Protein-protein complex formation affects the Ni-Fe and Fe-S centers in the H2-sensing regulatory hydrogenase from Ralstonia eutropha H16

ChemPhysChem

Volumn 11, Issue 6, 2010, Pages 1297-1306

  Löscher, Simone ^a   Gebler, Antje ^b   Stein, Matthias ^c   Sanganas, Oliver ^a   Buhrke, Thorsten ^b   Zebger, Ingo ^d   Dau, Holger ^a   Friedrich, Bärbel ^b   Lenz, Oliver ^b   Haumann, Michael ^a  

^a FREIE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

^b HUMBOLDT UNIVERSITY   (Germany)

^c HEIDELBERG INSTITUTE FOR THEORETICAL STUDIES   (Germany)

^d TECHNISCHE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

Author keywords

Cluster compounds; Enzymes; Hydrogen; Sensors; X ray absorption spectroscopy

Indexed keywords

HYDROGEN; HYDROGENASE; IRON; NICKEL; NICKEL IRON HYDROGENASE; NICKEL-IRON HYDROGENASE; SULFUR;

ARTICLE; CHEMISTRY; CUPRIAVIDUS NECATOR; DIMERIZATION; ELECTRON SPIN RESONANCE; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYMOLOGY; INFRARED SPECTROSCOPY; PROTEIN BINDING; X RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

CATALYTIC DOMAIN; CUPRIAVIDUS NECATOR; DIMERIZATION; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; HYDROGEN; HYDROGENASE; IRON; NICKEL; PROTEIN BINDING; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; SULFUR; X-RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

EID: 77951175056     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200901007     Document Type: Article

References (55)

1. P. M. Vignais, B. Billoud, J. Meyer, FEMS Microbiol. Rev. 2001, 25, 455.
2. P. M. Vignais, B. Billoud, Chem. Rev. 2007, 107, 4206.
3. L. K. Black, C. Fu, R. J. Maier, J. Bacteriol. 1994, 176, 7102
4. S. Elsen, A. Colbeau, J. Chabert, P. M. Vignais, J. Bacteriol. 1996, 178, 5174.
5. O. Lenz, B. Friedrich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 12474.
6. T. Burgdorf, O. Lenz, T. Buhrke, E. van der Linden, A. K. Jones, S. P. J. Albracht, B. Friedrich, J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2005, 10, 181.
7. J. C. Fontecilla-Camps, A. Volbeda, C. Cavazza, Y. Nicolet, Chem. Rev. 2007, 107, 4273.
8. F. Armstrong, S. P. J. Albracht, Philos. Trans. A Math. Phys. Eng. Sci. 2005, 363,937.
9. K. Schneider, H. G. Schlegel, Biochim. Biophys. Acta Enzymol. 1976, 452, 66.
10. B. Schink, H. G. Schlegel, Biochim. Biophys. Acta Enzymol. 1979, 567, 315.
11. L. Kleihues, O. Lenz, M. Bernhard, T. Buhrke, B. Friedrich, J. Bacteriol. 2000, 182, 2716.
12. O. Lenz, M. Bernhard, T. Buhrke, E. Schwartz, B. Friedrich, J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2002, 4, 255.
13. T. Buhrke, O. Lenz, A. Porthun, B. Friedrich, Mol. Microbiol. 2004, 51, 1677.
14. B. L. Taylor, I. B. Zhulin, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1999, 63, 479.
15. A. J. Pierik, M. Schmelz, O. Lenz, B. Friedrich, S. P. J. Albracht, FEBS Lett. 1998,438,231.
16. B. Friedrich, T. Buhrke, T. Burgdorf, O. Lenz, Biochem. Soc. Trans. 2005 33, 97.
17. A. L. De Lacey, C. Stadler, V. M. Fernandez, E. C. Hatchikian, H. J. Fan, S. Li, M. B. Hall, J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 318.
18. A. L. De Lacey, V. M. Fernandez, M. Rousset, R. Cammack, Chem. Rev. 2007, 107, 4304.
19. T. Buhrke, O. Lenz, N. Krauss, B. Friedrich, J. Biol. Chem. 2005, 280, 23791.
20. M. Brecht, M. van Gastel, T. Buhrke, B. Friedrich, W. Lubitz, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13075.
21. A. Volbeda, L. Martin, C. Cavazza, M. Matho, B. W. Faber, W. Roseboom, S. P. J. Albracht, E. Garcin, M. Rousset, J. C. Fontecilla-Camps, J. Biol. Inorg. Chem. 2005, 10, 239.
22. H. Ogata, S. Hirota, A. Nakahara, H. Komori, N. Shibata, T. Kato, K. Kano, Y. Higuchi, Structure 2005, 13, 1635.
23. M. Carepo, D. L. Tierney, C. D. Brondino, T. C. Yang, A. Pamplona, J. Telser, I. Moura, J. J. G. Moura, B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124,281.
24. A. Gebler, T. Burgdorf, A. L. D. Lacey, O. Rüdiger, A. Martinez-Arias, O. Lenz, B. Friedrich, FEBS J. 2007, 274, 74.
25. O. Lenz, I. Zebger, J. Hamann, P. Hildebrandt, B. Friedrich, FEBS Lett. 2007, 581, 3322.
26. M. Haumann, A. Porthun, T. Buhrke, P. Liebisch, W. Meyer-Klaucke, B. Friedrich, H. Dau, Biochemistry 2003, 42, 11004.
27. T. Buhrke, S. Löscher, O. Lenz, E. Schlodder, I. Zebger, L. K. Andersen, P. Hildebrandt, W. Meyer-Klaucke, H. Dau, B. Friedrich, M. Haumann, J. Biol. Chem. 2005, 280, 19488.
28. M. Bradford, Anal. Biochem. 1976, 72, 248.
29. R. Klockenkämper, Total Reflection X-ray Fluorescence Analysis, Wiley, London, 1996.
30. T. Burgdorf, S. Löscher, P. Liebisch, E. Van der Linden, M. Galander, F. Lendzian, W. Meyer-Klaucke, S. P. J. Albracht, B. Friedrich, H. Dau, M. Haumann, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 576.
31. R. F. Pettifer, C. J. Hermes, J. Appl. Crystallogr. 1985, 18, 404.
32. H. Dau, P. Liebisch, M. Haumann, Anal. Bioanal. Chem. 2003, 376, 562.
33. S. I. Zabinsky, J. J. Rehr, A. Ankudinov, R. C. Albers, M. J. Eller, Phys. Rev. B 1995,52,2995.
34. Y. Higuchi, H. Ogata, K. Miki, N. Yasuoka, T. Yagi, Structure 1999, 7, 549.
35. Volbeda, M. Charon, C. Piras, E. C. Hatchikian, M. Frey, J. C. Fontecilla-Camps, Nature 1995, 373, 580.
36. M. Stein, M. Haumann, unpublished results.
37. M. Stein, W. Lubitz, Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 243.
38. M. Stein, W. Lubitz, Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 2668.
39. F. Neese, ORCA, Version 2.6.-63, University of Bonn, Germany, 2008.
40. J. Andzelm, C. Kölmel, A. Klamt, J. Chem. Phys. 1995, 103, 9312.
41. J. J. G. Moura, I. Moura, B. H. Huynh, H. J. Krüger, M. Teixeira, R. C. DuVarney, D. V. DerVartanian, A. V. Xavier, H. D. J. Peck, J. LeGall, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1982, 108, 1388.
42. A. Müller, I. Tscherny, R. Kappl, C. Hatchikian, J. Hüttermann, R. Cammack, J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 177.
43. S. Foerster, M. van Gastel, M. Brecht, W. Lubitz, J. Biol. Inorg. Chem. 2005,10,51.
44. G. J. Colpas, M. J. Maroney, C. Bagyinka, M. Kumar, W. S. Willis, S. L. Suib, P. K. Mascharak, N. Baidya, Inorg. Chem. 1991, 30, 920.
45. F. Leroux, S. Dementin, B. Burlat, L. Cournac, A. Volbeda, S. Champ, L. Martin, B. Guigliarelli, P. Bertrand, J. Fontecilla-Camps, M. Rousset, C. Léger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 11188.
46. S. Löscher, T. Burgdorf, I. Zebger, P. Hildebrandt, H. Dau, B. Friedrich, M. Haumann, Biochemistry 2006, 45, 11658.
47. T. E. Westre, P. Kennepohl, J. G. DeWitt, B. Hedman, K. O. Hodgson, E. I. Solomon, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6297.
48. H. Beinert, R. H. Holm, E. Munck, Science 1997, 277, 653.
49. A. F. Arendsen, J. Hadden, G. Card, A. S. McAlpine, S. Bailey, V. Zaitsev, E. H. M. Duke, P. F. Lindley, M. Kröckel, A. X. Trautwein, M. C. Feiters, J. M. Charnock, C. D. Graner, S. J. Marritt, A. J. Thomson, I. M. Kooter, M. K. Johnson, W. A. M. van der Berg, W. M. A. M. van Dongen, W. R. Hagen, J. Biol. Inorg. Chem. 1998, 3, 81.
50. S. Foerster, M. Stein, M. Brecht, H. Ogata, Y. Higuchi, W. Lubitz, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 83.
51. T. Buhrke, M. Brecht, W. Lubitz, B. Friedrich, J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 897.
52. O. Trofanchuk, M. Stein, C. Gessner, F. Lendzian, Y. Higuchi, W. Lubitz, J. Biol. Inorg. Chem. 2000, 5, 36.
53. E. Van der Linden, T. Burgdorf, M. Bernhard, B. Bleijlevens, B. Friedrich, S. Albracht, J. Biol. Inorg. Chem. 2004, 9, 616.
54. A. Volbeda, E. Garcin, C. Piras, A. L. de Lacey, V. M. Fernandez, E. C. Hatchikian, M. Frey, J. C. Fontecilla-Camps, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 12989.
55. W. Gu, L. Jacquamet, D. Patil, H. Wang, D. Evans, M. Smith, M. Millar, S. Koch, D. Eichhorn, M. Latimer, S. Cramer, J. Inorg. Biochem. 2003, 93, 41.