Genes and enzymes involved in deoxysugar biosynthesis in bacteria

Natural Product Reports

Volumn 16, Issue 3, 1999, Pages 283-299

  Trefzer, Axel ^a   Salas, Jose A ^b   Bechthold, Andreas ^a  

^a UNIVERSITY OF TÜBINGEN   (Germany)

^b DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL METABOLISM; CARBOHYDRATE METABOLISM; DEOXYSUGAR;

BACTERIA; CARBOHYDRATE SEQUENCE; CARBOHYDRATES; DAUNORUBICIN; ENZYMES; FUCOSE; GENES, BACTERIAL; LINCOMYCIN; LIPOPOLYSACCHARIDES; MANNOSE; MOLECULAR SEQUENCE DATA; MULTIGENE FAMILY; OLEANDOMYCIN; PLICAMYCIN; POLYSACCHARIDES; STREPTOMYCIN; TYLOSIN;

BACTERIA (MICROORGANISMS);

EID: 3843086796     PISSN: 02650568     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/a804431g     Document Type: Article

References (126)

1. J. F. Kennedy and C. A. White, Bioactive Carbohydrates in Chemistry, Biochemistry and Biology, Ellis Horwood Publishers, Chichester, 1983.
2. L. Stryer, Biochemistry, 4th Edition, W. H. Freeman Company, New York, 1995.
3. C. A. Schnaitman and J. D. Klena, Microbiol. Rev., 1993, 57, 655.
4. P. R. Reeves, Bacterial Cell Wall, Elsevier Science, Oxford, 1994, 281.
5. U. Graefe, Biochemie der Antibiotika, Spektrum Akademischer Verlag GmbH Heidelberg, Berlin, New York, 1992.
6. C. Whitfield, W. J. Keenleyside and B. R. Clarke, in Escherichia coli in Domestic Animals and Humans, CAB International, Wallingford, 1994, 437.
7. H. W. Liu and J. S. Thorson, Annu. Rev. Microbiol., 1994, 48, 223.
8. P. R. Reeves, M. Hobbs, M. A. Valvano, M. Skurnik, C. Whitfield, D. Coplin, N. Kido, J. Klena, D. Maskell, C. R. Raetz and P. D. Rick, Trends Microbiol., 1996, 4, 495.
9. A. C. Weymouth-Wilson, Nat. Prod. Rep., 1997, 14, 99.
10. A. Kirschning, A. F.-W. Bechthold and J. Rohr, Top. Curr. Chem., 1997, 188, 1.
11. V. L. LV́ov, A. S. Shashkov, B. A. Dimitriev, N. K. Kochtkov, B. Jann and K. Jann, Carbohydr. Res., 1984, 126, 149.
12. C. L. Marolda and M. A. Valvano, J. Bacteriol., 1995, 177, 5539.
13. C. L. Marolda and M. A. Valvano, J. Bacteriol., 1993, 175, 148.
14. D. Liu and P. R. Reeves, Microbiology, 1994, 140, 49.
15. G. Stevenson, B. Neal, D. Liu, M. Hobbs, N. H. Packer, M. Batley, J. W. Redmond, L. Lindquist and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1994, 176, 4144.
16. R. Austrian, Rev. Infect. Dis., 1981, 3 Suppl, 1.
17. A. Guidolin, J. K. Morona, R. Morona, D. Hansman and J. C. Paton, Infect. Immun., 1994, 62, 5384.
18. J. K. Morona, R. Morona, and J. C. Paton, Mol. Microbiol., 1997, 23, 751.
19. E. Garcia and R. Lopez, FEMS Microbiol. Lett., 1997, 149, 1.
20. P. I. Tarr, Clin. Infect. Dis., 1995, 20, 1.
21. L. Wang P. R. Reeves, Infect. Immun., 1998, 66, 3545.
22. G. Stacey, S. Luka, J. Sanjuan, Z. Banfalvi, A. J. Nieuwkoop, J. Y. Chun, L. S. Forsberg and R. Carlson, J. Bacteriol., 1994, 176, 620.
23. P. Mergaert, M. Van Montagu and M. Holsters, FEBS Lett., 1997, 409, 312.
24. W. D. Grant, I. W. Sutherland and J. F. Wilkinson, J. Bacteriol., 1969, 100, 1187.
25. G. Stevenson, K. Andrianopoulos, M. Hobbs and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1996, 178, 4885.
26. K. Andrianopoulos, L. Wang and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1998, 180, 998.
27. L. Zhang, J. Radziejewska-Lebrecht, D. Krajewska-Pietrasik, P. Toivanen and M. Skurnik, Mol. Microbiol., 1997, 23, 63.
28. L. Zhang, P. Toivanen and M. Skurnik, Microbiology, 1996, 142, 277.
29. M. Skurnik, R. Venho, P. Toivanen and A. al-Hendy, Mol. Microbiol., 1995, 17, 575.
30. S. Aleksic, G. Suchan, J. Bockemuhl and V. Aleksic, Contrib. Microbiol. Immunol., 1991, 12, 235.
31. J. S. Thorson, T. M. Kelly and H. W. Liu, J. Bacteriol., 1994, 176, 1840.
32. J. S. Thorson, S. F. Lo, O. Ploux, X. He and H. W. Liu, J. Bacteriol., 1994, 176, 5483.
33. A. C. Kessler, P. K. Brown, L. K. Romana and P. R. Reeves, J. Gen. Microbiol., 1991, 137, 2689.
34. A. C. Kessler, A. Haase and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1993, 175, 1412.
35. M. Hobbs and P. R. Reeves, Biochim. Biophys. Acta, 1995, 14, 273.
36. S. H. Xiang, M. Hobbs and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1994, 176, 4357.
37. H. Nikaido, K. Nikaido and P. H. Makela, J. Bacteriol., 1966, 91, 1126.
38. H. Nikaido, M. Levinthal, K. Nikaido and K. Nakane, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1967, 57, 1825.
39. H. N. Brahmbhatt, N. B. Quigley and P. R. Reeves, Mol. Gen. Genet., 1986, 203, 172.
40. H. N. Brahmbhatt, P. Wyk, N. B. Quigley and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1988, 170, 98.
41. X. M. Jiang, B. Neal, F. Santiago, S. J. Lee, L. K. Romana and P. R. Reeves, Mol. Microbiol., 1991, 5, 695.
42. P. Wyk and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1989, 171, 5687.
43. L. Wang, L. K. Romana and P. R. Reeves, Genetics, 1992, 130, 429.
44. N. K. Verma and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1989, 171, 5694.
45. N. K. Verma, N. B. Quigley and P. R. Reeves, J. Bacteriol., 1988, 170, 103.
46. T. M. Hallis, Y. Lei, N. L. Que, H́. Liu, Biochemistry, 1998, 37, 4935.
47. D. A. Bastin and P. R. Reeves, Gene, 1995, 164, 17.
48. G. Blanco, H. Fu, C. Méndez, C. Khosla and J. A. Salas, Chem. Biol., 1996, 3, 193.
49. F. Lombo, G. Blanco, E. Fernandez, C. Mendez and J. A. Salas, Gene, 1996, 172, 87.
50. E. Künzel, S.-E. Wohlert, R. Machinek, C. Méndez, J. A. Salas and J. Rohr, submitted for publication in J. Nat. Prod.
51. F. Lombo, K. Siems, A. F. Brana, C. Mendez, K. Bindseil and J. A. Salas, J. Bacteriol., 1997, 179, 3354.
52. E. Fernández, U. Weißbach, C. Sáncez-Reillo, A. F. Braña, J. Rohr and J. A. Salas, J. Bacteriol., 1998, 180, 4929.
53. G. Blanco and J. A. Salas, unpublished results.
54. F. Buzzetti, F. Eisenberg, H. N. Grant, W. Keller-Schierlein, W. Voser and H. Zahner, Experientia, 1968, 24, 320.
55. J. L. Mertz, J. S. Peloso, B. J. Barker, G. E. Babbitt, J. L. Occolowitz, V. L. Simson and R. M. Kline, J. Antibiot. (Tokyo), 1986, 39, 877.
56. S. Gaisser, A. Trefzer, S. Stockert, A. Kirschning and A. Bechthold, J. Bacteriol., 1997, 179, 6271.
57. A. Bechthold and J. Rohr, New Aspects in Bioorganic Chemistry, Wiley VCH, Weinheim, accepted for publication.
58. L. Westrich, S. Domann, B. Faust, D. Bedford, D. A. Hopwood and A. Bechthold, FEMS Microbiol. Lett., 1999, 170, 381.
59. J. Rohr, S.-E. Wohlert, C. Oelkers, A. Kirschning and M. Ries, Chem. Commun., 1997, 10, 973.
60. H. Drautz, H. Zahner, J. Rohr and A. Zeeck, J. Antibiot. (Tokyo), 1986, 39, 1657.
61. H. Decker and S. Haag, J. Bacteriol., 1995, 177, 6126.
62. B. Faust, E. Künzel, C. Oelkers, G. Wetnauer, L. Westrich, D. Bearden, J. Rohr and A. Bechthold, unpublished results.
63. A. Trefzer, D. Hoffmeister, L. Westrich, G. Weitnauer, S. Stockert, E. Künzel, J. Rohr and A. Bechthold, unpublished results.
64. S. Barcza, M. Brufani, W. Keller-Schierlein and H. Zahner, Helv. Chim. Acta, 1966, 20, 1736.
65. D. H. Sherman, F. Malpartida, M. J. Bibb, H. M. Kieser, M. J. Bibb and D. A. Hopwood, EMBO J., 1989, 8, 2717.
66. A. Bechthold, J. K. Sohng, T. M. Smith, X. Chu and H. G. Floss, Mol. Gen. Genet., 1995, 248, 610.
67. K. Ichinose, D. J. Bedford, D. Tornus, A. Bechthold, M. J. Bibb, W. P. Revill, H. G. Floss and D. A. Hopwood. Chem. Biol., 1998, 5, 647.
68. B. Draeger, S.H. Park and H. G. Floss, J. Am. Chem Soc., submitted.
69. S. Dutka-Malen, P. Mazodier and B. Badet, Biochimie, 1988, 70, 287.
70. D. Mengin-Lecreulx and J. van Heijenoort, J. Biol. Chem., 1996, 271, 32.
71. D. Mengin-Lecreulx and J. van Heijenoort, J. Bacteriol., 1993, 175, 6150.
72. A. M. Gehring, W. J. Lees, D. J. Mindiola, C. T. Walsh and E. D. Brown, Biochemistry, 1996, 35, 579.
73. M. A. Gallo, J. Ward and C. R. Hutchinson, Microbiology, 1996, 142, 269.
74. K. Madduri and C. R. Hutchinson, J. Bacteriol., 1995, 177, 1208.
75. C. Scotti and C. R. Hutchinson, J. Bacteriol., 1996, 178, 7316.
76. S. L. Otten, M. A. Gallo, K. Madduri, X. Liu and C. R. Hutchinson, J. Bacteriol., 1997, 179, 4446.
77. K. Madduri, J. Kennedy, G. Rivola, A. Inventi-Solari, S. Filippini, G. Zanuso, A. L. Colombo, K. M. Gewain, J. L. Occi, D. J. MacNeil and C. R. Hutchinson, Nat. Biotechnol., 1998, 16, 69.
78. M. L. Dickens, J. Ye and W. R. Strohl, J. Bacteriol., 1996, 178, 3384.
79. S. L. Otten, X. Liu, J. Ferguson and C. R. Hutchinson, J. Bacteriol., 1995, 177, 6688.
80. H. Krügel, G. Schumann, F. Hanel and G. Fiedler, Mol. Gen. Genet., 1993, 241, 193.
81. W. Piepersberg and J. Distler, Biotechnology Vol. 7, VCH, Weinheim, 1997, 397.
82. U. Peschke, H. Schmidt, H. Z. Zhang and W. Piepersberg, Mol. Microbiol., 1995, 16, 1137.
83. N. Dhillon, R. S. Hale, J. Cortes and P. F. Leadlay, Mol. Microbiol., 1989, 3, 1405.
84. S. F. Haydock, J. A. Dowson, N. Dhillon, G. A. Roberts, J. Cortes and P. F. Leadlay, Mol. Gen. Genet., 1991, 230, 120.
85. S. Gaisser, G. A. Bohm, J. Cortes and P. F. Leadlay, Mol. Gen. Genet., 1997, 256, 239.
86. R. G. Summers, S. Donadio, M. J. Staver, E. Wendt-Pienkowski, C. R. Hutchinson and L. Katz, Microbiology, 1997, 143, 3251.
87. S. Gaisser, G. A. Bohm, M. Doumith, M. C. Raynal, N. Dhillon, J. Cortes and P. F. Leadlay, Mol. Gen. Genet., 1998, 258, 78.
88. K. Salah-Bey, M. Doumith, J. M. Michel, S. Haydock, J. Cortes, P. F. Leadlay and M. C. Raynal, Mol. Gen. Genet., 1998, 257, 542.
89. J. Vara, M. Lewandowska-Skarbek, Y. G. Wang, S. Donadio and C. R. Hutchinson, J. Bacteriol., 1989, 171, 5872.
90. J. A. Vara and C. R. Hutchinson, J. Biol. Chem., 1988, 263, 14992.
91. K. J. Linton, B. W. Jarvis and C. R. Hutchinson, Gene, 1995, 153, 33.
92. J. M. Weber, J. O. Leung, G. T. Maine, R. H. Potenz, T. J. Paulus and J. P. DeWitt, J. Bacteriol., 1990, 172, 2372.
93. C. Olano, I. Aquirrezabalaga, L. Rodriquez, C. Méndez and J. A. Salas, unpublished results.
94. C. Olano, A. M. Rodriguez, J. M. Michel, C. Mendez, M. C. Raynal and J. A. Salas, Mol. Gen. Genet., 1998, 259, 299.
95. L. M. Quiros, C. Hernandez and J. A. Salas, Eur. J. Biochem., 1994, 222, 129.
96. C. Hernandez, C. Olano, C. Mendez and J. A. Salas, Gene, 1993, 134, 139.
97. C. Vilches, C. Hernandez, C. Mendez and J. A. Salas, J. Bacteriol., 1992, 174, 161.
98. L. M. Quiros and J. A. Salas, J. Biol. Chem., 1995, 270, 18234.
99. L. M. Quiros, I. Aguirrezabalaga, C. Olano, C. Mendez and J. A. Salas, Mol. Microbiol., 1998, 28, 1177.
100. J. Sasaki, K. Mizoue, S. Morimoto and S. Omura, J. Antibiot. (Tokyo), 1996, 49, 1110.
101. G. Jenkins and E. Cundliffe, Gene, 1991, 108, 55.
102. S. H. Park and H. G. Floss, unpublished results.
103. L. A. Merson-Davies and E. Cundliffe, Mol. Microbiol., 1994, 13, 349.
104. A. R. Gandecha, S. L. Large and E. Cundliffe, Gene, 1997, 184, 197.
105. V. T. Wilson and E. Cundliffe, Gene, 1998, 214, 95.
106. J. Distler, A. Ebert, K. Mansouri, K. Pissowotzki, M. Stockmann and W. Piepersberg, Nucleic Acids Res., 1987, 15, 8041.
107. J. Distler, C. Braun, A. Ebert and W. Piepersberg, Mol. Gen. Genet., 1987, 208, 204.
108. W. Piepersberg, Biotechnology of Antibiotics, Marcel Dekker Inc., New York, 1997, 81.
109. T. F. Parsons and J. Preiss, J. Biol. Chem., 1978, 253, 7638.
110. T. F. Parsons and J. Preiss, J. Biol. Chem., 1978, 253, 6197.
111. J. W. Cornforth, J. W. Redmond, H. Eggerer, W. Buckel and C. Gutschow, Eur. J. Biochem., 1970, 14, 1.
112. J. Luthy, J. Retey and D. Arigoni, Nature, 1969, 221, 1213.
113. C. E. Snipes, G. U. Brillinger, L. Sellers, L. Mascaro and H. G. Floss, J. Biol. Chem., 1977, 252, 8113.
114. P. J. Oths, R. M. Mayer and H. G. Floss, Carbohydr. Res., 1990, 198, 91.
115. C. E. Snipes, C.-J. Chang and H. G. Floss, J. Am. Chem Soc., 1979, 101, 701.
116. Y. Yu, R. N. Russell, J. S. Thorson, L. D. Liu and H. W. Liu, J. Biol. Chem., 1992, 267, 5868.
117. M. Stockmann and W. Piepersberg, FEMS Microbiol. Lett., 1992, 69, 185.
118. H. Decker, S. Gaisser, S. Pelzer, P. Schneider, L. Westrich, W. Wohlleben and A. Bechthold, FEMS Microbiol. Lett., 1996, 141, 195.
119. X. He, J. S. Thorson and H. W. Liu, Biochemistry, 1996, 35, 4721.
120. P. A. Rubenstein and J. L. Strominger, 1974, 249, 3776.
121. O. Han, V. P. Miller and H. W. Liu, J. Biol. Chem., 1990, 265, 8033.
122. W. Piepersber, Crit. Rev. Biotechnol., 1994, 14, 251.
123. J. J. Lee, J. P. Lee, P. J. Keller, C. E. Cottrell, C. Chang, H. Zahner and H. G. Floss, J. Antibiot. (Tokyo), 1986, 39, 1123.
124. M. Yamazaki, L. Thorne, M. Mikolajczak, R. W. Armentrout and T. J. Pollock, J. Bacteriol., 1996, 178, 2676.
125. I. M. Saxena, R. Malcolm Brown, M. Fevre, R.A. Geremia and B. Henrissat, J. Bacteriol., 1995, 177, 1419.
126. J. A. Campbell, G. J. Davies, V. Bulone, B. Henrissat. Biochem. J., 1997, 326, 929.