Mass spectrometric characterization of oligomers in pseudomonas aeruginosa azurin solutions

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 16, 2011, Pages 4790-4800

  Sokolová, Lucie ^a   Williamson, Heather ^b   Sýkora, Jan ^c   Hof, Martin ^c   Gray, Harry B ^b   Brutschy, Bernd ^a   Vlček, Antonín ^c,d  

^a GOETHE UNIVERSITY   (Germany)

^b CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^c J HEYROVSKÝ INSTITUTE OF PHYSICAL CHEMISTRY   (Czech Republic)

^d QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ANISOTROPY; BEHAVIORAL RESEARCH; CHROMOPHORES; DESORPTION; MASS SPECTROMETERS; MASS SPECTROMETRY; OLIGOMERIZATION; PROTEINS; ROTATION; SODIUM CHLORIDE;

ANISOTROPY MEASUREMENTS; AVERAGE DATA; BUFFER CONCENTRATIONS; BUFFER IONS; CORRELATION TIME; DILUTED SOLUTIONS; INDIVIDUAL COMPONENTS; ION DESORPTION; LABELED PROTEINS; LABELING PROTEINS; LASER INDUCED; MASS SPECTROSCOPY; OLIGOMER DISTRIBUTION; PEAK SHIFT; PHENANTHROLINES; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; SOLUTION BEHAVIOR; SOLUTION COMPOSITION; TIME-RESOLVED ANISOTROPY; TIME-SCALES;

OLIGOMERS;

EID: 79955401295     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp110460k     Document Type: Article

References (52)

1. Salgado, E. N.; Radford, R. J.; Tezcan, F. A. Acc. Chem. Res. 2010, 43, 661
2. Impagliazzo, A.; Blok, A. J.; Cliff, M. J.; Ladbury, J. E.; Ubbink, M. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 226
3. Tessier, P. M.; Lenhoff, A. M. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 512
4. Janin, J.; Rodier, F. Proteins 1995, 23, 580
5. Dobson, C. M. Protein Folding and Misfolding. From Atoms to Organisms. In Physical Biology. From Atoms to Medicine, Zewail, A. H., Ed. Imperial College Press: London, 2008; pp 289.
6. Kang, S. A.; Crane, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 15465-15470
7. Fletcher, S.; Hamilton, A. D. J. R. Soc. Interface 2006, 3, 215
8. Morgner, N.; Barth, H.-D.; Brutschy, B. Aust. J. Chem. 2006, 59, 109-114
9. Morgner, N.; Kleinschroth, T.; Barth, H.-D.; Ludwig, B.; Brutschy, B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1429-1438
10. Sokolova, L.; Wittig, I.; Barth, H.-D.; Schägger, H.; Brutschy, B.; Brandt, U. Proteomics 2010, 10, 1401-1407
11. Morgner, N.; Zickermann, V.; Kerscher, S.; Wittig, I.; Abdrakhmanova, A.; Barth, H.-D.; Brutschy, B.; Brandt, U. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1777, 1384-1391
12. Permyakov, E. Metalloproteomics; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2009.
13. van de Kamp, M.; Floris, R.; Hali, F. C.; Canters, G. W. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 907
14. van de Kamp, M.; Silvestrini, M. C.; Brunori, M.; Van Beeumen, J.; Hali, F. C.; Canters, G. W. Eur. J. Biochem. 1990, 194, 109
15. Nar, H.; Messerschmidt, A.; Huber, R.; van de Kamp, M.; Canters, G. W. J. Mol. Biol. 1991, 218, 427
16. Leckner, J.; Bonander, N.; Wittung-Stafshede, P.; Malmström, B. G.; Karlsson, B. G. Biochem. Biophys. Acta 1997, 1342, 19-27
17. Bramanti, A.; Pompa, P. P.; Maruccio, G.; Calabi, F.; Arima, V.; Cingolani, R.; Corni, S.; Di Felice, R.; De Rienzo, F.; Rinaldi, R. Jpn. J. Appl. Phys. 2005, 44, 6864-6866
18. Lancaster, K. M.; Yokoyama, K.; Richards, J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Inorg. Chem. 2009, 48, 1278-1280
19. Choi, J.-W.; Oh, B.-K.; Kim, Y. J. Appl. Phys. Lett. 2007, 91, 263902
20. Lee, T.; Kim, S.-U.; Min, J.; Choi, J.-W. Adv. Mater. 2010, 22, 510-514
21. Rinaldi, R.; Biasco, A.; Maruccio, G.; Arima, V.; Visconti, P.; Cingolani, R.; Facci, P.; De Rienzo, F.; Di Felice, R.; Molinari, E.; Verbeet, M. P.; Canters, G. W. Appl. Phys. Lett. 2003, 82, 472
22. Yokoyama, K.; Leigh, B. S.; Sheng, Y.; Niki, K.; Nakamura, N.; Ohno, H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B.; Richards, J. H. Inorg. Chim. Acta 2008, 361, 1095-1099
23. Fujita, K.; Nakamura, N.; Ohno, H.; Leigh, B. S.; Niki, K.; Gray, H. B.; Richards, J. H. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13954-13961
24. Khoshtariya, D. E.; Dolidze, T. D.; Shushanyan; Davis, K. L.; Waldeck, D. H.; van Eldik, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 2757-2762
25. Farver, O.; Bonander, N.; Skov, L. K.; Pecht, I. Inorg. Chim. Acta 1996, 243, 127
26. Farver, O.; Canters, G. W.; van Amsterdam, I.; Pecht, I. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 6757
27. Farver, O.; Pecht, I. Coord. Chem. Rev. 2011, 10.1016/j.ccr.2010.08.005
28. Shih, C.; Museth, A. K.; Abrahamsson, M.; Blanco-Rodriguez, A. M.; Di Bilio, A. J.; Sudhamsu, J.; Crane, B. R.; Ronayne, K. L.; Towrie, M.; Vlček, A., Jr.; Richards, J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 2008, 320, 1760
29. Langen, R.; Chang, I.-J.; Germanas, J. P.; Richards, J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1995, 268, 1733
30. Di Bilio, A. J.; Hill, M. G.; Bonander, N.; Karlsson, B. G.; Villahermosa, R. M.; Malmström, B. G.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9921
31. Skov, L. K.; Pascher, T.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 1102
32. Crane, B. R.; Di Bilio, A. J.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11623
33. Di Bilio, A. J.; Crane, B. R.; Wehbi, W. A.; Kiser, C. N.; Abu-Omar, M. M.; Carlos, R. M.; Richards, J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3181
34. Miller, J. E.; Gradinaru, C.; Crane, B. R.; Di Bilio, A. J.; Wehbi, W. A.; Un, S.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14220
35. Miller, J. E.; Di Bilio, A. J.; Wehbi, W. A.; Green, M. T.; Museth, A. K.; Richards, J. R.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1655, 59
36. Grǎdinaru, C.; Crane, B. R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 20073
37. Morgner, N.; Barth, H.-D.; Brutschy, B.; Scheffer, U.; Breitung, S.; Göbelb, M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 1600
38. Hoffmann, J.; Schmidt, T. L.; Heckel, A.; Brutschy, B. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009, 23, 2176
39. Morgner, N.; Barth, H. D.; Schmidt, T. L.; Heckel, A.; Scheffer, U.; Göbel, M.; Fucini, P.; Brutschy, B. Z. Phys. Chem. 2007, 221, 1-16
40. Hoffmann, J.; Aslimovska, L.; Bamann, C.; Glaubitz, C.; Bamberg, E.; Brutschy, B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 3480
41. Blanco-Rodríguez, A. M.; Di Bilio, A. J.; Shih, C.; Museth, A. K.; Clark, I. P.; Towrie, M.; Cannizzo, A.; Sudhamsu, J.; Crane, B. R.; Sýkora, J.; Winkler, J. R.; Gray, H. B.; Záliš, S.; Vlček, A., Jr. Chem.-Eur. J. 2011, 17, in press.
42. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy, 3 rd ed.; Springer: New York, 2006.
43. Deprez, E.; Tauc, P.; Leh, H.; Mouscadet, J.-F.; Auclair, C.; Hawkins, M. E.; Brochon, J.-C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10090-10095
44. Lakshmikanth, G. S.; Krishnamoorthy, G. Biophys. J. 1999, 77, 1100-1106
45. Petrich, J. W.; Longworth, J. W.; Fleming, G. R. Biochemistry 1987, 26, 2711
46. Mei, G.; Gilardi, G.; Venanzi, M.; Rosato, N.; Canters, G. W.; A., F. A. Protein Sci. 1996, 5, 2248
47. Benny Lee, K. C.; Siegel, J.; Webb, S. E. D.; Leveque-Fort, S.; Cole, M. J.; Jones, R.; Dowling, K.; Lever, M. J.; French, P. M. W. Biophys. J. 2001, 81, 1265-1274
48. Berberan-Santos, M. N.; Bodunov, E. N.; Valeur, B. Chem. Phys. 2005, 315, 171-182
49. Blanco-Rodríguez, A. M.; Busby, M.; Ronayne, K. L.; Towrie, M.; Sýkora, J.; Hof, M.; Záliš, S.; Grǎdinaru, C.; Di Bilio, A. J.; Crane, B. R.; Gray, H. B.; Vlček, J., A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 11788
50. Berberan-Santos, M. N.; Bodunov, E. N.; Valeur, B. Chem. Phys. 2005, 317, 57-62
51. Nar, H.; Messerschmidt, A.; Huber, R.; van de Kamp, M.; Canters, G. W. J. Mol. Biol. 1991, 221, 765
52. Blanco-Rodríguez, A. M.; Busby, M.; Grǎdinaru, C.; Crane, B. R.; Di Bilio, A. J.; Matousek, P.; Towrie, M.; Leigh, B. S.; Richards, J. H.; Vlček, A., Jr.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4365