Evaluation of the field-adapted ADMA approach: Absolute and relative energies of crambin and derivatives

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 7, Issue 24, 2005, Pages 4061-4069

  Exner, Thomas E ^a   Mezey, Paul G ^b,c  

^a UNIVERSITY OF KONSTANZ   (Germany)

^b MEMORIAL UNIVERSITY OF NEWFOUNDLAND   (Canada)

^c EÖTVÖS LORÁND UNIVERSITY   (Hungary)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CRAMBIN PROTEIN, CRAMBE ABYSSINICA; PEPTIDE FRAGMENT; VEGETABLE PROTEIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; EVALUATION; PHYSICAL CHEMISTRY; QUANTUM THEORY; THERMODYNAMICS;

CHEMISTRY, PHYSICAL; PEPTIDE FRAGMENTS; PLANT PROTEINS; QUANTUM THEORY; THERMODYNAMICS;

EID: 29844451503     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b509557c     Document Type: Article

References (47)

1. P. D. Walker and P. G. Mezey, J. Am. Chem. Soc., 1993, 115, 12423.
2. P. D. Walker and P. G. Mezey, J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 12022.
3. P. D. Walker and P. G. Mezey, Can. J. Chem., 1994, 72, 2531.
4. P. D. Walker and P. G. Mezey, J. Math. Chem., 1995, 17, 203.
5. P. D. Walker and P. G. Mezey, J. Comput. Chem., 1995, 16, 1238.
6. P. G. Mezey, J. Math. Chem., 1995, 18, 141.
7. P. G. Mezey, Adv. Quantum Chem., 1996, 27, 163.
8. P. G. Mezey, Int. J. Quantum Chem., 1997, 63, 39.
9. P. G. Mezey, Int. Rev. Phys. Chem., 1997, 16, 361.
10. P. G. Mezey, Adv. Mol. Structure Res., 1998, 4, 115.
11. P. G. Mezey, J. Comput. Methods Sci. Eng. (JCMSE), 2001, 1, 99.
12. T. E. Exner and P. G. Mezey, J. Phys. Chem. A, 2002, 106, 5504.
13. T. E. Exner and P. G. Mezey, J. Phys. Chem. A, 2002, 106, 11791.
14. T. E. Exner and P. G. Mezey, J. Comput. Chem., 2003, 24, 1980.
15. T. E. Exner and P. G. Mezey, J. Phys. Chem. A, 2004, 108, 4301.
16. M. M. Teeter and W. A. Hendrickson, J. Mol. Biol., 1979, 127, 219.
17. H. Liu, M. Elstner, E. Kaxiras, T. Fraunheim, J. Hermans and W. Yang, Proteins, 2001, 44, 484.
18. C. Van Alsenoy, C. H. Yu, A. Peeters, J. M. L. Martin and L. Schaefer, J. Phys. Chem. A, 1998, 102, 2246.
19. H. M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, T. N. Bhat, H. Weissig, I. N. Shindyalov and P. E. Bourne, Nucleic Acids Res., 2000, 28, 235.
20. M. V. Fernandez-Serra, J. Junquera, C. Jelsch, C. Lecomte and E. Artacho, Solid State Commun., 2000, 116, 395.
21. P. G. Mezey, Struct. Chem., 1995, 6, 261.
22. P. G. Mezey, in Computational Chemistry: Reviews and Current Trends, ed. L. Leszczynski, World Scientific, Singapore, vol. 1, 1996, pp. 109-137.
23. C. C. J. Roothaan, Rev. Mod. Phys., 1951, 23, 69.
24. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Alyala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, J. A. Pople, GAUSSIAN 98 (Revision A.9), Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 1998.
25. R. S. Mulliken, J. Chem. Phys., 1955, 23, 1833.
26. R. S. Mulliken, J. Chem. Phys., 1955, 23, 1841.
27. R. S. Mulliken, J. Chem. Phys., 1955, 23, 2338.
28. R. S. Mulliken, J. Chem. Phys., 1955, 23, 2343.
29. P.-O. Löwdin, Adv. Quantum Chem., 1970, 5, 185.
30. L. C. Cusachs and P. Politzer, Chem. Phys. Lett., 1968, 1, 529.
31. W. J. Hehre, R. F. Stewart and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1969, 51, 2657.
32. J. B. Collins, P. v. R. Schleyer, J. S. Binkley and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1976, 64, 5142.
33. B. R. Brooks, R. E. Bruccoleri, B. D. Olafson, D. J. States, S. Swaminathan and M. Karplus, J. Comput. Chem., 1983, 4, 187.
34. J. S. Binkley, J. A. Pople and W. J. Hehre, J. Am. Chem. Soc., 1980, 102, 939.
35. M. S. Gordon, J. S. Binkley, J. A. Pople, W. J. Pietro and W. J. Hehre, J. Am. Chem. Soc., 1982, 104, 2797.
36. W. J. Pietro, M. M. Francl, W. J. Hehre, D. J. Defrees, J. A. Pople and J. S. Binkley, J. Am. Chem. Soc., 1982, 104, 5039.
37. K. D. Dobbs and W. J. Hehre, J. Comput. Chem., 1986, 7, 359.
38. K. D. Dobbs and W. J. Hehre, J. Comput. Chem., 1987, 8, 861.
39. K. D. Dobbs and W. J. Hehre, J. Comput. Chem., 1987, 8, 880.
40. R. Ditchfield, W. J. Hehre and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1971, 54, 724.
41. W. J. Hehre, R. Ditchfield and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1972, 56, 2257.
42. P. C. Hariharan and J. A. Pople, Mol. Phys., 1974, 27, 209.
43. M. S. Gordon, Phys. Lett., 1980, 76, 163.
44. P. C. Hariharan and J. A. Pople, Theor. Chim. Acta, 1973, 28, 213.
45. R. C. Binning Jr and L. A. Curtiss, J. Comput. Chem., 1990, 11, 1206.
46. D. A. Case, D. A. Pearlman, J. W. Caldwell, T. E. Cheatham III, J. Wang, W. S. Ross, C. L. Simmerling, T. A. Darden, K. M. Merz, R. V. Stanton, A. L. Cheng, J. J. Vincent, M. Crowley, V. Tsui, H. Gohlke, R. J. Radmer, Y. Duan, J. Pitera, I. Massova, G. L. Seibel, U. C. Singh, P. K. Weiner, P. A. Kollman, Amber 7, University of California, San Francisco, CA, 2002.
47. Zs. Szekeres, T. E. Exner and P. G. Mezey, Int. J. Quantum Chem., 2005, 104, 847.