Effect of time on the rate of long range polymer segmental intramolecular encounters

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 8, 2009, Pages 2284-2292

  Ingratta, Mark ^a   Duhamel, Jean ^a  

^a UNIVERSITY OF WATERLOO   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE; POLYMERS; POLYSTYRENES; PROBES; RATE CONSTANTS; VISCOSITY;

BLOB MODELS; CONCENTRATION OF; EXCITED PYRENES; FLUORESCENCE DECAYS; GROUND-STATE; HELICAL POLYPEPTIDES; LONG RANGES; MASTER CURVES; POLYMER COILS; POLYSTYRENE CHAINS; PROBING TIME; SOLVENT VISCOSITIES;

PYRENE;

EID: 65249112220     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8082858     Document Type: Article

References (77)

1. Dobson, C. M. Nature 2003, 426, 884-890.
2. Udgaonkar, J. B. Annu. ReV. Biophys. 2008, 37, 489-510.
3. Dyson, H. J.; Wright, P. E.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 13057-13061.
4. Naganathan, A. N.; Doshi, U.; Fung, A.; Sadqi, M.; Muñoz, V. Biochemistry 2006, 45, 8466-8475.
5. Prusiner, S. B. Science 1997, 278, 245-251.
6. Johnston, J. A.; Dalton, M. J.; Gurney, M. E.; Kopito, R. R. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000, 97, 12571-12576.
7. Bieri, O.; Hellrung, B.; Schutkowski, M.; Drewello, M.; Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. 1999, 96, 9597-9601.
8. Möglich, A.; Krieger, F.; Kiefhaber, T. J. Mol. Biol. 2005, 345, 153-162.
9. Neuweiler, H.; Löllmann, M.; Doose, S.; Sauer, M. J. Mol. Biol. 2007, 365, 856-869.
10. Hagen, S. J.; Hofrichter, J.; Szabo, A.; Eaton, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. 1996, 93, 11615-11617.
11. McGimpsey, W. G.; Chen, L.; Carraway, R.; Samaniego, W. N. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 6082-6090.
12. Lapidus, L. J.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000, 97, 7220-7225.
13. Krieger, F.; Fierz, B.; Bieri, O.; Drewello, M.; Kiefhaber, T. J. Mol. Biol. 2003, 332, 265-274.
14. Möglich, A.; Joder, K.; Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 12394-12399.
15. Fierz, B.; Satzger, H.; Root, C.; Gilch, P.; Zinth, W.; Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. 2007, 104, 2163-2168.
16. Fierz, B.; Kiefhaber, T. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 672-679.
17. Hudgins, R. R.; Huang, F.; Gramlich, G.; Nau, W. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 556-564.
18. Huang, F.; Hudgins, R. R.; Nau, W. M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16665-16675.
19. Roccatano, D.; Sahoo, H.; Zacharias, M.; Nau, W. M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2639-2646.
20. Wilemski, G.; Fixman, M. J. Chem. Phys. 1974, 60, 878-890.
21. Szabo, A.; Schulten, K.; Schulten, Z. J. Chem. Phys. 1980, 72, 4350-4357.
22. Cuniberti, C.; Perico, A. Prog. Polym. Sci. 1984, 10, 271-316.
23. Winnik, M. A. Acc. Chem. Res. 1985, 18, 73-79.
24. Cuniberti, C.; Perico, A. Eur. Polym. J. 1977, 13, 369-374.
25. Wang, F. W.; Lowry, R. E.; Grant, W. H. Polymer 1984, 25, 690- 692.
26. Cheung, S.-T.; Winnik, M. A.; Redpath, A. E. C. Makromol. Chem. 1982, 183, 1815-1824.
27. Pandey, S.; Kane, M. A.; Baker, G. A.; Bright, F. V.; Fürstner, A.; Seidel, G.; Leitner, W. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 1820-1832.
28. Gardinier, W. E.; Kane, M. A.; Bright, F. V. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 18520-18529.
29. Gardinier, W. E.; Bright, F. V. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 14824- 14829.
30. Kanaya, T.; Goshiki, K.; Yamamoto, M.; Nishijima, Y. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 3580-3587.
31. Almeida, L. M.; Vaz, W. L. C.; Zachariasse, K. A.; Madeira, V. M. C. Biochemistry 1982, 21, 5972-5977.
32. Zachariasse, K. A.; Duveneck, G.; Busse, R. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 1045-1051.
33. Zachariasse, K. A.; Duveneck, G. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3790-3792.
34. Reynders, P.; Kühnle, W.; Zachariasse, K. A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 3929-3939.
35. Zachariasse, K. A.; Maçanita, A. L.; Kühnle, W. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9356-9365.
36. Winnik, M. A.; Redpath, T.; Richards, D. H. Macromolecules 1980, 13, 328-335.
37. Svirskaya, P.; Danhelka, J.; Redpath, A. E. C.; Winnik, M. A. Polymer 1983, 24, 319-322.
38. Redpath, A. E. C.; Winnik, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 5604-5607.
39. Winnik, M. A.; Redpath, A. E. C.; Paton, K.; Danhelka, J. Polymer 1984, 25, 91-99.
40. Xu, H.; Martinho, J. M. G.; Winnik, M. A.; Beinert, G. Makrom. Chem. 1989, 190, 1333-1343.
41. Farinha, J. P. S.; Martinho, J. M. G.; Xu, H.; Winnik, M. A.; Quirk, R. P. J. Polym. Sci.: Part B: Polym. Phys. 1994, 32, 1635-1642.
42. Martinho, J. M. G.; Reis e Sousa, A. T.; Winnik, M. A. Macromolecules 1993, 26, 4484-4488.
43. Reis e Sousa, A. T.; Castanheira, E. M. S.; Fedorov, A.; Martinho, J. M. G. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6406-6411.
44. Farinha, J. P. S.; Piçarra, S.; Miesel, K.; Martinho, J. M. G. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10536-10545.
45. Duhamel, J. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 953-960.
46. Cuniberti, C.; Perico, A. Eur. Polym. J. 1980, 16, 887-893.
47. Winnik, M. A.; Egan, L. S.; Tencer, M.; Croucher, M. D. Polymer 1987, 28, 1553-1560.
48. Wang, F. W.; Lowry, R. E. Polymer 1985, 26, 1046-1052.
49. Seixas de Melo, J.; Costa, T.; Miguel, M. da G.; Lindman, B.; Schillen, K. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12605-12621.
50. Seixas de Melo, J.; Costa, T.; Francisco, A.; Maçanita, A. L.; Gago, S.; Gonçalves, I. S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 1370-1385.
51. Picarra, S.; Relogio, P.; Afonso, C. A. M.; Martinho, J. M. G.; Farinha, J. P. S. Macromolecules 2003, 36, 8119-8129.
52. Picarra, S.; Relogio, P.; Afonso, C. A. M.; Martinho, J. M. G.; Farinha, J. P. S. Macromolecules 2004, 37, 1670-1670.
53. Picarra, S.; Duhamel, J.; Fedorov, A.; Martinho, J. M. G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12009-12015.
54. Mathew, H.; Siu, H.; Duhamel, J. Macromolecules 1999, 32, 7100- 7108.
55. Kanagalingam, S.; Ngan, C. F.; Duhamel, J. Macromolecules 2002, 35, 8560-8570.
56. de Gennes, P.-G. Scaling Concepts in Polymer Physics Cornell University Press, Ithaca, 1979.
57. Birks, J. B. Photophysics of Aromatic Molecules. Wiley: New York, 1970; p 301.
58. Kanagalingam, S.; Spartalis, J.; Cao, T.-C.; Duhamel, J. Macromolecules 2002, 35, 8571-8577.
59. Goodpaster, J. V.; Harrison, J. F.; McGuffin, V. L. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10645-10654.
60. Ingratta, M.; Hollinger, J.; Duhamel, J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 9420-9428.
61. Ingratta, M.; Duhamel, J. Macromolecules 2007, 40, 6647-6657.
62. James, D. R.; Demmer, D. R.; Verall, R. E.; Steer, R. P. ReV. Sci. Instrum. 1983, 54, 1121-1130.
63. Siu, H.; Duhamel, J. Macromolecules 2004, 37, 9287-9289.
64. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy 2nd Ed. Kluwer Acad. NY, 1999.
65. Prazeres, T. J. V.; Beingessner, R.; Duhamel, J.; Olesen, K.; Shay, G.; Bassett, D. R. Macromolecules 2001, 34, 7876-7884.
66. Press, W. H.; Flannery, B. P.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T. Numerical Recipes. The Art of Scientific Computing (Fortran Version); Cambridge University Press; Cambridge, 1992.
67. Demas, J. N. Excited-State Lifetime Measurements; Academic Press: New York, 1983.
68. Martinho, J. M. G.; Egan, L. S.; Winnik, M. A. Anal. Chem. 1987, 59, 861-864.
69. Bandrup, J. ; Immergut, E. H. ; Grulke, E. A. Polymer Handbook, 4th ed.; John Wiley & Sons: NY, 1999, p VII 675-683.
70. Duhamel, J.; Kanagalingam, S.; O'Brien, T.; Ingratta, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12810-12822.
71. Ingratta, M.; Duhamel, J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9209-9218.
72. Almgren, M.; Löfroth, J.-E. J. Colloid Interface Sci. 1981, 81, 486- 499.
73. Ingratta, M.; Duhamel, J. accepted in Macromolecules, 2009.
74. Emert, J.; Behrens, C.; Goldenberg, M. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 771-772.
75. Flory, P. J. Principles of Polymer Chemistry Cornell University Press, Ithaca, 1953.
76. Thirumalai, D. J. Phys. I 1995, 5, 1457-1467.
77. Naganathan, A. N.; Muños, V. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 480-481.