Effects of bioconjugation on the structures and electronic spectra of CdSe: Density functional theory study of CdSe - Adenine complexes

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 1, 2010, Pages 471-479

  Kim, Ho Sung ^a   Jang, Sung Woo ^a   Chung, Sang Yoon ^a   Lee, Sungyul ^a   Lee, Yonghoon ^b,e   Kim, Bongsoo ^c   Liu, Christopher ^d   Neuhauser, Daniel ^d  

^a Kyung Hee University   (South Korea)

^b Gwangju Institute of Science and Technology (GIST)   (South Korea)

^c Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

^d UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^e Mokpo National University   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CADMIUM ALLOYS; CHEMICAL BONDS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; NANOCLUSTERS; PASSIVATION; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

BIO-CONJUGATION; BLUESHIFTS; ELECTRONIC EXCITATION; ELECTRONIC SPECTRUM; EXCITATION SPECTRUM; NATURAL BOND ORBITAL ANALYSIS; PURINE RING; TIME-DEPENDENT DFT;

CADMIUM COMPOUNDS;

EID: 75649107202     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp907725f     Document Type: Article

References (52)

1. Sarikaya, M.; Tamerler, C.; Jen, A.; Schulten, K.; Baneyx, F. Nature-Mater. 2004, 2, 577.
2. Whaley, S.; English, D.; Hu, E.; Barbara, P.; Belcher, A. Nature 2000, 405, 665.
3. Flynn, C.; Lee, S.-W.; Peelle, B.; Belcher, A. Acta Mater. 2003, 51, 5867.
4. Seeman, N.; Belcher, A. Proc. Natl. Acad. Sci. 2002, 99, 6451.
5. Peelle, B.; Krauland, E.; Wittrup, K.; Belcher, A. Langmuir 2005, 21, 6929.
6. Mattoussi, H.; Mauro, J. M.; Goldman, E. R.; Anderson, G. P.; Sundar, V. C.; Mikulec, F. V.; Bawendi, M. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12142.
7. Tsay, J. M.; Doose, S.; Weiss, S. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1639.
8. Gill, R.; Willner, I.; Shweky, I.; Banin, U. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 23715.
9. Chung, S.-Y.; Lee, S. C.; Liu, S.; Neuhauser, D. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 292.
10. Cohen, R.; Kronik, L.; Shanzer, A.; Cahen, D.; Liu, A.; Rosenwaks, Y.; Lorenz, J. K.; Ellis, A. B. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10545.
11. Artemyev, M.; Kisiel, D.; Abmiotko, S.; Antipina, M. N.; Khomutov, G. B.; Kislov, V. V.; Rakhnyanskaya, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10594.
12. Pinaud, F.; King, D.; Moore, H.-P.; Weiss, S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6115.
13. Chen, F.; Gerion, D. Nano Lett. 2004, 4, 1827.
14. Patolsky, F.; Gill, R.; Weizmann, Y.; Mokari, T.; Banin, U.; Willner, I. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13918.
15. Gill, R.; Zayats, M.; Willner, I. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 7602.
16. Ma, N.; Yang, J.; Stewart, K. M.; Kelley, S. O. Langmuir 2007, 23, 12783.
17. Sandros, M. G.; Gao, D.; Benson, D. E. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12198.
18. Clapp, A. R.; Medintz, I. L.; Fisher, B. R.; Anderson, G. P.; Mattoussi, H. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1242.
19. Bakalova, R.; Ohba, H.; Zhelev, Z.; Nagase, T.; Jose, R.; Ishikawa, M.; Baba, Y. Nano Lett. 2004, 4, 1567.
20. Schlamp, M. C.; Peng, X.; Alivisatos, A. P. J. Appl. Phys. 1997, 82, 5837.
21. Klimov, V. I.; Mikhailovsky, A. A.; Xu, S.; Malko, A.; Hollingsworth, J. A.; Leatherdale, C. A.; Eisler, H.-J.; Bawendi, M. G. Science 2000, 290, 314.
22. Liu, P.; Wang, Q.; Li, X. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 7670.
23. Freeman, R.; Finder, T.; Bahshi, L.; Willner, I. Nano Lett. 2009, 9, 2037.
24. Smith, A.; Ruan, G.; Rhyner, M.; Nie, S. Biomed. Eng. 2006, 34, 3.
25. Michalet, X.; Pinaud, F.; Bentolila, L.; Tsay, J.; Doose, S.; Li, J.; Sundaresan, G.; Wu, A.; Gambhir, S.; Weiss, S. Science 2005, 307, 538.
26. Eichkorn, K.; Ahlrichs, R. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 235.
27. Deglmann, P.; Ahlrichs, R.; Tsereteli, K. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1585.
28. Leung, K.; Whaley, K. B. J. Chem. Phys. 1999, 110, 11012.
29. Troparevsky, M. C.; Chelikowsky, J. R. J. Chem. Phys. 2001, 114, 943.
30. Troparevsky, M. C.; Kronik, L.; Chelikowsky, J. R. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2284.
31. Puzder, A.; Williamson, A. J.; Gygi, F.; Galli, G. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 217401.
32. Peng, Z. A.; Peng, X. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 1389.
33. Nirmal, M.; Norris, D. J.; Kuno, M.; Bawendi, M. G.; Efros, A. L.; Rosen, M. Phys. Rev. Lett. 1995, 75, 3728.
34. Efros, A. L.; Rosen, M.; Kuno, M.; Nirmal, M.; Norris, D. J.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. B 1996, 54, 4843.
35. Fisher, B. R.; Eisler, H. J.; Stott, N. E.; Bawendi, M. G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 143.
36. Qu, L.; Peng, X. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 2049.
37. Ebenstein, Y.; Mokari, T.; Banin, U. Avvi. Phys. Lett. 2002, 80, 4033.
38. de Mello Donega, C.; Hickey, S. G.; Wuister, S. F.; Vanmaekelberg, D.; Meijerink, A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 489.
39. Lim, S. J.; Chon, B.; Joo, T.; Shin, S. K. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 1744.
40. Joo, J.; Son, J. S.; Kwon, S. G.; Yu, J. H.; Hyeon, T. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5632.
41. Jose, R.; Zhanpeisov, N. U.; Fukumura, H.; Baba, Y.; Ishikawa, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 629.
42. Jacobsohn, M.; Banin, U. J. Phys. Chem. B 1999, 104, 1.
43. Li, L.-s.; Hu, J.; Yang, W.; Alivisatos, A. P. Nano Lett. 2001, 1, 349.
44. Zlateva, G.; Zhelev, Z.; Bakalova, R.; Kanno, I. Inorg. Chem. 2007, 46, 6212.
45. Manna, L.; Scher, E. C.; Alivisatos, A. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12700.
46. Jasieniak, J.; Mulvaney, P. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 2841.
47. Behrens, S.; Bettenhausen, M.; Eichhöfer, A.; Fenske, D. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1997, 36, 2797.
48. Soloviev, V. N.; Eichhofer, A.; Fenske, D.; Banin, U. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2354.
49. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
50. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
51. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. P. Phys. Rev.B1988, 37, 785.
52. Hanus, M.; Kabelá, M.; Rejnek, J.; Ryjáek, F.; Hobza, P. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 2087.