Structures and isomerization of neutral and zwitterion serine-water clusters: Computational study

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 101, Issue 1, 2005, Pages 55-66

  Jeon, I N Sun ^a   Ahn, Doo Sik ^a   Park, Sung Woo ^a   Lee, Sungyul ^a   Kim, Bongsoo ^b  

^a Kyung Hee University   (South Korea)

^b Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

Author keywords

Clusters; conformers; Isomerization; Serine (h2o)n; Serine zwitterion (h2o) n

Indexed keywords

BIOCHEMISTRY; CONFORMATIONS; HYDROGEN BONDS; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR STRUCTURE; PHYSICAL CHEMISTRY; POLARIZATION; REACTION KINETICS;

CLUSTERS; CONFORMERS; SERINE-(H2O)N; SERINE-ZWITTERION-(H2O)N;

ISOMERIZATION;

EID: 10044232671     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.20269     Document Type: Article

References (46)

1. Zwier, T. S. J Phys Chem A 2001, 105, 8827.
2. Shishkin, O. V.; Sukhanov, O. S.; Gorb, L.; Leszczynski, J. Phys Chem Chem Phys 2002, 4, 5359.
3. Robertson, E. G.; Simons, J. P. Phys Chem Chem Phys 2001, 3, 1.
4. Sicinska, D.; Paneth, P.; Truhlar, D. G. J Phys Chem B 2002, 124, 13257.
5. Scheiner, S.; Kar, T.; Pattanayak, J. J Am Chem Soc 2002, 124, 13257.
6. Schutz, M.; Burgi, T.; Leutwyler, S.; Fischer, T. J Chem Phys 1993, 98, 3763.
7. Kim, N. J.; Kang, H.; Jeong, G.; Kim, Y. S.; Lee, K. T.; Kim, S. K. J Phys Chem A 2001, 104, 6552.
8. Ahn, D.-S.; Park, S.-W.; Jeon, I.-S.; Lee, S. Bull Korean Chem Soc (in press).
9. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem Rev 1999, 99, 2161, and references therein.
10. Cappelli, C.; Mennucci, B.; da Silva, C. O.; Tomasi, J. J Chem Phys 2000, 112, 5382.
11. Bandyopadhyay, P.; Gordon, M. S.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J Chem Phys 2002, 116, 5023.
12. Tortonda, F. R.; Pascual-Ahuir, J. L.; Silla, E.; Tunon, I. Chem Phys Lett 1996, 260, 21; J Chem Phys 1998, 109, 592.
13. Tortonda, F. R.; Pascual-Ahuir, J. L.; Silla, E.; Tunon, I. Chem Phys Lett 1996, 260, 21; J Chem Phys 1998, 109, 592.
14. Tortonda, F. R.; Silla, E.; Tunon, I.; Rinaldi, D.; Ruiz-Lopez, M. F. Theor Chem Ace 2000, 104, 89.
15. Tunon, I.; Silla, E.; Ruiz-Lopez, M. F. Chem Phys Lett 2000, 321, 433.
16. Ellzy, W. E.; Jensen, J. O.; Hameka, H. F.; Kay, J. G. Spectrochim Acta Part A 2001, 59, 2619.
17. Lee, K. T.; Sung, J.; Lee, K. J.; Kim, S. K.; Park, Y. D. J Chem Phys 2002, 116, 8251.
18. Lee, K. T.; Sung, J.; Lee, K. J.; Kim, S. K.; Park, Y. D. Chem Phys Lett 2003, 368, 262.
19. Phillips, L. A.; Levy, D. H. J Chem Phys 1986, 90, 4921.
20. Fleming, G. R.; Levy, D. H. J Am Chem Soc 1988, 110, 1352.
21. Snoek, L. C.; Kroemer, R. T.; Hockridge, M. R.; Simons, J. P. Phys Chem Chem Phys 2001, 3, 1819; Snoek, L. C.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Phys Chem Chem Phys 2001, 4, 2130.
22. Snoek, L. C.; Kroemer, R. T.; Hockridge, M. R.; Simons, J. P. Phys Chem Chem Phys 2001, 3, 1819; Snoek, L. C.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Phys Chem Chem Phys 2001, 4, 2130.
23. Snoek, L. C.; Robertson, E. G.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Chem Phys Lett 2000, 321, 49.
24. Spinor, J.; Sulkes, M. J Chem Phys 1993, 98, 9389.
25. Csaszar, A. G.; Perczel, A.; Prog Biophys Mol Biol 1999, 71, 243.
26. Csaszar, A. G. J Phys Chem 1996, 100, 3541.
27. Godfrey, P. D.; Firth, S.; Heatherley, L. D.; Brown, R. D.; Pierlot, A. P. J Am Chem Soc 1993, 115, 9687.
28. Park, S.-W.; Ahn, D.-S.; Lee, S. Chem Phys Lett 2003, 371, 74.
29. Gao, X.; Fischer, G. J Phys Chem A 1999, 103, 4404.
30. Gao, X.; Fischer, G. Spectrochim Acta 1999, 55, 2329.
31. Gordon, H. L.; Jarrell, H. C.; Szabo, A. G.; Willis, K. J.; Somorjai, R. L. J Phys Chem 1992, 96, 1915.
32. Hu, C. H.; Shen, M.; Schafer III, H. F. J Am Chem Soc 1993, 115, 2923.
33. Bonaccorsi, R.; Palla, P.; Tomasi, J. J Am Chem Soc 1984, 106, 1945.
34. Kassab, E.; Langtet, J.; Evieth, E.; Akacem, Y. J Mol Struct (Theochem) 2000, 531, 267.
35. Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J Am Chem Soc 1995, 117, 8159.
36. Ahn, D.-S.; Park, S.-W.; Jeon, I.-S.; Lee, M.-K.; Kim, N.-H.; Han, Y.-H. ; Lee, S. J Phys Chem B 2003, 107, 14109.
37. Berg, J. M.; Tymoczko, J. L.; Stryer, L. Biochemistry, 5th ed.; W. H. Freeman: San Francisco, 2002.
38. Gronert, S.; O'Hair, R. A. J. J Am Chem Soc 1995, 117, 2071.
39. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheesemarv, J. R.; Keith, T. A.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; J. A. Pople, J. A. Gaussian: Pittsburgh, PA, 1995.
40. Albrecht, G.; Corey, R. B. J Am Chem Soc 1939, 61, 1087.
41. Ding, Y.; Krogh-Jespersen, K. Chem Phys Lett 1992, 199, 261.
42. Jonsson, P. G.; Kvick, A. Acta Crystallogr Sect B 1972, 28, 1827.
43. Xu, S.; Niles, J. M.; Bowen, K. H. J Chem Phys 2003, 119, 10696.
44. Agmon, N. Chem Phys Lett 1995, 244, 456.
45. Toba, S.; Colombo, G.; Merz, K. M. J Am Chem Soc 1999, 121, 2290.
46. Park, S. T.; Kim, S. K.; Kim, M. S. Nature (London) 2002, 415, 306.