Generalized energy-based fragmentation approach for computing the ground-state energies and properties of large molecules

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 111, Issue 11, 2007, Pages 2193-2199

  Li, Wei ^a   Li, Shuhua ^a   Jiang, Yuansheng ^a  

^a NANJING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTATION THEORY; GROUND STATE; POLARIZATION; PROTEINS; QUANTUM CHEMISTRY;

CHARGED MOLECULES; ELECTROSTATIC INTERACTION; GENERALIZED ENERGY-BASED FRAGMENTATION (GEBF); POLAR MOLECULES;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 34047234363     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp067721q     Document Type: Article

References (72)

1. Strout, D. L.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1995, 102, 8448.
2. Strain, M. C.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. Science 1996, 271, 51.
3. White, C. A.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6593.
4. Scuseria, G. E. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 4782.
5. Schwegler, E.; Challacombe, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 2726.
6. Ochsenfeld, C.; White, C. A.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 1998, 109, 1663.
7. Burant, J. C.; Strain, M. C.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. Chem. Phys. Lett. 1996, 248, 43.
8. Kudin, K. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. B 2000, 61, 16440.
9. Stratmann, R. E.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J. Chem. Phys. Lett. 1996, 257, 213.
10. Millam, J. M.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5569.
11. Li, X.; Millam, J. M.; Scuseria, G. E.; Frisch, M. J.; Schlegel, H. B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 7651.
12. Lecszsynski, J. Computational Chemistry: Review of Current Trends; World Scientific Publishing: Singapore, 2002; Vol. 7.
13. Pulay, P. Chem. Phys. Lett. 1983, 100, 151.
14. Saebø, S.; Pulay, P. Annu. Rev. Phys. Chem. 1993, 44, 213.
15. Hampel, C.; Werner, H.-J. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6286.
16. Schütz, M.; Hetzer, G.; Werner, H.-J. J. Chem. Phys. 1999, 111, 5691.
17. Schütz, M.; Werner, H.-J. J. Chem. Phys. 2001, 114, 661.
18. Werner, H.-J.; Manby, F. R.; Knowles, P. J. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8149.
19. Ayala, P. Y.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1999, 110, 3660.
20. Scuseria, G. E.; Ayala, P. Y. J. Chem. Phys. 1999. 111, 8330.
21. Ayala, P. Y.; Kudin, K. N.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 2001, 115, 9698.
22. Almlöf, J. Chem. Phys. Lett. 1991, 181, 319.
23. Head-Gordon, M.; Maslen, P. E.; White, C. A. J. Chem. Phys. 1998, 108, 616.
24. Nakao, Y.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 6375.
25. Christiansen, O.; Manninen. P.; Jørgensen, P.; Olsen, J. J. Chem. Phys. 2006, 124, 084103.
26. Förner, W.; Ladik, J.; Otto, P.; Čižek, J. Chem. Phys. 1985, 97, 251.
27. Li, S.; Ma, J.; Jiang, Y. J. Comput. Chem. 2002, 23, 237.
28. Li, S.; Shen, J.; Li, W.; Jiang, Y. J. Chem. Phys. 2006, 125, 074109.
29. Saebø, S.; Baker, J.; Wolinski, K.; Pulay, P. J. Chem. Phys. 2004, 120, 11423.
30. Azhary, A. E.; Rauhut, G.; Pulay, P.; Werner, H.-J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5185.
31. Rauhut, G.; Werner, H.-J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 4853.
32. Schütz, M.; Werner, H.-J.; Lindh, R.; Manby, F. R. J. Chem. Phys. 2004, 121, 737.
33. Ochsenfeld, C.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1997, 270, 399.
34. Larsen, H.; Helgaker, T.; Olsen, J.; Jorgensen, P. J. Chem. Phys. 2001, 115, 10344.
35. Niklasson, A. M. N.; Challacombe, M. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 193001.
36. Weber, V.; Niklasson, A. M. N.; Chailacombe, M. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 193002.
37. Stevens, R. M.; Pitzer, R. M.; Lipscomb, W. N. J. Chem. Phys. 1963, 38, 550.
38. Stevens, R. M.; Lipscomb, W. N. J. Chem. Phys. 1964, 41, 3710.
39. Yang, W. Phys. Rev. Lett. 1991, 66, 1438.
40. Yang, W.; Lee, T.-S. J. Chem. Phys. 1995, 103, 5674.
41. Exner, T. E.; Mezey, P. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4301.
42. He, X.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 031103.
43. Chen, X.; Zhang, Y.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 184105.
44. Chen, X.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2006, 125, 044903.
45. Li, W.; Li, S. J. Chem. Phys. 2005, 122, 194109.
46. Gu, F. L.; Aoki, Y.; Korchowiec, J.; Imamura, A.; Kirtman, B. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10385.
47. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 6832.
48. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2005, 122, 134103.
49. Hirata, S.; Valiev. M.; Dupuis, M.; Xantheas, S. S.; Sugiki, S.; Sekino, H. Mol. Phys. 2005, 103, 2255.
50. Morita, S.; Sakai, S. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1107.
51. Sakai, S.; Morita, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8424.
52. Li, W.; Li, S. J. Chem. Phys. 2004, 121, 6649.
53. Li, S.; Li, W.; Fang, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7215.
54. Deev, V.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 154102.
55. Collins, M. A.; Deev, V. J. Chem. Phys. 2006, 125, 104104.
56. Bettens, R. P. A.; Lee, A. M. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8777.
57. Jiang, N.; Ma, J.; Jiang, Y. J. Chem. Phys. 2006, 124, 114112.
58. Li, W.; Fang, T.; Li, S. J. Chem. Phys. 2006, 124, 154102.
59. Ganesh, V.; Dongare, R. K.; Balanarayan, P.; Gadre, S. R. J. Chem. Phys. 2006, 125, 104109.
60. X⋯Y ≤ 3.5 Å, and
61. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Lahain, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.04. Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
62. Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.
63. Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1841.
64. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1984, 5, 129.
65. Besler, B. H.; Merz, K. M., Jr.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431.
66. Foster, J. P.; Weinhold, F. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7211.
67. Reed, A. E.; Weinstock, R. B.; Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735.
68. Cao, Y.; Friesner, R. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 104102.
69. Mei, Y.; Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2.
70. Li, S.; Li, W.; Fang, T.; Ma, J.; Jiang, Y. LSQC; Version 1.1. Nanjing University: Nanjing, 2006.
71. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235.
72. http://www.mpi.org/.