Effects of the lipid bilayer phase state on the water membrane interface

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 36, 2010, Pages 11784-11792

  Stȩpniewski, Michał ^a   Bunker, Alex ^b,c   Pasenkiewicz Gierula, Marta ^a   Karttunen, Mikko ^d   Róg, Tomasz ^e,f  

^a JAGIELLONIAN UNIVERSITY   (Poland)

^b UNIVERSITY OF HELSINKI   (Finland)

^c AALTO UNIVERSITY   (Finland)

^d Department of Applied Mathematics ^*  (Canada)

^e UNIVERSITY OF WESTERN ONTARIO   (Canada)

^f TAMPERE UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Finland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBONYLATION; CRYSTALLINE MATERIALS; GELS; ION EXCHANGE; LIPID BILAYERS; LIQUIDS;

BI-LAYER; CARBONYL GROUPS; COMPACT STRUCTURES; GEL PHASE; HEAD GROUPS; INTERFACIAL REGION; IONIC PENETRATION; LIQUID-CRYSTALLINE; LIQUID-CRYSTALLINE PHASE; MD SIMULATION; MEMBRANE INTERFACE; PHASE STATE; PHOSPHATIDYLCHOLINE; WATER INTERACTIONS; WATER LAYERS; WATER MEMBRANE;

PHASE INTERFACES;

EID: 77956519357     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp104739a     Document Type: Article

References (86)

1. Feigenson, G. W. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 47-52
2. Lasic, D. D. Trends Biotechnol. 1998, 16, 307-321
3. Farokhzad, O. C.; Langer, R. ACS Nano 2009, 3, 16-20
4. Mouritsen, O. G. Life-As a Matter of Fat; Springer: Berlin, 2005.
5. Mouritsen, O. G.; Jørgensen, K. Chem. Phys. Lipids 1994, 73, 3-25
6. Pabst, G.; Danner, S.; Karmakar, S.; Deutsch, G.; Raghunathan, V. A. Biophys. J. 2007, 93, 513-525
7. Sevcsik, E.; Pabst, G.; Jilek, A.; Lohner, K. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 2586-2595
8. Paasonen, L.; Romberg, B.; Storm, G.; Yliperttula, M.; Urtti, A.; Hennink, W. E. Bioconjugate Chem. 2007, 18, 2131-2136
9. Sammalkorpi, M.; Karttunen, M.; Haataja, M. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 17977-17980
10. Murtola, T.; Bunker, A.; Vattulainen, I.; Deserno, M.; Karttunen, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 1869-1892
11. Pasenkiewicz-Gierula, M.; Takaoka, Y.; Miyagawa, H.; Kitamura, K.; Kusumi, A. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3677-3691
12. Pasenkiewicz-Gierula, M.; Takaoka, Y.; Miyagawa, H.; Kitamura, K.; Kusymi, A. Biophys. J. 1999, 76, 1228-1240
13. Yeghiazaryana, G. A.; Poghosyana, A. H.; Shahinyan, A. A. Phys. A (Amsterdam, Neth.) 2006, 362, 197-203
14. Róg, T.; Murzyn, K.; Pasenkiewicz-Gierula, M. Chem. Phys. Lett. 2002, 352, 323-327
15. Murzyn, K.; Zhao, W.; Karttunen, M.; Kurdziel, M.; Róg, T. Biointerphases 2006, 1, 98-105
16. Eun, C.; Berkowitz, M. L. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 13222-13228
17. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L. Langmuir 1995, 11, 4519-4531
18. Pertsin, A.; Platonov, D.; Grunze, M. Langmuir 2007, 23, 1388-1393
19. Perera, L.; Essmann, U.; Berkowitz, M. L. Langmuir 1996, 12, 2625-2629
20. Tieleman, D. P.; Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1331, 235-270
21. Pandit, S. A.; Bostick, D.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2003, 85, 3120-3131
22. Pandit, S. A.; Bostick, D.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2003, 84, 3743-3750
23. Pandit, S. A.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2002, 82, 1818-1827
24. Vacha, R.; Berkowitz, M. L.; Jungwirth, P. Biophys. J. 2009, 96, 4493-4501
25. Lopez Cascales, J. J.; Otero, T. F.; Smith, B. D.; Gonzalez, C.; Marquez, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 2358-2363
26. Berkowitz, M. L.; Bostick, D. L.; Pandit, S. Chem. Rev. 2006, 106, 1527-1539
27. Poyry, S.; Róg, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 15513-15521
28. Böckmann, R. A.; Grubmüller, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1021-1024
29. Porasso, R. D.; López Cascales, J. J. Colloids Surf., B 2009, 4, 2-50
30. Zhao, W.; Róg, T.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Biophys. J. 2007, 92, 1114-1124
31. Zhao, W.; Róg, T.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Biochimie 2008, 90, 930-938
32. Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1953-1962
33. Gurtovenko, A. A.; Miettinen, M.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 21126-21134
34. Miettinen, M. S.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 9226-9234
35. Gurtovenko, A. A.; Miettinen, M.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 21126-21134
36. Fyta, M.; Kalcher, I.; Dzubiella, J.; Vrbka, L.; Netz, R. R. J. Chem. Phys. 2010, 132 024911
37. Horinek, D.; Mamatkulov, S. I.; Netz, R. R. J. Chem. Phys. 2009, 130, 124507
38. Patra, M.; Karttunen, M. J. Comput. Chem. 2004, 25, 678-689
39. Cordom, A.; Edholm, O.; Perez, J. J. J. Phys. Chem. B. 2008, 112, 1397-1408
40. Róg, T.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 97-121
41. Pandit, S. A.; Scott, H. L. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 136-148
42. Berkowitz, M. L. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 86-96
43. Marrink, S. J.; de Vries, A. H.; Tieleman, D. P. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 149-168
44. Tu, K.; Tobias, D. J.; Blasie, J. K.; Klein, M. L. Biophys. J. 1996, 70, 595-608
45. Venable, R. M.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W. J. Chem. Phys. 2000, 112, 4822-4832
46. Heller, H.; Schaefer, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8343-8360
47. Curdova, J.; Capkova, P.; Plasek, J.; Repakova, J.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3640-3650
48. Pimthon, J.; Willumeit, R.; Lendlein, A.; Hofmann, D. J. Mol. Struct. 2009, 921, 38-50
49. Coppock, P. S.; Kindt, J. T. Langmuir 2009, 25, 352-359
50. Leekumjorn, S.; Sum, A. K. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6026-6033
51. Leekumjorn, S.; Sum, A. K. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 354-365
52. Debnath, A.; Ayappa, K. G.; Kumaran, V.; Maiti, P. K. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10660-10668
53. de Vries, A. H.; Yefimov, S.; Mark, A. E.; Marrink, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 5392-5396
54. Cascales, J. J. L.; Otero, T. F.; Fernandez-Romero, A. J.; Camacho, L. Langmuir 2006, 22, 5818-5824
55. Marrink, S. J.; Risselada, J.; Mark, A. E. Chem. Phys. Lipids 2005, 135, 223-244
56. Koynova, R.; Caffrey, M. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1376, 91-145
57. Róg, T.; Martinez-Seara, H.; Munck, N.; Oresic, M.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 3413-3422
58. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236
59. Rizzo, R. C.; Jorgensen, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4827-4836
60. Price, M. L.; Ostrovsky, D.; Jorgensen, W. L. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1340-1352
61. Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6474-6487
62. Róg, T.; Bunker, A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. J. Phys. Chem. B. 2007, 111, 10146-10154
63. Takaoka, Y.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Miyagawa, H.; Kitamura, K.; Tamura, Y.; Kusumi, A. Biophys. J. 2000, 79, 3118-3138
64. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
65. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317
66. van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701-1718
67. Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472
68. Nose, S. J. Chem. Phys. 1984, 81, 511-519
69. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697
70. Parrinello, M.; Rahman, A. J. Appl. Phys. 1981, 52, 7182-7190
71. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8592
72. Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvonen, M. T.; Falck, E.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4485-4494
73. Sun, W. J.; Tristram-Nagle, S.; Suter, R. M.; Nagle, J. F. Biophys. J. 1996, 71, 885-891
74. Davis, J. H. Biochim. Biophys. Acta 1983, 737, 117-171
75. Pasenkiewicz-Gierula, M.; Róg, T.; Kitamura, K.; Kusumi, A. Biophys. J. 2000, 78, 1376-1389
76. Rapaport, D. C. Mol. Phys. 1983, 50, 1151-1162
77. Chandra, A. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 768-771
78. Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 115505
79. Róg, T.; Murzyn, K.; Milchoud, J.; Karttunen, M.; Pasenkiewicz-Gierula, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 2378-2387
80. Siu, S. W. I.; Vacha, R.; Jungwirth, P.; Bockmann, R. A. J. Chem. Phys. 2008, 128, 125103
81. Vacha, R.; Siu, S. W. I.; Petrov, M.; Bockmann, R. A.; Barucha-Kraszewska, J.; Jurkiewicz, P.; Hof, M.; Berkowitz, M. L.; Jungwirth, P. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 7235-7243
82. Tristram-Nagle, S.; Zhang, R.; Suter, R. M.; Worthington, C. R.; Sun, W. J.; Nagle, J. F. Biophys. J. 1993, 64, 1097-1109
83. Shinoda, K.; Shinoda, W.; Mikami, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 643-650
84. Aroti, A.; Leontidis, E.; Dubois, M.; Zembb, T.; Brezesinski, G. Colloids Surf., A 2007, 303, 144-158
85. Sun, W.-J.; Suter, R. M.; Knewtson, M. A.; Worthington, C. R.; Tristram-Nagle, S.; Zhang, R.; Nagle, J. F. Phys. Rev. E 1993, 49, 4665-4676
86. Katsaras, J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 4141-4147