The successful quest for oral factor Xa inhibitors; learnings for all of medicinal chemistry?

Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters

Volumn 21, Issue 21, 2011, Pages 6228-6235

  Young, Robert J ^a  

^a GLAXOSMITHKLINE   (United Kingdom)

Author keywords

Anticoagulants; Factor Xa; Ligand efficiency; Oral drugs; Propert forecast index

Indexed keywords

1 [3 (AMINOMETHYL)PHENYL] N [3 FLUORO 2' (METHYLSULFONYL)[1,1' BIPHENYL] 4 YL] 3 (TRIFLUOROMETHYL) 1H PYRAZOLE 5 CARBOXAMIDE; APIXABAN; BETRIXABAN; BLOOD CLOTTING FACTOR 10A INHIBITOR; DABIGATRAN; DABIGATRAN ETEXILATE; EDOXABAN; GSK 10234807; GW 813893; N [2 [4 (1 METHYL 4 PIPERIDINYL) 1 PIPERAZINYL] 2 OXO 1 PHENYLETHYL] 1H INDOLE 6 CARBOXAMIDE; RAZAXABAN; RIVAROXABAN; UNCLASSIFIED DRUG; XIMELAGATRAN;

ARTICLE; DECISION MAKING; DRUG EFFICACY; DRUG SAFETY; EXPOSURE; MEDICINE; PHYSICAL CHEMISTRY; RETROSPECTIVE STUDY; STRUCTURE ANALYSIS;

EID: 80054782568     PISSN: 0960894X     EISSN: 14643405     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/j.bmcl.2011.08.119     Document Type: Article

References (76)

1. Gustafsson, D.; Bylund, R.; Antonsson, T.; Nilsson, I.; Nyström, J.-E.; Eriksson, U.; Bredberg, U.; Teger-Nilsson, A.-C. Nat. Rev. Drug Disc. 2004, 3, 649.
2. Sobieraj-Teague, M.; O'Donnell, M.; Eikelboom, J. Semin. Thromb. Hemost. 2009, 35, 515.
3. Saiah, E.; Soares, C. Curr. Top. Med. Chem. 2005, 5, 1677.
4. Hirsh, J.; Fuster, V.; Ansell, J.; Halperin, J. L. Circulation 2003, 107, 1692.
5. Nutescu, E. A.; Wittkowsky, A. K.; Dobesh, P. P.; Hawkins, D. W.; Dager, W. E. Ann Pharmacother. 2006, 40, 1558.
6. Turpie, A. G. Curr. Opin. Drug Discov. Devel. 2009, 12, 497.
7. Hyers, T. M. Arch. Intern. Med. 2003, 163, 759.
8. Harenberg, J.; Wehling, M. Semin. Thromb. Hemost. 2008, 34, 39.
9. Lassen, M. R. Exp. Opin. Pharmacother. 2009, 10, 1769.
10. Gomez-Outes, A.; Lecumberri, R.; Pozo, C.; Rocha, E. Curr. Vasc. Pharmacol. 2009, 7, 309.
11. Schwienhorst, A. Cell. Mol. Life Sci. 2006, 63, 2773.
12. Eriksson, B. I.; Quinlan, D. J.; Weitz, J. I. Clin. Pharmacokin. 2009, 48, 1.
13. Furugohri, T.; Shiozaki, Y.; Muramatsu, S.; Honda, Y.; Matsumoto, C.; Isobe, K.; Su, N. Eur. J. Pharmacol. 2005, 514, 35.
14. Sinha, U.; Ku, P.; Malinowski, J.; Zhu, B. Y.; Scarborough, R. M.; Marlowe, C. K.; Wong, P. W.; Lin, P. H.; Hollenbach, S. J. Eur. J. Pharmacol. 2000, 395, 51.
15. Casimiro-Garcia, A.; Dudley, D. A.; Heemstra, R. J.; Filipski, K. J.; Bigge, C. F.; Edmunds, J. J. Expert Opin. Ther. Patents 2006, 16, 119.
16. De Candia, M.; Lopopolo, G.; Altomare, C. Expert Opin. Ther. Patents 2009, 19, 1535.
17. Pinto, D. J. P.; Smallheer, J. M.; Cheney, D. L.; Knabb, R. M.; Wexler, R. R. J. Med. Chem. 2010, 53, 6243.
18. Quan, M. L.; Smallheer, J. M. Curr. Opin. Drug Disc. Dev. 2004, 7, 460.
19. Eikelboom, J. E.; Weitz, J. I. Thromb. Haem. 2009, 101, 2.
20. Sanford, M.; Plosker, G. L. Drugs 2008, 68, 1699;
21. Sobera, L. A.; Bozzo, J.; Castaner, J. Drugs Future 2005, 30, 877.
22. Roehrig, S.; Straub, A.; Pohlmann, J.; Lampe, T.; Pernerstorfer, J.; Schlemmer, K. H.; Reinemer, P.; Perzborn, E. J. Med. Chem. 2005, 48, 5900.
23. Abrams, P. J.; Emerson, C. R. Pharmacotherapy 2009, 29, 167.
24. Escolar, G.; Villalta, J.; Casals, F.; Bozzo, J.; Serradell, N.; Bolos, J. Drugs Future 2006, 31, 484;
25. Perzborn, E.; Roehrig, S.; Straub, A.; Kubitza, D.; Misselwitz, F. Nat. Rev. Drug Discov. 2011, 10, 61.
26. Pinto, D. J.; Orwat, M. J.; Koch, S.; Rossi, K. A.; Alexander, R. S.; Smallwood, A.; Luettgen, J. M.; Knabb, R. M.; He, K.; Xin, B.; Wexler, R. R.; Lam, P. Y. J Med Chem. 2007, 50, 5339.
27. Wong, P. C.; Pinto, D. J. P.; Zhang, D. J. Thromb .Thrombolysis 2011, 31, 478.
28. Bates, S. M.; Weitz, J. I. Drugs Future 2008, 33, 293.
29. ChEMBL is a database of bioactive drug-like small molecules, it contains 2-D structures, calculated properties (e.g. logP, Molecular Weight, Lipinski Parameters, etc.) and abstracted bioactivities (e.g., binding constants, pharmacology and ADMET data). https://www.ebi.ac.uk/chembldb/
30. Padmanabhan, K.; Padmanabhan, K. P.; Tulinsky, A.; Park, C. H.; Bode, W.; Huber, R.; Blankenship, D. T.; Cardin, A. D.; Kisiel, W. J. Mol. Biol. 1993, 232, 947.
31. Muresan, S.; Sadowski, J. In Methods and Principles in Medicinal Chemistry; Mannhold, R., Kubinyi, H., Timmerman, H., Eds.; Wiley InterScience, 2008; pp 439-461.
32. Vieth, M.; Siegel, M. G.; Higgs, R. E.; Watson, I. A.; Robertson, D. H.; Savin, K. A.; Durst, G. L.; Hipskind, P. A. J. Med. Chem. 2004, 47, 224.
33. Lipinski, C. A.; Lombardo, F.; Dominy, B. W.; Feeney, P. J. Adv. Drug Deliv. Rev. 2001, 46, 3.
34. Ries, U. J.; Wienen, W. Drugs Future 2003, 28, 355.
35. Leung, D.; Abbenante, G.; Fairlie, D. P. J. Med. Chem. 2000, 43, 305.
36. Kikumoto, R.; Tamao, Y.; Tezuka, T.; Tonomura, S.; Hara, H.; Ninomiya, K.; Hijikata, A.; Okamoto, S. Biochemistry 1984, 23, 85.
37. Gustafsson, D.; Nystrom, J.-E.; Carlsson, S.; Bredberg, U.; Eriksson, U.; Gyzander, E.; Elg, M.; Antonsson, T.; Hoffmann, K.-J.; Ungell, A.-L.; Sörensen, H.; Nagard, S.; Abrahamsson, A.; Bylund, R. Thromb. Res. 2001, 101, 171;
38. Mohapatra, R.; Tran, M.; Gore, J. M.; Spencer, F. A. Am. Heart J. 2005, 150, 19.
39. Keisu, M.; Andersson, T. B. Handb. Exp. Pharmacol. 2010, 196, 407.
40. Masters, J. J.; Franciskovich, J. B.; Tinsley, J. M.; Campbell, C.; Campbell, J. B.; Craft, T. J.; Froelich, L. L.; Gifford-Moore, D. S.; Hay, L. A.; Herron, D. K. J. Med. Chem. 2000, 43, 2087.
41. Komoriya, S.; Haginoya, N.; Kobayashi, S.; Nagata, T.; Mochizuki, A.; Suzuki, M.; Yoshino, T.; Horino, H.; Nagahara, T.; Suzuki, M.; Isobe, Y.; Furugoori, T. Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 3927.
42. Choi-Sledeski, Y. M.; Kearney, R.; Poli, G.; Pauls, H.; Gardner, C.; Gong, Y.; Becker, M.; Davis, R.; Spada, A.; Liang, G.; Chu, V.; Brown, K.; Collussi, D.; Leadley, R.; Rebello, S.; Moxey, P.; Morgan, S.; Bentley, R.; Kasiewski, C.; Maignan, S.; Guilloteau, J.-P.; Mikol, V. J. Med. Chem. 2003, 46, 681.
43. Abel, R.; Young, T.; Farid, R.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 2817.
44. Glen, R. C.; Martin, G. R.; Hill, A. P.; Hyde, R. M.; Woollard, P. M.; Salmon, J. A.; Buckingham, J.; Robertson, A. D. J. Med. Chem. 1995, 38, 3566. and compare with the Pfizer golden triangle described in.
45. Johnson, T. W.; Dress, K. R.; Edwards, M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 5560.
46. Fritsma, G. A. In Hematology: Clinical Principles and Applications; Rodak, B., Ed.; W.B. Saunders & Co: Philadelphia, 2002; pp 719-753.
47. Trainor, G. L. Expert. Opin. Drug Discov. 2007, 2, 51.
48. Smith, D. A.; Di, L.; Kerns, E. H. Nat. Rev. Drug Disc. 2010, 9, 929.
49. Tucker, T. J.; Lumma, W. C.; Mulichak, A. M.; Chen, Z.; Naylor-Olsen, A. M.; Lewis, S. D.; Lucas, R.; Freidinger, R. M.; Kuo, L. C. J. Med. Chem. 1997, 40, 830.
50. Young, R.J.; Green, D.V.S, Luscombe, C.N.; Hill, A.P. Drug Discovery Today, (in press) doi:10.1016/j.drudis.2011.06.001.
51. Young, R. J.; Borthwick, A. D.; Brown, D.; Burns-Kurtis, C. L.; Campbell, M.; Chan, C.; Charbaut, M.; Chung, C.-w.; Convery, M. A.; Kelly, H. A.; King, N. P.; Kleanthous, S.; Mason, A. M.; Pateman, A. J.; Patikis, A. N.; Pinto, I. L.; Pollard, D. R.; Senger, S.; Shah, G. P.; Toomey, J. R.; Watson, N. S.; Weston, H. E. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 23.
52. Young, R. J.; Borthwick, A. D.; Brown, D.; Burns-Kurtis, C. L.; Campbell, M.; Chan, C.; Charbaut, M.; Convery, M. A.; Diallo, H.; Hortense, E.; Irving, W. R.; Kelly, H. A.; King, N. P.; Kleanthous, S.; Mason, A. M.; Pateman, A. J.; Patikis, A. N.; Pinto, I. L.; Pollard, D. R.; Senger, S.; Shah, G. P.; Toomey, J. R.; Watson, N. S.; Weston, H. E.; Zhou, P. ibid 2008, 18, 28.
53. Pinto, D. J.; Orwat, M. J.; Wang, S.; Fevig, J. M.; Quan, M. L.; Amparo, E.; Cacciola, J.; Rossi, K. A.; Alexander, R. S.; Smallwood, A. M.; Luettgen, J. M.; Liang, L.; Aungst, B. J.; Wright, M. R.; Knabb, R. M.; Wong, P. C.; Wexler, R. R.; Lam, P. Y. J. Med. Chem. 2001, 44, 566.
54. Quan, M. L.; Lam, P. Y. S.; Han, Q.; Pinto, D. J. P.; He, M. Y.; Li, R.; Ellis, C. D.; Clark, C. G.; Teleha, C. A.; Sun, J.-H.; Alexander, R. S.; Bai, S.; Luettgen, J. M.; Knabb, R. M.; Wong, P. C.; Wexler, R. R. J. Med. Chem. 2005, 48, 1729.
55. Chan, C.; Borthwick, A. D.; Brown, D.; Burns-Kurtis, C. L.; Campbell, M.; Chaudry, L.; Chung, C.-W.; Convery, M. A.; Hamblin, J. N.; Johnstone, L.; Kelly, H. A.; Kleanthous, S.; Patikis, A.; Patel, C.; Pateman, A. J.; Senger, S.; Shah, G. P.; Toomey, J. R.; Watson, N. S.; Weston, H. E.; Whitworth, C.; Young, R. J.; Zhou, P. J. Med. Chem. 2007, 50, 1546.
56. Abboud, M. A.; Needle, S. J.; Burns-Kurtis, C. L.; Valocik, R. E.; Koster, P. F.; Amour, A. J.; Chan, C.; Brown, D.; Chaudry, L.; Zhou, P.; Patikis, A.; Patel, C.; Pateman, A. J.; Young, R. J.; Watson, N. S.; Toomey, J. R. J. Cardiovasc. Pharmacol. 2008, 52, 66.
57. Gleeson, M. P. J. Med. Chem. 2008, 51, 817.
58. Leeson, P. D.; Springthorpe, B. Nat. Rev. Drug Discov. 2007, 6, 881.
59. Peters, J.-U.; Schnider, P.; Mattei, P.; Kansy, M. ChemMedChem 2009, 4, 680.
60. Waring, M. J. Exp. Opin. Drug Discov. 2010, 5, 235.
61. Hann, M. M. Med. Chem. Commun. 2011, 2, 349.
62. Gleeson, M. P.; Hersey, A.; Montanari, D.; Overington, J. Nat. Rev. Drug Disc. 2011, 10, 197.
63. Hill, A. P.; Young, R. J. Drug Discov. Today 2010, 15, 648.
64. Leeson, P. D.; Empfield, J. R. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 393.
65. Ritchie, T. J.; MacDonald, S. J. F. Drug Discov. Today 2009, 14, 1011.
66. Ritchie, T. J.; MacDonald, S. J. F.; Young, R. J.; Pickett, S. D. Drug Discovery Today 2011, 16, 164.
67. Lovering, F.; Bikker, J.; Humblet, C. J. Med. Chem. 2009, 52, 6752.
68. Rees, D. C.; Congreve, M.; Murray, C. W.; Carr, R. Nat. Rev. Drug Discov. 2004, 3, 660.
69. Hopkins, A. L.; Groom, C. R.; Alex, A. Drug Discovery Today 2004, 9, 430.
70. Carr, R. A.; Congreve, M.; Murray, C. W.; Rees, D. C. Drug Discovery Today 2005, 10, 987.
71. Ryckmans, T.; Edwards, M. P.; Horne, V. A.; Correia, A. M.; Owen, D. R.; Thompson, L. R.; Tran, I.; Tutt, M. F.; Young, T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 4406.
72. Edwards, M. P.; Price, D. A. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 381.
73. Neumann, T.; Junker, H.-D.; Oliver, K.; Burkert, K.; Ottleben, H.; Gamer, J.; Sekul, R.; Deppe, H.; Feurer, A.; Tomandl, D.; Metz, G. Lett. Drug Design Disc. 2005, 2, 590.
74. Howard, N.; Abell, C.; Blakemore, W.; Chessari, G.; Congreve, M.; Howard, S.; Jhoti, H.; Murray, C. W.; Seavers, L. C.; van Montfort, R. L. J. Med. Chem. 2006, 49, 1346.
75. Liebeschuetz, J. W.; Jones, S. D.; Morgan, P. J.; Murray, C. W.; Rimmer, A. D.; Roscoe, J. M. E.; Waszkowycz, D.; Welsh, P. M.; Wylie, W. A.; Young, S. C.; Martin, H.; Mahler, J.; Brady, L.; Wilkinson, K. J. Med. Chem. 2002, 45, 1221.
76. Mortenson, P. N.; Murray, C. W. J. Comput. Aided Mol. Des. 2011, 25, 663.