Polymer microfluidic chips with integrated waveguides for reading microarrays

Analytical Chemistry

Volumn 79, Issue 23, 2007, Pages 9007-9013

  Xu, Feng ^a   Datta, Proyag ^a   Wang, Hong ^a   Gurung, Sitanshu ^a   Hashimoto, Masahiko ^a   Wei, Suying ^a   Goettert, Jost ^a   McCarley, Robin L ^a   Soper, Steven A ^a  

^a LOUISIANA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; EXCITATION ENERGY; MICROARRAYS; POLYMER SOLUTIONS; POLYMETHYL METHACRYLATES; WAVEGUIDES;

AMINE-TERMINATED OLIGONUCLEOTIDES; CARBODIIMIDE COUPLING; LIGATION ASSAYS; POLYMER MICROFLUIDIC CHIPS;

MICROFLUIDICS;

AMINE; CYANAMIDE; GENOMIC DNA; OLIGONUCLEOTIDE; POLY(METHYL METHACRYLATE); POLYMER;

AMPLICON; ARTICLE; BREAST CANCER; DNA CONTENT; DNA PROBE; ENZYME ACTIVATION; FLUORESCENCE; GENE MUTATION; HYBRIDIZATION; MICROARRAY ANALYSIS; MICROFLUIDICS; MICROSCOPE IMAGE; NUCLEOTIDE SEQUENCE; POINT MUTATION; POLYMERASE CHAIN REACTION; WILD TYPE;

BASE SEQUENCE; DNA PRIMERS; GENES, BRCA1; MICROFLUIDICS; MUTATION; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; POLYMERASE CHAIN REACTION; POLYMERS;

EID: 36849059262     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac7016597     Document Type: Article

References (32)

1. Schena, M. Microarray Biochip Technology; Eaton Publishing: Natick, MA, 2000.
2. Yang, P.; Wirnsberger, G.; Huang, H. C.; Cordera, S. R.; McGehee, M. D.; Scott, B.; Deng, T.; Whitesides, G. M.; Chmelka, B. F.; Buratto, S. K.; Stucky, G. D. Science 2000, 287, 465-467.
3. Barnes, W. L.; Dereux, A.; Ebbesen, T. W. Nature 2003, 424, 824-830.
4. Arentoft, J.; Sondergaard, T.; Kristensen, M.; Boltasseva, A.; Thorhauge, M.; Frandsen, L. Electron. Lett. 2002, 38, 274-275.
5. Pawlak, M.; Schick, E.; Bopp, M. A.; Schneider, M. J.; Oroszlan, P.; Ehrat, M. Proteomics 2002, 2, 383-393.
6. Sugimoto, Y.; Tanaka, Y.; Ikeda, N.; Nakamura, Y.; Asakawa, K.; Inoue, K. Opt. Express 2004, 12, 1090-1096.
7. Kawakami, S. Electron. Lett. 1997, 33, 1260-1261.
8. Papra, A.; Bernard, A.; Juncker, D.; Larsen, N. B.; Michel, B.; Delamarchce, E. Langmuir 2001, 17, 4090-4095.
9. Plowman, T. E.; Durstchci, J. D.; Wang, H. K.; Christensen, D. A.; Herron, J. N.; Reichert, W. M. Anal. Chem. 1999, 71, 4344-4352.
10. Adar, R.; Serbin, M. R.; Mizrahi, V. J. Lightwave Technol. 1994, 12, 1369-1372.
11. Rowe, C. A.; Tender, L. M.; Feldstein, M. J.; Golden, J. P.; Scruggs, S. B.; MacCraith, B. D.; Cras, J. J.; Leigler, F. S. Anal. Chem. 1999, 71, 3846-3852.
12. Reichert, W. M.; Ives, J. T.; Suci, P. A.; Hlady, V. Appl. Spectrosc. 1987, 41, 636-640.
13. Ives, J. T.; Reichert, W. M. Appl. Spectrosc. 1988, 42, 68-72.
14. Shadpour, H.; Musyimi, H.; Chen, J. F.; Soper, S. A. J. Chromatogr., A 2006, 1111, 238-251.
15. Chronis, N.; Lee, L. P. Lab Chip 2004, 4, 125-130.
16. Situma, C.; Hashimoto, M.; Soper, S. A. Biomol. Eng. 2006, 23, 213-231.
17. Wang, Y.; Vaidya, B.; Farquar, H. D.; Stryjewski, W.; Hammer, R. P.; McCarley, R. L.; Soper, S. A.; Cheng, Y. W.; Barany, F. Anal. Chem. 2003, 75, 1130-1140.
18. Liu, R. H.; Yang, J. N.; Lenigk, R.; Bonanno, J.; Grodzinski, P. Anal. Chem. 2004, 76, 1824-1831.
19. Liu, Y. J.; Rauch, C. B.; Stevens, R. L.; Lenigk, R.; Yang, J. N.; Rhine, D. B.; Grodzinski, P. Anal. Chem. 2002, 74, 3063-3070.
20. Anderson, R. C.; Su, X.; Bogdan, G. J.; Fenton, J. Nucleic Acids Res. 2000, 28, e60.
21. Favis, R.; Day, J. P.; Gerry, N. P.; Phelan, C.; Narod, S.; Barany, F. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 561-564.
22. Hashimoto, M.; Hupert, M. L.; Murphy, M. C.; Soper, S. A.; Cheng, Y. W.; Barany, F. Anal. Chem. 2005, 77, 3243-3255.
23. Datta, P.; Xu, F.; Gurung, S.; Soper, S. A.; Goettert, J. Proc. SPIE-Int. Soc. Opt. Eng. 2005, 6112, 611208.
24. Rivaton, A. Polym. Degrad. Stab. 1995, 49, 163-179.
25. McCarley, R. L.; Vaidya, B.; Wei, S.; Smith, A. F.; Patel, A. B.; Feng, J.; Murphy, M. C.; Soper, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 842-843.
26. Hashimoto, M.; Barany, F.; Soper, S. A. Biosen. Bioelectron. 2006, 21, 1915-1923.
27. Wei, S. Y.; Vaidya, B.; Patel, A. B.; Soper, S. A.; McCarley, R. L. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 16988-16996.
28. Taitt, C. R.; Anderson, G. P.; Ligler, F. S. Biosen. Bioelectron. 2005, 20, 2470-2487.
29. Kim, J.-S.; Kim, J.-J. IEEE Photonics Technol. Lett. 2004, 16, 798-800.
30. FitzGerald, M. G.; MacDonald, D. J.; Krainer, M.; Hoover, I.; O'Neil, E.; Unsal, H.; Silva-Arrieto, S.; Finkelstein, D. M.; Beer-Romero, P.; Englert, C.; Sgroi, D. C.; Smith, B. L.; Younger, J. W.; Garber, J. E.; Duda, R. B.; Mayzel, K. A.; Isselbacher, K. J.; Friend, S. H.; Haber, D. A. N. Engl. J. Med. 1996, 334, 143-149.
31. Langston, A. A.; Malone, K. E.; Thompson, J. D.; Daling, J. R.; Ostrander, E. A. N. Engl. J. Med. 1996, 334, 137-142.
32. Tomlinson, G. E.; Chen, T. T.; Stastny, V. A.; Virmani, A. K.; Spillman, M. A.; Tonk, V.; Blum, J. L.; Schneider, N. R.; Wistuba, I. I.; Shay, J. W.; Minna, J. D.; Gazdar, A. F. Cancer Res. 1998, 58, 3237-3242.