Filling the gap in LNA antisense oligo gapmers: The effects of unlocked nucleic acid (UNA) and 4′-C-hydroxymethyl-DNA modifications on RNase H recruitment and efficacy of an LNA gapmer

Molecular BioSystems

Volumn 5, Issue 8, 2009, Pages 838-843

  Fluiter, Kees ^a   Mook, Olaf R F ^a   Vreijling, Jeroen ^a   Langkjær, Niels ^b   Højland, Torben ^b   Wengel, Jesper ^b   Baas, Frank ^a  

^a ACADEMIC MEDICAL CENTER   (Netherlands)

^b UNIVERSITY OF SOUTHERN DENMARK   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE; DNA; LOCKED NUCLEIC ACID; OLIGONUCLEOTIDE; RIBONUCLEASE H;

ARTICLE; CHEMISTRY; GENE SILENCING; HUMAN; METHODOLOGY; TUMOR CELL LINE;

CELL LINE, TUMOR; DNA; GENE KNOCKDOWN TECHNIQUES; HUMANS; OLIGONUCLEOTIDES; OLIGONUCLEOTIDES, ANTISENSE; RIBONUCLEASE H;

EID: 70349328532     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b903922h     Document Type: Article

References (24)

1. A. A. Koshkin S. K. Singh P. Nielsen V. K. Rajwanshi R. Kumar M. Meldgaard C. E. Olsen J. Wengel Tetrahedron 1998 54 3607 3630
2. B. Vester J. Wengel Biochemistry 2004 43 13233 13241
3. M. D. Sørensen L. Kværnø T. Bryld A. E. Håkansson B. Verbeure G. Gaubert P. Herdewijn J. Wengel J. Am. Chem. Soc. 2002 124 2164 2176
4. W. F. Lima J. G. Nichols H. Wu T. P. Prakash M. T. Migawa T. K. Wyrzykiewicz B. Bhat S. T. Crooke J. Biol. Chem. 2004 279 36317 36326
5. B. P. Monia E. A. Lesnik C. Gonzalez W. F. Lima D. McGee C. J. Guinosso A. M. Kawasaki P. D. Cook S. M. Freier J. Biol. Chem. 1993 268 14514 14522
6. J. Kurreck E. Wyszko C. Gillen V. A. Erdmann Nucleic Acids Res. 2002 30 1911 1918
7. D. A. Braasch Y. Liu D. R. Corey Nucleic Acids Res. 2002 30 5160 5167
8. K. Fluiter M. Frieden J. Vreijling C. Rosenbohm M. B. De Wissel S. M. Christensen T. Koch H. Ørum F. Baas ChemBioChem 2005 6 1104 1109
9. C. Wahlestedt P. Salmi L. Good J. Kela T. Johnsson T. Hokfelt C. Broberger F. Porreca J. Lai K. Ren M. Ossipov A. Koshkin N. Jakobsen J. Skouv H. Ørum M. H. Jacobsen J. Wengel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 5633 5638
10. K. Fluiter A. L. M. A. ten Asbroek M. B. de Wissel M. E. Jakobs M. Wissenbach H. Olsson O. Olsen H. Ørum F. Baas Nucleic Acids Res. 2003 31 953 962
11. P. Nielsen L. H. Dreiøe J. Wengel Bioorg. Med. Chem. 1995 3 19 28
12. M. M. Mangos K. L. Min E. Viazovkina A. Galarneau M. I. Elzagheid M. A. Parniak M. J. Damha J. Am. Chem. Soc. 2003 125 654 661
13. B. Vester A. M. Boel S. Lobedanz B. R. Babu M. Raunkjær D. Lindegaard D. Raunak P. J. Hrdlicka T. Højland P. K. Sharma S. Kumar P. Nielsen J. Wengel Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 2296 2300
14. N. Langkjaer, A. Pasternak and J. Wengel, manuscript submitted
15. W. Büsen P. Hausen Eur. J. Biochem. 1975 52 179 190
16. G. Cathala J. Rech J. Huet P. Jeanteur J. Biol. Chem. 1979 254 7353 7361
17. J. J. Turchi L. Huang R. S. Murante Y. Kim R. A. Bambara Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 9803 9807
18. S. M. Cerritelli R. J. Crouch Genomics 1998 53 300 307
19. W. F. Lima J. B. Rose J. G. Nichols H. Wu M. T. Migawa T. K. Wyrzykiewicz A. M. Siwkowski S. T. Crooke Mol. Pharmacol. 2007 71 83 91
20. H. Thrane J. Fensholdt M. Regner J. Wengel Tetrahedron 1995 51 10389 10402
21. E. J. Carrazana K. B. Pasieka J. A. Majzoub Mol. Cell. Biol. 1988 8 2267 2274
22. M. Scherr J. J. Rossi Nucleic Acids Res. 1998 26 5079 5085
23. K. Fluiter A. L. M. A. ten Asbroek M. van Groenigen M. Nooij M. C. G. Aalders F. Baas Cancer Res. 2002 62 2024 2028
24. A. Levin Biochim. Biophys. Acta 1999 1489 69 84