lee, T.; Duan, Y.; Wang, W.; Donini, O.; Cieplak, P.; Srinivasan, J.; Case, D. A.; Cheatham, T. E. Ace. Chem. Res. 2000, 33, 889-897.
3. Cheatham, T. E.; Kollman, P. A. Anna. Rev. Phys. Chem. 2000, 57,435-471.
4. Fernandez-Ramos, A.; Smedarchina, Z.; Siebrand, W.; Zgierski, M. Z. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9714-9721.
5. Petukhov, M.; Cregut, D.; Soares, C. M.; Serrano, L. Protein Sci. 1999,5, 1982-1989.
6. Toba, S.; Colombo, G.; Merz, K. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 727, 2290-2302.
7. Fedorov, A.; Shi, W.; Kicska, G.; Fedorov, E.; Tyler, P. C.; Furneaux, R. H.; Hanson, J. C.; Gainsford, G. J.; Larese, J. Z.; Schramm, W. L.; Almo, S. C. Biochemistry 2001, 40, 853-860.
8. Sadeghi, R. R.; chena, H. P. J. Chem. Phys. 1999, 111, 20862094.
9. Fenn, J. B. Amiu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 1-41.
10. Carney, J. R.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 86778688.
11. Carney, J. R.; Zwier, T. S. Chem. Phys. Lett. 2001. In press.
12. Ruoff, R. S.; Klots, T. D.; Emilsson, T.; Gutowsky, H. S. J. Chem. Plm. 1990,93,3142-3150..
13. Zwier, T. S. Anna. Rei: Phys. Chem. 1996, 47, 205-241.
14. Connell, L. L.; Corcoran, T. C; Joireman, P. W.; Felker, P. M. J. Phys. Chem. 1990, 94, 1229-1232.
15. Dian, B. C.; Zwier, T. S. Unpublished results.
16. Fraser, G. T.; Suenram, R. D.; Lugez, C. L. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1141-1146.
17. Keske, J.; McWhorter, D. A.; Pate, B. H. Int. Rev. Phys. Chem. 2000, 19, 363-407.
18. Rizzo, T. R.; Park, Y. D.; Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1986, 84, 2534-41.
19. Philips, L. A.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1988, 89, 85-90.
20. Felker, P. M. J. Phys. Chem. 1992, 96, 7844.
21. Felker, P. M. Chem. Rev. 1994, 94, 1784.
22. Liu, K.; Cruzan, J. D.; Saykally, R. J. Science 1995,277, 929-33.
23. Pratt, D. W. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 481-530.
24. Provençal, R. A.; Paul, J. B.; Chapo, C. N.; Saykally, R. J. Spectroscopy 1999, 14, 24.
25. Bück, U.; Ettischer, I.; Melzer, M.; Buch, V.; Sadlej, J. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2578.
26. Riehn, C.; Lahmann, C.; Wassermann, B.; Brutschy, B. Ber. Bunsen-Ges. Phys. Chem. 1992, 96, 1161-64.
27. Ebata, T.; Fujii, A.; Mikami, N. Int. Rev. Phys. Chem. 1998, 17, 331-362.
28. Robertson, E. G.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001,3, 1-18.
29. Janzen, C; Spangenberg, D.; Roth, W.; Kleinermanns, K. J. Chem. Phys. 1999, 770, 9898-9907.
30. Brutschy, B. Chem. Rev. 2000, 700, 3891-3920.
31. Mitsui, M.; Ohshima, Y.; Isiuchi, S.-i.; Sakai, M.; Fujii, M. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 8649-8659.
32. Coussan, S.; Meuwly, M.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2001,114, 3524-3534.
33. Kinsey, J. L. Anna. Rev. Phys. Chem. 1977, 28, 349.
34. Johnson, P. M.; Herman, M. R.; Zakheim, D. J. Chem. Phys. 1975, 62, 2500.
35. Boesl, U.; Neusser, H. J.; Schlag, E. W. J. Chem. Phys. 1980, 72, 4327-4333.
36. Dietz, T. G.; Duncan, M. A.; Liverman, M. G.; Smalley, R. E. J. Chem. Phys. 1980, 73, 4816-4821.
37. Murakami, J.-i.; Kaya, K.; Ito, M. J. Chem. Phys. 1980, 72,3263-3270.
38. Bach, A.; Coussan, S.; Muller, A.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2000,772,1192-1203.
39. Pimentel, G. C.; McClellan, A. L. The Hydrogen Bond; W. H. Freeman: San Francisco, 1960.
40. Page, R. H.; Shen, Y. R.; Lee, Y. T. J. Chem. Phys. 1988, 88, 5362-76.
41. Page, R. H.; Shen, Y. R.; Lee, Y. T. J. Chem. Phys. 1988, 88, 4621-4636.
42. Walther, T.; Bitto, H.; Minton, T. K.; Huber, J. R. Chem. Phys. Lett. 1994, 231, 64-69.
43. Devlin, J. P.; Sadlej, J.; Buch, V. J. Phys. Chem. A 2001, 705, 974-983.
44. Friesner, R. A.; Murphy, R. B.; Beachy, M. D.; Ringnalda, M. N.; Pollard, W. T.; Dunietz, B. D.; Cao, Y. X. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 1913-1928.
45. Park, Y. D.; Rizzo, T. R.; Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1986, 84, 6539-49.
46. Wu, Y. R.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1989, 97, 5278-5284.
47. Connell, L. L.; Corcoran, T. C.; Joireman, P. W.; Felker, P. M. Chem. Phys. Lett. 1990, 766, 510-516.
48. Snoek, L. C.; Robertson, E. G.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Chem. Phys. Lett. 2000, 321, 49-56.
49. Dian, B. C.; Longarte-Aldamo, A.; Mercier, S.; Zwier, T. S. Unpublished results.
50. Korter, T. M.; Pratt, D. W.; Kupper, J. J. Phys. Chem. A 1998, 702,7211-7216.
51. Neusser, H. J.; Siglow, K. Chem. Rev. 2000, 700, 3921-3942.
52. Mons, M.; Dimicoli, I.; Tardivel, B.; Piuzzi, F.; Brenner, V.; Millie, P. J. Phys. Chem. A 1099, 103, 9958-9965.
53. Carney, J. R.; Hagemeister, F. C.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 1998, 70S, 3379-3382.
54. Carney, J. R.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 1999, 705, 9943-9957.
55. Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Phys. Chem. 1988, 92, 6554-61.
56. Huang, Y.; Sulkes, M. J. Phys. Chem. 1996, 700, 16749-16486.
57. Frost, R. K.; Hagemeister, F. C.; Arlington, C. A.; Schleppenbach, D.; Zwier, T. S.; Jordan, K. D. J. Chem. Phys. 1996, 105, 2605-17.
58. Sekiya, H.; Hamabe, H.; Ujita, H.; Nakano, N.; Nishimura, Y. Chem. Phys. Lett. 1996, 255, 437-444.
59. Dickinson, J. A.; Hockridge, M. R.; Robertson, E. G.; Simons, J. P. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 6938-6949.
60. Dickinson, J. A.; Hockridge, M. R.; Robertson, E. G.; Simons, J. P. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 6938-6949.
61. Fedorov, A. V.; Cable, J. R. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 49434952.
62. Mons, M.; Dimicoli, I.; Tardivel, B.; Piuzzi, F.; Robertson, E. G.; Simons, J. P. J. Phys. Chem. A 2001, 705, 969-973.
63. Carney, J. R.; Zwier, T. S.; Fedorov, A.; Cable, J. R. Unpublished results.
64. Bach, A.; Coussan, S.; Muller, A.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9032-9043.
65. Bach, A.; Leutwyler, S. Chem. Phys. Lett. 1999, 299, 381-388.
66. Bach, A.; Coussan, S.; Muller, A.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2000, 112, 1192-1203.
67. Robertson, E. G. Chem. Phys. Lett. 2000, 325, 299-307.
68. Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 1994, 700, 7523.
69. Fredericks, S.; Jordan, K. D.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. 1996, 700, 7810-7821.
70. Hatherley, L. D.; Brown, R. D.; Godfrey, P. D.; Pierlot, A. P.; Caminati, W.; Damiani, D.; Melandri, S.; Favero, L. B. J. Phys. Chem. 1993,97,46-51.
71. Held, A.; Pratt, D. W. J. Am. Chem. Soc. 1993, 775, 9708-17.
72. Matsuda, Y.; Ebata, T.; Mikami, N. J. Chem. Phys. 1999, 770, 8397-8407.
73. Florio, G. M.; Gruenloh, C. J.; Quimpo, R. C.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 2000, 775, 11143-11153.
74. Carney, J. R.; Zwier, T. S.; Fedorov, A. V.; Cable, J. R. J. Phys. Chem. A 2001, 705, 3487-3497.
75. Engdahl, A.; Nelander, B. J. Chem. Phys. 1989, 91, 6604-6612.
76. Stockman, P. A.; Bumgarner, R. E.; Suzuki, S.; Blake, G. A. J. Chem. Phys. 1992, 96, 2496-2510.
77. Fedorov, A.; Camey, J. R.; Cable, J. R.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A In press.
78. Guelachvili, G.; Abdullah, A. H.; Tu, N.; Rao, K. N.; Urban, S. J. Mol. Spectrosc. 1989, 133, 345.
79. Carney, J. R.; Dian, B. C.; Florio, G. M.; Zwier, T. S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 725, 5596-5597.
80. Bach, A.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2000, 772, 560-565.
81. Matsuda, Y.; Ebata, T.; Mikami, N. J. Chem. Phys. 2000, 775,573580.
82. Borst, D. R.; Florio, G. M.; Muller, A.; Pratt, D. W.; Zwier, T. S.; Leutwyler, S. In preparation.
83. Connell, L. L. Structural Studies of Hydrogen-bonded Clusters using Rotational Coherence Spectroscopy. University of California at Los Angeles, 1991.
84. Cable, J. R.; Tubergen, M. J.; Levy, D. H. / Am. Chem. Soc. 1988, 770, 7349-55.
85. Li, L.; Lubman, D. M. Rev. Sei. Instrum. 1988, 59, 557.
86. Meijer, G.; de Vries, M. S.; Hunziker, H. R; Wendt, H. R. Appl. Phys. B 1990, 57, 395-403.
87. Piuzzi, F.; Dimicoli, I,; Mons, M.; Tardivel, B.; Zhao, Q. Chem. Phys. Lett. 2000, 320, 282.
88. de Vries, M. S. Rev. Anal. Chem. 2000, 79, 269-287.
89. Mitsui, M.; Ohshima, Y. J. Phys. Chem. A 2000,104,8638-8648.
90. Mitsui, M.; Ohshima, Y.; Kajimoto, O. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 8660-8670.
91. Florio, G. M.; Sibert, E. L., III; Zwier, T. S. Faraday Discuss. 2001, 77S. In press.
92. Mir, E.; Kleinermanns, K.; de Vries, M. S.; Nature 2000,408,949951.
93. Nir, E.; Imhof, P.; Kleinermanns, K.; de Vries, M. S.; J. Am. Chem. Soc. 2000, 722, 8091-8092.
94. Cohen, R.; Brauer, B.; Nir, E.; Grace, L.; de Vries, M. S.; J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6351-6355.
95. Florio, G. M.; Zwier, T. S. In preparation.