Circular DNA logic gates with strand displacement

Langmuir

Volumn 26, Issue 3, 2010, Pages 1416-1419

  Zhang, Cheng ^a   Yang, Jing ^a   Xu, Jin ^a  

^a PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALTERNATIVE APPROACH; BRANCH MIGRATION; CIRCULAR STRUCTURES; DNA NANOTECHNOLOGY; DNA SEQUENCE RECOGNITION; GOLD NANOPARTICLE; INPUT AND OUTPUTS; LOGIC SYSTEMS; SPECIFIC RECOGNITION; TUNABLE CONTROL;

GENES; LOGIC GATES;

DNA;

CIRCULAR DNA; GOLD; METAL NANOPARTICLE; SINGLE STRANDED DNA;

ARTICLE; CHEMISTRY; LOGIC; METABOLISM; SPECTROFLUOROMETRY;

DNA, CIRCULAR; DNA, SINGLE-STRANDED; GOLD; LOGIC; METAL NANOPARTICLES; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 75749122312     PISSN: 07437463     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la903137f     Document Type: Article

References (38)

1. Chen, X.; Wang, Y. F.; Liu, Q.; Zhang, Z. Z.; Fan, C. H.; He, L. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 1759.
2. Niazov, T.; Baron, R.; Katz, E.; Lioubashevski, O.; Willner, I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 17160.
3. Privman, M.; Tam, T. K.; Pita, M.; Katz, E. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1314.
4. Mu, L.; Shi, W.; She, G.; Chang, J. C.; Lee, S.-T. Angew. Chem., Im. Ed. 2009, 48, 1.
5. Amir, L.; Tam, T. K.; Pita, M.; Meijler, M. M.; Alfonta, L.; Katz, E. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 826.
6. Privman, M.; Tarn, T. K.; Pita, M.; Katz, E. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1314.
7. Miyoshi, D.; Inoue, M.; Sugimoto, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 7716.
8. Szaciowski, K.; Macyk, W.; Stochel, G. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4550.
9. Panyutin, I. G.; Hsieh, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 2021-2025
10. Yurke, B.; Turberfield, A. J.; Jr, A. P. M.; Simmel, F. C.; Neumann, J. L. Nature 2000, 406, 605.
11. Omabegho, T.; Sha, R.; Seeman, N. C. Science 2009, 324, 67.
12. Andersen, E. S.; Dong, M.; Nielsen, M. M.; Jahn, K.; Subramani, R.; Mamdouh, W.; Golas, M. M.; Sander, B.; Stark, H.; Cristiano, L. P.; et al. Nature 2009, 459, 73.
13. Seelig, G.; Soloveichik, D.; Zhang, D. Y.; Winfree, E. Science 2006, 314, 1585.
14. Seelig, G.; Yurke, B.; Winfree, E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12211.
15. Frezza, B. M.; Cockroft, S. L.; Ghadiri, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14875.
16. Shin, J. S.; Pierce, N. A. Nano Lett. 2004, 4, 905.
17. Chakraborty, B.; Sha, R.; Seeman, N. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 17245.
18. Gu, H.; Chao, J.; Xiao, S.; Seeman, N. C. Nature Nanotechnol. 2009, 4, 245.
19. Goodman, R. P.; Schaap, I. A. T.; Tardin, C. F.; Erben, C. M.; Berry, R. M.; Schmidt, C. F.; Turberfield, A. J. Science 2005, 310, 1661.
20. Goodman, R. P.; Heilemann, M.; Doose, S.; Erben, C. M.; Kapanidis, A. N.; Turberfield, A. J, Nature Nanotechnol. 2008, 3, 93.
21. Wang Z. G.; Wilner O. I.; Itamar, W. Nano Lett. Online Early Access August 31, 2009; DOl: 10.1021/nl902317p.
22. Weizmann, Y.; Braunschweig, A. B.; Wilner, O. I.; Cheglakov, Z.; Willner, I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 5289.
23. Storhoff, J. J.; Lucas, A. D.; Garimella, V.; Bao, Y. P.; Muller, U. R. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 883.
24. Hazarika, P.; Ceyhan, B.; Niemeyer, C. M. Small 2005, 1, 844.
25. Liu, J.; Lu, Y. Anal. Chem. 2004, 76, 1627.
26. Nam, J. M.; Thaxton, C. S.; Mirkin, C. A. Science 2003, 301, 1884.
27. Sharma, J.; Chhabra, R.; Liu, Y.; Ke, Y.; Yan, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 730.
28. Aldaye, F. A.; Sleiman, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4130.
29. Tian, Y.; Mao, C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11410.
30. Lee, I.-H.; Yang, K.-A.; Lee, J.-H.; Park, J.-Y.; Chai, Y. G.; et al. Nanolechnology 2008, 19, 395103.
31. Williams, S. C. Patterning nanocrystals using DN A; University of California: Berkeley, 2003.
32. Loweth, C. J.; Caldwell, W. B.; Peng, X.; Alivisatos, A. P.; Schultz, P. G. Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 1808.
33. Claridge, S. A.; Goh, S. L.; Frchet, J. M. J.; Williams, S. C.; Micheel, C. M.; Alivisatos, A. P. Chem. Mater. 2005, 17, 1628.
34. Claridge, S. A,; Liang, H. W.;Basu, S, R.; Fréchet, J. M. J.; Alivisatos, A. P. Nano Lett. 2008, 8, 1202.
35. Zanchet, D.; Micheel, C. M.; Parak, W. J.; Gerion, D.; Alivisatos, A. P. Nano Lett. 2001, 1, 32.
36. Hill, H. D.; Millstone, J. E.; Banholzer, M. J.; Mirkin, C. A. ACS Nano 2009, 2, 418.
37. Hurst, S. J.; Lytton-Jean, A. K. R.; Mirkin, C. A. Anal. Chem. 2006, 78, 8313.
38. Li, Q; Luan, G; Guo, Q; Liang, J. Nucleic Acids Res. 2002, 30, E5.