Single molecule fluorescence spectroscopy: A tool for protein studies approaching cellular environmental conditions

Soft Matter

Volumn 7, Issue 4, 2011, Pages 1254-1259

  Fitter, Jörg ^a   Katranidis, Alexandros ^a   Rosenkranz, Tobias ^a   Atta, Diaa ^a   Schlesinger, Ramona ^a   Büldt, Georg ^a  

^a FORSCHUNGSZENTRUM JÜLICH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELLULAR CONTEXTS; COMPLEX FORMATIONS; ENVIRONMENTAL CONDITIONS; HIGH SENSITIVITY; IN-SITU; MEMBRANE PROTEINS; MOLECULAR ASSEMBLY; PROTEIN COMPLEXES; RECENT PROGRESS; SAMPLE PREPARATION; SINGLE MOLECULE FLUORESCENCE; SINGLE-MOLECULE FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; SINGLE-MOLECULE TECHNIQUE;

BIOLOGICAL MEMBRANES; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; PROTEIN FOLDING;

MOLECULES;

EID: 79951493041     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0sm00538j     Document Type: Conference Paper

References (56)

1. T. Ha T. Enderle D. F. Ogletree D. S. Chemla P. R. Selvin S. Weiss Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 6264 6268
2. H. P. Lu L. Xun X. S. Xie Science 1998 282 1877 1882
3. M. Dahan A. A. Deniz T. J. Ha D. S. Chemla P. G. Schultz S. Weiss Chem. Phys. 1999 247 85 106
4. M. Bohmer J. Enderlein ChemPhysChem 2003 4 793 808
5. X. Michalet S. Weiss M. Jager Chem. Rev. 2006 106 1785 1813
6. A. A. Deniz S. Mukhopadhyay E. A. Lemke J. R. Soc., Interface 2008 5 15 45
7. C. Joo H. Balci Y. Ishitsuka C. Buranachai T. Ha Annu. Rev. Biochem 2008 77 51 76
8. G. Haran J. Phys.: Condens. Matter 2003 15 R1291 R1317
9. B. Schuler ChemPhysChem 2005 6 1206 1220
10. A. N. Kapanidis T. Strick Trends Biochem Sci. 2009 34 234 243
11. D. Zenisek J. A. Steyer W. Almers Nature 2000 406 849 854
12. U. Kubitscheck D. Grunwald A. Hoekstra D. Rohleder T. Kues J. P. Siebrasse R. Peters J. Cell Biol. 2005 168 233 243
13. G. Seisenberger M. U. Ried T. Endress H. Buning M. Hallek C. Brauchle Science 2001 294 1929 1932
14. G. J. Schutz G. Kada V. P. Pastushenko H. Schindler EMBO J. 2000 19 892 901
15. P. H. Lommerse B. E. Snaar-Jagalska H. P. Spaink T. Schmidt J. Cell Sci. 2005 118 1799 1809
16. J. Yu J. Xiao X. Ren K. Lao X. S. Xie Science 2006 311 1600 1603
17. S. W. Hell Nat. Biotechnol. 2003 21 1347 1355
18. E. Betzig G. H. Patterson R. Sougrat O. W. Lindwasser S. Olenych J. S. Bonifacino M. W. Davidson J. Lippincott-Schwartz H. F. Hess Science 2006 313 1642 1645
19. M. Bates B. Huang G. T. Dempsey X. Zhuang Science 2007 317 1749 1753
20. M. Heilemann L. S. van de M. Schuttpelz R. Kasper B. Seefeldt A. Mukherjee P. Tinnefeld M. Sauer Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 6172 6176
21. M. Heilemann P. Dedecker J. Hofkens M. Sauer Laser Photonics Rev. 2009 3 180 202
22. M. Dahan A. A. Deniz T. Ha J. R. Grunwell D. S. Chemla P. C. Schultz S. Weiss Biophys. J. 1999 76 A168
23. S. Weiss Science 1999 283 1676 1683
24. T. Ha, P. R. Selvin, Single-molecule techniques, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2008
25. E. Sisamakis A. Valeri S. Kalinin P. J. Rothwell C. A. Seidel Methods Enzymol. 2010 475 455 514
26. R. Roy S. Hohng T. Ha Nat. Methods 2008 5 507 516
27. A. Katranidis D. Atta R. Schlesinger K. H. Nierhaus T. Choli-Papadopoulou I. Gregor M. Gerrits G. Büldt J. Fitter Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 1758 1761
28. K. N. Fish Curr. Protoc. Cytom. 2009 12 12.18.1 12.18.13
29. D. Magde W. W. Webb E. Elson Phys. Rev. Lett. 1972 29 705 708
30. E. Haustein P. Schwille Methods 2003 29 153 166
31. X. Ren H. Li R. W. Clarke D. A. Alves L. Ying D. Klenerman S. Balasubramanian J. Am. Chem. Soc. 2006 128 4992 5000
32. S. C. Blanchard R. L. Gonzalez H. D. Kim S. Chu J. D. Puglisi Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 1008 1014
33. S. Uemura M. Dorywalska T. H. Lee H. D. Kim J. D. Puglisi S. Chu Nature 2007 446 454 457
34. S. Uemura R. Iizuka T. Ueno Y. Shimizu H. Taguchi T. Ueda J. D. Puglisi T. Funatsu Nucleic Acids Res. 2008 36 e70
35. D. Kajihara R. Abe I. Iijima C. Komiyama M. Sisido T. Hohsaka Nat. Methods 2006 3 923 929
36. I. Iijima T. Hohsaka ChemBioChem 2009 10 999 1006
37. E. Boukobza A. Sonnenfeld G. Haran J. Phys. Chem. B 2001 105 12165 12170
38. E. Rhoades E. Gussakovsky G. Haran Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 3197 3202
39. B. Okumus T. J. Wilson D. M. Lilley T. Ha Biophys. J. 2004 87 2798 2806
40. E. Rhoades M. Cohen B. Schuler G. Haran J. Am. Chem. Soc. 2004 126 14686 14687
41. T. Rosenkranz A. Katranidis D. Atta I. Gregor J. Enderlein M. Grzelakowski P. Rigler W. Meier J. Fitter ChemBioChem 2009 10 702 709
42. N. Marme J. P. Knemeyer M. Sauer J. Wolfrum Bioconjugate Chem. 2003 14 1133 1139
43. S. Doose H. Neuweiler M. Sauer ChemPhysChem 2005 6 2277 2285
44. P. Broz S. Driamov J. Ziegler N. Ben Haim S. Marsch W. Meier P. Hunziker Nano Lett. 2006 6 2349 2353
45. M. Kumar M. Grzelakowski J. Zilles M. Clark W. Meier Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 20719 20724
46. I. Cisse B. Okumus C. Joo T. Ha Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 12646 12650
47. D. Merkle N. Kahya P. Schwille ChemBioChem 2008 9 2673 2681
48. N. Kahya Biochim. Biophys. Acta 2010 1798 1392 1398
49. E. I. Pecheur D. Hoekstra J. Sainte-Marie L. Maurin A. Bienvenue J. R. Philippot Biochemistry 1997 36 3773 3781
50. N. Kahya E. I. Pecheur W. P. de Boeij D. A. Wiersma D. Hoekstra Biophys. J. 2001 81 1464 1474
51. J. Otomo W. Marwan D. Oesterhelt H. Desel R. Uhl J. Bacteriol. 1989 171 2155 2159
52. J. Kriegsmann I. Gregor d. H. I. von J. Klare M. Engelhard J. Enderlein J. Fitter ChemBioChem 2009 10 1823 1829
53. J. Kriegsmann M. Brehs J. P. Klare M. Engelhard J. Fitter Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 522 531
54. M. J. Levene J. Korlach S. W. Turner M. Foquet H. G. Craighead W. W. Webb Science 2003 299 682 686
55. J. M. Moran-Mirabal H. G. Craighead Methods 2008 46 11 17
56. S. Uemura C. E. Aitken J. Korlach B. A. Flusberg S. W. Turner J. D. Puglisi Nature 2010 464 1012 1017