Adenine ribbon stabilized by Watson-Crick and Hoogsteen hydrogen Bonds: WFT and DFT study

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 12, 2010, Pages 2888-2894

  Zierkiewicz, Wiktor ^a   Michalska, Danuta ^a   Hobza, Pavel ^b,c  

^a WROCLAW UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Poland)

^b INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY   (Czech Republic)

^c PALACKÝ UNIVERSITY   (Czech Republic)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENINE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DIMERIZATION; HYDROGEN BOND; QUANTUM THEORY; THERMODYNAMICS;

ADENINE; DIMERIZATION; HYDROGEN BONDING; MODELS, MOLECULAR; QUANTUM THEORY; THERMODYNAMICS;

EID: 77949357515     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b920433d     Document Type: Article

References (60)

1. J. D. Bernal, The Physical Basis of Life, Routledge and Kegan Paul, London, 1951
2. S. J. Sowerby P. A. Stockwell W. M. Heckl G. B. Petersen Origins Life Evol. Biosphere 2000 30 81
3. F. Ortmann W. G. Schmidt F. Bechstedt Phys. Rev. Lett. 2005 95 186101
4. M. M. Reiter F. Jamitzky F. Trixler W. Heckl Phys. Status Solidi A 2001 187 171
5. L. M. Pedrigaõ P. A. Staniec N. R. Champness R. E. A. Kelly L. N. Kantorovich P. H. Beton Phys. Rev. 2006 B73 195432
6. L. Perezgasga A. Serrato-Díaz A. Negró-Mendoza L. De Pablo Galán F. G. Mosqueira Origins Life Evol. Biosphere 2005 35 91
7. O. Plekan V. Feyer F. utara T. Skála M. vec V. Cháb V. Matolín K. C. Prince Surf. Sci. 2007 601 1973
8. V. Feyer O. Plekan K. C. Prince F. utara T. Skála V. Cháb V. Matolín G. Stenuit P. Umari Phys. Rev. 2009 B79 155432
9. M. Furukawa T. Yamada S. Katano M. Kawai H. Ogasawara A. Nilsson Surf. Sci. 2007 601 5433
10. T. Yamada K. Shirasaka A. Takano M. Kawai Surf. Sci. 2004 561 233
11. Q. Chen N. V. Richardson Nat. Mater. 2003 2 324
12. A. McNutt S. Haq R. Raval Surf. Sci. 2003 531 131
13. Q. Chen D. F. Frankel N. V. Richardson Langmuir 2002 18 3219
14. M. Furukawa H. Tanaka T. Kawai J. Chem. Phys. 2001 115 3419
15. C. I. Smith A. Bowfield G. J. Dolan M. C. Cuquerella C. P. Mansley D. G. Fernig C. Edwards P. Weightman J. Chem. Phys. 2009 130 044702
16. C. Prado F. Prieto M. Rueda J. Feliu A. Aldaz Electrochim. Acta 2007 52 3168
17. A. P. M. Camargo H. Baumgärtel C. Donner PhysChemComm 2002 5 151
18. M. Preuss F. Bechstedt Surf. Sci. 2008 602 1643
19. E. Rauls S. Blankenburg W. G. Schmidt Surf. Sci. 2008 602 2170
20. J. Gu J. Leszczynski Chem. Phys. Lett. 2001 335 465
21. M. Meyer J. Sühnel J. Phys. Chem. A 2008 112 4336
22. R. E. A. Kelly L. N. Kantorovich Surf. Sci. 2005 589 139
23. J. D. Watson F. H. C. Crick Nature 1953 171 737
24. R. K. Castellano V. Gramlich F. Diederich Chem.-Eur. J. 2002 8 118
25. S. Wang H. F. Schaefer III J. Chem. Phys. 2006 124 044303
26. W. Zierkiewicz L. Komorowski D. Michalska J. erny P. Hobza J. Phys. Chem. B 2008 112 16734
27. D. Dobrzyńska L. B. Jerzykiewicz J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11118
28. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1996 104 1040
29. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648
30. C. Lee W. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B: Condens. Matter 1988 37 785
31. M. Feyereisen G. Fitzgerald A. Komornicki Chem. Phys. Lett. 1993 208 359
32. J. Tao J. P. Perdew V. N. Staroverov G. E. Scuseria Phys. Rev. Lett. 2003 91 146401
33. C. Møller M. S. Plesset Phys. Rev. 1934 46 618
34. R. Krishnan J. S. Binkley R. Seeger J. A. Pople J. Chem. Phys. 1980 72 650
35. M. J. Frisch A. J. Pople J. S. Binkley J. Chem. Phys. 1984 80 3265
36. T. H. Dunning, Jr. J. Chem. Phys. 1989 90 1007
37. R. A. Kendall T. H. Dunning, Jr. R. J. Harrison J. Chem. Phys. 1992 96 6796
38. A. Schafer C. Huber R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1994 100 5829
39. P. Jureka J. erny P. Hobza D. R. Salahub J. Comput. Chem. 2007 28 555
40. S. F. Boys F. Bernardi Mol. Phys. 1970 19 553
41. R. Podeszwa R. Bukowski K. Szalewicz J. Chem. Theory Comput. 2006 2 400
42. A. Hesselmann G. Jansen Chem. Phys. Lett. 2002 362 319
43. A. Hesselmann G. Jansen Chem. Phys. Lett. 2002 357 464
44. A. Misquitta R. Podeszwa B. Jeziorski K. Szalewicz J. Chem. Phys. 2005 123 214103
45. J. P. Perdew K. Burke M. Ernzerhof Phys. Rev. Lett. 1996 77 3865
46. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03, Gaussian Inc., Wallingford, CT, 2004
47. R. Ahlrichs M. Bär M. Häser H. Horn C. Kölmel Chem. Phys. Lett. 1989 162 165
48. MOLPRO is a package of ab initio programs designed by H.-J. Werner, P. J. Knowles, R. D. Amos, A. Bernhardsson, A. Berning, P. Celani, D. L. Cooper, M. J. O. Deegan, A. J. Dobbyn, F. Eckert, C. Hampel, G. Hetzer, P. J. Knowles, T. Korona, R. Lindh, A. W. Lloyd, S. J. McNicholas, F. R. Manby, W. Meyer, M. E. Mura, A. Nicklass, P. Palmieri, R. Pitzer, G. Rauhut, M. Schütz, U. Schumann, H. Stoll, A. J. Stone, R. Tarroni, T. Thorsteinsson and H.-J. Werner
49. G. Karlstrom R. Lindh P. A. Malmqvist B. O. Roos U. Ryde V. Veryazov P. O. Widmark M. Cossi B. Schimmelpfennig P. Neogrady L. Seijo Comput. Mater. Sci. 2003 28 222
50. J. poner P. Hobza J. Phys. Chem. 1994 98 3161
51. J. poner J. Leszczynski P. Hobza J. Phys. Chem. 1996 100 1965
52. J. poner P. Jureka P. Hobza J. Am. Chem. Soc. 2004 126 10142
53. R. E. A. Kelly Y. J. Lee L. N. Kantorovich J. Phys. Chem. B 2005 109 11933
54. J. Antony B. Brüske S. Grimme Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 8440
55. M. Kabela H. Valdes E. C. Sherer C. J. Cramer P. Hobza Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 5000
56. R. Wieczorek J. J. Dannenberg J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8124
57. I. Dbkowska H. V. Gonzalez P. Jureka P. Hobza J. Phys. Chem. A 2005 109 1131
58. R. Sedlak P. Jureka P. Hobza J. Chem. Phys. 2007 127 075104
59. A. Hesselmann G. Jansen M. Schutz J. Am. Chem. Soc. 2006 128 11730
60. J. Cerny M. Kabelac P. Hobza J. Am. Chem. Soc. 2008 130 16055