Di-8-ANEPPS emission spectra in phospholipid/cholesterol membranes: A theoretical study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 14, 2011, Pages 4160-4167

  Robinson, David ^a   Besley, Nicholas A ^a   Obshea, Paul ^a   Hirst, Jonathan D ^a  

^a UNIVERSITY OF NOTTINGHAM   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVE NETWORKS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; EMISSION SPECTROSCOPY; FLUORESCENCE; MEMBRANES; MOLECULAR INTERACTIONS; MOLECULAR MODELING; MOLECULAR STRUCTURE;

ABSORPTION AND EMISSION SPECTRA; COMPLETE ACTIVE SPACE SELF-CONSISTENT FIELDS; DIPALMITOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE; DIPOLE POTENTIAL; EMISSION SPECTRUMS; EXCITED-STATE GEOMETRIES; FLUORESCENT PROBES; MEMBRANE BILAYERS; THEORETICAL STUDY; TIME DEPENDENT DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EXCITED STATES;

EID: 79953791484     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp1111372     Document Type: Article

References (70)

1. Helms, V. Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 12, 169-175
2. Paulick, M. G.; Forstner, M. B.; Groves, J. T.; Bertozzi, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 20332-20337
3. Limon, A.; Reyes-Ruiz, J. M.; Eusebi, F.; Miledi, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 15526-15530
4. Levine, B. G.; Coe, J. D.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 405-413
5. Leake, M. C.; Chandler, J. H.; Wadhams, G. H.; Bai, F.; Berry, R. M.; Armitage, J. P. Nature 2006, 443, 355-358
6. Prescott, M; Battad, J.; Wilmann, P.; Rossjohn, J.; Devenish, R. Biotechnol. Annu. Rev. 2006, 12, 31-66
7. Zhang, Z.; Alfonta, L.; Tian, F.; Bursulaya, B.; Uryu, S.; King, D. S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8882-8887
8. Hogue, C. W. V.; Rashquinha, I.; Szabo, A. G.; MacManus, J. P. FEBS Lett. 1992, 310, 269-272
9. Ross, J. B. A.; Senear, D. F.; Waxman, E.; Kombo, B. B.; Rusinova, E.; Huang, Y. T.; Laws, W. R.; Hasselbacher, C. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 12023-12027
10. Botchway, S. W.; Barba, I.; Jordan, R.; Harmston, R.; Haggie, P. M.; William, S. P.; Fulton, A. M.; Parker, A. W.; Brindle, K. M. Biochem. J. 2005, 390, 787-790
11. Bouevitch, O.; Lewis, A.; Pinevsky, I.; Wuskell, J. P.; Loew, L. M. Biophys. J. 1993, 65, 672-679
12. Campagnola, P. J.; Wei, M. D.; Lewis, A.; Loew, L. M. Biophys. J. 1999, 77, 3341-3349
13. Millard, A. C.; Jin, L.; Lewis, A.; Loew, L. M. Opt. Lett. 2003, 28, 1221-1223
14. Fluhler, E.; Burnham, V. G.; Loew, L. M. Biochemistry 1985, 24, 5749-5755
15. Zhang, J.; Davidson, R. M.; Wei, M. D.; Loew, L. M. Biophys. J. 1998, 74, 48-53
16. Loew, L. M. Pure Appl. Chem. 1996, 68, 1405-1409
17. Millard, A. C.; Jin, L.; Wei, M. D.; Wuskell, J. P.; Lewis, A.; Loew, L. M. Biophys. J. 2004, 86, 1169-1176
18. Montana, V.; Farkas, D. L.; Loew, L. M. Biochemistry 1989, 28, 4536-4539
19. Goff, G. L.; Vitha, M. F.; Clarke, R. J. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 562-570
20. Brockman, H. Chem. Phys. Lipids 1994, 73, 57-79
21. Clarke, R. J. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1327, 269-278
22. Pickar, A. D.; Benz, R. J. Membr. Biol. 1978, 44, 353-376
23. Gawrisch, K.; Ruston, D.; Zimmerberg, J.; Parsegian, V. A.; Rand, R. P.; Fuller, N. Biophys. J. 1992, 61, 1213-1223
24. Ob Shea, P. Membrane Potentials; measurement, occurrence and roles in cellular function. In Bioelectrochemistry of Membranes; Walz, D., Eds.; Birkhauser Verlag: Switzerland, 2004; pp 23 - 59.
25. Rusu, C. F.; Lanig, H.; Othersen, O. G.; Kryschi, C.; Clark, T. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 2445-2455
26. See, for example: Roos, B. O. Adv. Chem. Phys. 1987, 69, 399-442
27. Andersson, K.; Malmqvist, P.-Å.; Roos, B. O.; Sadlej, A. J.; Wolinski, K. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5483-5488
28. Andersson, K.; Malmqvist, P.-Å.; Roos, B. O. J. Chem. Phys. 1992, 96, 1218-1226
29. Finley, J.; Malmqvist, P.-A.; Roos, B. O.; Serrano-Andrs, L. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 299-306
30. Ghigo, G.; Roos, B. O.; Malmqvist, P.-Å. Chem. Phys. Lett. 2004, 396, 142-149
31. Cossi, M.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2427-2435
32. Robinson, D.; Besley, N. A.; Lunt, E. A. M.; Ob Shea, P.; Hirst, J. D. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 2535-2541
33. Robinson, D.; Besley, N. A.; Ob Shea, P.; Hirst, J. D. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 14521-14528
34. Widmark, P.-O.; Malmqvist, P.-A.; Roos, B. O. Theor. Chim. Acta 1990, 77, 291-306
35. Malmqvist, P. -Å.; Rendell, A.; Roos, B. O. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5477-5482
36. Karlström, G.; Lindh, R.; Malmqvist, P.-A.; Roos, B. O.; Ryde, U.; Veryazov, V.; Widmark, P.-O.; Cossi, M.; Schimmelpfennig, B.; Neogrady, P.; Seijo, L. Comput. Mater. Sci. 2003, 28, 222-239
37. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217
38. Feller, S; MacKerell, A. D., Jr. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 7510-7515
39. Krol, M.; Borowski, T.; Roterman, I.; Piekarska, B.; Stopa, B.; Rybarska, J.; Konieczny, L. J. Comput.-Aided Mol. Des. 2004, 18, 41-53
40. Yin, D. Parameterization for Empirical Force Field Calculations and A Theoretical Study of Membrane Permeability of Pyridine Derivative. Ph.D. Thesis, Department of Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy, University of Maryland, 1997.
41. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
42. Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
43. Darden, T.; York, D.; Pederson, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
44. Besley, N. A. Chem. Phys. Lett. 2004, 390, 124-129
45. Besley, N. A.; Oakley, M. T.; Cowan, A. J.; Hirst, J. D. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13502-13511
46. Besley, N. A.; Blundy, A. J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1701-1710
47. Potts, D. M.; Taylor, C. M.; Chaudhuri, R. K.; Freed, K. F. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2592-2600
48. Aquilante, F.; Malmqvist, P.-Å.; Pedersen, T. B.; Ghosh, A.; Roos, B. O. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 694-702
49. Robinson, D.; McDouall, J. J. W. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 9815-9822
50. Dreuw, A.; Weisman, J. L.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2943-2946
51. Tozer, D. J. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12697-12699
52. Gill, P. M. W.; Adamson, R. D.; Pople, J. A. Mol. Phys. 1996, 88, 1005-1009
53. Leininger, T.; Stoll, H.; Werner, H. J.; Savin, A. Chem. Phys. Lett. 1997, 275, 151-160
54. Iikura, H.; Tsuneda, T.; Yanai, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2001, 115, 3540-3544
55. Heyd, J.; Scuseria, G. E.; Ernzerhof, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8207-8215
56. Tawada, Y.; Tsuneda, T.; Yanagisawa, S.; Yanai, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 8425-8433
57. Toulouse, J.; Colonna, F.; Savin, A. Phys. Rev. A 2004, 70, 062505
58. Yanai, T.; Tew, D. P.; Handy, N. C. Chem. Phys. Lett. 2004, 393, 51-57
59. Kamiya, M.; Sekino, H.; Tsuneda, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2005, 122, 234111
60. Sato, T.; Tsuneda, T.; Hirao, K. Mol. Phys. 2005, 103, 1151-1164
61. Yanai, T.; Harrison, R. J.; Handy, N. C. Mol. Phys. 2005, 103, 413-424
62. Vydrov, O. A.; Heyd, J.; Krukau, A. V.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 2006, 125, 074106
63. Vydrov, O. A.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 2006, 125, 234109
64. Henderson, T. M.; Izmaylov, A. F.; Scuseria, G. E.; Savin, A. J. Chem. Phys. 2007, 127, 221103
65. Henderson, T. M.; Janesko, B. G.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 2008, 128, 194105
66. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868
67. Rohrdanz, M. A.; Martins, K. M.; Herbert, J. M. J. Chem. Phys. 2009, 130, 054112
68. Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650-654
69. Tozer, D. J.; Amos, R. D.; Handy, N. C.; Roos, B. O.; Serrano-Andres, L. Mol. Phys. 1999, 97, 859-868
70. Woolf, T. B.; Roux, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11631-11635