Tandem repeating modular proteins avoid aggregation in single molecule force spectroscopy experiments

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 111, Issue 49, 2007, Pages 12402-12408

  Dougan, Lorna ^a   Fernandez, Julio M ^a  

^a Och Spine at New York Presbyterian Hospitals   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MOLECULE FORCE SPECTROSCOPY; POLYPROTEIN;

AGGLOMERATION; MOLECULAR INTERACTIONS; MOLECULAR STRUCTURE; SOLVENTS;

PROTEINS;

PROTEIN;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMISTRY; KINETICS; METHODOLOGY; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN FOLDING; SPECTROSCOPY;

KINETICS; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN FOLDING; PROTEINS; SPECTRUM ANALYSIS;

EID: 38049103717     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp076095+     Document Type: Article

References (45)

1. Soto, C. Nat. Rev. Neurosci. 2003, 4, 49.
2. Dobson, C. M. Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 2001, 356, 133.
3. Dobson, C. M. Nature (London, U.K.) 2003, 426, 884.
4. Horwich, A. J. Clin. Invest. 2002, 110, 1221.
5. Radford, S. E.; Dobson, C. M. Cell 1999, 97, 291.
6. Thomas, P. J.; Qu, B. H.; Pedersen, P. L. Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 456.
7. Labeit, S.; Kolmerer, B. Science (Washington, DC, U.S.) 1995, 270, 293.
8. Fisher, T. E.; Oberhauser, A. F.; Carrion-Vazquez, M.; Marszalek, P. E.; Fernandez, J. M. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 379.
9. Fernandez, J. M.; Li, H. Science (Washington, DC, U.S.) 2004, 303, 1674.
10. Li, H. B.; Fernandez, J. M. J. Mol. Biol. 2003, 334, 75.
11. Oberhauser, A. F.; Marszalek, P. E.; Erickson, H. P.; Fernandez, J. M. Nature (London, U.K.) 1998, 393, 181.
12. Rief, M.; Gautel, M.; Oesterhelt, F.; Fernandez, J. M.; Gaub, H. E. Science (Washington, DC, U.S.) 1997, 276, 1109.
13. Wiita, A. P.; Ainavarapu, S. R. K.; Huang, H. H.; Fernandez, J. M. Proc. Nail. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 7222.
14. Walther, K.; Grater, F.; Dougan, L.; Badilla, C. L.; Berne, B. J.; Fernandez, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 7916.
15. Carrion-Vazquez, M.; Oberhauser, A. F.; Fowler, S. B.; Marszalek, P. E.; Broedel, S. E.; Clarke, J.; Fernandez, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3694.
16. Oberhauser, A. F.; Marszalek, P. E.; Carrion-Vazquez, M.; Fernandez, J. M. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 1025.
17. Rounsevell, R. W. S.; Steward, A.; Clarke, J. Biophys. J. 2005, 88, 2022.
18. Li, H. B.; Linke, W. A.; Oberhauser, A. F.; Carrion-Vazquez, M.; Kerkviliet, J. G.; Lu, H.; Marszalek, P. E.; Fernandez, J. M. Nature (London, U.K.) 2002, 418, 998.
19. Scott, K. A.; Steward, A.; Fowler, S. B.: Clarke, J. J. Mol. Biol. 2002, 315, 819.
20. Wright, C. F.; Teichmann, S. A.; Clarke, J.; Dobson, C. M. Nature (London, U.K.) 2005, 438, 878.
21. Chiti, F.; Webster, P.; Taddei, N.; Clark, A.; Stefani, M.; Ramponi, G.; Dobson, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3590.
22. Koti, A. S. R. a.; Brujic, J.; Huang, H. H.; Wiita, A. P.; Lu, H.; Walther K. A.; Carrion-Vazquez, M.; Li, H.; Fernandez, J. M. Biophys. J. 2007, 92, 225.
23. Li, H. B.; Carrion-Vazquez, M.; Oberhauser, A. F.; Marszalek, P. E.; Fernandez, J. M. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1117.
24. Schlierf, M.; Li, H.; Fernandez, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7299.
25. Oberhauser, A. F.; Hansma, P. K.; Carrion-Vazquez, M.; Fernandez, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 468.
26. Marszalek, P. E.; Lu, H.; Li, H. B.; Carrion-Vazquez, M.; Oberhauser, A. F.; Schulten, K.; Fernandez, J. M. Nature (London, U.K.) 1999, 402, 100.
27. Garcia-Manyes, S.; Brujic, J.; Fernandez, J. M. Biophys. J. 2007, 93, 2436.
28. Carrion-Vazquez, M.; Li, H. B.; Lu, H.; Marszalek, P. E.; Oberhauser, A. F.; Fernandez, J. M. Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 738.
29. Kentsis, A.; Sosnick, T. R. Biochemistry 1998, 37, 14613.
30. Luo, P. Z.; Baldwin, R. L. Biochemistry 1997, 36, 8413.
31. Fernandez, J. M.; Li, H. B.; Brujic, J. Science (Washington, DC, U.S.) 2004, 306, 411.
32. Plaxco, K. W.; Gross, M. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 659.
33. Shortle, D.; Ackerman, M. S. Science (Washington, DC, U.S.) 2001, 295, 487.
34. Tatham, A. S.; Shewry, P. R. Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 567.
35. Sharma, D.; Perisic, O.; Peng, Q.; Cao, Y.; Lam, C.; Lu, H.; Li, H. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9278.
36. Brockwell, D. J.; Beddard, G. S.; Paci, E.; West, D. K.; Olmsted, P. D.; Smith, D. A.; Radford, S. E. Biophys. J. 2005, 89, 506.
37. Dietz, H.; Rief, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16192.
38. Oberhauser, A. F.; Badilla-Fernandez, C.; Carrion-Vazquez, M.; Fernandez, J. M. J. Mol. Biol. 2002, 319, 433.
39. Friedel, M.; Baumketner, A.; Shea, J. E. Proc Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 8396.
40. Bjorklund, A. K.; Ekman, D.; Elofsson, A. PLOS Comput. Biol. 2006, 2, 959.
41. Ekman, D.; Bjorklund, A. K.; Frey-Skott, J.; Elofsson, A. J. Mol. Biol. 2005, 348, 231.
42. Apic, G.; Gough, J.; Teichmann, S. A. J. Mol. Biol. 2001, 310, 311.
43. Marcotte, E. M.; Pellegrini, M.; Yeates, T. O.; Eisenberg, D. J. Mol. Biol. 1999, 293, 151.
44. Parrini, C.; Taddei, N.; Ramazzotti, M.; Degl'lnnocenti, D.; Ramponi, G.; Dobson, C. M.; Chiti, F. Structure (Cambridge, MA, U.S.) 2005, 13, 1143.
45. Steward, A.; Adhya, S.; Clarke, J. J. Mol. Biol. 2002, 318, 935.