-
1
-
-
0003880161
-
-
Garland Publishing, Inc, New York
-
Alberts, B.; Bray, D.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Watson, J. D. Molecular biology of the cell; Garland Publishing, Inc.: New York, 1994.
-
(1994)
Molecular biology of the cell
-
-
Alberts, B.1
Bray, D.2
Lewis, J.3
Raff, M.4
Roberts, K.5
Watson, J.D.6
-
4
-
-
36849148382
-
-
Gilbert, W. Nature 1986, 319, 618-618.
-
(1986)
Nature
, vol.319
, pp. 618-618
-
-
Gilbert, W.1
-
6
-
-
0033102133
-
-
Åqvist, J.; Kolmodin, K.; Florian, J.; Warshel, A. Chem. Biol. 1999, 6, R71-R80.
-
(1999)
Chem. Biol
, vol.6
-
-
Åqvist, J.1
Kolmodin, K.2
Florian, J.3
Warshel, A.4
-
12
-
-
0020477044
-
-
Hassett, A.; Blättler, W.; Knowles, J. R. Biochemistry 1982, 21, 6335-6340.
-
(1982)
Biochemistry
, vol.21
, pp. 6335-6340
-
-
Hassett, A.1
Blättler, W.2
Knowles, J.R.3
-
13
-
-
51249090734
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Florian, J.; Warshel, A. ChemPhysChem 2008, 9, 1767-1773.
-
(2008)
ChemPhysChem
, vol.9
, pp. 1767-1773
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Florian, J.2
Warshel, A.3
-
14
-
-
0030724727
-
-
Mildvan, A. S. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1997, 29, 401- 416.
-
(1997)
Proteins: Struct., Funct., Genet
, vol.29
, pp. 401-416
-
-
Mildvan, A.S.1
-
15
-
-
0026713142
-
-
Langen, R.; Schweins, T.; Warshel, A. Biochemistry 1992, 31, 8691-8696.
-
(1992)
Biochemistry
, vol.31
, pp. 8691-8696
-
-
Langen, R.1
Schweins, T.2
Warshel, A.3
-
16
-
-
0034663856
-
-
Glennon, T. M.; Villa, J.; Warshel, A. Biochemistry 2000, 39, 9641- 9651.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 9641-9651
-
-
Glennon, T.M.1
Villa, J.2
Warshel, A.3
-
18
-
-
47949085748
-
-
Nam, K.; Gao, J. L.; York, D. M. RNA 2008, 14, 1501-1507.
-
(2008)
RNA
, vol.14
, pp. 1501-1507
-
-
Nam, K.1
Gao, J.L.2
York, D.M.3
-
21
-
-
0030664537
-
-
Shimada, T.; Sasaki, N.; Ohkura, R.; Sutoh, K. Biochemistry 1997, 36, 14037-14043.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 14037-14043
-
-
Shimada, T.1
Sasaki, N.2
Ohkura, R.3
Sutoh, K.4
-
22
-
-
0034722943
-
-
Gerratana, B.; Sowa, G. A.; Cleland, W. W. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12615-12621.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc
, vol.122
, pp. 12615-12621
-
-
Gerratana, B.1
Sowa, G.A.2
Cleland, W.W.3
-
23
-
-
33845198350
-
-
Klahn, M.; Rosta, E.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 15310-15323.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc
, vol.128
, pp. 15310-15323
-
-
Klahn, M.1
Rosta, E.2
Warshel, A.3
-
24
-
-
33745699355
-
-
Lopez, X.; Dejaegere, A.; Leclerc, F.; York, D. M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 11525-11539.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 11525-11539
-
-
Lopez, X.1
Dejaegere, A.2
Leclerc, F.3
York, D.M.4
Karplus, M.5
-
25
-
-
41849123553
-
-
Nam, K. H.; Gao, J. L.; York, D. M. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4680-4691.
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc
, vol.130
, pp. 4680-4691
-
-
Nam, K.H.1
Gao, J.L.2
York, D.M.3
-
27
-
-
58149235077
-
-
Yang, Y.; Yu, H.; York, D. M.; Elstner, M.; Cui, Q. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 2067-2084.
-
(2008)
J. Chem. Theory Comput
, vol.4
, pp. 2067-2084
-
-
Yang, Y.1
Yu, H.2
York, D.M.3
Elstner, M.4
Cui, Q.5
-
28
-
-
84986513644
-
-
Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11 (6), 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem
, vol.11
, Issue.6
, pp. 700-733
-
-
Field, M.J.1
Bash, P.A.2
Karplus, M.3
-
32
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4 (2), 187-217.
-
(1983)
J. Comput. Chem
, vol.4
, Issue.2
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
34
-
-
84906388801
-
-
Frisch, M. J, Trucks, G. W, Schlegel, H. B, Scuseria, G. E, Robb, M. A, Cheeseman, J. R, Montgomery, J. A, Jr, Vreven, T, Kudin, K. N, Burant, J. C, Millam, J. M, Iyengar, S. S, Tomasi, J, Barone, V, Mennucci, B, Cossi, M, Scalmani, G, Rega, N, Petersson, G. A, Nakatsuji, H, Hada, M, Ehara, M, Toyota, K, Fukuda, R, Hasegawa, J, Ishida, M, Nakajima, T, Honda, Y, Kitao, O, Nakai, H, Klene, M, Li, X, Knox, J. E, Hratchian, H. P, Cross, J. B, Bakken, V, Adamo, C, Jaramillo, J, Gomperts, R, Stratmann, R. E, Yazyev, O, Austin, A. J, Cammi, R, Pomelli, C, Ochterski, J. W, Ayala, P. Y, Morokuma, K, Voth, G. A, Salvador, P, Dannenberg, J. J, Zakrzewski, V. G, Dapprich, S, Daniels, A. D, Strain, M. C, Farkas, O, Malick, D. K, Rabuck, A. D, Raghavachari, K, Foresman, J. B, Ortiz, J. V, Cui, Q, Baboul, A. G, Clifford, S, Cioslowski, J, Stefanov, B. B, Liu, G, Liashenko, A, Piskorz, P, Komaromi, I, Martin, R. L, Fox, D. J, Keit
-
Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.05; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2003.
-
-
-
-
35
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79 (2), 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys
, vol.79
, Issue.2
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
36
-
-
0035249196
-
-
Im, W.; Bernèche, S.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2001, 114 (7), 2924- 2937.
-
(2001)
J. Chem. Phys
, vol.114
, Issue.7
, pp. 2924-2937
-
-
Im, W.1
Bernèche, S.2
Roux, B.3
-
37
-
-
34548059996
-
-
Schaefer, P.; Riccardi, D.; Cui, Q. J. Chem. Phys. 2005, 123, 014905.
-
(2005)
J. Chem. Phys
, vol.123
, pp. 014905
-
-
Schaefer, P.1
Riccardi, D.2
Cui, Q.3
-
38
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23 (3), 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys
, vol.23
, Issue.3
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.-P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
39
-
-
0003998388
-
-
85th ed, Lide, D. R, Ed, CRC Press: Boca Raton, FL
-
CRC Handbook Chemistry and Physics, 85th ed.; Lide, D. R., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 2005.
-
(2005)
CRC Handbook Chemistry and Physics
-
-
-
41
-
-
2642585833
-
-
Riccardi, D.; Li, G.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6467- 6478.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 6467-6478
-
-
Riccardi, D.1
Li, G.2
Cui, Q.3
-
44
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
-
(1988)
Phys. Rev. B
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
46
-
-
26844534384
-
-
Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650-654.
-
(1980)
J. Chem. Phys
, vol.72
, pp. 650-654
-
-
Krishnan, R.1
Binkley, J.S.2
Seeger, R.3
Pople, J.A.4
-
47
-
-
36549091139
-
-
Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265-3269.
-
(1984)
J. Chem. Phys
, vol.80
, pp. 3265-3269
-
-
Frisch, M.J.1
Pople, J.A.2
Binkley, J.S.3
-
48
-
-
84986468715
-
-
Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; v. R. Schleyer, P. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294-301.
-
Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; v. R. Schleyer, P. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294-301.
-
-
-
-
52
-
-
84962359221
-
-
Cossi, M.; Barone, V.; Cammi, R.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 255, 327-335.
-
(1996)
Chem. Phys. Lett
, vol.255
, pp. 327-335
-
-
Cossi, M.1
Barone, V.2
Cammi, R.3
Tomasi, J.4
-
53
-
-
84961981991
-
-
Barone, V.; Cossi, M.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3210- 3221.
-
(1997)
J. Chem. Phys
, vol.107
, pp. 3210-3221
-
-
Barone, V.1
Cossi, M.2
Tomasi, J.3
-
54
-
-
36449008977
-
-
Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4192-4200.
-
(1995)
J. Chem. Phys
, vol.103
, pp. 4192-4200
-
-
Curtiss, L.A.1
Raghavachari, K.2
Pople, J.A.3
-
55
-
-
0012154673
-
-
Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 7764-7776.
-
(1998)
J. Chem. Phys
, vol.109
, pp. 7764-7776
-
-
Curtiss, L.A.1
Raghavachari, K.2
Redfern, P.C.3
Rassolov, V.4
Pople, J.A.5
-
57
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13 (8), 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem
, vol.13
, Issue.8
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
58
-
-
33646356998
-
-
Riccardi, D.; Schaefer, P.; Yang, Y.; Yu, H.; Ghosh, N.; Prat-Resina, X.; König, P.; Xu, D.; Guo, H.; Elstner, M.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (13), 6458-6469.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, Issue.13
, pp. 6458-6469
-
-
Riccardi, D.1
Schaefer, P.2
Yang, Y.3
Yu, H.4
Ghosh, N.5
Prat-Resina, X.6
König, P.7
Xu, D.8
Guo, H.9
Elstner, M.10
Cui, Q.11
-
59
-
-
39749169756
-
-
Riccardi, D.; Koenig, P.; Guo, H.; Cui, Q. Biochemistry 2008, 47, 2369-2378.
-
(2008)
Biochemistry
, vol.47
, pp. 2369-2378
-
-
Riccardi, D.1
Koenig, P.2
Guo, H.3
Cui, Q.4
-
60
-
-
3442895931
-
-
Lopez, C. S.; Faza, A. N.; Gregersen, B. A.; Lopez, X.; de Lera, A. R.; York, D. M. ChemPhysChem 2004, 5, 1045-1049.
-
(2004)
ChemPhysChem
, vol.5
, pp. 1045-1049
-
-
Lopez, C.S.1
Faza, A.N.2
Gregersen, B.A.3
Lopez, X.4
de Lera, A.R.5
York, D.M.6
-
61
-
-
15944404979
-
-
Lopez, C. S.; Faza, O. N.; de Lera, A. R.; York, D. M. Chem .sEur. J. 2005, 11, 2081-2093.
-
Lopez, C. S.; Faza, O. N.; de Lera, A. R.; York, D. M. Chem .sEur. J. 2005, 11, 2081-2093.
-
-
-
-
62
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. 1996, 14, 33-38.
-
(1996)
J. Mol. Graph
, vol.14
, pp. 33-38
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
|