Sequential ordering among multicolor fluorophores for protein labeling facility via aggregation-elimination based β-lactam probes

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 5, 2011, Pages 1766-1772

  Sadhu, Kalyan K ^a   Mizukami, Shin ^a   Watanabe, Shuji ^a   Kikuchi, Kazuya ^a  

^a OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 79954558915     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1mb05013c     Document Type: Article

References (62)

1. Z. Zhou A. Koglin Y. Wang A. P. McMahon C. T. Walsh J. Am. Chem. Soc. 2008 130 9925 9930
2. S. S. Gallagher J. E. Sable M. P. Sheetz V. W. Cornish ACS Chem. Biol. 2009 4 547 556
3. R. McRae P. Bagchi S. Sumalekshmy C. J. Fahrni Chem. Rev. 2009 109 4780 4827
4. H. Ren F. Xiao K. Zhan Y.-P. Kim H. Xie Z. Xia J. Rao Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 9658 9662
5. S. Mizukami S. Watanabe Y. Hori K. Kikuchi J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5016 5017
6. D. Maurel S. Banala T. Laroche K. Johnsson ACS Chem. Biol. 2010 5 507 516
7. C. Uttamapinant K. A. White H. Baruah S. Thompson M. Fernández- Suárez S. Puthenveetil A. Y. Ting Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 10914 10919
8. D. Srikun A. E. Albers C. I. Nam A. T. Iavarone C. J. Chang J. Am. Chem. Soc. 2010 132 4455 4465
9. D. Summerer S. Chen N. Wu A. Deiters J. W. Chin P. G. Schultz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 9785 9789
10. C. Smith Nature 2007 4 755 759
11. A. Olichon T. Surrey J. Biol. Chem. 2007 282 36314 36320
12. W. Sandtner F. Bezanilla A. M. Correa Biophys. J. 2007 93 L45 L47
13. J. Artus and A.-K. Hadjantonakis, in Modern Research and Educational Topics in Microscopy, ed., A. Mendez-Vilas, and, J. Diaz,, Formatex, 2007, pp. 190-202
14. M. Z. Lin L. wang Physiology 2008 23 131 141
15. R. W. Watkins L. D. Lavis V. M. Kung G. V. Los R. T. Raines Org. Biomol. Chem. 2009 7 3969 3975
16. B. A. Griffin S. R. Adams R. Y. Tsien Science 1998 281 269 272
17. B. A. Griffin S. R. Adams J. Jones R. Y. Tsien Methods Enzymol. 2000 327 565 578
18. S. R. Adams R. E. Campbell L. A. Gross B. R. Martin G. K. Walkup Y. Yao J. Llopis R. Y. Tsien J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6063 6076
19. C. Hoffman G. Gaietta M. Bunemann S. R. Adams S. Oberdolff-Maass B. Behr J.-P. Vilardaga R. Y. Tsien M. H. Ellisman Nat. Methods 2005 12 453 462
20. O. Tour S. R. Adams R. A. Kerr R. M. Meijer T. J. Sejnowski R. W. Tsien R. Y. Tsien Nat. Chem. Biol. 2007 3 423 431
21. S. R. Adams R. Y. Tsien Nat. Protoc. 2008 3 1527 1534
22. G. V. Los A. Darzins N. Karassina C. Zimprich R. Learish M. G. McDougall L. P. Encell R. Friedman-Ohana M. Wood G. Vidugiris K. Zimmerman P. Otto D. H. Klaubert K. V. Wood Cell Notes 2005 11 2 6
23. G. V. Los L. P. Encell M. G. McDougall D. D. Hartzell N. Karassina C. Zimprich M. G. Wood R. Learish R. F. Ohana M. Urh D. Simpson J. Mendez K. Zimmerman P. Otto G. Vidugiris J. Zhu A. Darzins D. H. Klaubert R. F. Bulleit K. V. Wood ACS Chem. Biol. 2008 3 373 382
24. J. Schroder H. Benink M. Dyba G. V. Los Biophys. J. 2009 96 L01 L03
25. R. F. Ohana L. P. Encell K. Zhao D. Simpson M. R. Slater M. Urh K. V. Wood Protein Expression Purif. 2009 68 110 120
26. A. Keppler S. Gendreizig T. Gronemeyer H. Pick H. Vogel K. Johnsson Nat. Biotechnol. 2003 21 86 89
27. A. Keppler H. Pick C. Arrivoli H. Vogel K. Johnsson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 9955 9959
28. M. Kindermann I. Sielaff K. Johnsson Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004 14 2725 2728
29. N. Johnsson K. Johnsson ACS Chem. Biol. 2007 2 31 38
30. A. Gautier A. Juilleratk C. Heinis I. R. Corrêa Jr. M. Kindermann F. Beaufils K. Johnsson Chem. Biol. 2008 15 128 136
31. M. Bannwarth I. R. Corrêa Jr. M. Sztretye S. Pouvreau C. Fellay A. Aebischer L. Royer E. Ríos K. Johnsson ACS Chem. Biol. 2009 4 179 190
32. M. A. Brun K.-T. Tan E. Nakata M. J. Hinner K. Johnsson J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5873 5884
33. A. Ojida K. Honda D. Shinmi S. Kiyonaka Y. Mori I. Hamachi J. Am. Chem. Soc. 2006 128 10452 10459
34. H. Nonaka S. Tsukiji A. Ojida I. Hamachi J. Am. Chem. Soc. 2007 129 15777 15779
35. Y. Sekine-Aizawa R. L. Huganir Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 17114 17119
36. T. L. Halo J. Appelbaum E. M. Hobert D. M. Balkin A. Schepartz J. Am. Chem. Soc. 2009 131 438 439
37. L. W. Miller J. Sable P. Goelet M. P. Sheetz V. W. Cornish Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 1672 1675
38. L. W. Miller Y. Cai M. P. Sheetz V. W. Cornish Nat. Methods 2005 2 255 257
39. N. T. Calloway M. Choob A. Sanz M. P. Sheetz L. W. Miller V. W. Cornish ChemBioChem 2007 8 767 774
40. S. S. Gallagher J. E. Sable M. P. Sheetz V. W. Cornish ACS Chem. Biol. 2009 4 547 556
41. H. E. Rajasekhar D. R. Reddy S. Mohandessi N. G. Butlin L. W. Miller Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 4990 4992
42. C. Szent-Gyorgyi B. F. Schmidt Y. Creeger G. W. Fisher K. L. Zakel S. Adler J. A. Fitzpatrick C. A. Woolford Q. Yan K. V. Vasilev P. B. Berget M. P. Bruchez J. W. Jarvik A. Waggoner Nat. Biotechnol. 2008 26 235 240
43. S. Watanabe S. Mizukami Y. Hori K. Kikuchi Bioconjugate Chem. 2010 21 2320 2326
44. D. Maurel L. Comps-Agrar C. Brock M.-L. Rives E. Bourrier M. A. Ayoub H. Bazin N. Tinel T. Durroux L. Prézeau E. Trinquet J.-P. Pin Nat. Methods 2008 5 561 567
45. F. Kampmeier M. Ribbert T. Nachreiner S. Dembski F. Beaufils A. Brecht S. Barth Bioconjugate Chem. 2009 20 1010 1015
46. K. K. Sadhu S. Mizukami S. Watanabe K. Kikuchi Chem. Commun. 2010 46 7403 7405
47. G. Guillaume M. Vanhove J. Lamotte-Brasseur P. Ledent M. Jamin B. Joris J.-M. Frère J. Biol. Chem. 1997 272 5438 5444
48. H. Adachi T. Ohta H. Matsuzawa J. Biol. Chem. 1991 266 3186 3191
49. G. Punte B. E. Rivero Acta Crystallogr., Sect. C: Cryst. Struct. Commun. 1989 45 1952 1957
50. K. Kumar P. R. Carey J. Chem. Phys. 1975 63 3697 3707
51. E. L. Kapinus I. I. Dilung Chem. Phys. Lett. 1990 174 75 79
52. U. Wenzel H.-G. Lohmannsroben J. Photochem. Photobiol., A 1996 96 13 18
53. S. Santabarbara R. Barbato G. Zucchelli F. M. Garlaschi R. S. Jennings FEBS Lett. 2001 505 159 162
54. K.-S. Focsaneanu J. C. Scaiano Photochem. Photobiol. Sci. 2005 4 817 821
55. H. Li J. Kang L. Ding F. Lu Y. Fang J. Photochem. Photobiol., A 2008 197 226 231
56. Y. Oseki M. Fujitsuka D. W. Cho A. Sugimoto S. Tojo T. Majima J. Phys. Chem. B 2005 109 19257 19262
57. R. Livingston L. Thompson M. V. Ramarao J. Am. Chem. Soc. 1952 74 1073 1075
58. J. C. Nnadi A. W. Peters S. Y. Wang J. Am. Chem. Soc. 1972 94 712 716
59. M. Sirish B. G. Maiya J. Photochem. Photobiol., A 1994 77 189 200
60. E. Tyystjärvi N. King M. Hakala E.-M. Aro J. Photochem. Photobiol., B 1999 48 142 147
61. C. Zhang J. Phys. Chem. A 2006 110 14029 14035
62. S. Vijayakumar G. Ravishanker R. F. Pratt D. L. Beveridge J. Am. Chem. Soc. 1995 117 1722 1730