Single molecule fluorescence under conditions of fast flow

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 1, 2012, Pages 179-185

  Horrocks, Mathew H ^a   Li, Haitao ^a   Shim, Jung Uk ^a   Ranasinghe, Rohan T ^a   Clarke, Richard W ^a   Huck, Wilhelm T S ^a   Abell, Chris ^a   Klenerman, David ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTES; AT-SPEED; COINCIDENCE DETECTION; CONFOCAL FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; CONFOCAL VOLUME; DYNAMIC RANGE; EXCITATION IRRADIANCE; MICRO-FLUIDIC DEVICES; MOLECULE COUNTING; OPTIMAL FLOW VELOCITY; OPTIMIZED CONDITIONS; ORDERS OF MAGNITUDE; PHOTOPHYSICAL PROCESS; RESIDENCE TIME; RESONANCE ENERGY TRANSFER; SINGLE MOLECULE; SINGLE MOLECULE FLUORESCENCE; STATISTICAL CONFIDENCE; STRUCTURAL CHARACTERIZATION; TWO-COLOR;

COINCIDENCE CIRCUITS; ENERGY TRANSFER; FLOW VELOCITY; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; MOLECULES; OPTIMIZATION;

CHEMICAL ANALYSIS;

ARTICLE; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; MICROFLUIDICS;

FLUORESCENCE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; MICROFLUIDICS;

EID: 84855391797     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac202313d     Document Type: Article

References (46)

1. Cornish, P. V.; Ha, T. ACS Chem. Biol. 2007, 2, 53-61
2. Dittrich, P. S.; Schwille, P. Appl. Phys. B: Lasers Opt. 2001, 73, 829-837
3. Levene, M. J.; Korlach, J.; Turner, S. W.; Foquet, M.; Craighead, H. G.; Webb, W. W. Science 2003, 299, 682-686
4. Nguyen, D. C.; Keller, R. A.; Jett, J. H.; Martin, J. C. Anal. Chem. 1987, 59, 2158-2161
5. Dovichi, N. J.; Martin, J. C.; Jett, J. H.; Trkula, M.; Keller, R. A. Anal. Chem. 1984, 56, 348-354
6. Barnes, M. D.; Lermer, N.; Kung, C. K.; Whitten, W. B.; Ramsey, J. M.; Hill, S. C. Opt. Lett. 1997, 22, 1265-1267
7. Lipman, E. A.; Schuler, B.; Bakajin, O.; Eaton, W. A. Science 2003, 301, 1233-1235
8. Gambin, Y.; VanDelinder, V.; Ferreon, A. C. M.; Lemke, E. A.; Groisman, A.; Deniz, A. A. Nat. Methods 2011, 8, 239-241
9. Kim, S.; Streets, A. M.; Lin, R. R.; Quake, S. R.; Weiss, S.; Majumdar, D. S. Nat. Methods 2011, 8, 242-245
10. Lemke, E. A.; Gambin, Y.; Vandelinder, V.; Brustad, E. M.; Liu, H. W.; Schultz, P. G.; Groisman, A.; Deniz, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13610-13612
11. Chao, S. Y.; Ho, Y. P.; Bailey, V. J.; Wang, T. H. J. Fluoresc. 2007, 17, 767-774
12. Goodwin, P. M.; Johnson, M. E.; Martin, J. C.; Ambrose, W. P.; Marrone, B. L.; Jett, J. H.; Keller, R. A. Nucleic Acids Res. 1993, 21, 803-806
13. Larson, E. J.; Hakovirta, J. R.; Cai, H.; Jett, J. H.; Burde, S.; Keller, R. A.; Marrone, B. L. Cytometry 2000, 41, 203-208
14. Foquet, M.; Korlach, J.; Zipfel, W. R.; Webb, W. W.; Craighead, H. G. Anal. Chem. 2004, 76, 1618-1626
15. Anazawa, T.; Matsunaga, H.; Yeung, E. S. Anal. Chem. 2002, 74, 5033-5038
16. Okagbare, P. I.; Soper, S. A. Analyst 2009, 134, 97-106
17. Mathies, R.; Oseroff, A. R.; Stryer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1976, 73, 1-5
18. Wang, G. R. Lab Chip 2005, 5, 450-456
19. Clarke, R. W.; Orte, A.; Klenerman, D. Anal. Chem. 2007, 79, 2771-2777
20. Vukojevic, V.; Heidkamp, M.; Ming, Y.; Johansson, B.; Terenius, L.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 18176-18181
21. Eggeling, C.; Widengren, J.; Rigler, R.; Seidel, C. A. M. Anal. Chem. 1998, 70, 2651-2659
22. White, S. S.; Li, H.; Marsh, R. J.; Piper, J. D.; Leonczek, N. D.; Nicolaou, N.; Bain, A. J.; Ying, L.; Klenerman, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 11423-11432
23. Chung, H. S.; Louis, J. M.; Eaton, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 11837-11844
24. Orte, A.; Clarke, R.; Balasubramanian, S.; Klenerman, D. Anal. Chem. 2006, 78, 7707-7715
25. Sia, S. K.; Whitesides, G. M. Electrophoresis 2003, 24, 3563-3576
26. Kong, X.; Nir, E.; Hamadani, K.; Weiss, S. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4643-4654
27. Li, H.; Ying, L. M.; Green, J. J.; Balasubramanian, S.; Klenerman, D. Anal. Chem. 2003, 75, 1664-1670
28. Orte, A.; Clarke, R. W.; Klenerman, D. Anal. Chem. 2008, 80, 8389-8397
29. Alves, D.; Li, H. T.; Codrington, R.; Orte, A.; Ren, X. J.; Klenerman, D.; Balasubramanian, S. Nat. Chem. Biol. 2008, 4, 287-289
30. Schuler, B.; Lipman, E. A.; Eaton, W. A. Nature 2002, 419, 743-747
31. Deniz, A. A.; Laurence, T. A.; Beligere, G. S.; Dahan, M.; Martin, A. B.; Chemla, D. S.; Dawson, P. E.; Schultz, P. G.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5179-5184
32. Chen, D.; Dovichi, N. J. Anal. Chem. 1996, 68, 690-696
33. Gopich, I.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 014707
34. Werner, J. H.; McCarney, E. R.; Keller, R. A.; Plaxco, K. W.; Goodwin, P. M. Anal. Chem. 2007, 79, 3509-3513
35. Kalinin, S.; Sisamakis, E.; Magennis, S. W.; Felekyan, S.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 6197-6206
36. Castro, A.; Williams, J. G. K. Anal. Chem. 1997, 69, 3915-3920
37. Cipriany, B. R.; Zhao, R. Q.; Murphy, P. J.; Levy, S. L.; Tan, C. P.; Craighead, H. G.; Soloway, P. D. Anal. Chem. 2010, 82, 2480-2487
38. Huang, B.; Wu, H. K.; Bhaya, D.; Grossman, A.; Granier, S.; Kobilka, B. K.; Zare, R. N. Science 2007, 315, 81-84
39. Wang, T.-H.; Peng, Y.; Zhang, C.; Wong, P. K.; Ho, C.-M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5354-5359
40. Agrawal, A.; Zhang, C.; Byassee, T.; Tripp, R. A.; Nie, S. Anal. Chem. 2006, 78, 1061-1070
41. Földes-Papp, Z.; Kinjo, M.; Tamura, M.; Birch-Hirschfeld, E.; Demel, U.; Tilz, G. P. Exp. Mol. Pathol. 2005, 78, 177-189
42. Ren, X.; Li, H.; Clarke, R. W.; Alves, D. A.; Ying, L.; Klenerman, D.; Balasubramanian, S. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4992-5000
43. Clarke, R. W.; Monnier, N.; Li, H.; Zhou, D.; Browne, H.; Klenerman, D. Biophys. J. 2007, 93, 1329-1337
44. Orte, A.; Birkett, N. R.; Clarke, R. W.; Devlin, G. L.; Dobson, C. M.; Klenerman, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 14424-14429
45. Stavis, S. M.; Edel, J. B.; Samiee, K. T.; Craighead, H. G. Lab Chip 2005, 5, 337-343
46. Liu, K. J.; Wang, T.-H. Biophys. J. 2008, 95, 2964-2975