Focal Volume Confinement by Submicrometer-Sized Fluidic Channels

Analytical Chemistry

Volumn 76, Issue 6, 2004, Pages 1618-1626

  Foquet, Mathieu ^a   Korlach, Jonas ^a,b   Zipfel, Warren R ^a   Webb, Watt W ^a,b   Craighead, Harold G ^a  

^a Department of Materials Science and Engineering   (United States)

^b Department of Population Medicine and Diagnostic Sciences   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHANNEL FLOW; DIFFUSION; FLUORESCENCE; FUSED SILICA; SIGNAL TO NOISE RATIO; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

SINGLE-MOLECULE DETECTION;

FLUIDIC DEVICES;

ARTICLE; CHANNEL GATING; DIFFUSION; FLUORESCENCE CORRELATION SPECTROSCOPY; GEOMETRY; MOLECULAR DYNAMICS;

KINETICS; MICROCHEMISTRY; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; MODELS, THEORETICAL; PARTICLE SIZE; PHOTONS; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 1542723103     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac035088o     Document Type: Article

References (56)

1. Rigler, R.; Elson, E. Fluorescence correlation spectroscopy: theory and applica tions; Springer: Berlin, 2001.
2. Hess, S. T.; Huang, S.; Heikal, A. A.; Webb, W. W. Biochemistry 2002, 41 697-705.
3. Krichevsky, O.; Bonnet, G. Rep. Prog. Phys. 2002, 65, 251-297.
4. Medina, M. A.; Schwille, P. Bioessays 2002, 24, 758-764.
5. Adachi, K.; Noji, H.; Kinosita, K., Jr. Methods Enzymol 2003, 361, 211-227.
6. Clausen-Schaumann, H.; Seltz, M.; Krautbauer, R.; Gaub, H. E. Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 524-530.
7. Edman, L.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8266-8271.
8. Zhuang, X.; Kim, H.; Pereira, M. J.; Babcock, H. P.; Walter, N. G.; Chu, S. Science 2002, 296, 1473-1476.
9. Xie, X. S.; Lu, H. P. J. Biol. Chem. 1999, 274, 15967-15970.
10. Xie, S. N. Single Mol. 2001, 2, 229-236.
11. Schuler, B.; Lipman, E. A.; Eaton, W. A. Nature 2002, 419, 743-747.
12. Zander, C.; Enderlein, J.; Keller, R. A. Single molecule detection in solution: methods and applications; Wiley-VCH Berlin, 2002.
13. Castro, A.; Shera, E. B. Appl. Opt. 1995, 34, 3218-3222.
14. Keller, R. A.; Ambrose, W. P.; Arias, A. A.; Cai, H.; Emory, S. R.; Goodwin, P. M.; Jett, J. H. Anal. Chem. 2002, 74, 316A-324A.
15. Vercoutere, W.; Akeson, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 816-822.
16. Barnes, M. D.; Whitten, W. B.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1995, 67, A418-A423.
17. Fan, F. R. F.; Kwak, J.; Bard, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 9669-9675.
18. Lermer, N.; Barnes, M. D.; Kung, C. Y.; Whitten, W. B.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1997, 69, 2115-2121.
19. Moerner, W. E.; Orrit, M. Science 1999, 283, 1670-1676.
20. Feder, T. J.; BrustMascher, I.; Slattery, J. P.; Baird, B.; Webb, W. W. Biophys. J. 1996, 70, 2767-2773.
21. Ghosh, R. N.; Webb, W. W. Biophys. J. 1994, 66, 1301-1318.
22. Barak, L. S.; Webb, W. W. J. Cell Biol. 1981, 90, 595-604.
23. Koppel, D. E.; Axelrod, D.; Schlessinger, J.; Elson, E. L.; Webb, W. W. Biophys. J. 1976, 16, 1315-1329.
24. Thompson, N. L.; Burghardt, T. P.; Axelrod, D. Biophys. J. 1981, 33, 435-454.
25. Mertz, J.; Xu, C.; Webb, W. W. Opt. Lett. 1995, 20, 2532-2534.
26. Betzig, E.; Chichester, R. J. Science 1993, 262, 1422-1425.
27. Klar, T. A.; Jakobs, S.; Dyba, M.; Egner, A.; Hell, S. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8206-8210.
28. Laurence, T. A.; Weiss, S. Science 2003, 299, 667-668.
29. Levene, M.; Korlach, J.; Turner, S. W.; Foquet, M.; Craighead, H. G.; Webb, W. W. Science 2003, 299, 682-686.
30. Gosch, M.; Blom, H.; Holm, J.; Heino, T.; Rigler, R. Anal. Chem. 2000, 72, 3260-3265.
31. Dörre, K.; Stephan, J.; Eigen, M. Single Mol. 2001, 2, 165-175.
32. Sauer, M.; Angerer, B.; Ankenbauer, W.; Földes-Papp, Z.; Göbel, F.; Han, K. T.; Rigler, R.; Schulz, A.; Wolfrum, J.; Zander, C. J. Biotechnol. 2001, 86, 181-201.
33. Han, J.; Craighead, H. G. Science 2000, 288, 1026-1029.
34. Zander, C.; Drexhage, K. H.; Han, K. T.; Wolfrum, J.; Sauer, M. Chem. Phys. Lett. 1998, 286, 457-465.
35. Craighead, H. G. Science 2000, 290, 1532-1536.
36. Reyes, D. R.; Iossifidis, D.; Auroux, P. A.; Manz, A. Anal. Chem. 2002, 74, 623-2636.
37. Auroux, P. A.; Iossifidis, D.; Reyes, D. R.; Manz, A. Anal. Chem. 2002, 74, 637-2652.
38. McKnight, T. E.; Culbertson, C. T.; Jacobson, S. C.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 2001, 73, 4045-4049.
39. Turner, S. W.; Cabodi, M.; Craighead, H. G. Phys. Rev. Lett. 2002, 88, 128103.
40. Chou, C. F.; Bakajin, O.; Turner, S. W.; Duke, T. A.; Chan, S. S.; Cox, E. C.; Craighead, H. G.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 13762-13765.
41. Gennerich, A.; Schild, D. Biophys. J. 2000, 79, 3294-3306.
42. Gennerich, A.; Schild, D. Biophys. J. 2002, 83, 510-522.
43. Foquet, M.; Korlach, J.; Zipfel, W. R.; Webb, W. W.; Craighead, H. G. Anal. Chem. 2002, 74, 1415-1422.
44. Rigler, R.; Mets, U.; Widengren, J.; Kask, P. Eur. Biophys. J. Biophys. Lett. 1993, 22, 169-175.
45. Magde, D.; Webb, W. W.; Elson, E. Phys. Rev. Lett. 1972, 29, 705-708.
46. Elson, E. L.; Magde, D. Biopolymers 1974, 13, 1-27.
47. Turner, S. W.; Perez, A. M.; Lopez, A.; Craighead, H. G. J. Vac. Sci. Technol., B 1998, 16, 3835-3840.
48. Starr, T. E.; Thompson, N. L. Biophys. J. 2001, 80, 1575-1584.
49. Huang, X. C.; Quesada, M. A.; Mathies, R. A. Anal. Chem. 1992, 64, 2149-2154.
50. Kameoka, J.; Orth, R.; Ilic, B.; Czaplewski, D.; Wachs, T.; Craighead, H. G. Anal. Chem. 2002, 74, 5897-5901.
51. Ehrfeld, W.; Hartmann, H.-J.; Hessel, V.; Kiesewalter, S.; Löwe, H. Micro Total Analysis Systems 2000, Kluwer Academic: Dordrecht, The Netherlands, 2000; pp 33-40.
52. Anazawa, T.; Matsunaga, H.; Yeung, E. S. Anal. Chem. 2002, 74, 5033-5038.
53. Larson, E. J.; Hakovirta, J. R.; Cai, H.; Jett, J. H.; Burde, S.; Keller, R. A.; Marrone, B. L. Cytometry 2000, 41, 203-208.
54. Zhang, S.; Neil, G.; Shinn, M. Opt. Express 2003, 11, 1942-1948.
55. Hoffnagle, J. A.; Jefferson, C. M. Appl. Opt. 2000, 39, 5488-5499.
56. Roos, P.; Skinner, C. D. Analyst 2003, 128, 527-531.