Formation of sequence-independent Z-DNA induced by a ruthenium complex at low salt concentrations

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 50, Issue 50, 2011, Pages 11962-11967

  Wu, Zhiguo ^a   Tian, Tian ^a   Yu, Junping ^b,c   Weng, Xiaocheng ^a   Liu, Yi ^a   Zhou, Xiang ^a,d  

^a BEIJING UNIVERSITY OF POSTS AND TELECOMMUNICATIONS   (China)

^b WUHAN UNIVERSITY   (China)

^c WUHAN INSTITUTE OF VIROLOGY   (China)

^d PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

circular dichroism; DNA structures; intercalation; nucleotides; ruthenium

Indexed keywords

2D-NMR SPECTROSCOPY; AFM; DNA STRUCTURES; GEL ELECTROPHORESIS; ISOTHERMAL TITRATION CALORIMETRY; LOW SALT CONCENTRATION; RUTHENIUM COMPLEXES;

DICHROISM; DNA; ELECTROPHORESIS; INTERCALATION; METAL COMPLEXES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; NUCLEOTIDES; RUTHENIUM;

RUTHENIUM COMPOUNDS;

COORDINATION COMPOUND; DNA; DNA Z; RUTHENIUM; SODIUM CHLORIDE;

ARTICLE; CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; CONFORMATION; HELA CELL; HUMAN; METABOLISM;

CIRCULAR DICHROISM; COORDINATION COMPLEXES; DNA; DNA, Z-FORM; HELA CELLS; HUMANS; NUCLEIC ACID CONFORMATION; RUTHENIUM; SODIUM CHLORIDE;

EID: 83455176806     PISSN: 14337851     EISSN: 15213773     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.201104422     Document Type: Article

References (56)

1. A. H. Wang, G. J. Quigley, F. J. Kolpak, J. L. Crawford, J. H. van Boom, G. van der Marel, A. Rich, Nature 1979, 282, 680-686.
2. T. Schwartz, M. A. Rould, K. Lowenhaupt, A. Herbert, A. Rich, Science 1999, 284, 1841-1845.
3. T. Schwartz, J. Behlke, K. Lowenhaupt, U. Heinemann, A. Rich, Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 761-765.
4. Y. G. Kim, M. Muralinath, T. Brandt, M. Pearcy, K. Hauns, K. Lowenhaupt, B. L. Jacobs, A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 6974-6979.
5. B. Wittig, S. Wolfl, T. Dorbic, W. Vahrson, A. Rich, EMBO J. 1992, 11, 4653-4663.
6. T. A. Brandt, B. L. Jacobs, J. Virol. 2001, 75, 850-856.
7. B. K. Ray, S. Dhar, A. Shakya, A. Ray, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, 103-108.
8. R. Liu, H. Liu, X. Chen, M. Kirby, P. O. Brown, K. Zhao, Cell 2001, 106, 309-318.
9. R. Z. Cer, K. H. Bruce, U. Mudunuri, M. Yi, N. Volfovsky, B. T. Luke, A. Bacolla, J. R. Collins, R. M. Stephens, Nucleic Acids Res. 2011, 39, D 383 -D 391.
10. R. M. Walmsley, J. W. Szostak, T. D. Petes, Nature 1983, 302, 84-86.
11. V. Muller, M. Takeya, S. Brendel, B. Wittig, A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 780-784.
12. S. C. Ha, J. K. Choi, H. Y. Hwang, A. Rich, Y. G. Kim, K. K. Kim, Nucleic Acids Res. 2009, 37, 629-637.
13. A. H. Wang, T. Hakoshima, G. van der Marel, J. H. van Boom, A. Rich, Cell 1984, 37, 321-331.
14. M. J. Ellison, J. Feigon, R. J. Kelleher, H. J. Wang, J. F. Habener, A. Rich, Biochemistry 1986, 25, 3648-3655.
15. J. Hizver, H. Rozenberg, F. Frolow, D. Rabinovich, Z. Shakked, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 8490-8495.
16. A. Barbič, D. P. Zimmer, D. M. Crothers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 2369-2373.
17. J. H. van de Sande, L. P. McIntosh, T. M. Jovin, EMBO J. 1982, 1, 777-782.
18. H. H. Klump, E. Schmid, M. Wosgien, Nucleic Acids Res. 1993, 21, 2343-2348.
19. M. E. Harder, W. C. Johnson, Nucleic Acids Res. 1990, 18, 2141-2148.
20. D. Mazumdar, N. Nagraj, H. K. Kim, X. Meng, A. K. Brown, Q. Sun, W. Li, Y. Lu, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 5506-5515.
21. Y. Xu, R. Ikeda, H. Sugiyama, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13519-13524.
22. T. Kimura, K. Kawai, S. Tojo, T. Majima, J. Org. Chem. 2004, 69, 1169-1173.
23. G. P. Schroth, T. F. Kagawa, P. S. Ho, Biochemistry 1993, 32, 13381-13392.
24. M. Behe, G. Felsenfeld, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1981, 78, 1619-1623.
25. N. Shimada, A. Kano, A. Maruyama, Adv. Funct. Mater. 2009, 19, 3590-3595.
26. T. J. Thomas, U. B. Gunnia, T. Thomas, J. Biol. Chem. 1991, 266, 6137-6141.
27. A. Johnson, Y. Qu, B. Van Houten, N. Farrell, Nucleic Acids Res. 1992, 20, 1697-1703.
28. X. G. Qu, J. O. Trent, I. Fokt, W. Priebe, J. B. Chaires, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12032-12037.
29. Y. Xu, Y. X. Zhang, H. Sugiyama, T. Umano, H. Osuga, K. Tanaka, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6566-6567.
30. A. Rich, S. G. Zhang, Nature Rev. Genet. 2003, 421, 566-572.
31. K. Struhl, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1985, 82, 8419-8423.
32. S. Adam, J. Liquier, J. A. Taboury, E. Taillandier, Biochemistry 1986, 25, 3220-3225.
33. P. Bourtayre, J. Liquier, L. Pizzorni, E. Z. Taillandier, J. Biomol. Struct. Dyn. 1984, 5, 97-104.
34. C. A. Puckett, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 46-47.
35. J. K. Barton, L. A. Basile, A. Danishefsky, A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 1961-1965.
36. T. Phillips, I. Haq, J. A. Thomas, Org. Biomol. Chem. 2011, 9, 3462-3470.
37. B. Heddi, A. T. Phan, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 9824-9833.
38. P. S. Ho, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 9549-9553.
39. A. M. Parkinson, M. Hawken, K. J. Hall, A. Sanders, Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 5469-5478.
40. A. Herbert, A. Rich, Genetica 1999, 106, 37-47.
41. J. S. Saad, M. Benedetti, G. Natile, L. G. Marzilli, Inorg. Chem. 2011, 50, 4559-4571.
42. J. S. Saad, P. A. Marzilli, F. P. Intini, G. Natile, L. G. Marzilli, Inorg. Chem. 2011, 50, 8608-8620.
43. B. Borah, J. S. Cohen, F. B. Howard, H. T. Miles, Biochemistry 1985, 24, 7456-7462.
44. D. J. Patel, S. A. Kozlowski, Biochemistry 1985, 24, 926-935.
45. P. A. Mirau, D. R. Kearns, Biochemistry 1984, 23, 5439-5446.
46. Y. G. Kim, H. J. Park, K. K. Kim, K. Lowenhaupt, A. Rich, Nucleic Acids Res. 2006, 34, 4937-4942.
47. B. Wong, S. Chen, J. A. Kown, A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 2229-2234.
48. L. J. Peck, A. Nordheim, A. Rich, J. C. Wang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1982, 79, 4560-4564.
49. K. Masuda, T. Nakata, K. Tamagake, Nucleic Acids Symp. Ser. 2000, 44, 63-64.
50. C. R. Krishnamoorthy, S. F. Yen, J. C. Smith, J. W. Lown, W. Wilson, Biochemistry 1986, 25, 5933-5940.
51. T. Phillips, I. Haq, A. J. Meijer, H. Adams, I. Soutar, L. Swanson, M. J. Sykes, J. A. Thomas, Biochemistry 2004, 43, 13657-13665.
52. T. Wiseman, S. Williston, J. F. Brandts, L. N. Lin, Anal. Biochem. 1989, 179, 131-137.
53. J. M. Ferreira, R. D. Sheardy, Biophys. J. 2006, 91, 3383-3389.
54. J. Bruzzo, P. Chiarella, R. P. Meiss, R. A. Ruggiero, J. Cancer. Res. Clin. Oncol. 2010, 136, 1605-1615.
55. M. A. Murado, J. A. Vazquez, J. Theor. Biol. 2007, 244, 489-499.
56. L. F. Tietze, B. Krewer, F. Major, I. Schuberth, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13031-13036.