-
1
-
-
0005241362
-
-
Emini, E.; Schleif, W.; Davis, L.; Heimbach, J.; Dixon, R.; Scolnick, E.; Sigal, I.; with Kohl, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4686-4690
-
(1988)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.85
, pp. 4686-4690
-
-
Emini, E.1
Schleif, W.2
Davis, L.3
Heimbach, J.4
Dixon, R.5
Scolnick, E.6
Sigal, I.7
With Kohl, N.8
-
5
-
-
76049105922
-
-
Perryman, A. L.; Zhang, Q.; Soutter, H. H.; Rosenfeld, R.; McRee, D. E.; Olson, A. J.; Elder, J. E.; David Stout, C. Chem. Biol. Drug Design 2010, 75, 257-268
-
(2010)
Chem. Biol. Drug Design
, vol.75
, pp. 257-268
-
-
Perryman, A.L.1
Zhang, Q.2
Soutter, H.H.3
Rosenfeld, R.4
McRee, D.E.5
Olson, A.J.6
Elder, J.E.7
David Stout, C.8
-
6
-
-
34249275362
-
-
Chellappan, S.; Kiran Kumar Reddy, G. S.; Ali, A.; Nalam, M. N. L.; Anjum, S. G.; Cao, H.; Kairys, V.; Fernandes, M. X.; Altman, M. D.; Tidor, B.; Rana, T. M.; Schiffer, C. A.; Gilson, M. K. Chem. Biol. Drug Design 2007, 69, 298-313
-
(2007)
Chem. Biol. Drug Design
, vol.69
, pp. 298-313
-
-
Chellappan, S.1
Kiran Kumar Reddy, G.S.2
Ali, A.3
Nalam, M.N.L.4
Anjum, S.G.5
Cao, H.6
Kairys, V.7
Fernandes, M.X.8
Altman, M.D.9
Tidor, B.10
Rana, T.M.11
Schiffer, C.A.12
Gilson, M.K.13
-
7
-
-
54849414837
-
-
Böttcher, J.; Blum, A.; Dörr, S.; Heine, A.; Diederich, W. E.; Klebe, G. ChemMedChem 2008, 3, 1337-1344
-
(2008)
ChemMedChem
, vol.3
, pp. 1337-1344
-
-
Böttcher, J.1
Blum, A.2
Dörr, S.3
Heine, A.4
Diederich, W.E.5
Klebe, G.6
-
8
-
-
52049093435
-
-
Damm, K. L.; Ung, P.; Quintero, J. J.; Gestwicki, J. E.; Carlson, H. A. Biopolymers 2008, 89, 643-652
-
(2008)
Biopolymers
, vol.89
, pp. 643-652
-
-
Damm, K.L.1
Ung, P.2
Quintero, J.J.3
Gestwicki, J.E.4
Carlson, H.A.5
-
9
-
-
0037028049
-
-
Markgren, P.-O.; Schaal, W.; Hämäläinen, M.; Karlén, A.; Hallberg, A.; Samuelsson, B.; Danielson, U. H. J. Med. Chem. 2002, 45, 5430-5439
-
(2002)
J. Med. Chem.
, vol.45
, pp. 5430-5439
-
-
Markgren, P.-O.1
Schaal, W.2
Hämäläinen, M.3
Karlén, A.4
Hallberg, A.5
Samuelsson, B.6
Danielson, U.H.7
-
10
-
-
34250380707
-
-
Trylska, J.; Tozzini, V.; Chang, C.; McCammon, J. A. Biophys. J. 2007, 92, 4179-4187
-
(2007)
Biophys. J.
, vol.92
, pp. 4179-4187
-
-
Trylska, J.1
Tozzini, V.2
Chang, C.3
McCammon, J.A.4
-
11
-
-
67249128279
-
-
Li, D.; Liu, M. S.; Ji, B.; Hwang, K.; Huang, Y. J. Chem. Phys. 2009, 130, 215102
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, vol.130
, pp. 215102
-
-
Li, D.1
Liu, M.S.2
Ji, B.3
Hwang, K.4
Huang, Y.5
-
12
-
-
18744366086
-
-
Andrec, M.; Gallicchio, E.; Felts, A. K.; Levy, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 6801-6806
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.102
, pp. 6801-6806
-
-
Andrec, M.1
Gallicchio, E.2
Felts, A.K.3
Levy, R.M.4
-
13
-
-
70349240373
-
-
Zheng, W.; Andrec, M.; Gallicchio, E.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 11702-11709
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 11702-11709
-
-
Zheng, W.1
Andrec, M.2
Gallicchio, E.3
Levy, R.M.4
-
14
-
-
79951523268
-
-
Zheng, W.; Gallicchio, E.; Deng, N.; Andrec, M.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1512-1523
-
(2011)
J. Phys. Chem. B
, vol.115
, pp. 1512-1523
-
-
Zheng, W.1
Gallicchio, E.2
Deng, N.3
Andrec, M.4
Levy, R.M.5
-
15
-
-
3142707288
-
-
Singhal, N.; Snow, C. D.; Pande, V. S. J. Chem. Phys. 2004, 121, 415
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.121
, pp. 415
-
-
Singhal, N.1
Snow, C.D.2
Pande, V.S.3
-
16
-
-
33748248896
-
-
Jayachandran, G.; Vishal, V.; Pande, V. S. J. Chem. Phys. 2006, 124, 164902
-
(2006)
J. Chem. Phys.
, vol.124
, pp. 164902
-
-
Jayachandran, G.1
Vishal, V.2
Pande, V.S.3
-
17
-
-
66849091890
-
-
Berezhkovskii, A.; Hummer, G.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 2009, 130, 205102
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, vol.130
, pp. 205102
-
-
Berezhkovskii, A.1
Hummer, G.2
Szabo, A.3
-
19
-
-
70450255797
-
-
Noe, F.; Schutte, C.; Vanden-Eijnden, E.; Reich, L.; Weikl, T. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 19011-19016
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.106
, pp. 19011-19016
-
-
Noe, F.1
Schutte, C.2
Vanden-Eijnden, E.3
Reich, L.4
Weikl, T.R.5
-
20
-
-
77649146257
-
-
Robbins, A. H.; Coman, R. M.; Bracho-Sanchez, E.; Fernandez, M. A.; Gilliland, C. T.; Li, M.; Agbandje-McKenna, M.; Wlodawer, A.; Dunn, B. M.; McKenna, R. Acta Crystallogr. D: Biol. Crystallogr. 2010, 66, 233-242
-
(2010)
Acta Crystallogr. D: Biol. Crystallogr.
, vol.66
, pp. 233-242
-
-
Robbins, A.H.1
Coman, R.M.2
Bracho-Sanchez, E.3
Fernandez, M.A.4
Gilliland, C.T.5
Li, M.6
Agbandje-Mckenna, M.7
Wlodawer, A.8
Dunn, B.M.9
McKenna, R.10
-
21
-
-
28844446162
-
-
Martin, P.; Vickrey, J. F.; Proteasa, G.; Jimenez, Y. L.; Wawrzak, Z.; Winters, M. A.; Merigan, T. C.; Kovari, L. C. Structure 2005, 13, 1887-1895
-
(2005)
Structure
, vol.13
, pp. 1887-1895
-
-
Martin, P.1
Vickrey, J.F.2
Proteasa, G.3
Jimenez, Y.L.4
Wawrzak, Z.5
Winters, M.A.6
Merigan, T.C.7
Kovari, L.C.8
-
22
-
-
33750086969
-
-
Layten, M.; Hornak, V.; Simmerling, C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13360-13361
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 13360-13361
-
-
Layten, M.1
Hornak, V.2
Simmerling, C.3
-
23
-
-
61449265073
-
-
Lexa, K. W.; Damm, K. L.; Quintero, J. J.; Gestwicki, J. E.; Carlson, H. A. Proteins 2009, 74, 872-880
-
(2009)
Proteins
, vol.74
, pp. 872-880
-
-
Lexa, K.W.1
Damm, K.L.2
Quintero, J.J.3
Gestwicki, J.E.4
Carlson, H.A.5
-
24
-
-
0033200247
-
-
Ishima, R.; Freedberg, D. I.; Wang, Y.-X.; Louis, J. M.; Torchia, D. A. Structure 1999, 7, 1047-1055
-
(1999)
Structure
, vol.7
, pp. 1047-1055
-
-
Ishima, R.1
Freedberg, D.I.2
Wang, Y.-X.3
Louis, J.M.4
Torchia, D.A.5
-
25
-
-
0036147844
-
-
Freedberg, D. I.; Ishima, R.; Jacob, J.; Wang, Y.-X.; Kustanovich, I.; Louis, J. M.; Torchia, D. A. Protein Sci. 2002, 11, 221-232
-
(2002)
Protein Sci.
, vol.11
, pp. 221-232
-
-
Freedberg, D.I.1
Ishima, R.2
Jacob, J.3
Wang, Y.-X.4
Kustanovich, I.5
Louis, J.M.6
Torchia, D.A.7
-
26
-
-
1842454635
-
-
Perryman, A. L.; Lin, J.-H.; McCammon, J. A. Protein Sci. 2004, 13, 1108-1123
-
(2004)
Protein Sci.
, vol.13
, pp. 1108-1123
-
-
Perryman, A.L.1
Lin, J.-H.2
McCammon, J.A.3
-
27
-
-
33644948688
-
-
Hornak, V.; Okur, A.; Rizzo, R. C.; Simmerling, C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2812-2813
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 2812-2813
-
-
Hornak, V.1
Okur, A.2
Rizzo, R.C.3
Simmerling, C.4
-
28
-
-
44949121782
-
-
Ding, F.; Layten, M.; Simmerling, C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7184-7185
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 7184-7185
-
-
Ding, F.1
Layten, M.2
Simmerling, C.3
-
29
-
-
32244437816
-
-
Hornak, V.; Okur, A.; Rizzo, R. C.; Simmerling, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 915-920
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.103
, pp. 915-920
-
-
Hornak, V.1
Okur, A.2
Rizzo, R.C.3
Simmerling, C.4
-
32
-
-
77749305127
-
-
Li, D.; Ji, B.; Hwang, K.; Huang, Y. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 3060-3069
-
(2010)
J. Phys. Chem. B
, vol.114
, pp. 3060-3069
-
-
Li, D.1
Ji, B.2
Hwang, K.3
Huang, Y.4
-
34
-
-
0028958868
-
-
Collins, J. R.; Burt, S. K.; Erickson, J. W. Nat. Struct. Mol. Biol. 1995, 2, 334-338
-
(1995)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.2
, pp. 334-338
-
-
Collins, J.R.1
Burt, S.K.2
Erickson, J.W.3
-
35
-
-
0032127391
-
-
Rick, S. W.; Erickson, J. W.; Burt, S. K. Proteins 1998, 32, 7-16
-
(1998)
Proteins
, vol.32
, pp. 7-16
-
-
Rick, S.W.1
Erickson, J.W.2
Burt, S.K.3
-
37
-
-
33847116895
-
-
Tozzini, V.; Trylska, J.; Chang, C.; McCammon, J. A. J. Struct. Biol. 2007, 157, 606-615
-
(2007)
J. Struct. Biol.
, vol.157
, pp. 606-615
-
-
Tozzini, V.1
Trylska, J.2
Chang, C.3
McCammon, J.A.4
-
38
-
-
33744940504
-
-
Chang, C.; Shen, T.; Trylska, J.; Tozzini, V.; McCammon, J. Biophys. J. 2006, 90, 3880-3885
-
(2006)
Biophys. J.
, vol.90
, pp. 3880-3885
-
-
Chang, C.1
Shen, T.2
Trylska, J.3
Tozzini, V.4
McCammon, J.5
-
39
-
-
66749119083
-
-
Metzner, P.; Schütte, C.; Vanden-Eijnden, E. Multiscale Model. Simul. 2009, 7, 1192
-
(2009)
Multiscale Model. Simul.
, vol.7
, pp. 1192
-
-
Metzner, P.1
Schütte, C.2
Vanden-Eijnden, E.3
-
40
-
-
70450255797
-
-
Noe, F.; Schutte, C.; Vanden-Eijnden, E.; Reich, L.; Weikl, T. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 19011-19016
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.106
, pp. 19011-19016
-
-
Noe, F.1
Schutte, C.2
Vanden-Eijnden, E.3
Reich, L.4
Weikl, T.R.5
-
42
-
-
0036074173
-
-
Ozkan, S. B.; Dill, K. A.; Bahar, I. Protein Sci. 2002, 11, 1958-1970
-
(2002)
Protein Sci.
, vol.11
, pp. 1958-1970
-
-
Ozkan, S.B.1
Dill, K.A.2
Bahar, I.3
-
43
-
-
2942567954
-
-
Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Suits, F. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6571-6581
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 6571-6581
-
-
Swope, W.C.1
Pitera, J.W.2
Suits, F.3
-
44
-
-
34247382025
-
-
Chodera, J. D.; Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Dill, K. A. Multiscale Model. Simul. 2006, 5, 1214
-
(2006)
Multiscale Model. Simul.
, vol.5
, pp. 1214
-
-
Chodera, J.D.1
Swope, W.C.2
Pitera, J.W.3
Dill, K.A.4
-
45
-
-
10944260594
-
-
Chekmarev, D. S.; Ishida, T.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 19487-19495
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 19487-19495
-
-
Chekmarev, D.S.1
Ishida, T.2
Levy, R.M.3
-
46
-
-
17444389688
-
-
Sriraman, S.; Kevrekidis, I. G.; Hummer, G. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6479-6484
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 6479-6484
-
-
Sriraman, S.1
Kevrekidis, I.G.2
Hummer, G.3
-
47
-
-
76149136021
-
-
Voelz, V. A.; Bowman, G. R.; Beauchamp, K.; Pande, V. S. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1526-1528
-
(2010)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.132
, pp. 1526-1528
-
-
Voelz, V.A.1
Bowman, G.R.2
Beauchamp, K.3
Pande, V.S.4
-
51
-
-
69049084558
-
-
Pietrucci, F.; Marinelli, F.; Carloni, P.; Laio, A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 11811-11818
-
(2009)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.131
, pp. 11811-11818
-
-
Pietrucci, F.1
Marinelli, F.2
Carloni, P.3
Laio, A.4
-
52
-
-
17444366185
-
-
Gallicchio, E.; Andrec, M.; Felts, A. K.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6722-6731
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 6722-6731
-
-
Gallicchio, E.1
Andrec, M.2
Felts, A.K.3
Levy, R.M.4
-
54
-
-
0029912748
-
-
Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236
-
(1996)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.118
, pp. 11225-11236
-
-
Jorgensen, W.L.1
Maxwell, D.S.2
Tirado-Rives, J.3
-
56
-
-
0035876257
-
-
Velazquez-Campoy, A.; Kisob, Y.; Freire, E. Arch. Biochem. Biophys. 2001, 390, 169-175
-
(2001)
Arch. Biochem. Biophys.
, vol.390
, pp. 169-175
-
-
Velazquez-Campoy, A.1
Kisob, Y.2
Freire, E.3
-
58
-
-
33744491862
-
-
Perryman, A. L.; Lin, J.-H.; McCammon, J. A. Biopolymers 2006, 82, 272-284
-
(2006)
Biopolymers
, vol.82
, pp. 272-284
-
-
Perryman, A.L.1
Lin, J.-H.2
McCammon, J.A.3
-
59
-
-
0542362994
-
-
Northrup, S. H.; Zarrin, F.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. 1982, 86, 2314-2321
-
(1982)
J. Phys. Chem.
, vol.86
, pp. 2314-2321
-
-
Northrup, S.H.1
Zarrin, F.2
McCammon, J.A.3
-
60
-
-
0000901098
-
-
Szabo, A.; Shoup, D.; Northrup, S. H.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1982, 77, 4484
-
(1982)
J. Chem. Phys.
, vol.77
, pp. 4484
-
-
Szabo, A.1
Shoup, D.2
Northrup, S.H.3
McCammon, J.A.4
-
61
-
-
1642310506
-
-
Shuman, C. F.; Hämäläinen, M. D.; Danielson, U. H. J. Mol. Recognit. 2004, 17, 106-119
-
(2004)
J. Mol. Recognit.
, vol.17
, pp. 106-119
-
-
Shuman, C.F.1
Hämäläinen, M.D.2
Danielson, U.H.3
|