-
3
-
-
0004173503
-
Interactions in macromolecular complexes used as non-viral vectors for gene delivery
-
3rd ed, Templeton, N. S, Ed, CRC:, Chapter 7
-
Podgornik, R.; Harries, D.; DeRouchey, J.; Strey, H. H.; Parsegian, V. A. Interactions in macromolecular complexes used as non-viral vectors for gene delivery. In Gene and Cell Therapy: Therapeutic Mechanisms and Strategies, 3rd ed.; Templeton, N. S., Ed.; CRC: 2008; Chapter 7.
-
(2008)
Gene and Cell Therapy: Therapeutic Mechanisms and Strategies
-
-
Podgornik, R.1
Harries, D.2
DeRouchey, J.3
Strey, H.H.4
Parsegian, V.A.5
-
9
-
-
30844443071
-
-
Luo, G.; Malkova, S.; Yoon, J.; Schultz, D. G.; Lin, B.; Meron, M.; Benjamin, I.; Vanysek, P.; Schlossman, M. L. Science 2006, 311, 216-218.
-
(2006)
Science
, vol.311
, pp. 216-218
-
-
Luo, G.1
Malkova, S.2
Yoon, J.3
Schultz, D.G.4
Lin, B.5
Meron, M.6
Benjamin, I.7
Vanysek, P.8
Schlossman, M.L.9
-
10
-
-
0023024664
-
-
Marra, J. Biophys. J. 1986, 50, 815-825.
-
(1986)
Biophys. J
, vol.50
, pp. 815-825
-
-
Marra, J.1
-
11
-
-
36449005629
-
-
Kekicheff, P.; Marcelja, S.; Senden, T. J.; Shubin, V. E. J. Chem. Phys. 1993, 99, 6098-6113.
-
(1993)
J. Chem. Phys
, vol.99
, pp. 6098-6113
-
-
Kekicheff, P.1
Marcelja, S.2
Senden, T.J.3
Shubin, V.E.4
-
12
-
-
0034213524
-
-
Fielden, M. L.; Hayes, R. A.; Ralston, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 2623-2628.
-
(2000)
Phys. Chem. Chem. Phys
, vol.2
, pp. 2623-2628
-
-
Fielden, M.L.1
Hayes, R.A.2
Ralston, J.3
-
13
-
-
25444501517
-
-
Quesada-Perez, M.; Gonzalez-Tovar, E.; Martin-Molina, A.; Lozada-Cassou, M.; Hidalgo-Alvarez, R. Colloids Surf., A 2005, 267, 24-30.
-
(2005)
Colloids Surf., A
, vol.267
, pp. 24-30
-
-
Quesada-Perez, M.1
Gonzalez-Tovar, E.2
Martin-Molina, A.3
Lozada-Cassou, M.4
Hidalgo-Alvarez, R.5
-
14
-
-
33744473301
-
-
Angelini, T. E.; Golestanian, R.; Coridan, R. H.; Butler, J. C.; Beraud, A.; Krisch, M.; Sinn, H.; Schweizer, K. S.; Wong, G. C. L. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 7962-7967.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci
, vol.103
, pp. 7962-7967
-
-
Angelini, T.E.1
Golestanian, R.2
Coridan, R.H.3
Butler, J.C.4
Beraud, A.5
Krisch, M.6
Sinn, H.7
Schweizer, K.S.8
Wong, G.C.L.9
-
15
-
-
0003779959
-
-
Holm, C, Kékicheff, P, Podgornik, R, Eds, Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands
-
Electrostatic Effects in Soft Matter and Biophysics; Holm, C., Kékicheff, P., Podgornik, R., Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 2001.
-
(2001)
Electrostatic Effects in Soft Matter and Biophysics
-
-
-
17
-
-
0036055199
-
-
Grosberg, A. Y.; Nguyen, T. T.; Shklovskii, B. I. Rev. Mod. Phys. 2002, 74, 329-345.
-
(2002)
Rev. Mod. Phys
, vol.74
, pp. 329-345
-
-
Grosberg, A.Y.1
Nguyen, T.T.2
Shklovskii, B.I.3
-
19
-
-
42749102137
-
-
Patra, M.; Patriarca, M.; Karttunen, M. Phys. Rev.E 2003, 67, 031402.
-
(2003)
Phys. Rev.E
, vol.67
, pp. 031402
-
-
Patra, M.1
Patriarca, M.2
Karttunen, M.3
-
20
-
-
79051469989
-
-
Punkkinen, O.; Naji, A.; Podgornik, R.; Vattulainen, I.; Hansen, P.-L. Europhys. Lett. 2008, 82, 48001.
-
(2008)
Europhys. Lett
, vol.82
, pp. 48001
-
-
Punkkinen, O.1
Naji, A.2
Podgornik, R.3
Vattulainen, I.4
Hansen, P.-L.5
-
21
-
-
38349011110
-
-
Falck, E.; Rog, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 44-45.
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc
, vol.130
, pp. 44-45
-
-
Falck, E.1
Rog, T.2
Karttunen, M.3
Vattulainen, I.4
-
24
-
-
21344449255
-
-
Richardsen, H.; Vierl, U.; Cevc, G.; Fenzl, W. Europhys. Lett. 1996, 34, 543-548.
-
(1996)
Europhys. Lett
, vol.34
, pp. 543-548
-
-
Richardsen, H.1
Vierl, U.2
Cevc, G.3
Fenzl, W.4
-
28
-
-
0017116260
-
-
Hauser, H.; Phillips, M. C.; Levine, B. A.; Williams, R. J. P. Nature 1976, 261, 390-394.
-
(1976)
Nature
, vol.261
, pp. 390-394
-
-
Hauser, H.1
Phillips, M.C.2
Levine, B.A.3
Williams, R.J.P.4
-
29
-
-
0019891896
-
-
Lis, L. J.; Lis, W. T.; Parsegian, V. A.; Rand, R. P. Biochemistry 1981, 20, 1771-17777.
-
(1981)
Biochemistry
, vol.20
, pp. 1771-17777
-
-
Lis, L.J.1
Lis, W.T.2
Parsegian, V.A.3
Rand, R.P.4
-
33
-
-
0041320867
-
-
Böckmann, R. A.; Hac, A.; Heimburg, T.; Grubmüller, H. Biophys. J. 2003, 85, 1647-1655.
-
(2003)
Biophys. J
, vol.85
, pp. 1647-1655
-
-
Böckmann, R.A.1
Hac, A.2
Heimburg, T.3
Grubmüller, H.4
-
34
-
-
23944438424
-
-
Petrache, H. I.; Kimchi, I.; Harries, D.; Parsegian, V. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11546-11547.
-
(2005)
J. Am. Chem. Soc
, vol.127
, pp. 11546-11547
-
-
Petrache, H.I.1
Kimchi, I.2
Harries, D.3
Parsegian, V.A.4
-
35
-
-
24144502022
-
-
Garcia-Manyes, S.; Oncins, G.; Sanz, F. Biophys. J. 2005, 89, 1812-1826.
-
(2005)
Biophys. J
, vol.89
, pp. 1812-1826
-
-
Garcia-Manyes, S.1
Oncins, G.2
Sanz, F.3
-
36
-
-
33745275187
-
-
Garcia-Manyes, S.; Oncins, G.; Sanz, F. Electrochim. Acta 2006, 51, 5029-5036.
-
(2006)
Electrochim. Acta
, vol.51
, pp. 5029-5036
-
-
Garcia-Manyes, S.1
Oncins, G.2
Sanz, F.3
-
37
-
-
33244480778
-
-
Petrache, H. I.; Tristram-Nagle, S.; Harries, D.; Kucerka, N.; Nagle, J. F.; Parsegian, V. A. J. Lipid Res. 2006, 47, 302-309.
-
(2006)
J. Lipid Res
, vol.47
, pp. 302-309
-
-
Petrache, H.I.1
Tristram-Nagle, S.2
Harries, D.3
Kucerka, N.4
Nagle, J.F.5
Parsegian, V.A.6
-
38
-
-
33744495078
-
-
Petrache, H. I.; Zemb, T.; Belloni, L.; Parsegian, V. A. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 7982-7987.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci
, vol.103
, pp. 7982-7987
-
-
Petrache, H.I.1
Zemb, T.2
Belloni, L.3
Parsegian, V.A.4
-
39
-
-
34548647556
-
-
Aroti, A.; Leontidis, E.; Dubois, M.; Zemb, T. Biophys. J. 2007, 93, 1580-1590.
-
(2007)
Biophys. J
, vol.93
, pp. 1580-1590
-
-
Aroti, A.1
Leontidis, E.2
Dubois, M.3
Zemb, T.4
-
40
-
-
33847721438
-
-
Fukuma, T.; Higgins, M. J.; Jarvis, S. P. Phys. Rev. Lett. 2007, 98, 106101.
-
(2007)
Phys. Rev. Lett
, vol.98
, pp. 106101
-
-
Fukuma, T.1
Higgins, M.J.2
Jarvis, S.P.3
-
41
-
-
35349028301
-
-
Pabst, G.; Hodzic, A.; Strancar, J.; Danner, S.; Rappolt, M.; Laggner, P. Biophys. J. 2007, 93, 2688-2696.
-
(2007)
Biophys. J
, vol.93
, pp. 2688-2696
-
-
Pabst, G.1
Hodzic, A.2
Strancar, J.3
Danner, S.4
Rappolt, M.5
Laggner, P.6
-
42
-
-
0037678992
-
-
Pandit, S. A.; Bostick, D.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2003, 84, 3743-3750.
-
(2003)
Biophys. J
, vol.84
, pp. 3743-3750
-
-
Pandit, S.A.1
Bostick, D.2
Berkowitz, M.L.3
-
44
-
-
4544290164
-
-
Böckmann, R. A.; Grubmüller, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1021-1024.
-
(2004)
Angew. Chem., Int. Ed
, vol.43
, pp. 1021-1024
-
-
Böckmann, R.A.1
Grubmüller, H.2
-
45
-
-
2942648828
-
-
Sachs, J. N.; Nanda, H.; Petrache, H. I.; Woolf, T. B. Biophys. J. 2004, 86, 3772-3782.
-
(2004)
Biophys. J
, vol.86
, pp. 3772-3782
-
-
Sachs, J.N.1
Nanda, H.2
Petrache, H.I.3
Woolf, T.B.4
-
49
-
-
33846438971
-
-
Shinoda, K.; Shinoda, W.; Mikami, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 643-650.
-
(2007)
Phys. Chem. Chem. Phys
, vol.9
, pp. 643-650
-
-
Shinoda, K.1
Shinoda, W.2
Mikami, M.3
-
51
-
-
43649093151
-
-
Lee, S.-J.; Song, Y.; Baker, N. A. Biophys. J. 2008, 94, 3565-3576.
-
(2008)
Biophys. J
, vol.94
, pp. 3565-3576
-
-
Lee, S.-J.1
Song, Y.2
Baker, N.A.3
-
53
-
-
39649091441
-
-
Cordomi, A.; Edholm, O.; Perez, J. J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1397-1408.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 1397-1408
-
-
Cordomi, A.1
Edholm, O.2
Perez, J.J.3
-
55
-
-
0242290834
-
-
Pandit, S. A.; Bostick, D.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2003, 85, 3120-3131.
-
(2003)
Biophys. J
, vol.85
, pp. 3120-3131
-
-
Pandit, S.A.1
Bostick, D.2
Berkowitz, M.L.3
-
56
-
-
1542285301
-
-
Mukhopadhyay, P.; Monticelli, L.; Tieleman, D. P. Biophys. J. 2004, 86, 1601-1609.
-
(2004)
Biophys. J
, vol.86
, pp. 1601-1609
-
-
Mukhopadhyay, P.1
Monticelli, L.2
Tieleman, D.P.3
-
57
-
-
33746954633
-
-
Pedersen, U. R.; Leidy, C.; Westh, P.; Peters, G. H. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1758, 573-582.
-
(2006)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1758
, pp. 573-582
-
-
Pedersen, U.R.1
Leidy, C.2
Westh, P.3
Peters, G.H.4
-
58
-
-
33846846337
-
-
Zhao, W.; Rog, T.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Biophys. J. 2007, 92, 1114-1124.
-
(2007)
Biophys. J
, vol.92
, pp. 1114-1124
-
-
Zhao, W.1
Rog, T.2
Gurtovenko, A.A.3
Vattulainen, I.4
Karttunen, M.5
-
60
-
-
2942651134
-
-
Gurtovenko, A. A.; Patra, M.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2004, 86, 3461-3472.
-
(2004)
Biophys. J
, vol.86
, pp. 3461-3472
-
-
Gurtovenko, A.A.1
Patra, M.2
Karttunen, M.3
Vattulainen, I.4
-
61
-
-
28144437407
-
-
Gurtovenko, A. A.; Miettinen, M.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 21126-21134.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 21126-21134
-
-
Gurtovenko, A.A.1
Miettinen, M.2
Karttunen, M.3
Vattulainen, I.4
-
66
-
-
46349090280
-
-
Mulkidjanian, A. Y.; Dibrov, P.; Galperin, M. Y. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1777, 985-992.
-
(2008)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1777
, pp. 985-992
-
-
Mulkidjanian, A.Y.1
Dibrov, P.2
Galperin, M.Y.3
-
68
-
-
0028887546
-
-
Alexiev, U.; Mollaaghababa, R.; Scherrer, P.; Khorana, H.; Heyn, M. Proc. Natl. Acad. Sci. 1995, 92, 372-376.
-
(1995)
Proc. Natl. Acad. Sci
, vol.92
, pp. 372-376
-
-
Alexiev, U.1
Mollaaghababa, R.2
Scherrer, P.3
Khorana, H.4
Heyn, M.5
-
69
-
-
0028102402
-
-
Heberle, J.; Riesle, J.; Thiedemann, G.; Oesterhelt, D.; Dencher, N. A. Nature 1994, 370, 379-382.
-
(1994)
Nature
, vol.370
, pp. 379-382
-
-
Heberle, J.1
Riesle, J.2
Thiedemann, G.3
Oesterhelt, D.4
Dencher, N.A.5
-
70
-
-
0030999097
-
-
Berger, O.; Edholm, O.; Jahnig, F. Biophys. J. 1997, 72, 2002-2013.
-
(1997)
Biophys. J
, vol.72
, pp. 2002-2013
-
-
Berger, O.1
Edholm, O.2
Jahnig, F.3
-
71
-
-
85067714153
-
-
http://www.softsimu.org/downloads.shtml.
-
-
-
-
72
-
-
0029633168
-
-
Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 43-56.
-
(1995)
Comput. Phys. Commun
, vol.91
, pp. 43-56
-
-
Berendsen, H.J.C.1
van der Spoel, D.2
van Drunen, R.3
-
73
-
-
0035789518
-
-
Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317.
-
(2001)
J. Mol. Model
, vol.7
, pp. 306-317
-
-
Lindahl, E.1
Hess, B.2
van der Spoel, D.3
-
74
-
-
27344454932
-
-
van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701-1718.
-
(2005)
J. Comput. Chem
, vol.26
, pp. 1701-1718
-
-
van der Spoel, D.1
Lindahl, E.2
Hess, B.3
Groenhof, G.4
Mark, A.E.5
Berendsen, H.J.C.6
-
75
-
-
0002775934
-
Interaction models for water in relation to protein hydration
-
Pullman, B, Ed, Reidel: Dordrecht, The Netherlands
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Interaction models for water in relation to protein hydration. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981; pp 331-342.
-
(1981)
Intermolecular Forces
, pp. 331-342
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
van Gunsteren, W.F.3
Hermans, J.4
-
76
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
77
-
-
85067707834
-
-
Essman, U.; Perela, L.; Berkowitz, M. L.; T.; Darden, H. L.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8592.
-
Essman, U.; Perela, L.; Berkowitz, M. L.; T.; Darden, H. L.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8592.
-
-
-
-
78
-
-
0038440700
-
-
Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvönen, M. T.; Lindqvist, P.; Falck, E.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2003, 84, 3636-3645.
-
(2003)
Biophys. J
, vol.84
, pp. 3636-3645
-
-
Patra, M.1
Karttunen, M.2
Hyvönen, M.T.3
Lindqvist, P.4
Falck, E.5
Vattulainen, I.6
-
79
-
-
4143138518
-
-
Anézo, C.; de Vries, A. H.; Höltje, H.-D.; Tieleman, D. P.; Marrink, S.-J. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9424-9433.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 9424-9433
-
-
Anézo, C.1
de Vries, A.H.2
Höltje, H.-D.3
Tieleman, D.P.4
Marrink, S.-J.5
-
80
-
-
2342422492
-
-
Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvönen, M. T.; Falck, E.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4485-4494.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 4485-4494
-
-
Patra, M.1
Karttunen, M.2
Hyvönen, M.T.3
Falck, E.4
Vattulainen, I.5
-
81
-
-
0000388705
-
-
Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472.
-
(1997)
J. Comput. Chem
, vol.18
, pp. 1463-1472
-
-
Hess, B.1
Bekker, H.2
Berendsen, H.J.C.3
Fraaije, J.G.E.M.4
-
83
-
-
16644384871
-
-
Enders, O.; Ngezahayo, A.; Wiechmann, M.; Leisten, F.; Kolb, H. A. Biophys. J. 2004, 87, 2522-2531.
-
(2004)
Biophys. J
, vol.87
, pp. 2522-2531
-
-
Enders, O.1
Ngezahayo, A.2
Wiechmann, M.3
Leisten, F.4
Kolb, H.A.5
-
84
-
-
0035830643
-
-
Lewis, R. N. A. H.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F.; McElhaney, R. N. Biochim. Biophys. Acta 2001, 1510, 70-82.
-
(2001)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1510
, pp. 70-82
-
-
Lewis, R.N.A.H.1
Tristram-Nagle, S.2
Nagle, J.F.3
McElhaney, R.N.4
-
85
-
-
0000153330
-
-
Zantl, R.; Baicu, L.; Artzner, F.; Sprenger, I.; Rapp, G.; Rädler, J. O. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 10300-10310.
-
(1999)
J. Phys. Chem. B
, vol.103
, pp. 10300-10310
-
-
Zantl, R.1
Baicu, L.2
Artzner, F.3
Sprenger, I.4
Rapp, G.5
Rädler, J.O.6
-
86
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
-
(1984)
J. Chem. Phys
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
van Gunsteren, W.F.3
DiNola, A.4
Haak, J.R.5
-
87
-
-
0037962802
-
-
Filippov, A.; Orädd, G.; Lindblom, G. Biophys. J. 2003, 84, 3079-3086.
-
(2003)
Biophys. J
, vol.84
, pp. 3079-3086
-
-
Filippov, A.1
Orädd, G.2
Lindblom, G.3
-
88
-
-
85067736560
-
-
Gennis, R. B. Biomembranes. Molecular Structure and Function; Springer Advanced Texts in Chemistry; Springer: New York, 1989.
-
Gennis, R. B. Biomembranes. Molecular Structure and Function; Springer Advanced Texts in Chemistry; Springer: New York, 1989.
-
-
-
-
89
-
-
59449089082
-
-
Flenner, E.; Das, J.; Rheinstadter, M. C.; Kosztin, I. Phys. Rev.E 2009, 79, 011907.
-
(2009)
Phys. Rev.E
, vol.79
, pp. 011907
-
-
Flenner, E.1
Das, J.2
Rheinstadter, M.C.3
Kosztin, I.4
-
90
-
-
34047092271
-
-
Murzyn, K.; Zhao, W.; Karttunen, M.; Kurdziel, M.; Róg, T. Biointerphases 2006, 1, 98-105.
-
(2006)
Biointerphases
, vol.1
, pp. 98-105
-
-
Murzyn, K.1
Zhao, W.2
Karttunen, M.3
Kurdziel, M.4
Róg, T.5
-
91
-
-
41849139641
-
-
Boström, M.; Lima, E. R. A.; Tavares, F. W.; Ninham, B. W. J. Chem. Phys. 2008, 128, 135104.
-
(2008)
J. Chem. Phys
, vol.128
, pp. 135104
-
-
Boström, M.1
Lima, E.R.A.2
Tavares, F.W.3
Ninham, B.W.4
-
92
-
-
31144474101
-
-
Zhang, L.; Spurlin, T. A.; Gewirth, A. A.; Granick, S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 33-35.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 33-35
-
-
Zhang, L.1
Spurlin, T.A.2
Gewirth, A.A.3
Granick, S.4
-
93
-
-
33845936297
-
-
Brändén, M.; Sandén, T.; Brzezinski, P.; Widengren, J. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 19766-19770.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci
, vol.103
, pp. 19766-19770
-
-
Brändén, M.1
Sandén, T.2
Brzezinski, P.3
Widengren, J.4
-
99
-
-
35948966376
-
-
Auffinger, P.; Cheatham, T. E.; Vaiana, A. C. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1851-1859.
-
(2007)
J. Chem. Theory Comput
, vol.3
, pp. 1851-1859
-
-
Auffinger, P.1
Cheatham, T.E.2
Vaiana, A.C.3
|