Molecular dynamics simulations and QM/MM studies of the reactivation by 2-PAM of tabun inhibited human acethylcolinesterase

Journal of the Brazilian Chemical Society

Volumn 22, Issue 1, 2011, Pages 155-165

  Da Silva Gonçalves, Arlan ^a   França, Tanos C C ^b   Figueroa Villar, José D ^b   Pascutti, Pedro G ^c  

^a Instituto Militar de Engenharia ^*  (Brazil)

^b MILITARY INSTITUTE OF ENGINEERING   (Brazil)

^c FEDERAL UNIVERSITY OF RIO DE JANEIRO   (Brazil)

Author keywords

Acethylcolinesterase; Molecular dynamics; Pralidoxime; QM MM studies

Indexed keywords

EID: 78650957877     PISSN: 01035053     EISSN: 16784790     Source Type: Journal    
DOI: 10.1590/s0103-50532011000100021     Document Type: Article

References (40)

1. Delfino, R. T.; Ribeiro, T. S.; Figueroa-Villar, J. D.; J. Braz. Chem. Soc. 2009, 20, 407.
2. Ekstrom, F. J.; Astot, C.; Pang, Y. P.; Clin. Pharmacol. Ther. 2007, 82, 282.
3. Worek, F.; Aurbek, N.; Koller, M.; Becker, C.; Eyer, P.; Thiermann, H.; Biochem. Pharmacol. 2007, 73, 1807.
4. Castro, A. T.; Figueroa-Villar, J. D.; Int. J. Quantum Chem. 2002, 89, 135.
5. Gonçalves, A. S.; França, T. C. C.; Wilter, A.; Figueroa-Villar, J. D.; J. Braz. Chem. Soc. 2006, 17, 968.
6. Gonçalves, A. S.; França, T. C. C.; Figueroa-Villar, J. D.; Pascutti, P. G.; J. Braz. Chem. Soc. 2010, 21, 179.
7. Delfino, R. T.; Figueroa-Villar, J. D.; J. Phys. Chem. B 2009, 113, 8402.
8. Smirnova, O. I.; Gurina, E. I.; Zhigalova, L. V.; Arestova, L. S.; Farmakologiya I Toksikologiya 1975, 38, 467.
9. Bay, E.; Krop, S.; Yates, L. F.; Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 1958, 98, 107.
10. Kuča, K.; Cabal, J.; Jun, D.; Kassa, J.; Bartosova, L.; Kunesova, G.; J. Appl. Toxicol. 2005, 25, 296.
11. Nemukhin, A. V.; Lushchekina, S. V.; Bochenkova, A. V.; Golubeva, A. A.; Varfolomeev, S. D.; J. Mol. Mod. 2008, 14, 409.
12. Lu, Z. Y.; Zhang, Y. K.; J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1237.
13. Shoeib, T.; Ruggiero, G. D.; Siu, K. W. M.; Hopkinson, A. C.; Williams, I. H.; J. Chem. Phys. 2002, 117, 2762.
14. Ramalho, T. C.; França, T. C. C.; Rennó, M. N.; Guimarães, A. P.; Cunha, E. F. F.; Kuča, K.; Chem.-Biol. Interact. 2010, 185, 73.
15. Aqvist, J.; Warshel, A.; Chem. Rev. 1993, 93, 2523.
16. Ramalho, T. C.; Caetano, M. S.; da Cunha, E. F. F.; Souza, T. C. S.; Rocha, M. V. J.; J. Biomol. Struct. Dyn. 2009, 27, 195.
17. Kwasnieski, O.; Verdier, L.; Malacria, M.; Derat, E.; J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10001.
18. Ramalho, T. C.; da Cunha, E. F. F.; de Alencastro, R. B.; J. Phys.: Condens. Matter 2004, 16, 6159.
19. Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J.; J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701.
20. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J.; J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.
21. Kahn, K.; Bruice, T. C.; J. Comput. Chem. 2001, 23, 977.
22. Brenamann, C. M.; Wiberg, K. B.; J. Comput. Chem. 1990, 11, 361.
23. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347.
24. Neumann, M.; J. Chem. Phys. 1986, 85, 1567.
25. Elhawary, M. E.; Wellon, O. K.; IEEE Trans. Power Apparatus Systm. 1982, 101, 854.
26. Lootsma, F. A.; Lecture Notes in Economics and Mathematical Systems 1991, 367, 1.
27. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L.; J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
28. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G.; J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
29. Li, H.; Robertson, A. D.; Jensen, J. H.; Proteins 2005, 61, 704.
30. Bas, D. C.; Rogers, D. M.; Jensen, J. H.; Proteins 2008, 73, 765.
31. Delano, W. L.; DeLano Scientific; Palo Alto, CA, USA, 2002.
32. Delano, W. L.; Brinberg, S.; DeLano Scientific LLC; San Francisco, CA, 2004.
33. Morokuma, K.; Dapprich, S.; Komaromi, I.; Froese, R. D.; Holthausen, M.; Musaev, D. G.; Byun, S.; Khoroshun, S.; Abstracts of Papers of the American Chemical Society 1997, 214, 74.
34. Morokuma, K.; Froese, R. D.; Dapprich, S.; Komaromi, I.; Khoroshun, D.; Byun, S.; Musaev, D. G.; Emerson, C. L.; Abstracts of Papers of the American Chemical Society 1998, 215, U218.
35. Boggio-Pasqua, M.; Robb, M. A.; Groenhof, G.; J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13580.
36. Groenhof, G.; Schafer, L. V.; Boggio-Pasqua, M.; Grubmuller, H.; Robb, M. A.; J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 3250.
37. Donnini, S.; Groenhof, G.; Wierenga, R. K.; Juffer, A. H.; Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006, 64, 700.
38. Gray, A. P.; Drug Metab. Rev. 1984, 15, 557.
39. Cope, A. C.; Lebel, N. A.; Moore, W. R.; Moore, P. T.; J. Am. Chem. Soc. 1961, 83, 3861.
40. Cope, A. C.; Mehta, A. S.; J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 1949.