The gas-phase structure of alanine

Journal of the American Chemical Society

Volumn 126, Issue 37, 2004, Pages 11675-11683

  Blanco, Susana ^a   Lesarri, Alberto ^a   López, Juan C ^a   Alonso, José L ^a  

^a UNIVERSITY OF VALLADOLID   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CONFORMATIONS; FOURIER TRANSFORM INFRARED SPECTROSCOPY; HYDROGEN BONDS; LASER ABLATION; OXYGEN;

ALANINE; CIS CONFIGURATIONS; GAS PHASE STRUCTURE; QUADROPOLE COUPLING;

STEREOCHEMISTRY;

ALANINE;

AMINO ACID ANALYSIS; ARTICLE; CALCULATION; CHEMICAL STRUCTURE; CONFORMATION; FOURIER ANALYSIS; GAS; HYDROGEN BOND; LASER SURGERY; STRUCTURE ANALYSIS; THEORY;

ALANINE; FOURIER ANALYSIS; GASES; HYDROGEN BONDING; MICROWAVES; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; SPECTRUM ANALYSIS; THERMODYNAMICS;

EID: 4544299868     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja048317c     Document Type: Article

References (75)

1. (a) Creighton, T. E. Protein Structure and Molecular Properties; Freeman: New York, 1993.
2. (b) Branden, C.; Tooze, J. Introduction to Protein Structure; Garland: New York, 1991.
3. (b) Engel, M. H.; Macko, S. A. Nature 1997, 389, 265.
4. (b) Snyder, L. E. Origins Life Evol. Biosphere 1997, 27, 115-133.
5. (a) Levy, D. H. Anna. Rev. Phys. Chem. 1980, 31, 197.
6. (b) Levy, D. H. Science 1981, 214, 263-269.
7. (c) T. S. Zwier, J. Phys. Chem. A 2001, 105, 8827.
8. (d) Robertson, E. G.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1.
9. Lesarri, A.; Mata, S.; Cocinero, E. J.; Blanco, S.; López, J. C.; Alonso, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 4673.
10. Lesarri, A.; Cocinero, E. J.; López, J. C.; Alonso, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 116, 615.
11. (a) Kuan, Y.-J.; Charnley, S. B.; Huang, H.-C; Tseng, W.-L.; Kisiel, Z. Astrophys. J. 2003, 593, 848-867.
12. (b) Hollis, J. M.; Pedelty, J. A.; Snyder, L. E.; Jewell, P. R.; Lovas, F. J.; Palmer, P.; Liu, S.-Y. Astrophys. J. 2003, 588, 353-359.
13. (a) Brown, R. D.; Godfrey, P. D.; Storey, J. W. V.; Bassez, M. P. J. Chem. Soc., Chem Commun. 1978, 547.
14. (b) Suenram, R. D.; Lovas, F. J. J. Mol. Spectrosc. 1978, 72, 372.
15. (c) Suenram, R. D.; Lovas, F. J. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7180.
16. (d) Lovas, F. J.; Kawashima, Y.; Grabow, J.-U.; Suenram, R. D.; Fraser, G. T.; Hirota, E. Astrophys. J. 1995, 455, L201.
17. (e) Godfrey, P. D.; Brown, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2019.
18. (f) McGlone, S. J.; Elmes, P. S.; Brown, R. D.; Godfrey, P. D. J. Mol. Struct. 1999, 485, 225.
19. Godfrey, P. D.; Firth, S.; Hatherley, L. D.; Brown, R. D.; Pierlot, A. P. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9687.
20. (a) Laser Ablation of Molecular Substrates special issue. Georgiou, S., Hillenkamp, F., Eds.; Chem. Rev. 2003, 103 (2), 317-644.
21. (b) Laser Ablation and Desorption. In Experimental Methods in the Physical Sciences; Miller, J. C., Haglund, R. F., Eds.; Academic Press: San Diego. CA, 1998; Vol. 30.
22. (a) Cable, J. R.; Tuberger, M. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 6198.
23. (b) Cable, J. R.; Tuberger, M. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 7349.
24. (c) Cable, J. R.; Tuberger, M. J.; Levy, D. H. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1988, 86, 143.
25. (a) Nir, E.; Kleinermanns, K.; de Vries, M. S. Nature 2000, 408, 949.
26. (b) Cohen, R.; Brauer, B.; Nir, E.; Grace, L.; De Vries, M. S. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6351.
27. (c) Snoek, L. C.; Robertson, E. G.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Chem. Phys. Lett. 2000, 321, 49.
28. (d) Piuzzi, F.; Dimicoli, L.; Mons, M.; Tardivel, B.; Zhao, Q. Chem. Phys. Lett. 2000, 320, 282.
29. (e) Snoek, L. C.; Kroener, R. T.; Hockridge, M. R.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1819.
30. (f) Grace, L. I.; Cohen, R.; Dunn, T. M.; Lubman, D. M.; de Vries, M. S. J. Mol. Spectrosc. 2002, 215, 204.
31. (g) Mons, M.; Dimicoli, I.; Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Elhanine, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 5088.
32. (h) Weinkauf, R.; Schermann, J.-P.; de Vries, M. S.; Kleinermans, K. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 309.
33. Lesarri, A.; Mata, S.; López, J. C.; Alonso, J. L. Rev. Sci. Instrum. 2003, 74, 4799.
34. Antolínez, S.; Lesarri, A.; Mata, S.; Blanco, S.; López, J. C.; Alonso, J. L. J. Mol. Struct. 2002, 612, 125.
35. Lesarri, A.; Mata, S.; Blanco, S.; López, J. C.; Alonso, J. L. J. Chem. Phys. 2004, 120, 6191.
36. (a) Vishveshwara, S.; Pople, J. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 2422.
37. (b) Sellers, H. L.; Schäfer, L. J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 7728.
38. (c) Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7917.
39. (d) Ramek, M.; Cheng, V. K. W.; Frey, R. F.; Newton, S. Q.; Schäfer, L. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1991, 235, 1.
40. (e) Császá, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9568.
41. (f) Hu, C.-H.; Shen, M.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2923.
42. (g) Barone, V.; Adamo, C.; Lelj, F. J. Chem. Phys. 1995, 102, 364.
43. (h) Császá, A. G. J. Mol. Struct. 1995, 346, 141.
44. (i) Sirois, S.; Proynov, E. I.; Nguyen, D. T.; Salahub, D. R. J. Chem. Phys. 1995, 102, 364.
45. (j) Stepanian, S. G.; Reva, I. D.; Radchenko, E. D.; Rosado, M. T. S.; Duarte, M. L. T. S.; Fausto, R.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1998, 702, 1041.
46. (k) Bludský, O.; Chocholoušová, J.; Vacek, J.; Huisken, F.; Hobza, P. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4629.
47. (a) Donohue, J. J. Am. Chem. Soc. 1950, 72, 949.
48. (b) Dunitz, J. D.; Ryan, R. R. Acta Crystallogr. 1966, 21, 617.
49. (c) Simpson, H. J.; Marsh, R. E. Acta Crystallogr. 1966, 20, 550.
50. (d) Lehmann, M. S.; Koetzle, T. F.; Hamilton, W. C. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 2657.
51. Godfrey, P. D.; Brown, R. D.; Rodgers, F. M. J. Mol. Struct. 1996, 376, 65.
52. Csaszar, A. G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3541-3551.
53. López, J. C.; de Luis, A.; Blanco, S.; Lesarri, A.; Alonso, J. L. J. Mol. Struct. 2002, 612, 287.
54. (a) Iijima, K.; Beagley, B. J. Mol. Struct. 1991, 248, 133.
55. (b) Iijima, K.; Nakano, M. J. Mol. Struct. 1999, 485-486, 255.
56. Ruoff, R. S.; Klots, T. D.; Emilson, T.; Gutowski, H. S. J. Chem. Phys. 1990, 93, 3142.
57. (a) Antolínez, S.; López, J. C.; Alonso, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 1772.
58. (b) Antolínez, S.; Lopez, J. C.; Alonso, J. L. Chem. Phys. Chem. 2001, 2, 114.
59. (c) Sanz, M. E; Lesarri, A.; López, J. C.; Alonso, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 935.
60. (d) Sanz, M. E.; López, J. C.; Alonso, J. L. Chem.-Eur. J. 2002, 8, 4265.
61. (a) Florio, G. M.; Christie, R. A.; Jordan, K. D.; Zwier, T. S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10236.
62. (b) Godfrey, P. D.; Brown, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10724.
63. (a) Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision A.7; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
64. (b) Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.04; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
65. Cremer, D.; Krüger, M. J. Phys. Chem. 1992, 92, 3239.
66. Pickett, H. M. J. Mol. Spectrosc. 1991, 148, 371.
67. Watson, J. K. G. In Vibrational Spectra and Structure; Durig, J. R., Ed.; Elsevier: Amsterdam, 1977; Vol. 6. pp 1-89.
68. Gordy, W.; Cook, R. L. Microwave Molecular Spectra, Wiley: New York, 1984.
69. Kraitchman, J. Am. J. Phys. 1953, 21, 17.
70. Van Eijck, B. P. J. Mol. Spectrosc. 1982, 91, 348.
71. Schwendeman, R. H. Structural Parameters from Rotational Spectra. In Critical Evaluation of Chemical and Physical Structural Information; Lide, D. R., Paul, M. A., Eds.; National Academy of Sciences: Washington DC, 1974.
72. Fraser, G. T.; Suenran, R. D.; Lugez, C. L. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1141.
73. (a) Levis, R. L. Annu. Rev. Phys. Chem. 1994, 45, 483 and references therein,
74. (b) Zhigilei, L. V.; Kodali, P. B. S.; Garrison, B. J. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2845.
75. (c) Zhigilei, L. V.; Leveugle, E.; Garrison, B. J.; Yingling, Y. G.; Zeifman, M. I. Chem. Rev. 2003, 103, 321.