Discovery, identification, and characterization of candidate pharmacodynamic markers of methionine aminopeptidase-2 inhibition

Journal of Proteome Research

Volumn 7, Issue 11, 2008, Pages 4807-4820

  Warder, Scott E ^a   Tucker, Lora A ^a   McLoughlin, Shaun M ^a   Strelitzer, Tamara J ^a   Meuth, Joseph L ^a   Zhang, Qian ^a   Sheppard, George S ^a   Richardson, Paul L ^a   Lesniewski, Rick ^a   Davidsen, Steven K ^a   Bell, Randy L ^a   Rogers, John C ^a,b   Wang, Jieyi ^a  

^a ABBOTT LABORATORIES   (United States)

^b Thermo Fisher Scientific   (United States)

Author keywords

Eukaryotic elongation factor 2; FT ICR MS; MALDI MS; Methionine aminopeptidase 2; Pharmacodynamic; Thioredoxin

Indexed keywords

CYCLOPHILIN A; ELONGATION FACTOR 2; EUKARYOTIC ELONGATION FACTOR 2; GLYCERALDEHYDE 3 PHOSPHATE DEHYDROGENASE; METHIONYL AMINOPEPTIDASE; METHIONYL AMINOPEPTIDASE 1; METHIONYL AMINOPEPTIDASE 2; PROTEIN HYDROLYSATE; PROTEOME; SH3 BINDING GLUTAMIC ACID RICH LIKE PROTEIN; THIOREDOXIN 1; TRYPSIN; UNCLASSIFIED DRUG; AMINOPEPTIDASE; METALLOPROTEINASE; PROTEINASE INHIBITOR; TUMOR MARKER;

AMINO TERMINAL SEQUENCE; ANIMAL CELL; ARTICLE; CELL PROLIFERATION; CONTROLLED STUDY; ENZYME ANALYSIS; ENZYME DEGRADATION; ENZYME INHIBITION; ENZYME SUBSTRATE; HUMAN; HUMAN CELL; ION CYCLOTRON RESONANCE MASS SPECTROMETRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MOUSE; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN CONFORMATION; SURFACE ENHANCED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; TANDEM MASS SPECTROMETRY; ANIMAL; CELL STRAIN K 562; CHEMISTRY; CLASSIFICATION; DRUG ANTAGONISM; DRUG EFFECT; ERYTHROLEUKEMIA; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR WEIGHT; PATHOLOGY; PROTEOMICS; TIME; TUMOR CELL LINE;

EUKARYOTA;

AMINOPEPTIDASES; ANIMALS; CELL LINE, TUMOR; CELL PROLIFERATION; HUMANS; K562 CELLS; LEUKEMIA, ERYTHROBLASTIC, ACUTE; METALLOENDOPEPTIDASES; MICE; MOLECULAR WEIGHT; PROTEASE INHIBITORS; PROTEOMICS; TIME FACTORS; TUMOR MARKERS, BIOLOGICAL;

EID: 58149383875     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr800388p     Document Type: Article

References (64)

1. Pieper, R.; Gatlin, C. L.; Makusky, A. J.; Russo, P. S.; Schatz, C. R.; Miller, S. S.; Su, Q.; McGrath, A. M.; Estock, M. A.; Parmar, P. P.; Zhao, M.; Huang, S. T.; Zhou, J.; Wang, F.; Esquer-Blasco, R.; Anderson, N. L.; Taylor, J.; Steiner, S. Proteomics 2003, 3 (7), 1345-64.
2. Petricoin, E. F., III; Ornstein, D. K.; Paweletz, C. P.; Ardekani, A.; Hackett, P. S.; Hitt, B. A.; Velassco, A.; Trucco, C.; Wiegand, L.; Wood, K.; Simone, C. B.; Levine, P. J.; Linehan, W. M.; Emmert- Buck, M. R.; Steinberg, S. M.; Kohn, E. C.; Liotta, L. A. J. Natl. Cancer Inst. 2002, 94 (20), 1576-8.
3. Fung, E. T.; Yip, T. T.; Lomas, L.; Wang, Z.; Yip, C.; Meng, X. Y.; Lin, S.; Zhang, F.; Zhang, Z.; Chan, D. W.; Weinberger, S. R. Int.J. Cancer 2005, 115 (5), 783-9.
4. Diamandis, E. P. Clin. Chem. 2003, 49 (8), 1272-5.
5. Diamandis, E. P. Cancer Res. 2006, 66 (11), 5540-1.
6. Akashi, T.; Nishimura, Y.; Wakatabe, R.; Shiwa, M.; Yamori, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2007, 352 (2), 514-21.
7. Melle, C.; Ernst, G.; Scheibner, O.; Kaufrnann, R.; Schimmel, B.; Bleul, A.; Settmacher, U.; Hommann, M.; Claussen, U.; von Eggeling, F. J. Proteome Res. 2007, 6 (1), 306-15.
8. Dummitt, B.; Micka, W. S.; Chang, Y. H. J. Cell Biochem. 2003, 89 (5), 964-74.
9. Barwick, R. C.; Jones, R. T.; Head, C. G.; Shih, M. F.; Prchal, J. T.; Shih, D. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA 1985, 82 (14), 4602-5.
10. Rowe, D. C.; McGettrick, A. F.; Latz, E.; Monks, B. G.; Gay, N. J.; Yamamoto, M.; Akira, S.; O'Neill, L. A.; Fitzgerald, K. A.; Golenbock, D. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 2006, 103 (16), 6299-304.
11. Behnia, R.; Panic, B.; Whyte, J. R.; Munro, S. Nat. Cell Biol. 2004, 6 (5), 405-13.
12. Varshavsky, A. Genes Cells 1997, 2 (1), 13-28.
13. Frottin, F.; Martinez, A.; Peynot, P.; Mitra, S.; Holz, R. C.; Giglione, C.; Meinnel, T. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5 (12), 2336-49.
14. Griffith, E. C.; Su, Z.; Niwayama, S.; Ramsay, C. A.; Chang, Y. H.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 1998, 95 (26), 15183-8.
15. Griffith, E. C.; Su, Z.; Turk, B. E.; Chen, S.; Chang, Y. H.; Wu, Z.; Biemann, K.; Liu, J. O. Chem. Biol. 1997, 4 (6), 461-71.
16. Wang, J.; Sheppard, G. S.; Lou, P.; Kawai, M.; BaMaung, N.; Erickson, S. A.; Tucker-Garcia, L.; Park, C.; Bouska, J.; Wang, Y. C.; Frost, D.; Tapang, P.; Albert, D. H.; Morgan, S. J.; Morowitz, M.; Shusterman, S.; Maris, J. M.; Lesniewski, R.; Henkin, J. Cancer Res. 2003, 63 (22), 7861-9.
17. Milkowski, D. W. RA. In Antiangiogenic Agents in Cancer Therapy, Humana: Totowa, NJ, 1998; p 385-398.
18. Kudelka, A. P.; Levy, T.; Verschraegen, C. F.; Edwards, C. L.; Piamsomboon, S.; Termrungruanglert, W.; Freedman, R. S.; Kaplan, A. L.; Kieback, D. G.; Meyers, C. A.; Jaeckle, K. A.; Loyer, E.; Steger, M.; Mante, R.; Mavligit, G.; Killian, A.; Tang, R. A.; Gutterman, J. U.; Kavanagh, J. J. Clin. Cancer Res. 1997, 3 (9), 1501-5.
19. Herbst, R. S.; Madden, T. L.; Tran, H. T.; Blumenschein, G. R., Jr.; Meyers, C. A.; Seabrooke, L. F.; Khuri, F. R.; Puduvalli, V. K.; Allgood, V.; Fritsche, H. A., Jr.; Hinton, L.; Newman, R. A.; Crane, E. A.; Fossella, F. V.; Dordal, M.; Goodin, T.; Hong, W. K. J. Clin. Oncol. 2002, 20 (22), 4440-7.
20. Sheppard, G. S.; Wang, J.; Kawai, M.; Fidanze, S. D.; Bamaung, N. Y.; Erickson, S. A.; Barnes, D. M.; Tedrow, J. S.; Kolaczkowski, L.; Vasudevan, A.; Park, D. C.; Wang, G. T.; Sanders, W. J.; Mantei, R. A.; Palazzo, F.; Tucker-Garcia, L.; Lou, P.; Zhang, Q.; Park, C. H.; Kim, K. H.; Petros, A.; Olejniczak, E.; Nettesheim, D.; Hajduk, P.; Henkin, J.; Lesniewski, R.; Davidsen, S. K.; Bell, R. L. J. Med. Chem. 2006, 49 (13), 3832-49.
21. Towbin, H.; Bair, K. W.; DeCaprio, J. A.; Eck, M. J.; Kim, S.; Kinder, F. R.; Morollo, A.; Mueller, D. R.; Schindler, P.; Song, H. K.; van Oostrum, J.; Versace, R. W.; Voshol, H.; Wood, J.; Zabludoff, S.; Phillips, P. E. J. Biol. Chem. 2003, 278 (52), 52964-71.
22. Hu, X.; Addlagatta, A.; Lu, J.; Matthews, B. W.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 2006, 103 (48), 18148-53.
23. McDonald, L.; Robertson, D. H.; Hurst, J. L.; Beynon, R. J. Nat. Methods 2005, 2 (12), 955-7.
24. (24)Timmer, J. C.; Enoksson, M.; Wildfang, E.; Zhu, W.; Igarashi, Y.; Denault, J. B.; Ma, Y.; Dummitt, B.; Chang, Y. H.; Mast, A. E.; Eroshkin, A.; Smith, J. W.; Tao, W. A.; Salvesen, G. S. Biochem. J. 2007, 407 (1), 41-8.
25. Gevaert, K.; Impens, F.; Van Damme, P.; Ghesquiere, B.; Hanoulle, X.; Vandekerckhove, J. FEBS J. 2007, 274 (24), 6277-89.
26. Wang, J.; Tucker, L. A.; Stavropoulos, J.; Zhang, Q.; Wang, Y. C.; Bukofzer, G.; Niquette, A.; Meulbroek, J. A.; Barnes, D. M.; Shen, J.; Bouska, J.; Donawho, C.; Sheppard, G. S.; Bell, R. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 2008, 105 (6), 1838-43.
27. Link, A. J.; Eng, J.; Schieltz, D. M.; Carmack, E.; Mize, G. J.; Morris, D. R.; Garvik, B. M.; Yates, J. R., III Nat. Biotechnol. 1999, 17 (7), 676-82.
28. Wolters, D. A.; Washburn, M. P.; Yates, J. R., III Anal. Chem. 2001, 73 (23), 5683-90.
29. King, D. S.; Fields, C. G.; Fields, G. B. Int. J. Pept. Protein Res. 1990, 36 (3), 255-66.
30. Wang, J.; Sheppard, G. S.; Lou, P.; Kawai, M.; Park, C.; Egan, D. A.; Schneider, A.; Bouska, J.; Lesniewski, R.; Henkin, J. Biochemistry 2003, 42 (17), 5035-42.
31. Ingber, D.; Fujita, T.; Kishimoto, S.; Sudo, K.; Kanamaru, T.; Brem, H.; Folkman, J. Nature 1990, 348 (6301), 555-7.
32. Liu, S.; Widom, J.; Kemp, C. W.; Crews, C. M.; Clardy, J. Science 1998, 282 (5392), 1324-7.
33. Turk, B. E.; Griffith, E. C.; Wolf, S.; Biemann, K.; Chang, Y. H.; Liu, J. O. Chem. Biol. 1999, 6 (11), 823-33.
34. Polevoda, B.; Sherman, F. J. Biol. Chem. 2000, 275 (47), 36479-82.
35. Zhang, Y.; Griffith, E. C.; Sage, J.; Jacks, T.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA 2000, 97 (12), 6427-32.
36. Cui, Y.; Mirkia, K.; Florence Fu, Y. H.; Zhu, L.; Yokoyama, K. K.; Chiu, R. J. Cell Biochem. 2002, 86 (4), 630-41.
37. Abe, J.; Zhou, W.; Takuwa, N.; Taguchi, J.; Kurokawa, K.; Kumada, M.; Takuwa, Y. Cancer Res. 1994, 54 (13), 3407-12.
38. Yoshida, T.; Kaneko, Y.; Tsukamoto, A.; Han, K.; Ichinose, M.; Kimura, S. Cancer Res. 1998, 58 (16), 3751-6.
39. Ueno, M.; Masutani, H.; Arai, R. J.; Yamauchi, A.; Hirota, K.; Sakai, T.; Inamoto, T.; Yamaoka, Y.; Yodoi, J.; Nikaido, T. J. Biol. Chem. 1999, 274 (50), 35809-15.
40. Yin, X.; Fontoura, B. M.; Morimoto, T.; Carroll, R. B. J. Cell Physiol. 2003, 196 (3), 474-82.
41. Berggren, M.; Gallegos, A.; Gasdaska, J. R.; Gasdaska, P. Y.; Warneke, J.; Powis, G. Anticancer Res. 1996, 16 (6B), 3459-66.
42. Welsh, S. J.; Bellamy, W. T.; Briehl, M. M.; Powis, G. Cancer Res. 2002, 62 (17), 5089-95.
43. Kakisaka, Y; Nakashima, T.; Sumida, Y.; Yoh, T.; Nakamura, H.; Yodoi, J.; Senmaru, H. Horm. Metab. Res. 2002, 34 (3), 160-4.
44. Nakamura, H.; Masutani, H.; Yodoi, J. Semin. Cancer Biol. 2006, 16 (6), 444-51.
45. Lemarechal, H.; Anract, P.; Beaudeux, J. L.; Bonnefont-Rousselot, D.; Ekindjian, O.; Borderie, D. Clin. Sci. 2007, 113, 149-55.
46. Bernier, S. G.; Lazarus, D. D.; Clark, E.; Doyle, B.; Labenski, M. T.; Thompson, C. D.; Westlin, W. F.; Hannig, G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101 (29), 10768-73.
47. Chang, T. J.; Juan, C. C.; Yin, P. H.; Chi, C. W.; Tsay, H. J. Oncol. Rep. 1998, 5 (2), 469-71.
48. Cuezva, J. M.; Chen, G.; Alonso, A. M.; Isidoro, A.; Misek, D. E.; Hanash, S. M.; Beer, D. G. Carcinogenesis 2004, 25 (7), 1157-63.
49. Choi, K. J.; Piao, Y. J.; Lim, M. J.; Kim, J. H.; Ha, J.; Choe, W.; Kim, S. S. Cancer Res. 2007, 67 (8), 3654-62.
50. Denko, N.; Schindler, C.; Koong, A.; Laderoute, K.; Green, C.; Giaccia, A. Clin. Cancer Res. 2000, 6 (2), 480-7.
51. Dastoor, Z.; Dreyer, J. L. J. Cell Set. 2001, 114 (Pt 9), 1643-53.
52. Kontou, M.; Will, R. D.; Adelfalk, C.; Wittig, R.; Poustka, A.; Hirsch-Kauffmann, M.; Schweiger, M. Oncogene 2004, 23 (12), 2146-52.
53. Liu, L.; Cash, T. P.; Jones, R. G.; Keith, B.; Thompson, C. B.; Simon, M. C. Mol. Cell 2006, 21 (4), 521-31.
54. Connolly, E.; Braunstein, S.; Formenti, S.; Schneider, R. J. Mol. Cell. Biol. 2006, 26 (10), 3955-65.
55. Arora, S.; Yang, J. M.; Kinzy, T. G.; Utsumi, R.; Okamoto, T.; Kitayama, T.; Ortiz, P. A.; Hait, W. N. Cancer Res. 2003, 63 (20), 6894-9.
56. Wu, H.; Yang, J. M.; Jin, S.; Zhang, H.; Hait, W. N. Cancer Res. 2006, 66 (6), 3015-23.
57. Majid, S. M.; Liss, A. S.; You, M.; Bose, H. R. Oncogene 2006, 25 (5), 756-68.
58. Hrdlickova, R.; Nehyba, J.; Bose, H. R., Jr. Mol. Cell. Biol. 2001, 21 (19), 6369-86.
59. Yin, L.; Xiang, Y.; Zhu, D. Y.; Yan, N.; Huang, R. H.; Zhang, Y.; Wang, D. C. Proteins 2005, 61 (1), 213-6.
60. Ji, Q. C.; Rodila, R.; Gage, E. M.; El-Shourbagy, T. A. Anal. Chem. 2003, 75 (24), 7008-14.
61. Huang, C. M.; Ananthaswamy, H. N.; Barnes, S.; Ma, Y.; Kawai, M.; Elmets, C. A. Proteomics 2006, 6 (22), 6107-16.
62. Miyamoto, S.; Sakamoto, T.; Soejima, H.; Shimomura, H.; Kajiwara, I.; Kojima, S.; Hokamaki, J.; Sugjyama, S.; Yoshimura, M.; Ozaki, Y.; Nakamura, H.; Yodoi, J.; Ogawa, H. Am. Heart J. 2003, 146 (3), 465-71.
63. Pekkari, K.; Gurunath, R.; Arner, E. S.; Holmgren, A. J. Biol. Chem. 2000, 275 (48), 37474-80.
64. Kiernan, U. A.; Nedelkov, D.; Niederkofler, E. E.; Tubbs, K. A.; Nelson, R. W. Methods Mol. Biol. 2006, 328, 141-50.