A close look at fluorescence quenching of organic dyes by tryptophan

ChemPhysChem

Volumn 6, Issue 11, 2005, Pages 2277-2285

  Doose, Sören ^a   Neuweiler, Hannes ^a   Sauer, Markus ^a  

^a BIELEFELD UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

Contact induced fluorescence quenching; Dyes; Electron transfer; Fluorescence spectroscopy; Tryptophan

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BINDING ENERGY; BIOPOLYMERS; DYES; ELECTRON TRANSITIONS; EXCITED STATES; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE QUENCHING; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; MOLECULAR DYNAMICS; RATE CONSTANTS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

COMPARATIVE MEASUREMENTS; ELECTRON TRANSFER; FLUORESCENCE CORRELATION SPECTROSCOPY; GUANIDINE HYDROCHLORIDE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PHOTO-INDUCED ELECTRON TRANSFER; TIME-RESOLVED FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; TRYPTOPHAN;

QUENCHING;

EID: 27844487609     PISSN: 14394235     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200500191     Document Type: Article

References (52)

1. C. A. M. Seidel, A. Schulz, M. H. M. Sauer, J. Phys. Chem. 1996, 100, 5541-5553.
2. M. Sauer, K. T. Han, V. Ebert, R. Müller, A. Schulz, S. Seeger, J. Wolfrum, J. Arden-Jacob, G. Deltau, N. J. Marx, C. Zander, K. H. Drexhage, J. Fluoresc. 1995, 5, 247-261.
3. L. Edman, U. Mets, R. Rigler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 6710-6715.
4. C. Eggeling, J. R. Fries, L. Brand, R. Günther, C. A. Seidel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 1556-1561.
5. J. P. Knemeyer, N. Marme, M. Sauer, Anal. Chem. 2000, 72, 3717-3724.
6. O. Piestert, H. Barsch, V. Buschmann, T. Heinlein, J. P. Knemeyer, K. D. Weston, M. Sauer, Nano Lett. 2003, 3, 979-982.
7. T. Heinlein, J. P. Knemeyer, O. Piestert, M. Sauer, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 7957-7964.
8. H. Neuweiler, A. Schulz, A. C. Vaiana, J. C. Smith, S. Kaul, J. Wolfrum, M. Sauer, Angew. Chem. 2002, 114, 4964-4968;
9. Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 4769-4773.
10. H. Neuweiler, A. Schulz, M. Bohmer, J. Enderlein, M. Sauer, J. Am. Chem. Soc 2003, 125, 5324-5330.
11. A. C. Vaiana, H. Neuweiler, A. Schulz, J. Wolfrum, M. Sauer, J. C. Smith, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14 564-14 572.
12. N. Marme, J. P. Knemeyer, M. Sauer, J. Wolfrum, Bioconjugate Chem. 2003, 14, 1133-1139.
13. N. Marme, J. P. Knemeyer, J. Wolfrum, M. Sauer, Angew. Chem. 2004, 116, 3886-3890;
14. Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 3798-3801.
15. R. M. Watt, E. W. Voss, Jr., Immunochemistry 1977, 14, 533-551.
16. N. Emans, J. Biwersi, A. S. Verkman, Biophys. J. 1995, 69, 716-728.
17. I. Nazarenko, B. Lowe, M. Darfler, P. Ikonomi, D. Schuster, A. Rashtchian, Nucleic Acids Res. 2002, 30, e37.
18. I. Nazarenko, R. Pires, B. Lowe, M. Obaidy, A. Rashtchian, Nucleic Acids Res. 2002, 30, 2089-2195.
19. J. Karolin, L. B.-A. Johansson, L. Strandberg, T. Ny, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7801-7806.
20. S. Kurata, T. Kanagawa, K. Yamada, M. Torimura, T. Yokomaku, Y. Kamagata, R. Kurane, Nucleic Acids Res. 2001, 29, E34.
21. M. Sauer, Angew. Chem. 2003, 115, 1834-1837;
22. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 1790-1793.
23. F. D. Lewis, R. L. Letsinger, M. R. Wasielewski, Acc. Chem. Res. 2001, 34, 159-170.
24. H. A. Wagenknecht, E. D. Stemp, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1-7.
25. D. Zhong, A. H. Zewail, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 11 867-11 872.
26. H. Yang, G. Luo, P. Karnchanaphanurach, T. M. Louie, I. Rech, S. Cova, L. Xun, X. S. Xie, Science 2003, 302, 262-266.
27. H. Neuweiler, M. Sauer, Curr. Pharm. Biotechnol. 2004, 5, 285-298.
28. H. Neuweiler, M. Sauer, Anal. Chem. 2005, 77, 179A-185A.
29. D. Magde, E. L. Elson, W. W. Webb, Biopolymers 1974, 13, 29-61.
30. R. Rigler, U. Mets, J. Widengren, P. Kask, Eur. Biophys. J. 1993, 22, 169-175.
31. S. T. Hess, S. Huang, A. A. Heikal, W. W. Webb, Biochemistry 2002, 41, 697-705.
32. O. Krichevsky, G. Bonnet, Rep. Prag. Phys. 2002, 65, 251-297.
33. J. Widengren, J. Dapprich, R. Rigler, Chem. Phys. 1997, 216, 417-426.
34. J. Widengren, U. Mets, R. Rigler, J. Phys. Chem. 1995, 99, 13 368-13 379.
35. J. Widengren, P. Schwille, J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6416-6428.
36. D. R. Larson, W. R. Zipfel, R. M. Williams, S. W. Clark, M. P. Bruchez, F. W. Wise, W. W. Webb, Science 2003, 300, 1434-1436.
37. S. Doose, J. M. Tsay, F. Pinaud, S. Weiss, Anal. Chem. 2005, 77, 2235-2242.
38. J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Plenum Press, New York, 1999.
39. V. Buschmann, K. D. Weston, M. Sauer, Bioconjugate Chem. 2003, 14, 195-204.
40. M. D. Cohen, E. Fischer, J. Chem. Soc. 1962, 2, 3044-3052.
41. J. M. Frank, S. J. Wawilow, Z. Phys. 1931, 69, 100-110.
42. D. M. Adams, L. Brus, C. E. D. Chidsey, S. Creager, C. Creutz, C. R. Kagan, P. V. Kamat, M. Lieberman, S. Lindsay, R. A. Marcus, R. M. Metzger, M. E. Michel-Beyerle, J. R. Miller, M. D. Newton, D. R. Rolison, O. Sankey, K. S. Schanze, J. Yardley, X. Zhu, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 6668-6697.
43. A. Einstein, Ann. Phys. 1905, 17, 549-560
44. B. J. Berne, R. Pecora, Dynamic Light Scattering, Wiley, New York, 1976.
45. M. L. Sheely, Ind. Eng. Chem. 1932, 24, 1060-1064.
46. K. Kawahara, C. Tanford, J. Biol. Chem. 1966, 241, 3228-3232.
47. K. Chattopadhyay, S. Saffarian, E. L. Elson, C. Frieden, Biophys. J. 2005, 88, 1413-1422.
48. S. Hell, G. Reiner, C. Cremer, E. H. K. Stelzer, J. Microsc. 1993, 169, 391-405.
49. A. N. Kapanidis, N. K. Lee, T. A. Laurence, S. Doose, E. Margeat, S. Weiss, Proc. Natl. Acad Sci. USA 2004, 101, 8936-8941.
50. R. R. Hudgins, F. Huang, G. Gramlich, W. M. Nau, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 556-564.
51. W. M. Nau, X. Wang, ChemPhysChem 2002, 3, 393-398.
52. M. Buscaglia, J. Kubelka, W. A. Eaton, J. Hofrichter, J. Mol. Biol. 2005, 347, 657-664.