A subsystem TDDFT approach for solvent screening effects on excitation energy transfer couplings

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 6, Issue 6, 2010, Pages 1843-1851

  Neugebauer, Johannes ^a   Curutchet, Carles ^b,c   Muñoz Losa, Aurora ^d   Mennucci, Benedetta ^d  

^a LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

^b UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^c Institut de Quimica Computacional   (Spain)

^d UNIVERSITY OF PISA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 77953318346     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct100138k     Document Type: Article

References (67)

1. Blankenship, R. E. Molecular Mechanisms of Photosynthesis; Blackwell Science: Oxford, 2002.
2. Scholes, G. D. Annu. Rev. Phys. Chem. 2003, 54, 57-87
3. Förster, T. Ann. Phys. 1948, 2, 55
4. Förster, T. Delocalized Excitation and Excitation Transfer. In Modern Quantum Chemistry. Part III: Action of Light and Organic Crystals; Sinanoǧlu, O., Ed.; Academic Press: New York, 1965; pp 93-137.
5. Dexter, D. L. J. Chem. Phys. 1953, 21, 836-850
6. Harcourt, R. D.; Scholes, G. D.; Ghiggino, K. P. J. Chem. Phys. 1994, 101, 10521-10525
7. Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5378-5386
8. Damjanović, A.; Ritz, T.; Schulten, K. Phys. Rev. E 1999, 59, 3293-3311
9. Tretiak, S.; Middleton, C.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 9540-9553
10. Tretiak, S.; Middleton, C.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4519-4528
11. Hsu, C.-P.; Fleming, G. R.; Head-Gordon, M.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3065-3072
12. Wong, K. F.; Bagchi, B.; Rossky, P. J. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 5752-5763
13. Beenken, W. J. D.; Pullerits, T. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2490-2495
14. Iozzi, M. F.; Mennucci, B.; Tomasi, J.; Cammi, R. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7029-7040
15. Curutchet, C.; Mennucci, B. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 16733-16744
16. Madjet, M. E.; Abdurahman, A.; Renger, T. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 17268-17281
17. Neugebauer, J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 2207-2217
18. Muñoz-Losa, A.; Curutchet, C.; Fdez. Galván, I.; Mennucci, B. J. Chem. Phys. 2008, 129 034104
19. Fink, R. F.; Pfister, J.; Zhao, H. M.; Engels, B. Chem. Phys. 2008, 346, 275-285
20. Hsu, C.-P. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 509-518
21. Sagvolden, E.; Furche, F.; Kohn, A. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 873-880
22. Neugebauer, J. ChemPhysChem 2009, 10, 3148-3173
23. Adolphs, J.; Renger, T. Biophys. J. 2006, 91, 2778-2797
24. Scholes, G. D.; Curutchet, C.; Mennucci, B.; Cammi, R.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6978-6982
25. Russo, V.; Curutchet, C.; Mennucci, B. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 853-863
26. Curutchet, C.; Scholes, G. D.; Mennucci, B.; Cammi, R. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 13253-13265
27. Curutchet, C.; Muñoz-Losa, A.; Monti, S.; Kongsted, J.; Scholes, G. D.; Mennucci, B. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1838-1848
28. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999-3094
29. Söderhjelm, P.; Husberg, C.; Strambi, A.; Olivucci, M.; Ryde, U. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 649-658
30. He, Z.; Sundström, V.; Pullerits, T. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 11606-11612
31. Timpmann, K.; Ellervee, A.; Pullerits, T.; Ruus, R.; Sundstrom, V.; Freiberg, A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 8436-8444
32. Neugebauer, J.; Louwerse, M. J.; Baerends, E. J.; Wesolowski, T. A. J. Chem. Phys. 2005, 122 094115
33. Dreuw, A.; Weisman, J. L.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2943-2946
34. Tozer, D. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12697-12699
35. Tawada, Y.; Tsuneda, T.; Yanagisawa, S.; Yanai, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 8425-8433
36. Gritsenko, O.; Baerends, E. J. J. Chem. Phys. 2004, 121, 655-660
37. Maitra, N. T. J. Chem. Phys. 2005, 122, 234104
38. Neugebauer, J.; Gritsenko, O.; Baerends, E. J. J. Chem. Phys. 2006, 124, 214102
39. Ziegler, T.; Seth, M.; Krykunov, M.; Autschbach, J. J. Chem. Phys. 2008, 129, 184114
40. Autschbach, J. ChemPhysChem 2009, 10, 1757-1760
41. Cortona, P. Phys. Rev. B 1991, 44, 8454-8458
42. Senatore, G.; Subbaswamy, K. R. Phys. Rev. B 1986, 34, 5754-5757
43. Wesolowski, T. A.; Warshel, A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8050
44. Wesolowski, T. A.; Weber, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 248, 71-76
45. Iannuzzi, M.; Kirchner, B.; Hutter, J. Chem. Phys. Lett. 2006, 421, 16-20
46. Jacob, C. R.; Visscher, L. J. Chem. Phys. 2008, 128, 155102
47. Amsterdam Density Functional program; Theoretical Chemistry, Vrije Universiteit: Amsterdam. URL: http://www.scm.com (access date: 01/17/2009).
48. te Velde, G.; Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. J.; van Gisbergen, S. J. A.; Fonseca Guerra, C.; Snijders, J. G.; Ziegler, T. J. Comput. Chem. 2001, 22, 931-967
49. Casida, M. E.; Wesolowski, T. A. Int. J. Quantum Chem. 2004, 96, 577-588
50. Neugebauer, J. J. Chem. Phys. 2007, 126, 134116
51. Neugebauer, J. J. Chem. Phys. 2009, 131 084104
52. Neugebauer, J. Phys. Reports 2010, 489, 1-87
53. Jacob, C. R.; Neugebauer, J.; Visscher, L. J. Comput. Chem. 2008, 29, 1011-1018
54. Wesolowski, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11444-11445
55. Davidson, E. R. J. Comput. Phys. 1975, 17, 87-94
56. Murray, C. W.; Racine, S. C.; Davidson, E. R. J. Comput. Phys. 1992, 103, 382-389
57. van Gisbergen, S. J. A.; Snijders, J. G.; Baerends, E. J. Comput. Phys. Commun. 1999, 118, 119-138
58. Wesolowski, T. A. J. Chem. Phys. 1997, 106, 8516-8526
59. Perdew, J. P. In Electronic Structure of Solids; Ziesche, P.; Eschrig, H., Eds.; Akademie Verlag: Berlin, 1991; p 11.
60. Lembarki, A.; Chermette, H. Phys. Rev. A 1994, 50, 5328
61. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.;; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
62. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007-1023
63. Gagliardi, L.; Lindh, R.; Karlstrom, G. J. Chem. Phys. 2004, 121, 4494-4500
64. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14.1, 33-38
65. Kiewisch, K.; Eickerling, G.; Reiher, M.; Neugebauer, J. J. Chem. Phys. 2008, 128 044114
66. Fux, S.; Kiewisch, K.; Jacob, C. R.; Neugebauer, J.; Reiher, M. Chem. Phys. Lett. 2008, 461, 353-359
67. Knox, R. S.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5289-5293