A direct-dynamics study of the zwitterion-to-neutral interconversion of glycine in aqueous solution

Journal of Chemical Physics

Volumn 113, Issue 21, 2000, Pages 9714-9721

  Fernández Ramos, Antonio ^a   Smedarchina, Zorka ^a   Siebrand, Willem ^a   Zgierski, Marek Z ^a  

^a NATIONAL RESEARCH COUNCIL CANADA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLYCEROL; MOLECULAR VIBRATIONS; MOLECULES; SOLUTIONS; WATER;

GLYCINE; SECOND ORDER MOLLER-PLESSET FROZEN CORE LEVEL; ZWITTERION TO NEUTRAL INTERCONVERSION;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0034500303     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (50)

1. M. Sheinblatt and H. S. Gutowsky, J. Am. Chem. Soc. 86, 4818 (1964).
2. K. C. Chang and E. Grunwald, J. Phys. Chem. 80, 1422 (1976).
3. E. Grunwald, K. C. Chang, P. L. Skipper, and V. K. Anderson, J. Phys. Chem. 80, 1425 (1976).
4. G. Wada, E. Tamura, M. Okina, and M. Nakamura, Bull. Chem. Soc. Jpn. 55, 3064 (1982).
5. J. H. Jensen and M. S. Gordon, J. Am. Chem. Soc. 117, 8159 (1995).
6. Y. Ding and K. Krogh-Jespersen, J. Comput. Chem. 17, 338 (1996).
7. R. Bonaccorsi, P. Palla, and J. Tomasi, J. Am. Chem. Soc. 106, 1945 (1984).
8. F. R. Tortonda, J. L. Pascual-Ahuir, E. Silla, and I. Tuñón, Chem. Phys. Lett. 260, 21 (1996).
9. T. N. Truong and E. V. Stefanovich, J. Chem. Phys. 103, 3709 (1995).
10. J. Andzelm, C. Kolmel, and A. Klamt, J. Chem. Phys. 103, 9312 (1995).
11. F. R. Tortonda, J. L. Pascual-Ahuir, E. Silla, I. Tuñón, and F. J. Ramírez, J. Chem. Phys. 109, 592 (1998).
12. M. Nagoaka, N. Okuyama-Yoshida, and T. J. Yamabe, J. Phys. Chem. A 102, 8202 (1998).
13. I. Tuñón, E. Silla, C. Millot, M. T. .C. Martíns-Costa, and M. F. Ruíz-López, J. Phys. Chem. A 102, 8673 (1998).
14. H. S. Rzepa and M. Y. Yi, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2, 531 (1991).
15. Z. Smedarchina, W. Siebrand, A. Fernández-Ramos, L. Gorb, and J. Leszczynski, J. Chem. Phys. 112, 566 (2000).
16. W. Siebrand, Z. Smedarchina, M. Z. Zgierski, and A. Fernández-Ramos, Int. Rev. Phys. Chem. 18, 5 (1999).
17. A. Fernández-Ramos, Z. Smedarchina, M. Z. Zgierski, and W. Siebrand, J. Chem. Phys. 109, 1004 (1998).
18. Z. Smedarchina, M. Z. Zgierski, W. Siebrand, and P. M. Kozlowski, J. Chem. Phys. 109, 1014 (1998).
19. V. A. Benderskii, V. I. Goldanskii, and D. E. Makarov, Phys. Rep. 233, 195 (1993).
20. V. A. Benderskii, D. E. Makarov, and C. H. Wight, Adv. Chem. Phys. 88, 1 (1994).
21. Z. Smedarchina, A. Fernández-Ramos, M. Z. Zgierski, and W. Siebrand, DOIT 1.2, a computer program to calculate hydrogen tunneling rate constants and splittings, National Research Council of Canada, to be released.
22. GAUSSIAN 98, Revision A.3, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, Jr., R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, J. A. Pople, Gaussian Inc., Pittsburgh, PA (1998).
23. M. W. Wong, K. B. Wiberg, and M. J. Frisch, J. Chem. Phys. 95, 8991 (1991).
24. M. W. Wong, M. J. Frisch, and K. B. Wiberg, J. Am. Chem. Soc. 113, 4776 (1991).
25. L. Onsager, J. Am. Chem. Soc. 58, 1486 (1936).
26. A. P. Scott and L. Radom, J. Phys. Chem. 100, 16502 (1996).
27. K. Furić, V. Mohaček, M. Bonifačić, and I. Štefanić, J. Mol. Struct. 267, 39 (1992).
28. C. Møller and M. S. Plesset, Phys. Rev. 46, 618 (1934).
29. J. A. Pople, M. Head-Gordon, and K. Raghavachari, J. Chem. Phys. 89, 7382 (1988).
30. I. Affleck, Phys. Rev. Lett. 46, 388 (1981).
31. R. P. Feynman and A. R. Hibbs, Quantum Mechanics and Path Integrals (McGraw-Hill, New York, 1965).
32. V. A. Benderskii, D. E. Makarov, D. L. Pastur, and P. G. Grinevich, Chem. Phys. 161, 51 (1992).
33. V. A. Benderskii, D. E. Makarov, and P. G. Grinevich, Chem. Phys. 170, 275 (1993).
34. D. G. Truhlar, B. C. Garrett, and S. J. Klippenstein, J. Phys. Chem. 100, 12771 (1996).
35. V. A. Benderskii, V. I. Goldanskii, and D. E. Makarov, Chem. Phys. 154, 407 (1991).
36. Z. Smedarchina, W. Siebrand, and M. Z. Zgierski, J. Chem. Phys. 104, 1203 (1996).
37. A. Fernández-Ramos, Z. Smedarchina, W. Siebrand, M. Z. Zgierski, and M. A. Rios, J. Am. Chem. Soc. 121, 6280 (1999).
38. J. O'M. Bockris and S.U.M. Khan, Quantum Electrochemistry (Plenum, New York, 1979).
39. (a) E. Lippert, Z. Naturforsch A 10, 541 (1955);
40. (b) Z. Elektrochem. 61, 962 (1957);
41. (c) N. Mataga, Y. Kaifu, and M. Koizumi, Bull. Chem. Soc. Jpn. 28, 690 (1955);
42. (d) N. Mataga, Y. Kaifu, and N. Koizumi, Bull. Chem. Soc. Jpn. ibid. 29, 465 (1956).
43. R. A. Marcus, J. Chem. Phys. 24, 966 (1956).
44. N. S. Hush, Trans. Faraday Soc. 57, 557 (1961).
45. D. Gerritsen and H.-H. Limbach, J. Am. Chem. Soc. 106, 869 (1984).
46. J. N. Earnhardt and D. N. Silverman, in Comprehensive Biological Catalysis, edited by M. Sinnott (Academic, New York, 1998), p. 483.
47. D. W. Christianson and C. A. Fierke, Acc. Chem. Res. 29, 331 (1996), and references therein.
48. S. Lindskog, Pharmacol. Ther. 74, 1 (1997).
49. H. Steiner, B. H. Jonsson, and S. Lindskog, Eur. J. Biochem. 59, 253 (1975).
50. D. Lu and G. A. Voth, J. Am. Chem. Soc. 120, 4006 (1998).