Recognition ability of DNA for carbon nanotubes correlates with their binding affinity

Langmuir

Volumn 27, Issue 13, 2011, Pages 8282-8293

  Roxbury, Daniel ^a   Tu, Xiaomin ^b   Zheng, Ming ^b   Jagota, Anand ^a  

^a Lehigh University   (United States)

^b NATIONAL INSTITUTE OF STANDARDS AND TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING AFFINITIES; BINDING STRENGTH; DNA RECOGNITION; FLUORESCENCE STUDIES; RECOGNITION ABILITIES; RECOGNITION SEQUENCE;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; ACTIVATION ENERGY; BINDING ENERGY; CARBON NANOTUBES; CHIRALITY; DNA; ENANTIOMERS; KINETICS; STEREOCHEMISTRY; SURFACE ACTIVE AGENTS;

DNA SEQUENCES;

CARBON NANOTUBE; DNA;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMISTRY; FLUORESCENCE; KINETICS; SURFACE PROPERTY;

BINDING SITES; DNA; FLUORESCENCE; KINETICS; NANOTUBES, CARBON; SURFACE PROPERTIES;

EID: 79959810232     PISSN: 07437463     EISSN: 15205827     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la2007793     Document Type: Article

References (48)

1. Ajayan, P. M. Chem. Rev. 1999, 99, 1787-1800
2. Baughman, R. H.; Zakhidov, A. A.; de Heer, W. A. Science 2002, 297, 787-792
3. Jorio, A.; Dresselhaus, G.; Dresselhaus, M. S. Carbon Nanotubes, Advanced Topics in the Synthesis, Structure, Properties and Applications; Springer: New York, 2008.
4. Saito, R.; Dresselhaus, G.; Dresselhaus, M. S. Physical Properties of Carbon Nanotubes; Imperial College Press: London, 1999.
5. Bahr, J. L.; Mikkelsen, E. T.; Bronikowski, M. J.; Smalley, R. E.; Tour, J. M. Chem. Commun. 2001, 193-194
6. Furtado, C. A.; Kim, U. J.; Gutierrez, H. R.; Pan, L.; Dickey, E. C.; Eklund, P. C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6095-6105
7. Bachilo, S. M.; Strano, M. S.; Kittrell, C.; Hauge, R. H.; Smalle, R. E.; Weisman, R. B. Science 2002, 298, 2361-2366
8. Moore, V. C.; Strano, M. S.; Haroz, E. H.; Hauge, R. H.; Smalley, R. E. Nano Lett. 2003, 3, 1379-1382
9. O'Connell, M. J.; Bachilo, S. M.; Huffman, C. B.; Moore, V. C.; Strano, M. S.; Haroz, E. H.; Rialon, K. L.; Boul, P. J.; Noon, W. H.; Kittrell, C.; Ma, J.; Hauge, R. H.; Weisman, R. B.; Smalley, R. E. Science 2002, 297, 593-596
10. Dieckmann, G. R.; Dalton, A. B.; Johnson, P. A.; Razal, J.; Chen, J.; Giordano, G. M.; Munoz, E.; Musselman, I. H.; Baughman, R. H.; Draper, R. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1770-1777
11. Kam, N. W. S.; Liu, Z.; Dai, H. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12492-12493
12. Kam, N. W. S.; O'Connell, M. J.; Wisdom, J. A.; Dai, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11600-11605
13. Zheng, M.; Jagota, A.; Semke, E. D.; Diner, B. A.; Mclean, S. R. L.; Richardson, R. E.; Tassi, N. G. Nat. Mater. 2003, 2, 338-343
14. Huang, X.; Mclean, S. R. L.; Zheng, M. Anal. Chem. 2005, 77, 6225-6228
15. Zheng, M.; Jagota, A.; Strano, M. S.; Santos, A. P.; Barone, P.; Chou, S. G.; Diner, B. A.; Dresselhaus, M. S.; Mclean, S. R. L.; Onoa, G. B.; Samsonidze, G. G.; Semke, E. D.; Usrey, M.; Walls, D. J. Science 2003, 302, 1545-1548
16. Tu, X. M.; Manohar, S.; Jagota, A.; Zheng, M. Nature 2009, 460, 250-253
17. Khripin, C. Y.; Manohar, S.; Zheng, M.; Jagota, A. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 13616-13621
18. Roxbury, D.; Manohar, S.; Jagota, A. J. Phys. Chem. C 2010, 114, 13267-13276
19. Manohar, S.; Tang, T.; Jagota, A. J. Phys. Chem. C 2007, 111, 17835-17845
20. McCarthy, B.; Coleman, J. N.; Czerw, R.; Dalton, A. B.; Panhuis, M. I. H.; Maiti, A.; Drury, A.; Bernier, P.; Nagy, J. B.; Lahr, B.; Byrne, H. J.; Carroll, D. L.; Blau, W. J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 2210-2216
21. Sowerby, S. J.; Cohn, C. A.; Heckl, W. M.; Holm, N. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 820-822
22. Sowerby, S. J.; Edelwirth, M.; Heckl, W. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5914-5922
23. Tao, N. J.; Shi, Z. J. Phys. Chem. 1994, 98, 1464-1471
24. Mamdouh, W.; Dong, M. D.; Xu, S. L.; Rauls, E.; Besenbacher, F. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13305-13311
25. Mamdouh, W.; Kelly, R. E. A.; Dong, M. D.; Kantorovich, L. N.; Besenbacher, F. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 695-702
26. Sowerby, S. J.; Edelwirth, M.; Reiter, M.; Heckl, W. M. Langmuir 1998, 14, 5195-5202
27. Edelwirth, M.; Freund, J.; Sowerby, S. J.; Heckl, W. M. Surf. Sci. 1998, 417, 201-209
28. Sowerby, S. J.; Stockwell, P. A.; Heckl, W. M.; Petersen, G. B. Origins Life Evol. Biospheres 2000, 30, 81-99
29. Gu, J. D.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 7353-7358
30. Otero, R.; Schock, M.; Molina, L. M.; Laegsgaard, E.; Stensgaard, I.; Hammer, B.; Besenbacher, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 2270-2275
31. Xu, S. L.; Dong, M. D.; Rauls, E.; Otero, R.; Linderoth, T. R.; Besenbacher, F. Nano Lett. 2006, 6, 1434-1438
32. Johnson, A. T.; Johnson, C.; Klein, M. L. Small 2010, 6, 31-34
33. Manohar, S.; Mantz, A. R.; Bancroft, K. E.; Hui, C. Y.; Jagota, A.; Vezenov, D. V. Nano Lett. 2008, 8, 4365-4372
34. Shi, X.; Kong, Y.; Zhao, Y.; Gao, H. Acta Mech. Sin. 2005, 21, 249-256
35. Manohar, S. DNA-CNT Interactions. Ph.D. dissertation, Lehigh University, Lehigh, PA, 2010.
36. Albertorio, F.; Hughes, M. E.; Golovchenko, J. A.; Branton, D. Nanotechnology 2009, 20
37. Cathcart, H.; Nicolosi, V.; Hughes, J. M.; Blau, W. J.; Kelly, J. M.; Quinn, S. J.; Coleman, J. N. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12734-12744
38. Coleman, J. N. Adv. Funct. Mater. 2009, 19, 3680-3695
39. Islam, M. F.; Rojas, E.; Bergey, D. M.; Johnson, A. T.; Yodh, A. G. Nano Lett. 2003, 3, 269-273
40. Choi, J. H.; Strano, M. S. Appl. Phys. Lett. 2007, 90, 223114
41. Eyring, H. Chem. Rev. 1935, 3, 107-115
42. Chao, C. Y.; Carvajal, D.; Szleifer, I.; Shull, K. R. Langmuir 2008, 24, 2472-2478
43. Chou, S. G.; Ribeiro, H. B.; Barros, E. B.; Santos, A. P.; Nezich, D.; Samsonidze, G. G.; Fantini, C.; Pimenta, M. A.; Jorio, A.; Filho, F. P.; Dresselhaus, G.; Dresselhaus, M. S.; Saito, R.; Zheng, M.; Onoa, G. B.; Semke, E. D.; Swan, A. K.; Unlu, M. S.; Goldberg, B. B. Chem. Phys. Lett. 2004, 397, 296-301
44. Matarredona, O.; Rhoads, H.; Li, Z.; Harwell, J. H.; Balzano, L.; Resasco, D. E. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 13357-13367
45. Bustamante, C.; Bryant, Z.; Smith, S. B. Nature 2003, 421, 423-427
46. Tinland, B.; Pluen, A.; Sturm, J.; Weill, G. Macromolecules 1997, 30, 5763-5765
47. Stofer, E.; Chipot, C.; Lavery, R. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9503-9508
48. Saenger, W. Principles of Nucleic Acid Structure; Springer-Verlag: New York, 1984.