Molecular dynamics studies of the size and internal structure of the PAMAM dendrimer grafted with arginine and histidine

Macromolecules

Volumn 44, Issue 21, 2011, Pages 8681-8686

  Lee, Hwankyu ^a   Choi, Joon Sig ^b   Larson, Ronald G ^c  

^a Dankook University   (South Korea)

^b Chungnam National University   (South Korea)

^c UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALL-ATOM SIMULATIONS; COARSE-GRAINED; DENSE CORE; DRUG ENCAPSULATION EFFICIENCY; ELECTROSTATIC CHARGES; ENCAPSULATION EFFICIENCY; FORCE FIELDS; INNER CAVITIES; INTERNAL STRUCTURE; PAMAM DENDRIMER; PH VALUE; PH-DEPENDENT;

ARGININE; ELECTROSTATICS; ENCAPSULATION; EXPERIMENTS; GRAFTING (CHEMICAL); MOLECULAR DYNAMICS; PH EFFECTS;

DENDRIMERS;

EID: 80455132530     PISSN: 00249297     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma2019396     Document Type: Article

References (49)

1. Naylor, A. M.; Goddard, W. A.; Kiefer, G. E.; Tomalia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 2339-2341
2. Tomalia, D. A.; Naylor, A. M.; Goddard, W. A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1990, 29, 138-175
3. Menjoge, A. R.; Kannan, R. M.; Tomalia, D. A. Drug Discovery Today 2010, 15, 171-185
4. Prosa, T. J.; Bauer, B. J.; Amis, E. J.; Tomalia, D. A.; Scherrenberg, R. J. Polym. Sci., Part B: Polym. Phys. 1997, 35, 2913-2924
5. Tomalia, D. A.; Reyna, L. A.; Svenson, S.; Portland Press Ltd.: 2007; pp 61-67.
6. Patri, A. K.; Kukowska-Latallo, J. F.; Baker, J. R. Adv. Drug Delivery Rev. 2005, 57, 2203-2214
7. Choi, Y.; Thomas, T.; Kotlyar, A.; Islam, M. T.; Baker, J. R. Chem. Biol. 2005, 12, 35-43
8. Choi, Y. S.; Mecke, A.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B.; Baker, J. R. Nano Lett. 2004, 4, 391-397
9. Majoros, I. J.; Williams, C. R.; Baker, J. R. Curr. Top. Med. Chem. 2008, 8, 1165-1179
10. Astruc, D.; Boisselier, E.; Ornelas, C. Chem. Rev. 2010, 110, 1857-1959
11. Patri, A. K.; Majoros, I. J.; Baker, J. R. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 466-471
12. Majoros, I. J.; Keszler, B.; Woehler, S.; Bull, T.; Baker, J. R. Macromolecules 2003, 36, 5526-5529
13. Hong, S. P.; Bielinska, A. U.; Mecke, A.; Keszler, B.; Beals, J. L.; Shi, X. Y.; Balogh, L.; Orr, B. G.; Baker, J. R.; Holl, M. M. B. Bioconjugate Chem. 2004, 15, 774-782
14. Hong, S. P.; Leroueil, P. R.; Janus, E. K.; Peters, J. L.; Kober, M. M.; Islam, M. T.; Orr, B. G.; Baker, J. R.; Holl, M. M. B. Bioconjugate Chem. 2006, 17, 728-734
15. Kim, Y.; Klutz, A. M.; Jacobson, K. A. Bioconjugate Chem. 2008, 19, 1660-1672
16. Luo, D.; Haverstick, K.; Belcheva, N.; Han, E.; Saltzman, W. M. Macromolecules 2002, 35, 3456-3462
17. Kojima, C.; Toi, Y.; Harada, A.; Kono, K. Bioconjugate Chem. 2007, 18, 663-670
18. Shukla, R.; Thomas, T. P.; Peters, J.; Kotlyar, A.; Myc, A.; Baker, J. R., Jr. Chem. Commun. 2005, 5739-5741
19. Malik, N.; Evagorou, E. G.; Duncan, R. Anti-Cancer Drugs 1999, 10, 767-776
20. Choi, J. S.; Nam, K.; Park, J. Y.; Kim, J. B.; Lee, J. K.; Park, J. S. J. Controlled Release 2004, 99, 445-456
21. Yu, G. S.; Bae, Y. M.; Choi, H.; Kong, B.; Choi, I. S.; Choi, J. S. Bioconjugate Chem. 2011, 22, 1046-1055
22. Leroueil, P. R.; Berry, S. A.; Duthie, K.; Han, G.; Rotello, V. M.; McNerny, D. Q.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B. Nano Lett. 2008, 8, 420-424
23. Leroueil, P. R.; Hong, S. Y.; Mecke, A.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 335-342
24. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 7778-7784
25. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 13202-13207
26. Lee, H.; Larson, R. G. Macromolecules 2011, 44, 2291-2298
27. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. C 2011, 115, 5316-5322
28. Lyulin, S. V.; Darinskii, A. A.; Lyulin, A. V. Macromolecules 2005, 38, 3990-3998
29. Lyulin, S. V.; Darinskii, A. A.; Lyulin, A. V. Phys. Rev. E 2008, 78, 9
30. Lyulin, S. V.; Vattulainen, I.; Gurtovenko, A. A. Macromolecules 2008, 41, 4961-4968
31. Maiti, P. K.; Bagchi, B. Nano Lett. 2006, 6, 2478-2485
32. Welch, P.; Muthukumar, M. Macromolecules 2000, 33, 6159-6167
33. Kelly, C. V.; Leroueil, P. R.; Nett, E. K.; Wereszczynski, J. M.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B.; Andricioaei, I. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9337-9345
34. Kelly, C. V.; Leroueil, P. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B.; Andricioaei, I. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9346-9353
35. Kelly, C. V.; Liroff, M. G.; Triplett, L. D.; Leroueil, P. R.; Mullen, D. G.; Wallace, J. M.; Meshinchi, S.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B. ACS Nano 2009, 3, 1886-1896
36. Lee, H.; Baker, J. R.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 4014-4019
37. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18204-18211
38. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 12279-12285
39. Lee, H.; Larson, R. G. Molecules 2009, 14, 423-438
40. Ginzburg, V. V.; Balijepailli, S. Nano Lett. 2007, 7, 3716-3722
41. Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435-447
42. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317
43. Van Der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701-1718
44. Marrink, S. J.; de Vries, A. H.; Mark, A. E. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 750-760
45. Marrink, S. J.; Risselada, H. J.; Yefimov, S.; Tieleman, D. P.; de Vries, A. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7812-7824
46. Monticelli, L.; Kandasamy, S. K.; Periole, X.; Larson, R. G.; Tieleman, D. P.; Marrink, S. J. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 819-834
47. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
48. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593
49. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38