Nanoparticle diffraction gratings for DNA detection on photopatterned glass substrates

Biointerphases

Volumn 3, Issue 3, 2008, Pages

  Sendroiu, Iuliana E ^a   Corna, Robert M ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BANDPASS FILTERS; DIFFRACTION; DIFFRACTION GRATINGS; FLUORESCENCE MICROSCOPY; GLASS; GOLD NANOPARTICLES; HELIUM NEON LASERS; MONOLAYERS; NANOPARTICLES; OLIGONUCLEOTIDES; PLASMONS; RNA; SUBSTRATES; SURFACE PLASMON RESONANCE;

ADSORPTION PROCESS; DIFFRACTION MEASUREMENTS; GENETIC SCREENING; MICRORNA PROFILING; QUANTITATIVE MEASUREMENT; SINGLE-STRANDED DNA; SURFACE PLASMON RESONANCE IMAGING; WHITE LIGHT SOURCES;

DNA;

EID: 67650728251     PISSN: 15594106     EISSN: 19348630     Source Type: Journal    
DOI: 10.1116/1.2994689     Document Type: Article

References (45)

1. A.-C. Syvanen, Nat. Rev. Genet. 2, 930 (2001).
2. B. W. Kirk, M. Feinsod, R. Favis, R. M. Kliman, and F. Barany, Nucleic Acids Res. 30, 3295 (2002).
3. Y. P. Bao, M. M. Huber, T. Wei, S. S. Marla, J. J. Storhoff, and U. R. Muller, Nucleic Acids Res. 33, el5 (2005).
4. D. Gerion, F. Chen, B. Kannan, A. Fu, W. J. Parak, D. J. Chen, A. Majumdar, and A. P. Alivisatos, Anal. Chem. 75, 4766 (2003).
5. Y. Li, A. W. Wark, H. J. Lee, and R. M. Corn, Anal. Chem. 78, 3158 (2006).
6. M. Schena, D. Shalon, R. Davis, and P. Brown, Science 270, 467 (1995).
7. C. Arenz, Angew. Chem. 118, 5170 (2006)
8. Angew. Chem., Int. Ed. 45, 5048 (2006).
9. R. W. Carthew, Curr. Opin. Genet. Dev. 16, 203 (2006).
10. A. Rodriguez et al., Science 316, 608 (2007).
11. S. F. Gonzalez, M. J. Krug, M. E. Nielsen, Y. Santos, and D. R. J. Call, J. Clin. Microbiol. 42, 1414 (2004).
12. S. Sengupta, K. Onodera, A. Lai, and U. J. Melcher, J. Clin. Microbiol. 41, 4542 (2003)
13. L. A. Neely et al., Nat. Methods 3, 41 (2006).
14. J. S. Hartig, I. Grune, S. H. Najafi-Shoushtari, and M. Famulok, J. Am. Chem. Soc. 126, 722 (2004).
15. H. J. Lee, A. W. Wark, and R. M. Corn, Langmuir 22, 5241 (2006).
16. H. J. Lee, Y. Li, A. W. Wark, and R. M. Corn, Anal. Chem. 77, 5096 (2005).
17. A. W. Wark, H. J. Lee, and R. M. Corn, Anal. Chem. 77, 3904 (2005).
18. T. T. Goodrich, H. J. Lee, and R. M. Corn, Anal. Chem. 76, 6173 (2004).
19. T. T. Goodrich, H. J. Lee, and R. M. Corn, J. Am. Chem. Soc. 126, 4086 (2004).
20. S. Fang, H. J. Lee, A. W. Wark, and R. M. Corn, J. Am. Chem. Soc. 128, 14044 (2006).
21. F. Yu, D. Yao, and W. Knoll, Nucleic Acids Res. 32, e75 (2004).
22. F. Yu, S. Tian, D. Yao, and W. Knoll, Anal. Chem. 76, 3530 (2004).
23. F. Yu and W. Knoll, Anal. Chem. 76, 1971 (2004).
24. A. M. Massary, K. J. Stevenson, and J. T. Hupp, J. Electroanal. Chem. 500, 185 (2001).
25. S. Tian, N. R. Armstrong, and W. Knoll, Langmuir 21, 4656 (2005).
26. J. B. Goh, P. L. Tam, R. W. Loo, and M. C. Goh, Anal. Biochem. 313, 262 (2003).
27. R. C. Bailey, J.-M. Nam, C. A. Mirkin, and J. T. Hupp, J. Am. Chem. Soc. 125, 13541 (2003).
28. A. W. Wark, H. J. Lee, A. J. Qavi, and R. M. Corn, Anal. Chem. 79, 6697 (2007).
29. J. Turkevich, P. C. Stevenson, and J. Hillier, Discuss. Faraday Soc. 11, 55 (1951).
30. R. Elghanian, J. J. Storhoff, R. C. Mucic, R. L. Letsinger, and C. A. Mirkin, Science 277, 1078 (1997)
31. G. P. Goodrich, M. R. Helfrich, J. J. Overberg, and C. D. Keating, Langmuir 20, 10246 (2004).
32. P. Gong and D. W. Grainger, Surf. Sci. 570, 67 (2004).
33. F. Cheng, L. J. Gamble, D. W. Grainger, and D. G. Castner, Anal. Chem. 79, 8781 (2007)
34. P. Gong, G. M. Harbers, and D. W. Grainger, Anal. Chem. 78, 2342 (2006).
35. E. A. Smith and R. M. Corn, Appl. Spectrosc. 57, 320A (2003).
36. T. Wilkop, Z. Wang, and Q. Cheng, Langmuir 20, 11141 (2004).
37. J. S. Shumaker-Parry and C. T. Campbell, Anal. Chem. 76, 907 (2004).
38. B. P. Nelson, T. E. Grimsrud, M. R. Liles, R. M. Goodman, and R. M. Corn, Anal. Chem. 73, 1 (2001).
39. L. He, M. D. Musick, S. R. Nicewarner, F. G. Salinas, S. J. Benkovic, M. J. Natan, and C. D. Keating, J. Am. Chem. Soc. 122, 9071 (2000).
40. M. C. Howland, A. R. Sapuri-Butti, S. S. Dixit, A. M. Dattelbaum, A. P. Shreve, and A. N. Parikh, J. Am. Chem. Soc. 127, 6752 (2005).
41. M. Nakagawa, N. Nawa, and T. Iyoda, Langmuir 20, 9844 (2004).
42. A. W. Wark, H. J. Lee, and R. M. Corn, in Handbook of Surface Plasmon Resonance, edited by R. B. M. Schasfoort and A. J. Tudos (RSC, Cambridge, UK, 2008), pp. 251-280.
43. M. G. Moharam and T. K. Gaylord, J. Opt. Soc. Am. 71, 811 (1981).
44. M. G. Moharam and T. K. Gaylord, J. Opt. Soc. Am. A 3, 1780 (1986).
45. K. L. Kelly, E. Coronado, L. L. Zhao, and G. C. Schatz, J. Phys. Chem. B 107, 668 (2003).