Molecular characterization of gel and liquid-crystalline structures of fully hydrated POPC and POPE bilayers

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 21, 2007, Pages 6026-6033

  Leekumjorn, Sukit ^a   Sum, Amadeu K ^a  

^a State University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINES; ANNEALING; GELS; HYSTERESIS LOOPS; LIPID BILAYERS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE; PHASE TRANSITIONS;

BILAYER THICKNESS; BILAYERS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS;

LIQUID CRYSTALS;

EID: 34250315776     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0686339     Document Type: Article

References (61)

1. Fahy, E.; et al. J. Lipid Res. 2005, 46, 839.
2. Emoto, K.; Kobayashi, T.; Yamaji, A.; Aizawa, H.; Yahara, I.; Inoue, K.; Umeda, M. P. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 12867.
3. Storey, M. K.; Clay, K. L.; Kutateladze, T.; Murphy, R. C.; Overduin, M.; Voelker, D. R. J. Biol. Chem. 2001, 276, 48539.
4. Martínez, P.; Morros, A. Front. Biosci. 1996, 1, d103.
5. Kearns, D. B.; Robinson, J.; Shimkets, L. J. J. Bacteriol. 2001, 183, 763.
6. Birner, R.; Bürgermeister, M.; Schneiter, R.; Daum, G. Mol. Biol. Cell 2001, 12, 997.
7. Jahn, R.; Grubmüller, H. Curr. Opin. Cell Biol. 2002, 14, 488.
8. Campbell, N. A.; Reece, J. B. Biology, 6th ed.; Benjamin Cummings: San Francisco, CA, 2001.
9. Lasic, D. D.; Papahadjopoulos, D. Curr. Opin. Solid State Mater. Sci. 1996, 1, 392.
10. Mattson, F. H.; Grundy, S. M. J. Lipid Res. 1985, 26, 194.
11. Rudel, L. L.; Haines, J. L.; Sawyer, J. K. J. Lipid Res. 1990, 31, 1873.
12. Nydahl, M. C.; Gustafsson, I. B.; Vessby, B. Am. J. Clin. Nutr. 1994, 59, 115.
13. Gardner, C. D.; Kraemer, H. C. Arterioscler. Thromb., Vasc. Biol. 1995, 15, 1917.
14. Kuo, P.; Weinfeld, M.; Rudd, M. A.; Amarante, P.; Loscalzo, J. Arteriosclerosis 1990, 10, 111.
15. Nolan, J. P.; Hammerstedt, R. H. FASEB J. 1997, 11, 670.
16. Russell, N. J. Comp. Biochem. Physiol., Part A: Mol. Integr. Physiol. 1997, 118, 489.
17. Sajbidor, J. Crit. Rev. Biotechnol. 1997, 17, 87.
18. Tang, G. Q.; Novitzky, W. P.; Carol Griffin, H.; Huber, S. C.; Dewey, R. E. Plant J. 2005, 44, 433.
19. Ladbrooke, B. D.; Chapman, D. Chem. Phys. Lipids 1969, 3, 304.
20. Cronan, J. E. J.; Gelmann, E. P. Bacteriol. Rev. 1975, 39, 232.
21. Barton, P. G.; Gunstone, F. D. J. Biol. Chem. 1975, 250, 4470.
22. Litman, B. J.; Lewis, E. N.; Levin, I. W. Biochemistry 1991, 30, 313.
23. Bryant, G.; Pope, J. M.; Wolfe, J. Eur. Biophys. J. 1992, 21, 363.
24. Wang, Z. Q.; Lin, H. N.; Li, S. S.; Huang, C. H. J. Biol. Chem. 1994, 269, 23491.
25. Huang, C. H.; Li, S.; Lin, H. N.; Wang, G. Q. Arch. Biochem. Biophys. 1996, 334, 135.
26. Shalaev, E. Y.; Steponkus, P. L. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8734.
27. Sengupta, K.; Raghunathan, V. A.; Katsaras, J. Phys. Rev. E 2003, 68, 03171001.
28. Marsh, D. Biophys. J. 1999, 77, 953.
29. Ceccarelli, M.; Marchi, M. Biochimie 1998, 80, 415.
30. Brown, D. A.; London, E. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1998, 14, 111.
31. Simons, K.; Toomre, D. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2001, 2, 216.
32. Simons, K.; Ikonen, E. Nature 1997, 387, 569.
33. Ikonen, E. Curr. Opin. Cell Biol. 2001, 13, 470.
34. Herreros, J.; Ng, T.; Schiavo, G. Mol. Biol. Cell 2001, 12, 2947.
35. Fantini, J.; Garmy, N.; Mahfoud, R.; Yahi, N. Expert Rev. Mol. Med. 2002, 2002, 1.
36. Lafont, F.; van der Goot, F. G. Cell. Microbiol. 2005, 7, 613.
37. Marrink, S. J.; Risselada, J.; Mark, A. E. Chem. Phys. Lipids 2005, 135, 223.
38. Marrink, S. J. Molecular dynamics simulation of cholesterol nucleation in mixed micelles modelling human bile; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 2004.
39. Leekumjorn, S.; Sum, A. K. Biochim. Biophys. Acta-Biomembranes 2006, 1768, 354.
40. Heller, H.; Schaefer, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8343.
41. Venable, R. M.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W. J. Chem. Phys. 2000, 112, 4822.
42. Leekumjorn, S.; Sum, A. K. Biophys. J. 2006, 90, 3951.
43. Suurkuusk, J.; Lentz, B. R.; Barenholz, Y.; Biltonen, R. L.; Thompson, T. E. Biochemistry 1976, 15, 1393.
44. Nagle, J. F.; Tristram-Nagle, S. Biochim. Biophys. Acta-Rev. Biomembr. 2000, 1469, 159.
45. Tieleman, D. P.; Berendsen, H. J. C. Biophys. J. 1998, 74, 2786.
46. Tieleman, D. P.; Forrest, L. R.; Sansom, M. S. P.; Berendsen, H. J. C. Biochemistry 1998, 37, 17554.
47. Ryckaert, J. P.; Bellemans, A. Chem. Phys. Lett. 1975, 30, 123.
48. Berger, O.; Edholm, O.; Jähnig, F. Biophys. J. 1997, 72, 2002.
49. Jorgensen, W. L.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 1657.
50. Essex, J. W.; Hann, M. M.; Richards, W. G. Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 1994, 344, 239.
51. Chiu, S. W.; Clark, M.; Balaji, V.; Subramaniam, S.; Scott, H. L.; Jakobsson, E. Biophys. J. 1995, 69, 1230.
52. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Intermolecular Forces; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981.
53. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
54. Essman, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
55. Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 43.
56. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
57. Terascale Computing Facility; Virginia Tech: http://www.arc.vt.edu.
58. Chen, T.; Acker, J. P.; Eroglu, A.; Cheley, S.; Bayley, H.; Fowler, A.; Toner, M. L. Cryobiology 2001, 43, 168.
59. Chen, L. B.; Johnson, M. L.; Biltonen, R. L. Biophys. J. 2001, 80, 254.
60. Perly, B.; Smith, I. C. P.; Jarrell, H. C. Biochemistry 1985, 24, 4659.
61. Falck, E.; Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvonen, M. T.; Vattulainen, 1. Biophys. J. 2004, 87, 1076.