Evidence of formation of adenine dimer cation radical in DNA: The importance of adenine base stacking

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 16, 2010, Pages 5600-5604

  Kobayashi, Kazuo ^a  

^a OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DEPROTONATION; DNA; GENES; OLIGONUCLEOTIDES; POSITIVE IONS; RADIATION CHEMISTRY; RADIOLYSIS; SULFUR COMPOUNDS;

BASE PAIRS; BASE STACKING; CATION-RADICALS; CHARGE RESONANCES; DEOXYADENOSINE; DIMER CATIONS; MONONUCLEOTIDES; NANOSECOND PULSE; POSITIVE CHARGES; STABILIZED DIMERS; TRANSIENT SPECTRA; TRANSIENT SPECTROSCOPY;

RATE CONSTANTS;

EID: 77951609664     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp100589w     Document Type: Article

References (48)

1. Schuster, G. B. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 253-260
2. Lewis, F. D.; Letsinger, R. L.; Wasielewski, M. R. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 159-171
3. Giese, B. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 631-6306
4. ONeill, M. A.; Barton, J. K. Charge Transfer in DNA: From Mechanism to Application; Wagenknecht, H. A., Ed.; Wiley-VCH: Weiheim, 2005, pp 27-75.
5. Berlin, Y. A.; Kurnilov, I. V.; Beratan, D. N.; Ratner, M. A.; Burin, A. L. Top. Curr. Chem. 2004, 237, 1-36
6. Senthilkumar, K.; Grozema, F. C.; Guerra, C. F.; Bickelhaupt, F. M.; Lewis, F. D.; Berlin, Y. A.; Ratner, M. A.; Siebbeles, L. D. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14894-14903
7. Bixon, M.; Giese, B.; Wessely, S.; Langenbacher, T.; Michel-Beyerle, M. E.; Jortner, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11713-11716
8. Blancafort, L.; Voityuk, A. A. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 6426-6432
9. Henderson, P. T.; Jones, D.; Hamppikian, G.; Kan, Y. Z.; Schuster, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 8353-8358
10. Nakatani, K.; Dohno, C.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10854-10855
11. Maggers, E.; Michel-Beyerle, M. E.; Giese, B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12950-12955
12. Lewis, F. D.; Zhu, H.; Daublain, P.; Fiebig, T.; Raytchev, M.; Wang, O.; Schfirovich, V. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 791-800
13. Giese, B.; Amaudrut, J.; Köhler, A.-K.; Spormann, M.; Wessely, S. Nature 2001, 412, 318-320
14. Kendrick, T.; Giese, B. Chem. Commun. 2002, 2016
15. Kawai, K.; Takada, T.; Tojo, S.; Majima, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6842-6843
16. Takada, T.; Kawai, K.; Cai, X. C.; Sugimoto, A.; Fujitsuka, M.; Majima, T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1125-1129
17. Takada, T.; Kawai, K.; Fujitsuka, M.; Majima, T. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 11012-11013
18. Augustyn, K. E.; Genereux, J. C.; Barton, J. K. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 5731-5733
19. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503-520
20. Steenken, S. Free Radical Res. Commun. 1992, 16, 349-379
21. Steenken, S. Biol. Chem. 1997, 378, 1293-1297
22. Candeias, L. P.; Steenken, S. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 699-704
23. Candeias, L. P.; Steenken, S. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2437-2440
24. Scheek, R. M.; Stob, S.; Schleich, T.; Alma, N. C. M.; Hibers, C. W.; Kaptain, R. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 5930-5932
25. Baik, M.-H.; Silverman, J. S.; Yang, I. V.; Ropp, P. A.; Szalai, V. S.; Thorp, H. H. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6437-6444
26. Chen, X.; Syrstad, E. A.; Nguyen, M. T.; Gerbaux, P.; Tureček, F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9283-9293
27. Kumar, A.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24181-24188
28. Adhikary, A.; Kumar, A.; Khanduri, D.; Sevilla, M. D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10282-10292
29. Lewis, F. D.; Daublain, P.; Zhang, L.; Cohen, B.; Vura-Weis, J; Wasielewski, M. R.; Shafirovich, V.; Wang, Q.; Raytchev, M.; Fiebig, T. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 3838-3843
30. Vura-Weis, J.; Wasielewski, M. R.; Thazhuthveetil, A. K.; Shafirovich, V. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 9722-9727
31. Candeias, L. P.; Steenken, S. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 1094-1099
32. Kobayashi, K.; Tagawa, S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10213-10218
33. Kobayashi, K.; Yamagami, R.; Tagawa, S. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10752-10757
34. Yamagami, R.; Kobayashi, K.; Tagawa, S. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 14772-14777
35. Yamagami, R.; Kobayashi, K.; Tagawa, S. Chem.- Eur. J. 2009, 45, 12201-12203
36. McElroy, W. J. J. Phys. Chem. 1990, 94, 2435-2441
37. ONeill, P.; Davies, S. E. Int. J. Radiat. Biol. 1987, 52, 577-587
38. Ito, T.; Kuno, S.; Uchida, T.; Fujita, S.; Nishimoto, S. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 389-394
39. Vieira, A. J. S. C.; Steenken, S. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4138-4144
40. Broom, A. D.; Schweizer, M. P.; Tso, P. O. P. J. Am. Chem. Soc. 1967, 89, 3612-3622
41. Olsthoorn, C. S. M.; Bostelaar, L. J.; De Rooij, J. F. M.; Van Boom, J. H.; Altona, C. Eur. J. Biochem. 1981, 115, 309-321
42. Shafirovich, V.; Dourandin, A.; Luneva, N. P.; Geacintov, N. E. J. Chem. Soc. Perkin. Trans. 2000, 2, 271-275
43. Badger, B.; Brocklehurst, B. Nature 1968, 219, 263
44. Fujitsuka, M.; Cho, D. W.; Tojo, S.; Yamashiro, S.; Shinmyozu, T.; Majima, T. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 5735-5739
45. Okamoto, K.; Kozawa, T.; Natsuda, K.; Seki, S.; Tagawa, S. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9275-9280
46. Close, D. M.; Nelson, W. H. Radiat. Res. 1989, 116, 367-378
47. Nelson, W. H.; Sagstuen, E.; Hole, E. O.; Close, D. M. Radiation, Res. 1998, 149, 75-86
48. Lewis, F. D.; Liu, J. Q.; Zuo, X. B.; Hayes, R. T.; Wasielewski, M. R. Nature 2001, 412, 318-320