Distributions of parameters and features of multiple bond ruptures in force spectroscopy by atomic force microscopy

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 114, Issue 19, 2010, Pages 8755-8765

  Guo, Senli ^a   Li, Nan ^a   Lad, Nimit ^a   Desai, Shivam ^a   Akhremitchev, Boris B ^a  

^a DUKE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTICAL MODEL; BIOTIN-STREPTAVIDIN; BOUND MOLECULES; EXPERIMENTAL DATA; FORCE SPECTROSCOPY; INTERMOLECULAR INTERACTIONS; KINETIC INFORMATION; KUHN LENGTHS; MOLECULAR BONDS; MULTIPLE BONDS; PHYSICO-CHEMICAL TOOLS; POLYMERIC TETHERS; RUPTURE FORCES; SINGLE BOND; SINGLE PEAK; VELOCITY DEPENDENCE;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; MATHEMATICAL MODELS;

ATOMIC SPECTROSCOPY;

EID: 77952373558     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp100543u     Document Type: Article

References (56)

1. Evans, E.; Ritchie, K. Biophys. J. 1997, 72, 1541
2. Izrailev, S.; Stepaniants, S.; Balsera, M.; Oono, Y.; Schulten, K. Biophys. J. 1997, 72, 1568
3. Dudko, O. K.; Filippov, A. E.; Klafter, J.; Urbakh, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 11378
4. Hummer, G.; Szabo, A. Biophys. J. 2003, 85, 5
5. Bustamante, C.; Chemla, Y. R.; Forde, N. R.; Izhaky, D. Annu. Rev. Biochem. 2004, 73, 705
6. Freund, L. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 8818
7. Evans, E. Faraday Discuss. 1998, 111, 1
8. Dudko, O. K.; Hummer, G.; Szabo, A. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 108101
9. Sheng, Y. J.; Jiang, S. Y.; Tsao, H. K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 061106
10. Hanke, F.; Kreuzer, H. J. Phys. Rev. E 2005, 72, 031805
11. Dudko, O. K.; Hummer, G.; Szabo, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 15755
12. Serpe, M. J.; Kersey, F. R.; Whitehead, J. R.; Wilson, S. M.; Clark, R. L.; Craig, S. L. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 19163
13. Oberbarnscheidt, L.; Janissen, R.; Oesterhelt, F. Biophys. J. 2009, 97, L19
14. Williams, P. M. Anal. Chim. Acta 2003, 479, 107
15. Sulchek, T. A.; Friddle, R. W.; Langry, K.; Lau, E. Y.; Albrecht, H.; Ratto, T. V.; DeNardo, S. J.; Colvin, M. E.; Noy, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 16638
16. Gu, C.; Kirkpatrick, A.; Ray, C.; Guo, S.; Akhremitchev, B. B. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 5085
17. Rief, M.; Gautel, M.; Oesterhelt, F.; Fernandez, J. M.; Gaub, H. E. Science 1997, 276, 1109
18. Rief, M.; Pascual, J.; Saraste, M.; Gaub, H. E. J. Mol. Biol. 1999, 286, 553
19. Fisher, T. E.; Marszalek, P. E.; Fernandez, J. M. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 719
20. Sharma, D.; Perisic, O.; Peng, Q.; Cao, Y.; Lam, C.; Lu, H.; Li, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9278
21. Averett, L. E.; Geer, C. B.; Fuierer, R. R.; Akhremitchev, B. B.; Gorkun, O. V.; Schoenfisch, M. H. Langmuir 2008, 24, 4979
22. Averett, L. E.; Schoenfisch, M. H.; Akhremitchev, B. B.; Gorkun, O. V. Biophys. J. 2009, 97, 2820
23. Sarkar, A.; Caamano, S.; Fernandez, J. M. Biophys. J. 2007, 92, L36
24. Florin, E. L.; Moy, V. T.; Gaub, H. E. Science 1994, 264, 415
25. Lo, Y. S.; Huefner, N. D.; Chan, W. S.; Stevens, F.; Harris, J. M.; Beebe, T. P. Langmuir 1999, 15, 1373
26. Seifert, U. Phys. Rev. Lett. 2000, 84, 2750
27. Tees, D. F. J.; Woodward, J. T.; Hammer, D. A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 7483
28. Ratto, T. V.; Rudd, R. E.; Langry, K. C.; Balhorn, R. L.; McElfresh, M. W. Langmuir 2006, 22, 1749
29. Guo, S.; Ray, C.; Kirkpatrick, A.; Lad, N.; Akhremitchev, B. B. Biophys. J. 2008, 95, 3964
30. Pincet, F.; Husson, J. Biophys. J. 2005, 89, 4374
31. Garg, A. Phys. Rev. B 1995, 51, 15592
32. Merkel, R.; Nassoy, P.; Leung, A.; Ritchie, K.; Evans, E. Nature 1999, 397, 50
33. Evans, E.; Ritchie, K. Biophys. J. 1999, 76, 2439
34. Ray, C.; Brown, J. R.; Akhremitchev, B. B. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 1963
35. Bell, G. I. Science 1978, 200, 618
36. Kamholz, A. E.; Schilling, E. A.; Yager, P. Biophys. J. 2001, 80, 1967
37. Guo, S.; Akhremitchev, B. B. Langmuir 2008, 24, 880
38. Ray, C.; Brown, J. R.; Akhremitchev, B. B. Langmuir 2007, 23, 6076
39. Janshoff, A.; Neitzert, M.; Oberdorfer, Y.; Fuchs, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 3213
40. Gu, C.; Ray, C.; Guo, S.; Akhremitchev, B. B. J. Phys. Chem. C 2007, 111, 12898
41. Kuhner, F.; Erdmann, M.; Gaub, H. E. Phys. Rev. Lett. 2006, 97, 218301
42. Ke, C. H.; Jiang, Y.; Rivera, M.; Clark, R. L.; Marszalek, P. E. Biophys. J. 2007, 92, L76
43. Ratto, T. V.; Langry, K. C.; Rudd, R. E.; Balhorn, R. L.; Allen, M. J.; McElfresh, M. W. Biophys. J. 2004, 86, 2430
44. Ray, C.; Akhremitchev, B. B. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14739
45. Guo, S.; Lad, N.; Ray, C.; Akhremitchev, B. B. Biophys. J. 2009, 96, 3412
46. Kellermayer, M. S. Z.; Bustamante, C.; Granzier, H. L. Biochim. Biophys. Acta 2003, 1604, 105
47. Rubinstein, M.; Colby, R. H. Polymer Physics; Oxford University Press: New York, 2003.
48. Mattice, W. L.; Helfer, C. A.; Sokolov, A. P. Macromolecules 2003, 36, 9924
49. Chen, A.; Moy, V. T. Biophys. J. 2000, 78, 2814
50. Oesterhelt, F.; Rief, M.; Gaub, H. E. New J. Phys. 1999, 1, 6.1
51. Ray, C.; Brown, J. R.; Akhremitchev, B. B. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 17578
52. Ray, C.; Brown, J. R.; Kirkpatrick, A.; Akhremitchev, B. B. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10008
53. Dufrene, Y. F.; Hinterdorfer, P. Pflugers Arch. 2008, 456, 237
54. Al-Maawali, S.; Bemis, J. E.; Akhremitchev, B. B.; Leecharoen, R.; Janesko, B. G.; Walker, G. C. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 3965
55. Valiaev, A.; Lim, D. W.; Schmidler, S.; Clark, R. L.; Chilkoti, A.; Zauscher, S. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10939
56. Kuhner, F.; Gaub, H. E. Polymer 2006, 47, 2555