Photoexcitation of dinucleoside radical cations: A time-dependent density functional study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 47, 2006, Pages 24181-24188

  Kumar, Anil ^a   Sevilla, Michael D ^a  

^a OAKLAND UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHARGE TRANSFER; CONFORMATIONS; DNA; FREE RADICALS; GROUND STATE; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

DINUCLEOSIDE PHOSPHATE; PHOTOEXCITATION; POLARIZED CONTINUUM MODEL (PCM); TRANSITION ENERGIES;

NUCLEIC ACIDS;

EID: 33846115741     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064524i     Document Type: Article

References (44)

1. Adhikary, A.; Collins, S.; Koppen, J.; Becker, D.; Sevilla, M. D. Nucleic Acid Res. 2006, 34, 1501.
2. Becker, D.; Bryant-Friedrich, A.; Trzasko, C.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 2003, 160, 174.
3. Becker, D.; Razskazovskii. Y.; Callaghan, M. U.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 1996, 146, 361.
4. Shukla, L. I.; Pazdro, R.; Huang, J.; DeVreugd, C.; Becker, D.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 2004, 161, 582.
5. Adhikary, A.; Malkhasian, A. Y. S.; Collins, S.; Koppen, J.; Becker, D.; Sevilla, M. D. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 5553.
6. Adhikary, A.; Kumar, A.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 2006, 165, 479.
7. (a) Hirata, S.; Head-Gordon, M.; Szczepanski, J.; Vala, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 4940.
8. (b) Halasinski, T. M.; Weisman, J. L.; Ruiterkamp, R.; Lee, T. J.; Salama, F.; Head-Gordon, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3660.
9. Halasinski, T. M.; Hudgins, D. M.; Salama, F.; Allamandola, L. J.; Bally, T. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 7484.
10. Szczepanski, J.; Banisaukas, J.; Vala, M.; Hirata, S.; Bartlett, R. J.; Head-Gordon, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 63
11. (e) Hirata, S.; Lee, T. J.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 1999, 111, 8904.
12. Jean, J. M.; Hall, K. B. Proc. Natl. Acad. Sci. 2001, 98, 37.
13. Jean, J. M.; Hall, K. B. Biochemistry 2002, 41, 13152.
14. Blancafort, L.; Voityuk, A. A. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 6426.
15. SPARTAN, version 5.0; Wavefunction, Inc.: Irvine, CA 1997.
16. Becke, A. D. J. Chem. Phys.. 1993, 98, 1372.
17. Stephen, P. J.; Devlin, F. J.; Frisch, M. J.; Chabalowski, C. F. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623.
18. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
19. Tsolakidis, A.; Kaxiras, E. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2373.
20. Cossi, M.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4708.
21. Gustavsson, T.; Banyasz, A.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D.; Scalmani, G.; Frisch, M. J.; Barone, V.; Improta, R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 607.
22. Shukla, M. K.; Leszczynski, J. J. Comput. Chem. 2004, 25, 768.
23. Shukla, M. K.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 11338.
24. Frisch, M. J.; et al. Gaussian03, Revision B.04; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
25. GaussView; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
26. Voityuk, A. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 204904.
27. Voityuk, A. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10793.
28. Sugiyama, H.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7063.
29. Saito, I.; Nakamura, T.; Nakatani, K.; Yoshioka, Y.; Yamaguchi, K.; Sugiyama, H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12686.
30. Hall, D. B.; Holmlin, R. E.; Barton, J. K. Nature 1996, 382, 731.
31. Senthilkumar, K.; Grozema, F. C.; Guerra, C. F.; Bickelhaupt, F. M.; Siebbeles, L. D. A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13658.
32. (a) Cai, Z.; Sevilla, M. D. Top. Curr. Chem. 2004, 237, 103.
33. (b) Barnett, R. N.; Cleveland, C. L.; Joy, A.; Landman, U.; Schuster, G. B. Science 2001, 294, 567-571.
34. Conwell, E. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 8795
35. Goldsmith, R. H.; Sinks, L. E.; Kelley, F. F.; Betzen, L. J.; Liu, W.; Weiss, E. A.; Ratner, M. A.; Wasielewski, M. R. Proc. Natl Acad. Sci. 2005, 102, 3540-3545.
36. (e) Lewis, F. D.; Zhu, H.; Daublain, P.; Fiebig, T.; Raytchev, M.; Qiang Wang, Q.; Shafirovich, V. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 791-800.
37. (f) Kelley, S. O.; Barton, J. K. Science 1999, 283, 375.
38. (g) Lewis, F. D. Photochem. Photobiol. 2005, 81, 65.
39. (h) Giese B. Nature 2001, 472, 318.
40. Dreuw, A.; Head-Gordon, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4007.
41. Dreuw, A.; Head-Gordon, M. Chem. Rev. 2005, 105, 4009.
42. Dreuw, A.; Weisman, J. L.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2943.
43. Colson, A. O.; Sevilla, M. D. Int. J. Radiat. Biol. 1995, 67, 627.
44. Evangelista, F. A.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10258.