On the different roles of anions and cations in the solvation of enzymes in ionic liquids

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 4, 2011, Pages 1649-1662

  Klähn, Marco ^a   Lim, Geraldine S ^a   Seduraman, Abirami ^a   Wu, Ping ^a  

^a INSTITUTE OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANION; CATION; IONIC LIQUID; LIPASE B, CANDIDA ANTARCTICA; TRIACYLGLYCEROL LIPASE;

ARTICLE; CHEMISTRY; ENZYME ACTIVE SITE; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; STATIC ELECTRICITY; SURFACE PROPERTY; THERMODYNAMICS;

ANIONS; CATALYTIC DOMAIN; CATIONS; IONIC LIQUIDS; LIPASE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; STATIC ELECTRICITY; SURFACE PROPERTIES; THERMODYNAMICS;

EID: 78651330977     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp01509a     Document Type: Article

References (58)

1. T. Welton Chem. Rev. 1999 99 2071 2083
2. R. D. Rogers K. R. Seddon Science 2003 302 792 793
3. K. R. Seddon Nat. Mater. 2003 2 363 365
4. P. Wasserscheid and T. Welton, Ionic Liquids in Synthesis, Wiley-VCH, Weinheim, 2003
5. J. F. Brennecke E. J. Maginn AIChE J. 2001 47 2384 2389
6. J. L. Anderson J. Ding T. Welton D. W. Armstrong J. Am. Chem. Soc. 2002 124 14247 14254
7. A. M. Klibanov Nature 2001 409 241 246
8. R. M. Lau F. van Rantwijk K. R. Seddon R. A. Sheldon Org. Lett. 2000 2 4189 4191
9. S. G. Cull J. D. Holbrey V. Vargas-Mora K. R. Seddon G. J. Lye Biotechnol. Bioeng. 2000 69 227 233
10. M. Erbeldinger A. J. Mesiano A. J. Russell Biotechnol. Prog. 2000 16 1129 1131
11. F. van Rantwijk R. A. Sheldon Chem. Rev. 2007 107 2757 2785
12. M. Moniruzzaman K. Nakashima N. Kamiya M. Goto Biochem. Eng. J. 2010 48 295 314
13. S. Park R. J. Kazlauskas J. Org. Chem. 2001 66 8395 8401
14. J. L. Kaar A. M. Jesionowski J. A. Berberich R. Moulton A. J. Russell J. Am. Chem. Soc. 2003 125 4125 4131
15. T. de Diego P. Lozano S. Gmouh M. Vaultier J. L. Iborra Biotechnol. Bioeng. 2004 88 916 924
16. W. Y. Lou M. H. Zong T. J. Smith H. Wu J. F. Wang Green Chem. 2006 8 509 512
17. T. Page N. D. Kraut P. M. Page G. A. Baker F. V. Bright J. Phys. Chem. B 2009 113 12825 12830
18. R. M. Lau M. J. Sorgedrager G. Carrea F. van Rantwijk F. Secundo R. A. Sheldon Green Chem. 2004 6 483 487
19. F. van Rantwijk F. Secundo R. A. Sheldon Green Chem. 2005 8 282 286
20. H. Zhao G. A. Baker Z. Song O. Olubajo T. Crittle D. Peters Green Chem. 2008 10 696 705
21. Z. Yang J. Biotechnol. 2009 144 12 22
22. E. J. Maginn J. Phys.: Condens. Matter 2009 21 373101 373117
23. N. M. Micaelo V. H. Teixeira A. M. Baptista C. M. Soares Biophys. J. 2005 89 999 1008
24. N. M. Micaêlo C. M. Soares J. Phys. Chem. B 2008 112 2566 2572
25. P. Lozano T. de Diego J. P. Guegan M. Vaultier J. L. Iborra Biotechnol. Bioeng. 2001 75 563 569
26. C. A. Summers R. A. Flowers II Protein Sci. 2000 9 2001 2008
27. M. Klähn A. Seduraman P. Wu J. Phys. Chem. B 2008 112 10989 11004
28. W. D. Cornell P. Cieplak C. I. Bayly I. R. Gould K. M. Merz D. M. Ferguson D. C. Spellmeyer T. Fox J. W. Caldwell P. A. Kollman J. Am. Chem. Soc. 1995 117 5179 5197
29. E. J. Sorin V. S. Pande Biophys. J. 2005 88 2472 2493
30. A. Seduraman M. Klähn P. Wu CALPHAD: Comput. Coupling Phase Diagrams Thermochem. 2009 33 605 613
31. M. Klähn C. Stüber A. Seduraman P. Wu J. Phys. Chem. B 2010 114 2856 2868
32. J. N. C. Lopes A. A. H. Padua K. Shimizu J. Phys. Chem. B 2008 112 5039 5046
33. M. Klähn A. Seduraman P. Wu J. Phys. Chem. B 2008 112 13849 13861
34. M. W. Mahoney W. L. Jorgensen J. Chem. Phys. 2000 112 8910 8922
35. M. W. Mahoney W. L. Jorgensen J. Chem. Phys. 2001 114 363 366
36. A. Chaumont R. Schurhammer G. Wipff J. Phys. Chem. B 2005 109 18964 18973
37. J. Uppenberg M. T. Hansen S. Patkar T. A. Jones Structure 1994 2 293 308
38. A. Warshel G. Naray-Szabo F. Sussman J.-K. Hwang Biochemistry 1989 28 3629 3637
39. J. Uppenberg N. Ohrner M. Norin K. Hult G. J. Kleywegt S. Patkar V. Waagen T. Anthonsen T. A. Jones Biochemistry 1995 34 16838 16851
40. D. Bashford, Scientific Computing in Object-Oriented Parallel Environments, Springer, Berlin/Heidelberg, 1997, vol. 1343, pp. 233-240
41. D. Van der Spoel E. Lindahl B. Hess G. Groenhof A. E. Mark H. J. C. Berendsen J. Comput. Chem. 2005 26 1701 1718
42. T. Darden D. York L. Pedersen J. Chem. Phys. 1993 98 10089 10092
43. U. Essmann L. Perera M. L. Berkowitz T. Darden H. Lee L. G. Pedersen J. Chem. Phys. 1995 103 8577 8593
44. M. P. Allen and D. J. Tildesley, Computer simulations of liquids, Oxford Science Publications, Oxford, 1987
45. H. J. C. Berendsen J. P. M. Postma A. DiNola J. R. Haak J. Chem. Phys. 1984 81 3684 3690
46. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
47. C. T. Lee W. T. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B 1988 37 785 789
48. M. J. Frisch, et al., Gaussian 03, Revision C.02, Gaussian Inc, Wallingford, CT, 2004
49. A. Warshel M. Levitt J. Mol. Biol. 1976 103 227 249
50. M. Klähn S. Braun-Sand E. Rosta A. Warshel J. Phys. Chem. B 2005 109 15645 15650
51. C. M. Breneman K. B. Wiberg J. Comput. Chem. 1990 11 361 373
52. A. Warshel, Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions, John Wiley & Sons, 1997
53. C. Wakai A. Oleinikova M. Ott H. Weingartner J. Phys. Chem. B 2005 109 17028 17030
54. Y. T. Wang G. A. Voth J. Am. Chem. Soc. 2005 127 12192 12193
55. A. Triolo O. Russina H. J. Bleif E. Di Cola J. Phys. Chem. B 2007 111 4641 4644
56. A. Triolo O. Russina B. Fazio G. B. Appetecchi M. Carewska S. Passerini J. Chem. Phys. 2009 130 164521
57. J. C. McGowan J. Appl. Chem. Biotechnol. 1978 28 599 607
58. Y. H. Zhao M. H. Abraham A. M. Zissimos J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003 43 1848 1854