General self-assembly mechanism converting hydrolyzed globular proteins into giant multistranded amyloid ribbons

Biomacromolecules

Volumn 12, Issue 5, 2011, Pages 1868-1875

  Lara, Cécile ^a   Adamcik, Jozef ^a   Jordens, Sophia ^a   Mezzenga, Raffaele ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMYLOID FIBRIL; CIRCULAR DICHROISM; FIBRILLATION MECHANISM; GLOBULAR PROTEINS; HELICAL RIBBONS; INCUBATION TIME; LACTOGLOBULIN; PEPTIDE FRAGMENTS; PEPTIDE SEQUENCES; PROTOFILAMENTS; SDS-PAGE; SECONDARY STRUCTURES; SINGLE-MOLECULE; STRUCTURAL CHANGE; SYNTHETIC PEPTIDE;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; DICHROISM; ENZYMES; GLYCOPROTEINS; PEPTIDES;

HYDROLYSIS;

AMYLOID; BETA LACTOGLOBULIN; GLOBULAR PROTEIN; LYSOZYME;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CIRCULAR DICHROISM; FIBER; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN FOLDING; PROTEIN HYDROLYSIS; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE;

AMYLOID; CIRCULAR DICHROISM; CRYOELECTRON MICROSCOPY; ELECTROPHORESIS, POLYACRYLAMIDE GEL; HYDROLYSIS; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; PROTEINS;

EID: 79955863547     PISSN: 15257797     EISSN: 15264602     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bm200216u     Document Type: Article

References (43)

1. Taylor, J. P.; Hardy, J.; Fischbeck, K. H. Science 2002, 296, 1991-1995
2. Chiti, F.; Dobson, C. M. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333-366
3. Selkoe, D. J. Nature 2003, 426, 900-904
4. Knowles, T. P.; Fitzpatrick, A. W.; Meehan, S.; Mott, H. R.; Vendruscolo, M.; Dobson, C. M.; Welland, M. E. Science 2007, 318, 1900-1903
5. Krebs, M. R. H.; Wilkins, D. K.; Chung, E. W.; Pitkeathly, M. C.; Chamberlain, A. K.; Zurdo, J.; Robinson, C. V.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 2000, 300, 541-549
6. Dobson, C. M. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 329-332
7. Bucciantini, M.; Giannoni, E.; Chiti, F.; Baroni, F.; Formigli, L.; Zurdo, J. S.; Taddei, N.; Ramponi, G.; Dobson, C. M.; Stefani, M. Nature 2002, 416, 507-511
8. Kumar, S.; Udgaonkar, J. B. Curr. Sci. 2010, 98, 639-656
9. Knowles, T. P. J.; Waudby, C. A.; Devlin, G. L.; Cohen, S. I. A.; Aguzzi, A.; Vendruscolo, M.; Terentjev, E. M.; Welland, M. E.; Dobson, C. M. Science 2009, 326, 1533-1537
10. Jimenez, J. L.; Nettleton, E. J.; Bouchard, M.; Robinson, C. V.; Dobson, C. M.; Saibil, H. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9196-9201
11. Juarez, J.; Taboada, P.; Mosquera, V. Biophys. J. 2009, 96, 2353-2370
12. Sagis, L. M. C.; Veerman, C.; Van der Linden, E. Langmuir 2004, 20, 924-927
13. Pearce, F. G.; Mackintosh, S. H.; Gerrard, J. A. J. Agric. Food. Chem. 2007, 55, 318-322
14. Goers, J.; Permyakov, S. E.; Permyakov, E. A.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochemistry 2002, 41, 1246-12551
15. Adamcik, J.; Jung, J. M.; Flakowski, J.; De Los Rios, P.; Dietler, G.; Mezzenga, R. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 423-428
16. Pepys, M. B.; Hawkins, P. N.; Booth, D. R.; Vigushin, D. M.; Tennent, G. A.; Soutar, A. K.; Totty, N.; Nguyen, O.; Blake, C. C. F.; Terry, C. J.; Feest, T. G.; Zalin, A. M.; Hsuan, J. J. Nature 1993, 362, 553-557
17. Gharibyan, A. L.; Zamotin, V.; Yanamandra, K.; Moskaleva, O. S.; Margulis, B. A.; Kostanyan, I. A.; Morozova-Roche, L. A. J. Mol. Biol. 2007, 365, 1337-1349
18. Vernaglia, B. A.; Huang, J.; Clark, E. D. Biomacromolecules 2004, 5, 1362-1370
19. Goda, S.; Takano, K.; Yamagata, Y.; Nagata, R.; Akutsu, H.; Maki, S.; Namba, K.; Yutani, K. Protein Sci. 2000, 9, 369-375
20. Cao, A. E.; Hu, D. Y.; Lai, L. H. Protein Sci. 2004, 13, 319-324
21. Ferreira, S. T.; Vieira, M. N. N.; De Felice, F. G. IUBMB Life 2007, 59, 332-345
22. Bolisetty, S.; Adamcik, J.; Mezzenga, R. Soft Matter 2011, 7, 493-499
23. Mezzenga, R.; Schurtenberger, P.; Burbidge, A.; Michel, M. Nat. Mater. 2005, 4, 729-740
24. Borgogna, M.; Bellich, B.; Zorzin, L.; Lapasin, R.; Cesaro, A. Food Chem. 2010, 122, 416-423
25. Jung, J. M.; Savin, G.; Pouzot, M.; Schmitt, C.; Mezzenga, R. Biomacromolecules 2008, 9, 2477-2486
26. Kavanagh, G. M.; Clark, A. H.; Ross-Murphy, S. B. Int. J. Biol. Macromol. 2000, 28, 41-50
27. Arnaudov, L. N.; De Vries, R. Biophys. J. 2005, 88, 515-526
28. Mishra, R.; Sörgjerd, K.; Nyström, S.; Nordigården, A.; Yu, Y. C.; Hammarström, P. J. Mol. Biol. 2007, 366, 1029-1044
29. Frare, E.; de Laureto, P. P.; Zurdo, J.; Dobson, C. M.; Fontana, A. J. Mol. Biol. 2004, 340, 1153-1165
30. Krebs, M. R. H.; Morozova-Roche, L. A.; Daniel, K.; Robinson, C. V.; Dobson, C. M. Protein Sci. 2004, 13, 1933-1938
31. Aggeli, A.; Nyrkova, I. A.; Bell, M.; Harding, R.; Carrick, L.; McLeish, T. C. B.; Semenov, A. N.; Boden, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11857-11862
32. Nyrkova, I. A.; Semenov, A. N.; Aggeli, A.; Boden, N. Eur. Phys. J. B 2000, 17, 481-497
33. Pashuck, E. T.; Stupp, S. I. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8819-8821
34. Lamm, M. S.; Rajagopal, K.; Schneider, J. P.; Pochan, D. J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 16692-16700
35. Kirschner, D. A.; Elliott-Bryant, R.; Szumowski, K. E.; Gonnerman, W. A.; Kindy, M. S.; Sipe, J. D.; Cathcart, E. S. J. Struct. Biol. 1998, 124, 88-98
36. Ferguson, N.; Berriman, J.; Petrovich, M.; Sharpe, T. D.; Finch, J. T.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9814-9819
37. Lashuel, H. A.; LaBrenz, S. R.; Woo, L.; Serpell, L. C.; Kelly, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5262-5277
38. Lu, K.; Jacob, J.; Thiyagarajan, P.; Conticello, V. P.; Lynn, D. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6391-6393
39. Paravastu, A. K.; Leapman, R. D.; Yau, W. M.; Tycko, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 18349-18354
40. Dong, J.; Shokes, J. E.; Scott, R. A.; Lynn, D. G. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 3540-3542
41. Petkova, A. T.; Leapman, R. D.; Guo, Z. H.; Yau, W. M.; Mattson, M. P.; Tycko, R. Science 2005, 307, 262-265
42. Sawaya, M. R.; Sambashivan, S.; Nelson, R.; Ivanova, M. I.; Sievers, S. A.; Apostol, M. I.; Thompson, M. J.; Balbirnie, M.; Wiltzius, J. J. W.; McFarlane, H. T.; Madsen, A. O.; Riekel, C.; Eisenberg, D. Nature 2007, 447, 453-457
43. Jordens, S.; Adamcik, J.; Amar-Yuli, I.; Mezzenga, R. Biomacromolecules 2011, 12, 187-193