Accurately reproducing ab initio electrostatic potentials with multipoles and fragmentation

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 113, Issue 39, 2009, Pages 10527-10533

  Le, Hai Anh ^a   Lee, Adrian M ^a   Bettens, Ryan P A ^a  

^a NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AB INITIO; ATOMIC SITES; ELECTROSTATIC POTENTIALS; FRAGMENT MOLECULES; LARGE SYSTEM; MULTIPOLES; NEURAMINIDASE; POINT CHARGE MODELS; QUADRUPOLES; SOLVENT-ACCESSIBLE SURFACES; TETRAMERS;

AMINES; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; TWO DIMENSIONAL;

ELECTROSTATICS;

EID: 70349459913     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9025706     Document Type: Article

References (53)

1. Yang, W. T.; Lee, T. S. J. Chem. Phys. 1995, 103, 5674.
2. Nakano, T.; Kaminuma, T.; Sato, T.; Akiyama, Y.; Uebayasi, M.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2000, 378, 614.
3. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 6904.
4. Exner, T. E.; Mezey, P. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4301.
5. Exner, T. E.; Mezey, P. G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 4061.
6. Eckard, S.; Exner, T. E. Z. Phys. Chem. 2006, 220, 927.
7. Exner, T. E.; Mezey, P. G. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1980.
8. Exner, T. E.; Mezey, P. G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 11791.
9. Rahalkar, A. P.; Ganesh, V.; Gadre, S. R. J. Chem. Phys. 2008, 129, 234101.
10. Ganesh, V.; Dongare, R. K.; Balanarayan, P.; Gadre, S. R. J. Chem. Phys. 2006, 125, 104109.
11. Gadre, S. R.; Shirsat, R. N.; Limaye, A. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 9165.
12. Babu, K.; Gadre, S. R. J. Comput. Chem. 2003, 24, 484.
13. Babu, K.; Ganesh, V.; Gadre, S. R.; Ghermani, N. E. Theor. Chem. Ace 2004, 111, 255.
14. Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 3599.
15. Mei, Y.; Ji, C. G.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2006, 125, 7.
16. Chen, X. H.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2006, 125, 7.
17. Chen, X. H.; Zhang, Y. K.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 5.
18. Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. Int. J. Quantum Chem. 2005, 103, 246.
19. He, X.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 4.
20. Mei, Y.; Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Phys. Chem. A 2005, 709, 2.
21. Chen, X. H.; Zhang, J. Z. H. J. Theory Comput. Chem. 2004, 3, 277.
22. Gao, A. M.; Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H.; Zhang, Y. K. Chem. Phys. Lett. 2004, 394, 293.
23. Xiang, Y.; Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1431.
24. Chen, X. H.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2004, 120, 11386.
25. Zhang, D. W.; Xiang, Y.; Gao, A. M.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1145.
26. Chen, X. H.; Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2004, 120, 839.
27. Zhang, D. W.; Xiang, Y.; Zhang, J. Z. H. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12039.
28. Zhang, D. W.; Chen, X. H.; Zhang, J. Z. H. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1846.
29. Li, S. H.; Li, W.; Fang, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7215.
30. Dong, H.; Hua, S. G.; Li, S. H. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 1335.
31. Li, W.; Dong, H.; Li, S. H. In Relative Energies of Proteins and Water Clusters Predicted with the Generalized Energy-Based Fragmentation Approach, Proceedings of the 12th European Workshop on Quantum Systems in Chemistry and Physics, August 30-September 5, 2007;
32. Univ London, Royl Holloway Coll., London, England. Source: Frontiers in Quantum Systems in Chemistry and Physics Book Series: Progress in Theoretical Chemistry and Physics. Volume: 18, pps: 289-299, published: 2008.
33. Hua, W. J.; Fang, T.; Li, W.; Yu, J. G.; Li, S. H. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 10864.
34. Li, H.; Li, W.; Li, S. H.; Ma, J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 7061.
35. Li, W.; Li, S. H.; Jiang, Y. S. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 2193.
36. Li, W.; Fang, T.; Li, S. H. J. Chem. Phys. 2006, 124, 6.
37. Deev, V.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 154102.
38. Collins, M. A.; Deev, V. A. J. Chem. Phys. 2006, 125, 104104.
39. Collins, M. A. J. Chem. Phys. 2007, 127, 10.
40. Netzloff, H. M.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 2007, 127, 13.
41. Bettens, R. P. A.; Lee, A. M. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8777.
42. Bettens, R. P. A.; Lee, A. M. Chem. Phys. Lett. 2007, 449, 341.
43. Lee, A. M.; Bettens, R. P. A. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 5111.
44. Stone, A. J. Chem. Phys. Lett. 1981, 83, 233.
45. Stone, A. J. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1128.
46. Stone, A. J.; Alderton, M. Mol. Phys. 1985, 56, 1047.
47. Varghese, J. N.; Colman, P. M.; vanDonkelaar, A.; Blick, T. J.; Sahasrabudhe, A.; McKimmBreschkin, J. L. Proc. Natl Acad. Sci. U.SA. 1997, 94, 11808.
48. Smith, B. J.; McKimm-Breshkin, J. L.; McDonald, M.; Fernley, R. T.; Varghese, J. N.; Colman, P. M. J. Med. Chem. 2002, 45, 2207.
49. Rafat, M.; Popelier, P. L. A. J. Comput. Chem. 2007, 28, 832.
50. Marcotte, I.; Separovic, F.; Auger, M.; Gagne, S. M. Biophys. J. 2004, 86, 1587.
51. Frisch, M. J; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; J. A. Montgomery, J.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, rev. D.Ol; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004..
52. Charifson, P. S.; Hiskey, R. G.; Pedersen, L. G. J. Comput. Chem. 1990, 11, 1181.
53. von Helmholtz, H. Ann. Phys. Chem. 1853, 89, 211.