The properties of water: Insights from quantum simulations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 17, 2009, Pages 5702-5719

  Paesani, Francesco ^a   Voth, Gregory A ^a  

^a UNIVERSITY OF UTAH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL COMPOUNDS; CLIMATE RESEARCH; COMPUTER MODELING; HYDROGEN BOND NETWORKS; LIQUID WATER; MOLECULAR LEVELS; NUCLEAR MOTIONS; QUANTUM SIMULATIONS; WATER PROPERTIES;

HYDROGEN;

EID: 66349087681     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp810590c     Document Type: Article

References (223)

1. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Interaction Models for Water in Relation to Protein Hydration. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981.
2. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
3. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269.
4. Reimers, J. R.; Watts, R. O.; Klein, M. L. Chem. Phys. 1982, 64, 95.
5. Horn, H. W.; Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Madura, J. D.; Dick, T. J.; Hura, G. L.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2004, 720, 9665.
6. Mahoney, M. W.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Phys. 2000, 772, 8910.
7. Abascal, J. L. F.; Vega, C. J. Chem. Phys. 2005, 123.
8. Abascal, J. L. F.; Sanz, E.; Fernandez, R. G.; Vega, C. J. Chem. Phys. 2005, 122.
9. Kumar, R.; Skinner, J. L. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 8311.
10. Dang, L. X.; Pettitt, B. M. J. Phys. Chem. 1987, 91, 3349.
11. Ferguson, D. M. J. Comput. Chem. 1995, 16, 501.
12. Teleman, O.; Jonsson, B.; Engstrom, S. Mol. Phys. 1987, 60, 193.
13. Amira, S.; Spangberg, D.; Hermansson, K. Chem. Phys. 2004, 303, 327.
14. Wu, Y. J.; Tepper, H. L.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2006, 124, 024503.
15. Paesani, F.; Zhang, W.; Case, D. A.; Cheatham, T. E., Ill; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2006, 125, 184507.
16. Lobaugh, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1997, 706, 2400.
17. Dang, L. X.; Chang, T. M. J. Chem. Phys. 1997, 706, 8149.
18. Rick, S. W.; Stuart, S. J.; Beme, B. J. J. Chem. Phys. 1994, 707, 6141.
19. Saint-Martin, H.; Hemandez-Cobos, J.; Bemal-Uruchurtu, M. I.; Ortega-Blake, I.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10899.
20. Lamoureux, G.; MacKerell, A. D. J.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2003, 779, 5185.
21. Bumham, C. J.; Li, J. C.; Xantheas, S. S.; Leslie, M. J. Chem. Phys. 1999, 770, 4566.
22. Bumham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 776, 1500.
23. Bumham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 776, 5115.
24. Fanourgakis, G. S.; Xantheas, S. S. J. Phys. Chem. A 2006, 770, 4100.
25. Fanourgakis, G. S.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2008, 728, 074506.
26. Bumham, C. J.; Anick, D. J.; Mankoo, P. K.; Reiter, G. F. J. Chem. Phys. 2008, 728, 154519.
27. Jeon, J.; Lefohn, A. E.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2003, 778, 7504.
28. Iuchi, S.; Morita, A.; Kato, S. J. Phys. Chem. B 2002, 706, 3466.
29. Ren, P.; Ponder, J. W. J. Phys. Chem. B 2003, 707, 5933.
30. Donchev, A. G.; Galkin, N. G.; Illarionov, A. A.; Khomzhii, O. V.; Olevanov, M. A.; Ozrin, V. D.; Subbotin, M. V.; Tarasov, V. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 8613.
31. Bukowski, R.; Szalewicz, K.; Groenenboom, G. C.; van der Avoird, A. Science 2007, 315, 1249.
32. Goldman, N.; Leforestier, C.; Saykally, R. J. Philos. Trans. R. Soc, Ser. A 2005, 363, 493.
33. Mankoo, P. K.; Keyes, T. J. Chem. Phys. 2008, 729, 034504.
34. Dang, L. X. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 620.
35. Marechal, Y. The Hydrogen Bond and the Water Molecule: The Physics and Chemistry of Water, Aqueous and Bio-Media; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2006.
36. Kennedy, D.; Norman, C. Science 2005, 309, 75.
37. Sorenson, J. M.; Hura, G.; Glaeser, R. M.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9149.
38. Soper, A. K. Chem. Phys. 2000, 258, 121.
39. Modig, K.; Pfrommer, B. G.; Halle, B. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 075502.
40. Wemet, P.; Nordlund, D.; Bergmann, U.; Cavalleri, M.; Odelius, M.; Ogasawara, H.; Naslund, L. A.; Hirsh, T. K.; Ojamae, L.; Glatzel, P.; Pettersson, L. G. M.; Nilsson, A. Science 2004, 304, 995.
41. Smith, J. D.; Cappa, C. D.; Wilson, K. R.; Messer, B. M.; Cohen, R. C.; Saykally, R. J. Science 2004, 306, 851.
42. Head-Gordon, T.; Johnson, M. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 7973.
43. Mantz, Y. A.; Chen, B.; Martyna, G. J. Chem. Phys. Lett. 2005, 405, 294.
44. Mantz, Y. A.; Chen, B.; Martyna, G. J. J. Phys. Chem. B 2006, 770, 3540.
45. Soper, A. K. J. Phys.: Condens. Matter 2005, 17, S3273.
46. Leetmaa, M.; Ljungberg, M.; Ogasawara, H.; Odelius, M.; Naslund, L.-A.; Nilsson, A.; Pettersson, L. G. M. J. Chem. Phys. 2006, 725, 244510.
47. Prendergast, D.; Galli, G. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 215502.
48. Leetmaa, M.; Wikfeldt, K. T.; Ljungberg, M. P.; Odelius, M.; Swenson, J.; Nilsson, A.; Pettersson, L. G. M. J. Chem. Phys. 2008, 729, 084502.
49. Tokushima, T.; Harada, Y.; Takahashi, O.; Senba, Y.; Ohashi, H.; Pettersson, L. G. M.; Nilsson, A.; Shin, S. Chem. Phys. Lett. 2008, 460, 387.
50. Smith, J. D.; Cappa, C. D.; Wilson, K. R.; Messer, B. M.; Cohen, R. C.; Saykally, R. J. Science 2004, 306, 851.
51. Wang, Z. H.; Pakoulev, A.; Pang, Y.; Dlott, D. D. Chem. Phys. Lett. 2003, 378, 281.
52. Smith, J. D.; Cappa, C. D.; Wilson, K. R.; Cohen, R. C.; Geissler, P. L.; Saykally, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 14171.
53. Walrafen, G. E.; Fisher, M. R.; Hokmabadi, M. S.; Yang, W. H. J. Chem. Phys. 1986, 85, 6970.
54. Nienhuys, H. K.; van Santen, R. A.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 2000, 772, 8487.
55. Rezus, Y. L. A.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114502.
56. Loparo, J. J.; Fecko, C. J.; Eaves, J. D.; Roberts, S. T.; Tokmakoff, A. Phys. Rev. B 2004, 70.
57. Bakker, H. J.; Rezus, Y. L. A.; Timmer, R. L. A. J. Phys. Chem. A 2008, 772, 11523.
58. Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2003, 778, 264.
59. Laage, D.; Hynes, J. T. Chem. Phys. Lett. 2006, 433, 80.
60. Laage, D.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. B 2008, 772, 14230.
61. Tauber, M. J.; Mathies, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 725, 1394.
62. Hart, R. T.; Benmore, C. J.; Neuefeind, J. C.; Kohara, S.; Tomberli, B.; Egelstaff, P. A. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 047801.
63. Hait, R. T.; Mei, Q.; Benmore, C. J.; Neuefeind, J. C.; Turner, J. F. C.; Dolgos, M.; Tomberli, B.; Egelstaff, P. A. J. Chem. Phys. 2006, 724, 134505.
64. Soper, A. K.; Benmore, C. J. Phys. Rev. Lett. 2008, 707, 065502.
65. Kushner, D. J.; Baker, A.; Dunstall, T. G. Can. J. Physiol. Pharmacol. 1999, 77, 79.
66. Kresheck, G. C.; Schneider, H.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1965, 69, 3132.
67. Marcus, Y.; Ben-Naim, A. J. Chem. Phys. 1985, 83, 4744.
68. Maybury, R. H.; Katz, J. J. Nature 1956, 777, 629.
69. Hermans, J. J.; Sheraga, H. A. Biochim. Biophys. Ada 1959, 36, 534.
70. Dong, A.; Kendrick, B.; Kreigard, L.; Matsuura, J.; Manning, M. C.; Capenter, J. F. Arch. Biochem. Biophys. 1998, 391.
71. Parker, M. J.; Clarke, A. R. Biochemistry 1997, 36, 5786.
72. Kem, D.; Zaccai, G.; Giege, R. Biophys. Chem. 1980, 59, 203.
73. Makhatadze, G. I.; Clore, G. M.; Gronenbom, A. M. Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 852.
74. Bonnete, F.; Madem, D.; Zaccai, G. J. Mol. Biol. 1994, 244, 436.
75. Baghurst, P. A.; Nichol, L. W.; Sawyer, W. H. J. Biol. Chem. 1972, 247, 3199.
76. Harmony, J. A.; Himes, R. H.; Schowen, R. L. Biochemistry 1975, 14, 5379.
77. Woodfin, B. M.; Henderson, R. F.; Henderson, T. R. J. Biol. Chem. 1970, 245, 3733.
78. Omori, H.; Kuroda, M.; Naora, H.; Takeda, H.; Nio, Y.; Otani, H.; Tamura, K. J. Cell Biol. 1997, 74, 273.
79. Panda, D.; Chakrabarti, G.; Hudson, J.; Pigg, K.; Miller, H. P.; Wilson, L.; Himes, R. H. Biochemistry 2000, 39, 5075.
80. Chakrabarti, G.; Kim, B.; Gupta, M. L.; Barton, J. S., Jr.; Himes, R. H. Biochemistry 1999, 38, 3067.
81. Cioni, P.; Strambini, G. B. Biophys. J. 2002, 82, 3246.
82. Ikeda, M.; Suzuki, S.; Kishio, M.; Hirono, M.; Sugiyama, T.; Matsuura, J.; Suzuki, T.; Sota, T.; Allen, C. N.; Konishi, S.; Yoshioka, T. Biophys. J. 2004, 86, 565.
83. Altermatt, H. J.; Gebbers, J. O.; Laissue, J. A. Cancer 1988, 57, 303.
84. Takeda, H.; Nio, Y.; Omori, H.; Uegaki, K.; Hirahara, N.; Sasaki, S.; Tamura, K.; Ohtani, H. Anti-Cancer Drugs 1998, 9, 715.
85. Bhak, J. Y.; Lee, J.-H.; Chung, H. S.; Lee, H. Y.; Chung, B. C.; Park, M. S.; Min, S. K.; Kim, M. O. J. Ind. Eng. Chem. 2007, 13, 501.
86. Dash, J. G.; Fu, H.; Wettlaufer, J. S. Rep. Prog. Phys. 1995, 58, 115.
87. Wettlaufer, J. S. Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. A 1999, 357, 3403.
88. Li, Y.; Somorjai, G. A. J. Phys. Chem. C 2007, 777, 9631.
89. Rosenberg, R. Phys. Today 2005, 58, 50.
90. Makkonen, L. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 6196.
91. Molina, M. J. The probable role of stratospheric 'ice' clouds: heterogeneous chemistry of the 'ozone hole'. In The Chemistry of the Atmosphere: Its Impact on Global Change; Calvert, J. G., Ed.; Blackwell Scientific Publications: Oxford, U.K., 1994.
92. Feynman, R. P. Statistical Mechanics; Benjamin: New York, 1972.
93. Beme, B. J.; Thirumalai, D. Annu. Rev. Phys. Chem. 1986, 37, 401.
94. Tuckerman, M. E. Path Integration via Molecular Dynamics. In Quantum Simulations of Complex Many-Body Systems: From Theory to Algorithms; Grotendorst, J., Marx, D., Muramatsu, A., Eds.; John von Neumann Institute for Computing: Jiilich, Germany, 2002; Vol. 10, p 269.
95. Schulman, L. S. Techniques and Applications of Path Integration; Wiley & Sons: New York, 1996.
96. Ceperley, D. M. Rev. Mod. Phys. 1995, 67, 279.
97. Chandler, D.; Wolynes, P. G. J. Chem. Phys. 1981, 74, 4078.
98. Martyna, G. J.; Klein, M. L.; Tuckerman, M. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2635.
99. Hall, W. R.; Beme, B. J. J. Chem. Phys. 1984, 87, 3641.
100. Sprik, M.; Klein, M. L.; Chandler, D. Phys. Rev. B 1985, 31, 4234.
101. Cao, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 700, 5093.
102. Cao, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 700, 5106.
103. Cao, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 707, 6157.
104. Cao, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 707, 6168.
105. Cao, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 707, 6184.
106. Jang, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1999, 777, 2357.
107. Jang, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1999, 777, 2371.
108. Reichman, D. R.; Roy, P.-N.; Jang, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 919.
109. Krishna, V.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 2006, 770, 18953.
110. Jang, S. J. Chem. Phys. 2006, 724, 064107.
111. Paesani, F.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2008, 729, 194113.
112. Miller, W. H. J. Phys. Chem. A 2001, 705, 2942.
113. Sun, X.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 1999, 770, 6635.
114. Makri, N.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2002, 776, 9207.
115. Makri, N. J. Phys. Chem. A 2004, 708, 806.
116. Nakayama, A.; Makri, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 4230.
117. Liu, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2006, 725, 224104.
118. Liu, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2007, 727, 114506.
119. Liu, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2007, 726, 234110.
120. Liu, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2008, 728, 144511.
121. Liu, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2008, 729, 124111.
122. Reichman, D. R.; Rabani, E. Phys. Rev. Lett. 2001, 87, 265702.
123. Reichman, D. R.; Rabani, E. J. Chem. Phys. 2002, 776, 6271.
124. Poulsen, J. A.; Nyman, G.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 2003, 779, 12179.
125. Poulsen, J. A.; Nyman, G.; Rossky, P. J. J. Phys. Chem. A 2004, 708, 8743.
126. Poulsen, J. A.; Nyman, G.; Rossky, P. J. J. Phys. Chem. B 2004, 708, 19799.
127. Poulsen, J. A.; Nyman, G.; Rossky, P. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 6709.
128. Poulsen, J. A.; Nyman, G.; Rossky, P. J. J. Chem. Theory Comput. 2006,2, 1482.
129. Poulsen, J. A.; Scheers, J.; Nyman, G.; Rossky, P. J. Phys. Rev. B 2007, 75, 224505.
130. Craig, I. R.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2004, 727, 3368.
131. Craig, I. R.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 123, 034102.
132. Craig, I. R.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 722, 084106.
133. Miller, T. F., Ill; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 123, 154504.
134. Miller, T. F., Ill; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 722, 184503.
135. Braams, B. J.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2006, 725, 124105.
136. Braams, B. J.; Miller, T. F.; Manolopoulos, D. E. Chem. Phys. Lett. 2006, 478, 179.
137. Habershon, S.; Braams, B. J.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2007, 727, 174108.
138. Habershon, S.; Fanourgakis, G. S.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2008, 729, 074501.
139. Collepardo-Guevara, R.; Craig, I. R.; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2008, 728, 144502.
140. Horikoshi, A.; Kinugawa, K. J. Chem. Phys. 2003, 779, 4629.
141. Horikoshi, A.; Kinugawa, K. J. Chem. Phys. 2005, 722, 174104.
142. Kuharski, R. A.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1985, 82, 5164.
143. Wallqvist, A.; Beme, B. J. Chem. Phys. Lett. 1985, 777, 214.
144. Guillot, B.; Guissani, Y. J. Chem. Phys. 1998, 708, 10162.
145. Hernandez de la Pefla, L.; Kusalik, P. G. J. Chem. Phys. 2004, 727, 5992.
146. Hernandez de la Pena, L.; Kusalik, P. G. J. Am. Chem. Soc. 2005, 727, 5246.
147. Hernandez de la Pefla, L.; Kusalik, P. G. J. Chem. Phys. 2006, 725, 054512.
148. Miller, T. F., Ill; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 123, 154504.
149. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
150. Grossman, J. C.; Schwegler, E.; Draeger, E. W.; Gygi, F.; Galli, G. J. Chem. Phys. 2004, 720, 300.
151. VandeVondele, J.; Mohamed, F.; Krack, M.; Hutter, J.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 2005, 722, 014515.
152. Lee, H.-S.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 2006, 725, 154507.
153. Lee, H.-S.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 2007, 726, 164501.
154. Chen, B.; Ivanov, I.; Klein, M. L.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 2003, 97, 215503.
155. Morrone, J. A.; Car, R. Phys. Rev. Lett. 2008, 707, 017801.
156. Donchev, A. G.; Ozrin, V. D.; Subbotin, M. V.; Tarasov, O. V.; Tarasov, V. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 7829.
157. Bumham, C. J.; Li, J. C.; Xantheas, S. S.; Leslie, M. J. Chem. Phys. 1999, 770, 4566.
158. Bumham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 776, 1500.
159. Bumham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 776, 5115.
160. Fanourgakis, G. S.; Xantheas, S. S. J. Phys. Chem. A 2006, 770, 4100.
161. Stem, H. A.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 2001, 775, 7622.
162. Fanourgakis, G. S.; Schenter, G. K.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2006, 725, 141102.
163. Paesani, F.; Iuchi, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2007, 727, 074506.
164. Bumham, C. J.; Reiter, G. F.; Mayers, J.; Abdul-Redah, T.; Reichert, H.; Dosch, H. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 3966.
165. Head-Gordon, T.; Johnson, M. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 7973.
166. Head-Gordon, T.; Rick, S. W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 83.
167. Sorenson, J. M.; Hura, G.; Glaeser, R. M.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9149.
168. Hura, G.; Russo, D.; Glaeser, R. M.; Head-Gordon, T.; Krack, M.; Parrinello, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 1981.
169. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulations of Liquids; Oxford: Oxford, U.K., 1987.
170. Yeh, I. C.; Hummer, G. J. Phys. Chem. B 2004, 708, 15873.
171. Hernandez de la Pena, L.; Razul, M. S. G.; Kusalik, P. G. J. Phys. Chem. A 2005, 709, 7236.
172. Miller, T. F., Ill; Manolopoulos, D. E. J. Chem. Phys. 2005, 123, 154504.
173. Bertie, J. E.; Lan, Z. Appl. Spectrosc. 1996, 50, 1047.
174. Guillot, B. J. Chem. Phys. 1991, 95, 1543.
175. Corcelli, S. A.; Skinner, J. L. J. Phys. Chem. A 2005, 709, 6154.
176. Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. Chem. Phys. Lett. 2003, 369, 472.
177. Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2002, 777, 8847.
178. Rey, R.; Moller, K. B.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. A 2002, 706, 11993.
179. Moller, K. B.; Rey, R.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. A 2004, 708, 1275.
180. Fecko, C. J.; Eaves, J. D.; Loparo, J. J.; Tokmakoff, A.; Geissler, P. L. Science 2003, 301, 1698.
181. Eaves, J. D.; Tokmakoff, A.; Geissler, P. L. J. Phys. Chem. A 2005, 709, 9424.
182. Eaves, J. D.; Loparo, J. J.; Fecko, C. J.; Roberts, S. T.; Tokmakoff, A.; Geissler, P. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 13019.
183. Harder, E.; Eaves, J. D.; Tokmakoff, A.; Beme, B. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 702, 11611.
184. Corcelli, S. A.; Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2004, 720, 8107.
185. Schmidt, J. R.; Corcelli, S. A.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2004, 727, 8887.
186. Hayashi, T.; Jansen, T. L.; Zhuang, W.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. A 2005, 709, 64.
187. Jansen, T. L.; Hayashi, T.; Zhuang, W.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114504.
188. Auer, B.; Kumar, R.; Schmidt, J. R.; Skinner, J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 704, 14215.
189. Moilanen, D. E.; Fenn, E. E.; Lin, Y. S.; Skinner, J. L.; Bagchi, B.; Fayer, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 705, 5295.
190. Laage, D.; Hynes, J. T. Chem. Phys. Lett. 2006, 433, 80.
191. Tan, H. S.; Piletic, I. R.; Fayer, M. D. J. Chem. Phys. 2005, 722, 174501.
192. Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2003, 778, 264.
193. Rezus, Y. L. A.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114502.
194. Winkler, R.; Lindner, J.; Bursing, H.; Vohringer, P. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4674.
195. Fanourgakis, G. S.; Schenter, G. K.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2006, 125.
196. Fenimore, P. W.; Frauenfelder, H.; McMahon, B. H.; Parak, F. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 16047.
197. Fenimore, P. W.; Frauenfelder, H.; McMahon, B. H.; Young, R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 707, 14408.
198. Frauenfelder, H.; Fenimore, P. W.; Chen, G.; McMahon, B. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 15469.
199. Konermann, L.; Simmons, D. A. Mass Spectrom. Rev. 2003, 22, 1.
200. Schowen, K. B.; Schowen, R. L. Methods Enzymol. 1982, 87, 551.
201. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A. E.; Pratt, L. R. Chem. Phys. 2000, 258, 349.
202. Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, I., T. E.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Merz, K. M.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Kolossvary, I.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Vanicek, J.; Wu, X.; Brozell, S. R.; Steinbrecher, T.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Homak, V.; Cui, G.; Mathews, D. H.; Seetin, M. G.; Sagui, C.; Babin, V.; P.A., K. AMBER 10, 10th ed.; University of California-San Francisco: San Francisco, CA, 2008.
203. Wang, J. M.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157.
204. Wang, B.; Merz, K. M. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 209.
205. Vanicek, J.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2007, 127, 114309.
206. Mclntyi-e, J. D. E.; Salomon, M. J. Phys. Chem. 1968, 72, 2431.
207. Finlayson-Pitts, B. J.; Pitts, J. N., Jr. Chemistry of the Upper and Lower Atmosphere: Theory, Experiments and Applications; Academic Press: San Diego, CA, 2000.
208. Kroes, G. J. Surf. Sci. 1992, 275, 365.
209. Materer, N.; Starke, U.; Barbieri, A.; VanHove, M. A.; Somorjai, G. A.; Kroes, G. J.; Minot, C. Surf. Sci. 1997, 381, 190.
210. Bolton, K.; Pettersson, J. B. C. J. Phys. Chem. B 2000,104, 1590.
211. Ikeda-Fukazawa, T.; Kawamura, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1395.
212. Mantz, Y. A.; Geiger, F. M.; Molina, L. T.; Molina, M. J.; Trout, B. L. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10733.
213. Conde, M. M.; Vega, C.; Patrykiejew, A. J. Chem. Phys. 2008, 129, 014702.
214. Paesani, F.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 324.
215. Eisenberg, D.; Kauzmann, W. The Structure and Properties of Water; Oxford University Press: London, 1969.
216. Furukawa, Y.; Yamamoto, M.; Kuroda, T. J. Cryst. Growth 1987, 82, 665.
217. Bluhm, H.; Ogletree, D. F.; Fadley, C. S.; Hussain, Z.; Salmeron, N. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 14, 1221.
218. Gillen, K. T.; Douglas, D. C.; Hoch, M. J. R. J. Chem. Phys. 1972,57, 5117.
219. Mills, R. J. Phys. Chem. 1973, 77, 685.
220. Bagchi, B. Chem. Rev. 2005, 105, 3197.
221. Wallqvist, A.; Beme, B. J. J. Chem. Phys. 1993, 97, 13841.
222. Madden, P.; Kivelson, D. Adv. Chem. Phys. 1984, 56, 467.
223. Tan, H. S.; Piletic, I. R.; Fayer, M. D. J. Chem. Phys. 2005, 122.