Molecular dynamics study of the structure and interparticle interactions of polyethylene glycol-conjugated PAMAM dendrimers

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 40, 2009, Pages 13202-13207

  Lee, Hwankyu ^a   Larson, Ronald G ^b  

^a NATIONAL HEART LUNG AND BLOOD INSTITUTE   (United States)

^b UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AGGLOMERATION; ASSOCIATION REACTIONS; DENDRIMERS; MOLECULAR DYNAMICS; POLYETHYLENE OXIDES; SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; THERMOPLASTICS;

COARSE GRAINED MODELS; EXPLICIT WATER; INTER-PARTICLE INTERACTION; LAYER THICKNESS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PAMAM DENDRIMER; PARTICLE AGGREGATION; POLYAMIDOAMINE DENDRIMERS;

POLYETHYLENE GLYCOLS;

DENDRIMER; MACROGOL DERIVATIVE; PAMAM STARBURST; POLYAMINE; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; STATIC ELECTRICITY;

COMPUTER SIMULATION; DENDRIMERS; MOLECULAR STRUCTURE; POLYAMINES; POLYETHYLENE GLYCOLS; STATIC ELECTRICITY; WATER;

EID: 70349696667     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp906497e     Document Type: Article

References (60)

1. Davis, M. E. Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 128.
2. Ferrari, M. Nat. Rev. Cancer 2005, 5, 161.
3. Popielarski, S. R.; Pun, S. H.; Davis, M. E. Bioconjugate Chem. 2005, 16, 1063.
4. Rolland, A. P. Crit. Rev. Ther. Drug Carrier Syst. 1998, 15, 143.
5. Segura, T.; Shea, L. D. Annu. Rev. Mater. Res. 2001, 31, 25.
6. Tomalia, D. A.; Naylor, A. M.; Goddard, W. A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1990, 29, 138.
7. Leroueil, P. R.; Berry, S. A.; Duthie, K.; Han, G.; Rotello, V. M.; McNerny, D. Q.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B. Nano Lett. 2008, 8, 420.
8. Leroueil, P. R.; Hong, S. Y.; Mecke, A.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 335.
9. Hong, S. P.; Bielinska, A. U.; Mecke, A.; Keszler, B.; Beals, J. L.; Shi, X. Y.; Balogh, L.; Orr, B. G.; Baker, J. R.; Holl, M. M. B. Bioconjugate Chem. 2004, 15, 114.
10. Hong, S. P.; Leroueil, P. R.; Janus, E. K.; Peters, J. L.; Kober, M. M.; Islam, M. T.; Orr, B. G.; Baker, J. R.; Holl, M. M. B. Bioconjugate Chem. 2006, 17, 728.
11. Mecke, A.; Majoros, I. J.; Patri, A. K.; Baker, J. R.; Holl, M. M. B.; Orr, B. G. Langmuir 2005, 21, 10348.
12. Majoros, I. J.; Williams, C. R.; Baker, J. R. Curr. Top. Med. Chem. 2008, 8, 1165.
13. Harris, J. M.; Chess, R. B. Nat. Rev. Drug Discovery 2003, 2, 214.
14. Harris, J. M.; Martin, N. E.; Modi, M. Clin. Pharmacokinet. 2001, 40, 539.
15. Ji, M. L.; Yang, W. L.; Ren, Q. G.; Lu, D. R. Nanotechnology 2009, 20.
16. Kim, Y.; Klutz, A. M.; Jacobson, K. A. Bioconjugate Chem. 2008, 19, 1660.
17. Kojima, C; Toi, Y.; Harada, A.; Kono, K. Bioconjugate Chem. 2008, 19, 2280.
18. Singh, P.; Gupta, U.; Asthana, A.; Jain, N. K. Bioconjugate Chem. 2008, 19, 2239.
19. Steinmetz, N. F.; Manchester, M. Biomacromolecules 2009, 10, 784.
20. Wang, W.; Xiong, W.; Wan, J. L.; Sun, X. H.; Xu, H. B.; Yang, X. L. Nanotechnology 2009, 20, 105103.
21. Huang, R. Q.; Qu, Y. H.; Ke, W. L.; Zhu, J. H.; Pei, Y. Y.; Jiang, C. FASEB J. 2007, 21, 1117.
22. Bhadra, D.; Bhadra, S.; Jain, S.; Jain, N. K. Int. J. Pharm. 2003, 257, 111.
23. Sarkar, K.; Yang, H. Drug Delivery 2008, 15, 343.
24. Kojima, C; Kono, K.; Maruyama, K.; Takagishi, T. Bioconjugate Chem. 2000, 11, 910.
25. Yang, H.; Morris, J. J.; Lopina, S. T. J. Colloid Interface Sci. 2004, 273, 148.
26. Bartlett, D. W.; Davis, M. E. Bioconjugate Chem. 2007, 18, 456.
27. Lai, S. K.; O'Hanlon, D. E.; Harrold, S.; Man, S. T.; Wang, Y. Y.; Cone, R.; Hanes, J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007, 104, 1482.
28. Gurtovenko, A. A.; Lyulin, S. V.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Chem. Phys. 2006, 124.
29. Han, M.; Chen, P. Q.; Yang, X. Z. Polymer 2005, 46, 3481.
30. Lee, H.; Baker, J. R.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 4014.
31. Lee, I.; Athey, B. D.; Wetzel, A. W.; Meixner, W.; Baker, J. R. Macromolecules 2002, 35, 4510.
32. Lin, S. T.; Maiti, P. K.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8663.
33. Maiti, P. K.; Cagin, T.; Lin, S. T.; Goddard, W. A. Macromolecules 2005, 38, 979.
34. Kelly, C. V.; Leroueil, P. R.; Nett, E. K.; Wereszczynski, J. M.; Baker, J. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B.; Andricioaei, I. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9337.
35. Kelly, C. V.; Leroueil, P. R.; Orr, B. G.; Holl, M. M. B.; Andricioaei, I. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9346.
36. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1118.
37. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 12279.
38. Lee, H.; Larson, R. G. Molecules 2009, 14, 423.
39. Cieplak, M.; Thompson, D. J. Chem. Phys. 2008, 128.
40. Thompson, D. Langmuir 2007, 23, 8441.
41. Larin, S. V.; Lyulin, S. V.; Lyulin, A. V.; Darinskii, A. A. Polym. Sci., Ser. A 2009, 51, 459.
42. Lyulin, S. V.; Darinskii, A. A.; Lyulin, A. V. Macromolecules 2005, 38, 3990.
43. Lyulin, S. V.; Darinskii, A. A.; Lyulin, A. V. Phys. Rev. E 2008, 78, 9.
44. Lyulin, S. V.; Vattulainen, I.; Gurtovenko, A. A. Macromolecules 2008, 41, 4961.
45. Maiti, P. K.; Bagchi, B. Nano Lett. 2006, 6, 2478.
46. Welch, P.; Muthukumar, M. Macromolecules 2000, 33, 6159.
47. Lee, H.; Larson, R. G. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18204.
48. Lee, H.; de Vries, A. H.; Marrink, S. J.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B, submitted for publication, 2009.
49. Hedden, R. C; Bauer, B. J. Macromolecules 2003, 36, 1829.
50. Vagberg, L. J. M.; Cogan, K. A.; Gast, A. P. Macromolecules 1991, 24, 1670.
51. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
52. Hess, B.; Kutzner, C; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435.
53. Marrink, S. J.; de Vries, A. H.; Mark, A. E. J. Phys. Chem B 2004, 108, 750.
54. Marrink, S. J.; Risselada, H. J.; Yefimov, S.; Tieleman, D. P.; de Vries, A. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7812.
55. Berendsen, H. J. C; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
56. Theodorou, D. N.; Suter, U. W. Macromolecules 1985, 18, 1206.
57. Daoud, M.; Cotton, J. P. J. Phys. 1982, 43, 531.
58. Yeh, I. C; Hummer, G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 15873.
59. Fuhrmans, M.; Sanders, B. P.; Marrink, S. J.; de Vries, A. H. Theor. Chem. Acc. 2009.
60. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33.