Manipulation of protein-complex function by using an engineered heterotrimeric coiled-coil switch

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 7, Issue 15, 2009, Pages 3102-3111

  Mizuno, Toshihisa ^a   Suzuki, Kumiko ^a   Imai, Tatsuya ^a   Kitade, Yuya ^a   Furutani, Yuji ^a   Kudou, Motonori ^b   Oda, Masayuki ^c   Kandori, Hideki ^a   Tsumoto, Kouhei ^b   Tanaka, Toshiki ^a  

^a NAGOYA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Japan)

^b UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

^c KYOTO PREFECTURAL UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COILED COIL; COILED-COIL STRUCTURE; COMPLEX FUNCTIONS; DESIGN METHODOLOGY; K-COMPLEX; LIGAND BINDING; MULTI-PROTEIN COMPLEX; NATURAL PROTEINS; PEPTIDE LIGAND; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN SEQUENCES; RANDOM COIL; RNA POLYMERASE; RNA SYNTHESIS; STRUCTURAL TRANSITIONS; T7 LYSOZYME; TERTIARY STRUCTURES;

AMINES; BIOCHEMICAL ENGINEERING; DIELECTRIC RELAXATION; ENZYMES; GENETIC ENGINEERING; LIGANDS; NUCLEIC ACIDS; RNA; SWITCHING FUNCTIONS; TARGETS;

COMPLEXATION;

EID: 68949152721     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b901118h     Document Type: Article

References (51)

1. I. Hamachi R. Eboshi J. Watanabe S. Shinkai J. Am. Chem. Soc. 2000 122 4530 4531
2. T. Kiwada K. Sonomura Y. Sugiura K. Asami S. Futaki J. Am. Chem. Soc. 2006 128 6010 6011
3. J. Liang J. R. Kim J. T. Boock T. J. Mansell M. Ostermeier Protein Sci. 2007 16 929 937
4. M. Dalmau S. Lim S. Wang Nano Lett. 2009
5. K. Curley D. S. Lawrence Curr. Opin. Chem. Biol. 1999 3 84 88
6. D. S. Lawrence Curr. Opin. Chem. Biol. 2005 9 570 575
7. Y. Shigeri Y. Tatsu N. Yumoto Pharmacol. Ther. 2001 91 85 92
8. D. M. Rothman E. J. Petersson M. E. Vzquez G. S. Brandt D. A. Dougherty B. Imperiali J. Am. Chem. Soc. 2005 127 846 847
9. M. E. Vzquez M. Nitz J. Stehn M. B. Yaffe B. Imperiali J. Am. Chem. Soc. 2003 125 10150 10151
10. G. A. Woolley Acc. Chem. Res. 2005 38 486 493
11. G. A. Woolley A. S. I. Jaikaran M. Berezovski J. P. Calarco S. N. Krylov O. S. Smart J. R. Kumita Biochemistry 2006 45 6075 6084
12. N. Wu A. Deiters T. A. Cropp D. King P. G. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2004 126 14306 14307
13. K. Zou S. Cheley R. S. Givens H. Bayley J. Am. Chem. Soc. 2002 124 8220 8229
14. H. E. Hoffman E. R. Blair J. E. Johndrow A. C. Bishop J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2824 2825
15. X. Zhang A. C. Bishop J. Am. Chem. Soc. 2007 129 3812 3813
16. G. Guntas M. Ostermeier J. Mol. Biol. 2004 336 263 273
17. M. Ostermeier Protein Eng. Des. Sel. 2005 18 359 364
18. H. D. Mootz T. W. Muir J. Am. Chem. Soc. 2002 124 9044 9045
19. A. N. Lupas M. Gruber Adv. Protein. Chem. 2005 70 37 78
20. D. N. Woolfson Adv. Protein Chem. 2005 70 79 112
21. P. Burkhard J. Stetefeld S. V. Strelkov Trends Cell Biol. 2001 11 82 88
22. A. Lupas Trends Biochem. Sci. 1996 21 375 382
23. K. Suzuki H. Hiroaki D. Kohda T. Tanaka Protein Eng. 1998 11 1051 1055
24. B. Tripet K. Wagschal P. Lavigne C. T. Mant R. S. Hodges J. Mol. Biol. 2000 300 377 402
25. A. Kashiwada H. Hiroaki D. Kohda M. Nango T. Tanaka J. Am. Chem. Soc. 2000 122 212 215
26. T. Kiyokawa K. Kanaori K. Tajima M. Kawaguchi T. Mizuno J. Oku T. Tanaka Chem. Eur. 2004 10 3548 3554
27. S. Yuzawa T. Mizuno T. Tanaka Chem.-Eur. J. 2006 12 7345 7352
28. T. Mizuno K. Murao Y. Tanabe M. Oda T. Tanaka J. Am. Chem. Soc. 2007 129 11378 11383
29. K. Lugar U. Hommel M. Herold J. Hofsteenge K. Kirschner Science 1989 243 206 219
30. M. M. G. Krishna W. Englander Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 1053 1058
31. X. Cheng X. Zhang J. W. Pflugrath F. W. Studier Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 4034 4038
32. D. Jeruzalmi T. A. Steitz EMBO J. 1998 17 4101 4113
33. A. Kumar S. S. Patel Biochemistry 1997 36 13954 13962
34. K. Suzuki T. Yamada T. Tanaka Biochemistry 1999 38 1751 1756
35. K. Wada T. Mizuno J. Oku T. Tanaka Protein Peptide Lett 2003 10 27 33
36. X. Li K. Suzuki K. Tajima A. Kashiwada H. Hiroaki D. Kohda T. Tanaka Protein Sci. 2000 9 1327 1333
37. M. Koike K. Wada T. Kiyokawa K. Kanaori K. Tajima T. Mizuno J. Oku T. Tanaka Peptide Science 2003 2002 355 356
38. T. Kiyokawa K. Kanaori K. Tajima M. Koike T. Mizuno J. Oku T. Tanaka J. Pept. Res. 2004 63/4 347 354
39. T. Tanaka T. Mizuno S. Fukui H. Hiroaki J. Oku K. Kanaori K. Tajima M. Shirakawa J. Am. Chem. Soc. 2004 126 12043 12048
40. B. Ciani E. G. Hutchinson R. B. Sessions D. N. Woolfson J. Biol. Chem. 2002 277 10150 10155
41. M. J. Pandya E. Cerasoli A. Joseph R. G. Stoneman E. Waite D. N. Woolfson J. Am. Chem. Soc. 2004 126 17016 17024
42. E. Cerasoli B. K. Sharpe D. N. Woolfson J. Am. Chem. Soc. 2005 127 15008 15009
43. X. I. Ambroggio B. Kuhlman J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1154 1161
44. N. Doi H. Yanagawa FEBS Lett. 1999 457 1 4
45. S. Nautiyal D. N. Woolfson D. S. King T. Alber Biochemistry 1995 34 11645 11651
46. D. M. Eckert V. N. Malashkevich P. S. Kim J. Mol. Biol. 1998 284 859 865
47. D. L. Vien, N. B. Colthup, W. G. Fateley and J. G. Grasselli, The Handbook of Infrared and Raman Characteristic Frequencies of Organic Molecules, Academic Press, 1991
48. P. B. Harbury T. Zhang P. S. Kim T. Alber Science 1993 262 1401 1407
49. J. E. Coligan, B. M. Dunn, D. W. Speicher and P. T. Wingfield, Short Protocol in Protein Science, Wiley, 2003
50. J. W. Bryson J. R. Desjarlais T. M. Handel W. F. DeGrado Protein Sci. 1998 7 1401 1414
51. Y. Kitade Y. Furutani N. Kamo H. Kandori Biochemistry 2009 48 1596 1603