Infrared multiple photon dissociation spectra of proton- and sodium ion-bound glycine dimers in the N-H and O-H stretching region

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 112, Issue 41, 2008, Pages 10220-10225

  Atkins, Chad G ^a   Rajabi, Khadijeh ^a   Gillis, Elizabeth A L ^a   Fridgen, Travis D ^a  

^a MEMORIAL UNIVERSITY OF NEWFOUNDLAND   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISSOCIATION; ELECTRONIC STRUCTURE; HYDROGEN; IONS; METAL IONS; OLIGOMERS; PHOTONS; PROTONS;

CARBOXYL GROUPS; ENERGY STRUCTURES; EXPERIMENTAL SPECTRUMS; GLYCINE MOLECULES; HOMODIMERS; INFRARED MULTIPLE PHOTON DISSOCIATIONS; LOWEST ENERGY STRUCTURES; PROTONATED; SODIUM IONS; STRETCHING MODES; STRETCHING REGIONS; STRUCTURE CALCULATIONS;

INFRARED SPECTROSCOPY;

GLYCINE; ION; SODIUM;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; DIMERIZATION; HYDROGEN BOND; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY; METHODOLOGY; OSMOLARITY; PHOTON;

COMPUTER SIMULATION; DIMERIZATION; GLYCINE; HYDROGEN BONDING; IONS; MODELS, CHEMICAL; OSMOLAR CONCENTRATION; PHOTONS; SODIUM; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED;

EID: 55149101287     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp805514b     Document Type: Article

References (60)

1. Levy, H. A.; Corey, R. B. J. Am. Chem. Soc. 1941, 63, 2095.
2. (a) Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Rosado, M. T. S.; Duarte, M. L. T. S.; Fausto, R.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1041.
3. (b) Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4623.
4. (c) Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Rosado, M. T. S.; Duarte, M. L. T. S.; Fausto, R.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1041.
5. (d) Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 4404.
6. (a) Blanco, S.; Lesarri, A.; Lopez, J. C.; Alonso, J. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11675.
7. (b) Lesani, A.; Cocinero, E. J.; Lopez, J. C.; Alonso, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 120, 6191.
8. (a) Godfrey, P. D.; Brown, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2019.
9. (b) Godfrey, P. D.; Firth, S.; Hatherley, L. D.; Brown, R. D.; Pierlot, A. P. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9687.
10. Csaszar, A. G.;: Perczel, A. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999, 71, 243.
11. Ding, Y.; Krogh-Jespersen, K. Chem. Phvs. Lett. 1992, 199, 261.
12. Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8159.
13. Ahn, D.; Park, S.; Jeon, I.; Lee, M.; Kim, N.; Man, Y.; Lee, S. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 14109.
14. Bachrach, S. M. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 3722.
15. Xu, S.; Nilles, J. M.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 10696.
16. Alberty, R. A. Biophys. Chem. 2007, 125, 328.
17. Wu, R.; McMahon, T. B. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 3722.
18. Raspopov, S. A.; McMahon, T. B. J. Mass Spectrom. 2005, 40, 1536.
19. Lioe, H.; O'Hair, R. A. J.; Gronert, S.; Austin, A.; Reid, G. E. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 267, 220.
20. Jones, C. M.; Bernier, M.; Carson, E.; Colyer, K. E.; Metz, R.; Pawlow, A.; Wischow, E. D.; Webb, I.; Andriole, E. J.; Poustma, J. C. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 267, 54.
21. Wyttenbach, T.; Witt, M.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3548.
22. Shoeib, T.; Siu, K. W. M.; Hopkinson, A. C. J. Phvs. Chem. A 2002, 106, 6121.
23. Wang, P.; Ohanessian, G.; Wesdemiotis, C. Int. J. Mass Spectrom. 2008, 269, 34.
24. Marino, T.; Russo, N.; Toscano, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 2588.
25. Zhao, J.; Siu, K. W. M.; Hopkinson, A. C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 281.
26. Armentrout. P. B.; Rodgers, M. T.; Oomens, J.; Steill, J. D. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 2248.
27. Bush, M. F.; O'Brien, J. T.; Prell, J. S.; Saykally, R. J.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1612.
28. Dunbar, R. C.; Polfer, N. C.; Oomens, J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14562.
29. Forbes, M. W.; Bush, M. F.; Polfer, N. C.; Oomens, J.; Dunbar, R. C.; Williams, E. R.; Jockusch, R. A. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 11759.
30. Jockusch, R. A.; Price, W. D.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9266.
31. Jockusch, R. A.; Lemoff, A. S.; Williams, E. R. J. Phvs. Chem. A 2001, 105, 10929.
32. Lemoff, A. S.; Williams, E. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004, 15, 1014.
33. Bush, M. F.; Prell, J. S.; Saykally, R. J.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 13544.
34. Rajabi, K.; Fridgen, T. D. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 23.
35. Wu, R.; McMahon, T. B. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4864.
36. Wang, P.; Wesdemiotis, C.; Kapota, C.; Ohanessian, G. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 541.
37. Moision, R. M.; Armentrout, P. B. J.. Phys. Chem. A 2002, 106, 10350.
38. Kish, M. M.; Wesdemiotis, C.; Ohanessian, G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 3086.
39. Cerda, B. A.; Hoyau, S.; Ohanessian, G.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2437.
40. Dunbar, R. C. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 8067.
41. Kapota, C.; Lemaire, J.; Maitre, P.; Ohanessian, G. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1836.
42. Balaj, O.-P.; Kapota, C.; Lemaire, J.; Ohanessian, G. Int. J. Mass Spectrom. 2008, 269, 196.
43. Bakker, J. M.; Besson, T.; Lemaire, J.; Scuderi, D.; Maitre, P. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 13415.
44. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Ilyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, eevision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
45. Andersson, M. P.; Uvdal, P. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2937.
46. Scott, A. P.; Radom, L. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16502.
47. Oomens, J.; Sartakov, B. G.; Meijer, G.; von Helden, G. Int. J. Mass Spectrom. 2006, 254, 1.
48. Oh, H.; Lin, C.; Hwang, H. Y.; Zhai, H.; Breuker, K.; Zabrouskov, V.; Carpenter, B. K.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4076.
49. Jensen, F. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9533.
50. Price, W. D.; Schnier, P. D.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 664.
51. Burt, M. B.; Fridgen, T. D. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10738.
52. Fridgen, T. D.; MacAleese, L.; Maitre, P.; McMahon, T. B.; Boissel, P.; Lemaire, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2747.
53. Fridgen, T. D.; MacAleese, L.; McMahon, T. B.; Lemaire, J.; Maitre, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 955.
54. (a) Chiavassa, T.; Roubin, P.; Pizzala, L.; Verlaque, P.; Allouche, A.; Marinelli, F. J. Phys. Chem. 1992, 96, 10659.
55. (b) Chiavassa, T.; Verlaque, P.; Pizzala, L.; Roubin, P. Spectrochim. Acta 1994, 50A, 343.
56. Matanovic, I.; Doslic, N. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 4185.
57. Tayyari, S. F.; Zeegers,-Huyskens, Th.; Wood, J. L. Spectrochim. Acta 1979, 35A, 1289.
58. Jezierska, A.; Panek, J. J. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 375.
59. Bludsky, O.; Chocholousova, J.; Vacek, J.; Huisken, F.; Hobza, P. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4629.
60. Hoyau, S.; Ohanessian, G. Chem. Eur. J. 1998, 4, 1561.