An enzyme-based E-DNA sensor for sequence-specific detection of femtomolar DNA targets

Journal of the American Chemical Society

Volumn 130, Issue 21, 2008, Pages 6820-6825

  Liu, Gang ^a   Wan, Ying ^a   Gau, Vincent ^b   Zhang, Jiong ^a   Wang, Lihua ^a   Song, Shiping ^a   Fan, Chunhai ^a  

^a SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

^b GeneFluidics Inc   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIBODIES; CHEMICAL SENSORS; ELECTRODES; ENZYME ACTIVITY;

E-DNA SENSORS; FEMTOMOLAR DNA TARGETS;

DNA SEQUENCES;

AVIDIN; BIOTIN; DIGOXIGENIN; DNA; HORSERADISH PEROXIDASE;

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; CONTROLLED STUDY; ELECTRODE; ENZYME BINDING; HYBRIDIZATION; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; SENSOR;

AVIDIN; BIOSENSING TECHNIQUES; BIOTIN; DIGOXIGENIN; DNA, BACTERIAL; ENZYMES, IMMOBILIZED; ESCHERICHIA COLI; HORSERADISH PEROXIDASE; OLIGONUCLEOTIDES; POLYMERASE CHAIN REACTION; STREPTAVIDIN;

EID: 44349123358     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja800554t     Document Type: Article

References (43)

1. Debouck, C.; Goodfellow, P. N. Nat. Genet. 1999, 21, 48-50.
2. Heller, M. J. Annu. Rev. Biomed. Eng. 2002, 4, 129-153.
3. Taton, T. A.; Mirkin, C. A.; Letsinger, R. L. Science 2000, 289, 1757-1760.
4. Boon, E. M.; Ceres, D. M.; Drummond, T. G.; Hill, M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1096-1100.
5. Fan, C.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9134-9137.
6. Long, Y.; Li, C.; Sutherland, T. C.; Kraatz, H. B.; Lee, J. S. Anal. Chem. 2004, 76, 4059-4065.
7. Minunni, M.; Tombelli, S.; Fonti, J.; Spiriti, M. M.; Mascini, M.; Bogani, P.; Buiatti, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7966-7967.
8. Xiao, Y.; Lai, R.; Plaxco, K. W. Nat. Protoc. 2007, 2, 2875-2880.
9. Park, S. J.; Taton, T. A.; Mirkin, C. A. Science 2002, 295, 1503-1506.
10. Drummond, T. G.; Hill, M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 1192-1199.
11. Fan, C.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Trends Biotechnol. 2005, 23, 186-192.
12. Millan, K. M.; Mikkelsen, S. R. Anal. Chem. 1993, 65, 2317-2323.
13. Millan, K. M.; Saraullo, A.; Mikkelsen, S. R. Anal. Chem. 1994, 66, 2943-2948.
14. Patolsky, F.; Lichtenstein, A.; Willner, I. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 253-257.
15. Yu, H. Z.; Luo, C. Y.; Sankar, C. G.; Sen, D. Anal. Chem. 2003, 75, 3902-3907.
16. Yu, C. J.; Wan, Y. J.; Yowanto, H.; Li, J.; Tao, C. L.; James, M. D.; Tan, C. L.; Blackburn, G. F.; Meade, T. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11155-11161.
17. Kim, E.; Kim, K.; Yang, H.; Kim, Y. T.; Kwak, J. Anal. Chem. 2003, 75, 5665-5672.
18. Zhang, J.; Song, S. P.; Zhang, L. Y.; Wang, L. H.; Wu, H. P.; Pan, D.; Fan, C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 8575-8580.
19. Lai, R. Y.; Lagally, E. T.; Lee, S. H.; Soh, H. T.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 4017-4021.
20. Xiao, Y.; Lubin, A. A.; Baker, B. R.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 16677-16680.
21. Tyagi, S.; Kramer, F. R. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 303-308.
22. Tyagi, S.; Bratu, D. P.; Kramer, F. R. Nat. Biotechnol. 1998, 16, 49-53.
23. Bonnet, G.; Tyagi, S.; Libchaber, A.; Kramer, F. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6171.
24. Xiao, Y.; Qu, X.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 11896-11897.
25. Bockisch, B.; Grunwald, T.; Spillner, E.; Bredehorst, R. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e101.
26. Paton, A. W.; Paton, J. C. J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 2944-2947.
27. Poddar, S. K. Mol. Cell. Probes 2000, 14, 25-32.
28. Guo, L.-H.; Facci, J. S.; McLendon, G.; Mosher, R. Langmuir 1994, 10, 4588-4593.
29. Gau, V.; Ma, S.-C.; Wang, H.; Tsukuda, J.; Kibler, J.; Haake, D. A. Methods 2005, 37, 73-83.
30. Fan, C.; Wang, H.; Zhu, D.; Wagner, G.; Li, G. Anal. Sci. 2001, 73, 2850-2854.
31. Fanjul-Bolado, P.; Gonzalez-Garcia, M. B.; Costa-Garcia, A. Anal. Bioanal. Chem. 2004, 382, 297-302.
32. Das, A.; Hecht, M. H. J. Inorg. Biochem. 2007, 101, 1820-1826.
33. Li, X.; Lee, J. S.; Kraatz, H.-B. Anal. Chem. 2006, 78, 6096-6101.
34. Herrwerth, S.; Eck, W.; Reinhardt, S.; Grunze, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9359-9366.
35. Gabriel, S.; Dubruel, P.; Schacht, E.; Jonas, A. M.; Gilbert, B.; Jerome, R.; Jerome, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 5505-5509.
36. Wang, J.; Liu, G.; Jan, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3010-3011.
37. Zhang, J.; Song, S.; Wang, L.; Pan, D.; Fan, C. Nat. Protoc. 2007, 2, 2888.
38. Immoos, C. E.; Lee, S. J.; Grinstaff, M. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10814-5.
39. Mao, Y.; Luo, C.; Deng, W.; Jin, G.; Yu, X.; Zhang, Z.; Ouyang, Q.; Chen, R.; Yu, D. Nucleic Acids Res. 2004, 32, e144.
40. Wu, Z.; Jiang, J.; Shen, G.; Yu, R. Hum. Mutat. 2007, 28, 630-637.
41. Wei, F.; Chen, C.; Zhai, L.; Zhang, N.; Zhao, X. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5306-5307.
42. Du, H.; Disney, M. D.; Miller, B. L.; Krauss, T. D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4012-4013.
43. Du, H.; Strohsahl, C. M.; Camera, J.; Miller, B. L.; Krauss, T. D. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7932-7940.